OFFRE DE STAGE DE 6 MOIS (à partir de Janvier 2020 au plus tôt)
Evaluation de l’impact du repeuplement de saumons atlantique grâce aux empreintes génétiques
Contexte de l’étude :
Depuis 2008, MIGADO s’est entourée de l’INRA et du SYSAAF pour améliorer le suivi des repeuplements de saumons (en Dordogne et Garonne) en intégrant l’outil génétique. L’objectif principal est de savoir s’ils sont issus des piscicultures de repeuplement ou de reproduction sauvage, et ainsi d’évaluer l’efficacité du repeuplement.
Description du stage :
Le (la) stagiaire travaillera sur des jeux de données acquis par MIGADO depuis 2008 (codes de prélèvements, enregistrement des fécondations, des effectifs et stades de lâcher, etc). En parallèle, la filiation des saumons est reconstituée grâce aux empreintes génétiques.
L’objectif du stage est d’apporter des éléments de réponses à de nombreuses questions soulevées quant à l’impact du repeuplement, telles que :
- quels stades et lieux de lâcher génèrent le plus de retours ?
- quelle est la variabilité génétique des migrants échantillonnés ?
- quelle est la part de saumons issue de pontes de reproducteurs sauvages et celle issue de croisements réalisés dans les piscicultures de repeuplement ?
Pour y répondre, le (la) stagiaire sera entouré(e) des collègues généticiens du SYSAAF pour l’aider dans la compréhension des données, dans l’interrogation de la base de données, et dans leur analyse. Les encadrants de l’INRA viendront en soutien pour affiner les questions auxquelles le stage doit répondre, en particulier sur les aspects relatifs à la variabilité génétique, et bien sûr pour l’interprétation des résultats obtenus. L’équipe de MIGADO sera disponible pour présenter les objectifs et la structuration du repeuplement ainsi que pour répondre à toutes questions relatives aux données et à la rédaction du rapport de stage.
Compétences recherchées :
En Master 2 ou Ecole d’ingénieur (césure ou dernière année), le (la) stagiaire doit montrer des qualités de rigueur et de persévérance, des capacités de synthèse, d’analyse de données et rédactionnelles, ainsi qu’un bon relationnel. Il (elle) devra pouvoir manipuler Access et Excel sans difficultés.
Présentation des partenaires impliqués :
L’association MIGADO (Migrateurs Garonne Dordogne Charente Seudre) a pour objectifs principaux la gestion, la restauration et le soutien des populations de poissons migrateurs du bassin Gironde-Garonne-Dordogne-CharenteSeudre. Ses principaux domaines d’action sont le suivi et la gestion des populations, la production piscicole, la conservation et la réintroduction d’espèces, le suivi des milieux aquatiques, l’animation de programmes et l’éducation à l’environnement.
Le SYSAAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français) est spécialisé dans l’appui technique d’une 40aine d’entreprises et associations dans les domaines de la sélection génétique ou de la restauration écologique, ce qui concerne 28 espèces avicoles et aquacoles.
L’INRA intervient à travers ses équipes Génétique et Aquaculture (Jouy-en-Josas) et Conservation et Restauration des Ecosystèmes Aquatiques (unité ESE, Rennes), qui apportent leurs connaissances en assignation de parenté, dynamique et génétique des populations et biologie des espèces diadromes.
Avantage : Outre la rémunération mensuelle de 568,76€ net, vous aurez accès au RU (tarif étudiant) ou au restaurant d’entreprise (tarif négocié).
Localisation : SYSAAF, Station LPGP/INRA, Campus de Beaulieu, 35042 Rennes cedex.
Pour candidater (lettre de motivation + CV) :
Auprès d’Anastasia Bestin : anastasia.bestin@inra.fr (02 23 48 57 22)
Evaluation de l’impact du repeuplement de saumons atlantique grâce aux empreintes génétiques
Contexte de l’étude :
Depuis 2008, MIGADO s’est entourée de l’INRA et du SYSAAF pour améliorer le suivi des repeuplements de saumons (en Dordogne et Garonne) en intégrant l’outil génétique. L’objectif principal est de savoir s’ils sont issus des piscicultures de repeuplement ou de reproduction sauvage, et ainsi d’évaluer l’efficacité du repeuplement.
Description du stage :
Le (la) stagiaire travaillera sur des jeux de données acquis par MIGADO depuis 2008 (codes de prélèvements, enregistrement des fécondations, des effectifs et stades de lâcher, etc). En parallèle, la filiation des saumons est reconstituée grâce aux empreintes génétiques.
L’objectif du stage est d’apporter des éléments de réponses à de nombreuses questions soulevées quant à l’impact du repeuplement, telles que :
- quels stades et lieux de lâcher génèrent le plus de retours ?
- quelle est la variabilité génétique des migrants échantillonnés ?
- quelle est la part de saumons issue de pontes de reproducteurs sauvages et celle issue de croisements réalisés dans les piscicultures de repeuplement ?
Pour y répondre, le (la) stagiaire sera entouré(e) des collègues généticiens du SYSAAF pour l’aider dans la compréhension des données, dans l’interrogation de la base de données, et dans leur analyse. Les encadrants de l’INRA viendront en soutien pour affiner les questions auxquelles le stage doit répondre, en particulier sur les aspects relatifs à la variabilité génétique, et bien sûr pour l’interprétation des résultats obtenus. L’équipe de MIGADO sera disponible pour présenter les objectifs et la structuration du repeuplement ainsi que pour répondre à toutes questions relatives aux données et à la rédaction du rapport de stage.
Compétences recherchées :
En Master 2 ou Ecole d’ingénieur (césure ou dernière année), le (la) stagiaire doit montrer des qualités de rigueur et de persévérance, des capacités de synthèse, d’analyse de données et rédactionnelles, ainsi qu’un bon relationnel. Il (elle) devra pouvoir manipuler Access et Excel sans difficultés.
Présentation des partenaires impliqués :
L’association MIGADO (Migrateurs Garonne Dordogne Charente Seudre) a pour objectifs principaux la gestion, la restauration et le soutien des populations de poissons migrateurs du bassin Gironde-Garonne-Dordogne-CharenteSeudre. Ses principaux domaines d’action sont le suivi et la gestion des populations, la production piscicole, la conservation et la réintroduction d’espèces, le suivi des milieux aquatiques, l’animation de programmes et l’éducation à l’environnement.
Le SYSAAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français) est spécialisé dans l’appui technique d’une 40aine d’entreprises et associations dans les domaines de la sélection génétique ou de la restauration écologique, ce qui concerne 28 espèces avicoles et aquacoles.
L’INRA intervient à travers ses équipes Génétique et Aquaculture (Jouy-en-Josas) et Conservation et Restauration des Ecosystèmes Aquatiques (unité ESE, Rennes), qui apportent leurs connaissances en assignation de parenté, dynamique et génétique des populations et biologie des espèces diadromes.
Avantage : Outre la rémunération mensuelle de 568,76€ net, vous aurez accès au RU (tarif étudiant) ou au restaurant d’entreprise (tarif négocié).
Localisation : SYSAAF, Station LPGP/INRA, Campus de Beaulieu, 35042 Rennes cedex.
Pour candidater (lettre de motivation + CV) :
Auprès d’Anastasia Bestin : anastasia.bestin@inra.fr (02 23 48 57 22)