PhD Project Advertisement

 Project title: The importance of sleep: using AI (video-based motion capture systems) to improve the health, resilience and productivity of dairy cows. Project No: FBS2024-041-McBride-as Lead supervisor: Sebastian McBride, Department of Life Sciences, Aberystwyth University Email: sdm@aber.ac.uk Co-supervisor/s: Matthew Parker, University of Surrey Vikki Revell, University of Surrey Manod Williams, Aberystwyth University Project description: This project focuses on sleep in dairy cows. Sleep is one of most critical and often overlooked factors affecting farm animal health and production. It is fundamental to animal well-being and chronically disrupted sleep leads to a number of issues such changes in brain function, changes in physiology and reduced resilience to stress. Optimal sleep is, therefore, critical to the well-being of animals and, in the context of farm animals, has the potential to greatly impact the animal’s level of sustainability and production. Understanding and being able to improve farm animal sleep is, thus, both an ethical and economic priority. One of the main problems of measuring sleep in animals is the complexity of equipment and the time taken to process the data. For example, both EEG (the ‘gold-standard’ sleep measurement) and behavioural measurement approaches to animal sleep quantification are time- and resource-intensive, and therefore often prohibit studies looking at factors that affect animal sleep. Recent developments using artificial intelligence have now created automated video analysis systems that can greatly reduce sleep quantification time in both mice and dogs. We have also started to develop similar methods for measuring sleep in horses to improve welfare and performance. Collectively, this presents the primary motivation of the project, which is to develop, refine and implement an artificial intelligence approach to quantify sleep in dairy cows. This will provide a practical solution to the measurement of sleep in dairy cows and will ultimately allow critical production-related questions to be answered such as: how does sleep change over the lactation period, what indoor and outdoor husbandry factors affect bovine sleep, how does disturbed sleep affect milk yield, what are the long and short term effects of calf separation on sleep. There are three main stages of the project which are: 1. To collect video footage of wake and sleep states of 10 cows within a commercial indoor dairy system alongside EEG and actigraphy data; 2. To use artificial intelligence techniques to train computer vision technology to identify different sleep, wake and eating states from the videos footage by cross-referencing the behavioural, EEG and actigraphy data; 3. To validate the automated sleep video analysis system by running a sleep disturbance trial through small changes in the animal’s husbandry (light and bedding). Aberystwyth University has a commercial indoor dairy system and all video, EEG and actigraphy data will be collected onsite at this facility (Stages 1 and 3). The University of Surrey Sleep Research Centre is home to an interdisciplinary team of physiologists and hardware/software engineers and will provide the necessary expertise in video-based motion-capture machine learning to develop the automated bovine sleep video analysis system (Stage 2). Training opportunities: This interdisciplinary project will equip the student with a unique specific skill set that will place them in a very strong position as an applied behavioural scientist for future work in the agrifood sector. Specifically, coding and development of neural networks for the extraction of video-capture data, sleep scoring from EEG traces, developing algorithms to extract accelerometer data, animal behavioural analysis, large animal handling, experimental and statistical design. They will also be trained in all the full skill set required for a career as an academic scientist (writing up work for publication, preparing and delivering presentations, writing funding applications). They will also acquire a critical knowledge of animal welfare and animal experimentation (including personal licence training from the Home Office) and will have their training strongly nested in the principles of the 3Rs of in vivo research. This will include using the PREPARE (Norecopa) and ARRIVE (NC3Rs) guidelines. In addition, they will be trained in the principles of Open Science, including pre-registration of studies, and providing access to experimental data sets. Student profile: This project would suit a candidate with an undergraduate degree or background in computer science and/or cognitive neuroscience background or, someone who is open and has a propensity to learning artificial learning and EEG measurement techniques. The candidate should also have a strong interest in using science to solve real-world agricultural/biological problems. A full driver’s licence would also be an advantage to allow the candidate to move easily between farm and non-farm campuses at Aberystwyth University. Stipend (Salary): FoodBioSystems DTP students receive an annual tax free stipend (salary) that is paid in instalments throughout the year. For 2023/24 this is £18,622 and it will increase slightly each year at rate set by UKRI. Equality Diversity and Inclusion: The FoodBioSystems DTP is committed to equality, diversity and inclusion (EDI), to building a doctoral researcher(DR) and staff body that reflects the diversity of society, and to encourage applications from under-represented and disadvantaged groups. Our actions to promote diversity and inclusion are detailed on the FoodBioSystems DTP website. In accordance with UKRI guidelines, our studentships are offered on a part time basis in addition to full time registration. The minimum registration is 50% FT and the studentship end date will be extended to reflect the part-time registration. References: Geuther, B., Chen, M., Galante, R.J., Han, O., Lian, J., George, J., Pack, A.I., Kumar, V., 2021. High-throughput visual assessment of sleep stages in mice using machine learning. Sleep 45. Putyora, E., Brocklehurst, S., Tuyttens, F., Sandilands, V., 2023. The Effects of Mild Disturbances on Sleep Behaviour in Laying Hens. Animals 13. Ternman, E., Hänninen, L., Pastell, M., Agenäs, S., Nielsen, P.P., 2012. Sleep in dairy cows recorded with a non-invasive EEG technique. Applied Animal Behaviour Science 140, 25-32. For up to date information on funding eligibility, studentship rates and part time registration, please visit the FoodBioSystems website

PhD positions in animal behaviour with immediate start

 We are looking for 2 strong candidates for an immediate start of PhD projects (1st February 2024) on deer behaviour on any of the following topics:

1. Sleep ecology in deer: investigating development of sleep behaviour in fawns in relation to environmental, social, and maternal factors. This project requires strong statistical skills using R; ideally experience with analysis of biologger data (triaxial accelerometers). 

2. Early life experience and social behaviour in fallow deer fawns. This project requires strong statistical skills using R; ideally experience with analysis of biologger data (trriaxial accelerometers) and with observation of animal behaviour.

3. Evolution of diversity in parental care strategies in vertebrates: this project takes a large scale comparative perspective to investigate how different care behaviours evolved with one another and in relation to ecological, envioronmental and social factors. The project requires strong statistical skills in R and ideally experience with phylogenetic comparative methods.

4. Investigating parent-offpring conflict in fallow deer mother-fawn pairs over time. The project requires observational skills of animal behaviour and strong motivation to do fieldwork.

Scholarships fund UK nationals and residents only. Interested students should contact Isabella Capellini (I.CapelliniATqub.ac.uk) and Domhnall Jennings (D.JenningsATqub.ac.uk) with the following information:

(i) which project they are interested in and how they would like to develop it; 

(ii) why they want to do a PhD and the chosen project in particular;

(iii) what skills they already have that will help them deliver the project successfully and which skills they will need to develop;

(iv) attach their CV and transcript.

Research Assistant

 

Research Technical Assistant

 All information here : Careers (myworkdayjobs.com)

Recherche d’un/une assistant de recherche Printemps-Eté 2024

 Effets des repères visuels sur la danse des abeilles Mots clés : abeilles, danse en huit, navigation, communication, repères visuels, éthologie Contexte et objectifs : Les abeilles partagent des informations spatiales à travers une danse en huit. Ce comportement, unique dans le monde animal, est une opportunité exceptionnelle pour étudier la cognition animale insectes sans interventions de la part du scientifique. En particulier pendant le butinage, la danse sert à recruter d’autres abeilles pour exploiter en masse des sources de nectar/pollen/eau/etc dans un environnement qui est souvent complexe. Lestravaux antérieurs suggèrent que la danse communique une coordonnée. Cependant nous faisons l’hypothèse que ce language est plus complexe car les abeilles 1) se nourrissent sur plusieurs fleurs réparties parfois sur des grands espaces, et 2) se servent de multiples informations visuelles (panorama, repères visuels) pour se retrouver. L’objectif du stage sera d’étudier les effets des repères visuels sur la danse des abeilles. Le/la volontaire sera, selon ses disponibilités, amené à travailler sur le terrain (plusieurs hectares dédiés aux expériences dans les alentours de Toulouse) et à collecter des données à partir de vidéos. Profil recherché : Etudiant(e) de niveau licence ou master en biologie, écologie, éthologie ou proche de ces spécialités. Les qualités requises sont les suivantes : - Autonomie - Sérieux et rigueur scientifique - Grande motivation Responsables : Joanna Brebner (Chercheuse postdoctorante) et Mathieu Lihoreau (Directeur de Recherche CNRS) Lieu: Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA-CBI), Université Paul Sabatier, TOULOUSE (31000) Début possible : Avril 2024 – Septembre 2024 Durée : 1 à 2 mois (non gratifié). Un stage plus long (gratifié) est également envisageable. Pour candidater : Envoyer CV et lettre de motivation par email à Joanna Brebner (joanna.brebner@univ-tlse3.fr)

Position Avian neurobiologist at the University of Leiden (The Netherlands)

 The Institute of Biology at Leiden University has a vacancy for an avian neurobiologist.

 

https://www.universiteitleiden.nl/vacatures/2023/q4/14361-assistant-or-associate-professor-in-avian-neurobiology

 

At the Institute of Biology there are excellent bird and behavioural testing facilities. We have an inhouse bird facility (20 steps from our offices) with several housing and experimental rooms and 20 walk-in sound attenuated chambers,  with operant setups and  3 active birdsong/bioacoustics PI’s (Katharina Riebel, Michelle Spierings, Hans Slabbekoorn) and their research groups on the same floor!

Post doc

 I am currently looking for an enthusiastic researcher to join a highly interdisciplinary team investigating “overimitation in dogs”. The project aims to delve comprehensively into the intriguing aspect of dogs imitating causally irrelevant, non-functional behaviors (called “overimitation”) using an innovative experimental and methodological approach. Within the scope of the project, cutting-edge technology will be integrated with behavioral tests to meticulously explore this cognitive trait in dogs. Data collection will predominantly occur at the Clever Dog Lab of the Messerli Research Institute (unit Comparative Cogniton) situated on the Vetmeduni Vienna campus.

The employment is a temporary, full-time position of 3 years according to central collective agreement.

Starting date March 1st, 2024 or as agreed.

Placement: Vienna, Austria.

For more information, see: https://www.vetmeduni.ac.at/en/cognition/scientific-positions

 

All electronic applications received by December 31st, 2023, will be considered.

We would be grateful if you could share these positions within your network and sorry for the cross posting if any.

 

If you have any questions or would like more information about the positions, feel free to reach out to ludwig.huber@vetmeduni.ac.at

Kind regards,

Ludwig Huber

Offre de stage de l'INRAE St Gilles

 Le projet vise à évaluer l’impact d’un accès répété à une salle de « récréation » enrichie sur le comportement des truies gestantes élevées en groupe. L’objectif est de déterminer si l’accès répété à la salle enrichie tout en long de la gestation est une stratégie efficace pour améliorer le bien-être des truies dans un contexte d’élevage conventionnel. Le stage consisterait à des observations sur enregistrements vidéos des comportements de groupe de truies gestantes ayant accès ou non à cette salle.

Contacter Caroline Clouard - caroline.clouard@inrae.fr

2 PhD projects in deer - open to UK and international students

 We are advertising two fully funded PhD projects on red and fallow deer behaviour within the NERC DTP QUADRAT. The scholarship offers a stipend for 3.5 years and covers fees, including fees for international students. Interested students should contact the lead supervisor to discuss the project.

1. Sleep in the landscape of fear

Lead supervisor: Dr Isabella Capellini (I.CapelliniATqub.ac.uk)

Sleep is essential to health in all mammals, however we know nearly nothing about wild animals accommodate time for sleep over the 24 hours cycle. Using state of the art biologgers on wild red deer under risk of predation by wolf, this project investigate a long-standing question: how do animals alter their sleep time and pattern when under greater risk of predation? For full project description please see here.

2. The role of social phenotype in bystander behaviour during fallow deer fights

Lead supervisor: Dr Domhnall Jennings (D.JenningsATqub.ac.uk)

Contests and fights are widespread in animals since individuals need to secure resources for their own survival and reproductive success. In social species, life fallow deer, some individuals observe ongoing fights and may decide to intervene, disrupting those fights. This project will investigate how individuals' social networks influence their decision to intervene or not. For full project description please see here.

Deadline for applications: ***17th of January 2024*** .

How to apply: please see instructions in QUADRAT here.

PhD Opportunity: Sleep in the Landscape of Fear in Red Deer

A Ph.D. project opportunity in collaboration with our colleagues, focusing on sleep in the landscape of fear in red deer. 

The project is open for applications, and you can find more details here: https://www.quadrat.ac.uk/projects/sleep-in-the-landscape-of-fear/. The application deadline is Wednesday, January 17th. 

This opportunity is available to students and includes full coverage of fees and scholarships. The primary supervisor is Dr. Isabella Capellini from Quenn´s University Belfast, in collaboration with Luca Borger (University of Swansea), Miloš Ježek (Czech University of Life Sciences, Prague), and Oleg Lyamin (University of California, Los Angeles).

Two PhD opportunities: Social evolution in African wasps

 Love social evolution? Keen on fieldwork? Ready to brave the odd sting in the name of science?

We are looking to recruit two excellent and initiative-taking students to conduct PhDs in animal behaviour and evolution. You will conduct field experiments with social wasps across Africa to tackle open questions in the evolution of conflict and cooperation, based in the friendly and dynamic School of Biological Sciences at the University of Bristol (UK).

We are delighted that PhD opportunity 2 (see below) is part of the University of Bristol's new PhD Scholarship for UK home-fee students of Black or mixed Black heritage. For more information on this scholarship, please feel free to get in touch via email.
 
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PhD OPPORTUNITY 1 (open to applicants worldwide): “Social wasps across Africa: exploring how societies evolve at a continental scale”

A major goal amongst evolutionary biologists is to uncover the links between climate and cooperation. In this PhD, you will use the extraordinarily wide distribution of Africa’s Belonogaster wasps – which span the continent south of the Sahara – to investigate key links between climate and sociality.
 
To find out more about this project, see the project description at www.tinyurl.com/AfricanWasps and contact the lead supervisor at patrick.kennedy@bristol.ac.uk. This project is advertised as part of a competition-funded ‘Doctoral Training Partnership’ (DTP) in the UK, and will involve fieldwork, theory, and working with specimens at the Natural History Museum, London.
 
Deadline for DTP application: 9th January 2024 (contact the supervisor well before this deadline to discuss the project and your suitability)
 
Lead supervisor: Patrick Kennedy (Bristol)
Co-supervisors: Gavin Broad (Natural History Museum), Andy Higginson (Exeter), Andy Radford (Bristol), Stephen Montgomery (Bristol)
 
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PhD OPPORTUNITY 2 (Bristol Scholarship for UK students of Black or mixed Black heritage): “Power games in the wild: the social evolution of dominance”

Animal social groups are often profoundly unequal. In this PhD, you will explore how social power evolves and is maintained, and develop evolutionary theory to explain why different species and populations evolve to have radically different types of power structure. You will have a rare opportunity to combine evolutionary theory and fieldwork: you will develop theoretical models using both evolutionary game theory and computational simulations, and test predictions by devising creative behavioural experiments with social wasps at our field sites in Africa.
 
To find out more about this project, see the project description at www.tinyurl.com/WaspPower and contact the lead supervisor at patrick.kennedy@bristol.ac.uk. This project is advertised as part of the new competition-funded Bristol Scholarship for UK home-fee students of Black or mixed Black heritage.
 
Deadline for full application: 8th January 2024 (contact the supervisor well before this deadline to discuss the project and your suitability)
 
Lead supervisor: Patrick Kennedy (Bristol)
Co-supervisor: Stephanie King (Bristol)
 
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Entry requirements: The successful applicants will have a demonstrable passion for evolution and ecology. You must have a first or upper second-class degree (or international equivalent) in a discipline related to the PhD project. Applicants with additional relevant experience and/or a master's degree are strongly encouraged to apply.

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Patrick Kennedy, School of Biological Sciences, University of Bristol

https://tinyurl.com/BristolWaspsLab

Proposition de stage

 INTITULE DU STAGE : Impact de l’enrichissement sur le bien-être des vaches laitières Contexte et problématique : Malgré une intensification de l’élevage des animaux de ferme, les éleveurs souhaitent fournir un environnement approprié à leurs animaux en relation avec les futures exigences de conformité, tout en essayant de mieux comprendre les besoins des animaux et notamment leur bien-être. Nos projets se concentrent sur un objectif principal : améliorer les systèmes actuels de logement par l’enrichissement de l’environnement. Notre question de recherche principale concerne alors : comment enrichir l’environnement de la vache (enrichissement social ou environnemental par ex) pour améliorer son bien-être et mieux répondre à ses besoins comportementaux et ses attentes ? Pour parvenir à répondre à cette question, plusieurs réponses des animaux seront étudiées, notamment les aspects cliniques avec le confort thermique, l’analyse de la démarche par ex, et les aspects comportementaux avec la robustesse comportementale, les émotions etc. Objectifs généraux du stage / Résultats attendus : Volet clinique : Évaluer les aspects cliniques du bien-être comme la démarche des vaches et la température corporelle. Volet comportement : Mesurer les émotions (tests de réactivité par ex) et comportements (budget-temps) des vaches face à différentes formes d’enrichissement. Projet dans lequel s’insère le stage : Le stage fait partie de la programmation scientifique de la Chaire de recherche-innovation en Bien-être animal et Intelligence artificielle WELL-E. ACTIVITES DOMINANTES CONFIEES AU STAGIAIRE : - Préparation et participation aux expérimentations en cours au moment du stage - Utilisation de logiciels pour le codage des comportements (The Observer) ou des paramètres cliniques - Analyses à l’aide du logiciel R - Rédaction d’un compte-rendu de stage sous la forme d’un papier scientifique - Présentations orales lors de rencontres de laboratoire PROFIL REQUIS : - Connaissances : intérêt pour l’étude du comportement et du bien-être en élevage - Compétences opérationnelles : analyse de jeux de données et codage sous R - Langues : anglais, français (optionnel) - Permis de conduire (le cas échéant) : AVANTAGES PROPOSES (le cas échéant) : - bourse : 2000CAD/mois CO-ENCADREMENT SCIENTIFIQUE ET TECHNIQUE Partenaire 1 : Elsa Vasseur, Professeur, Université de McGill Partenaire 2 : Marjorie Cellier, Chercheuse post-doctorale, Université de McGill CONTACT DU RESPONSABLE SCIENTIFIQUE : Nom et fonction du responsable scientifique à contacter : Marjorie Cellier Adresse : Macdonald-Stewart Building, Macdonald Campus, 21111 Lakeshore Road, Ste Anne de Bellevue, QC, H9X 3V9, Canada Site web (équipe et/ou projet) : www.cowlifemcgill.com et www.well-e.org Email : marjorie.cellier@mcgill.ca DATES DU STAGE : Nombre de semaines à déterminer avec l’encadrante (attention, les demandes de visa peuvent prendre du temps) LIEU DU STAGE : Département des Sciences Animales, Université de McGill, Campus Macdonald, Ste Anne de Bellevue, QC, H9X 3V9, Canada

PhD position

PhD-position on measurements and modeling of noise in offshore windfarms

https://www.jobbnorge.no/en/available-jobs/job/253237/phd-research-fellow-in-environmental-impacts-underwater-noise-of-floating-offshore-wind-turbines

Funded PhD studentship on the UK pool frog reintroduction

 I'm recruiting a PhD student at Swansea University to use genomic and ecological techniques help boost the success of the reintroduction of pool frogs; the UK's rarest amphibian.

Reintroduction is a vital conservation tool, used to re-establish species following local extinction. However, only around 30% of reintroductions are successful, so a key priority is to understand how to boost success. We will work with project partners the Amphibian and Reptile Conservation (ARC) Trust and the Institute of Zoology (IOZ) to enhance the reintroduction of the pool frog (Pelophylax lessonae). This species was reintroduced to the UK in 2005 following extinction in the 1990s, and populations are breeding, although there are issues with small population sizes and breeding pool abandonment. This PhD will take a comprehensive approach to understanding reintroduction success, combining ecological, physiological and behavioural data (collected in the field with ARC) with health, disease and genomic data (collected in conjunction with IOZ). We will (1) investigate whether genomic diversity is stable or reducing in the reintroduced populations (2) investigate links between genomic diversity, reproductive fitness and health (3) explore how pool frogs use different habitats within the reintroduction sites and (4) establish how pool management techniques can boost breeding pool use. The results will directly inform ARC in genomic and habitat management strategies in UK pool frogs and will more broadly shape future reintroduction projects in the UK and globally.

Due to the funding requirements, we can only accept applications from students eligible for UK tuition fee rates (e.g. UK nationals or residents).

Application deadline: 8^th December 2023

Position starts: October 2024

Please see our website for more details and information on how to apply: https://www.swansea.ac.uk/postgraduate/scholarships/research/biological-sciences-sures-phd-informing-2024-rs464.php

Please contact Dr Hazel Nichols (h.j.nichols@swansea.ac.uk) if you'd like to discuss the position further.

Offre de stage

 Offre de stage M2 sur l'effet des liens sociaux sur la réponse aux chatouilles chez le bonobo (Labo ENES, St Etienne).

Nous proposons un stage M2 de 6 mois sur

L'EFFET DE LA FAMILIARITÉ SUR LA RÉPONSE AUX TICKLING À BONOBOS

Période approximative : janvier à juin 2024

Chez l'homme, les gros chatouilles induisent une réponse comportementale complexe qui inclut le retrait de l'acteur, l'abri des zones chatouilles, le tortillement et les rires incontrôlables. Une telle réponse est socialement modulée, car les chatouilles peuvent être perçues comme soit

agréable ou désagréable selon la qualité relationnelle partagée entre les joueurs.

Pour cette raison, chez notre espèce, les gros chatouilles ont été liés à l'émergence de la distinction de soi et de l'intersubjectivité primaire. Bien que de gros chatouilles aient été signalées chez les grands singes, ce comportement a reçu une attention rare et le peu d'informations disponibles se limite aux chimpanzés.

Le but de cette étude est d'étudier en bonobos (Pan paniscus) si la réponse aux chatouilles varie en fonction du niveau de familiarité qu'ils partagent avec le sujet qui effectue une telle action ludique, en informant éventuellement de la présence/l'étendue des capacités intersubjectives chez cette espèce. Une importance particulière sera accordée à l'expression des signaux communicatifs (par exemple, gestes, expressions faciales, vocalisations).

Plus précisément, le stagiaire abordera la question de recherche suivante :

LA RÉPONSE DE BONOBOS AUX TICKLINS EST-ELLE AFFECTÉ PAR LA FORCE DU LIEN SOCIAL ?

Le candidat retenu sera basé au laboratoire de recherche en bioacoustique ENES, Université Jean Monnet, Saint-Etienne ( https://www.eneslab.com ). Le travail consistera à coder de

enregistrements vidéo et audio qui ont été collectés au sanctuaire Lola ya Bonobo (Kinshasa, RD Congo) à l'été 2023. Le stagiaire développera des compétences en observation éthologique (BORIS

logiciel) du comportement social et de la bioacoustique (logiciel PRAAT).

Nous recherchons un étudiant hautement motivé, patient et méticuleux (le codage vidéo et audio peuvent être difficile ! ).

Ce stage fait partie du "JOUONS ! ” projet financé par le LabEX ASLAN du CNRS - Université de Lyon.

Plus d'infos ici : https://aslan.universite-lyon.fr/projet-let-s-play-245355...

Cette offre durera jusqu'à ce qu'un bon candidat soit trouvé. Alors n'attendez pas pour postuler. Premier arrivé, premier servi !

Pour les candidats intéressés, veuillez envoyer votre CV et lettre de motivation par e-mail aux deux : - Elisa Demuru : elisa.demuru@cnrs.fr

- Florence Levréro : florence.levrero@univ-st-etienne.fr

PhD - Mapping the happy brain

PhD that is available with Alistair Lawrence and his group at Edinburgh / SRUC.

'Mapping the happy brain' https://www.findaphd.com/phds/project/eastbio-mapping-the-happy-brain-brain-activation-in-response-to-positive-emotional-states-in-the-rat/?p161236

Job

 We're looking for a new Research Technician to work in a team based at the National Pig Centre, one of the UK’s leading research intensive Universities.

The NPC is the UK’s largest and most advanced facility for research into pig nutrition, behaviour, health & health and production systems.

 

Apply here:  https://jobs.leeds.ac.uk/vacancy.aspx?ref=FBSBY1181

Proposition de stage libre / Césure niveau Licence 3 – Master

 Titre du stage : "Capacités attentionnelles visuelles des enfants et adolescents avec et sans Trouble du Spectre de l’Autisme (TSA) en présence d’animaux : approche comportementale et eye-tracking". En collaboration avec les associations Handi’Chiens et Umanima, financé par la Fondation Pierre et Adrienne Sommer. Périodes : 11 mars au 10 mai 2024 Date de fin des candidatures : 12/12/2023 Encadrantes : Manon Toutain (Doctorante), Dr Marine Grandgeorge (Maitre de conférences), Dr Laurence Henry (Maitre de conférences) Structure de recherche : Laboratoire Ethos, Station biologique de Paimpont Numéro de téléphone : 02.99.61.81.59 (Manon Toutain) Adresse : Laboratoire Ethos, Station biologique de Paimpont Lieu du stage : Laboratoire Ethos, Station biologique de Paimpont, LD Beauvais, 35380 Paimpont Résumé du stage : Ce projet s’inscrit dans les recherches menées par l’équipe CIRCE sur la compréhension des mécanismes impliqués dans les interactions Homme-Animal, et plus précisément dans le cadre d’un projet de doctorat qui vise à mieux comprendre l’attention visuelle des enfants et adolescents sur des cibles humaines et animales. L’attention visuelle joue un rôle clé dans le développement d’un individu (mémoire, apprentissage, imitation, représentation du monde), particulièrement dans ses interactions sociales et pseudo-sociales (reconnaissance des émotions, perception d’autrui). Le stage proposé est une étude de l’attention visuelle d’enfants et d’adolescents, lors de rencontres avec différentes espèces animales. La caractérisation de l’exploration visuelle d’une face animale et humaine au cours d’une rencontre n’a jamais encore été étudiée bien qu’essentielle dans la compréhension de l’information faciale. Le stage consistera à caractériser l’attention visuelle de deux groupes d’enfants et d’adolescents dans différents contextes à l’aide d’une approche comportementale doublée d’eyetracking embarqué. Mission du stage : Le stage ne comporte pas de terrain et repose sur une analyse d’une base de données déjà récoltée. Il s’agira majoritairement de codage comportemental de vidéos préexistantes (via The Observer) et de codage de données eye-tracking (Tobii). Frais pris en charge : Matériel fourni par le laboratoire et frais de mission s’il y en a. Les autres frais seront à assurer par l’étudiant. Profil candidat (e) : - Rigueur et minutie dans les analyses. - Capacité à rester concentré sur un écran pendant plusieurs heures, les tâches de codage sont répétitives. - Formation en éthologie, biologie, ou biostatistique requise - Maitrise du logiciel R appréciée. - Connaissances en eye-tracking et sur le logiciel The Observer sont un atout mais non nécessaires. - Permis de conduire et voiture conseillée (compte tenu du lieu de stage). Candidature : Adressez un CV et une lettre de motivation par e-mail avant le 15/10/2023 à manon.toutain@univ-rennes.fr ; marine.grandgeorge@univ-rennes.fr et laurence.henry@univ-rennes.fr Publications: Correia‐Caeiro, C., Lawrence, A., Abdelrahman, A., Guo, K., & Mills, D. (2022). How do children view and categorise human and dog facial expressions?. Developmental Science, e13332. Grandgeorge, M., Degrez, C., Alavi, Z., & Lemonnier, E. (2016). Face processing of animal and human static stimuli by children with autism spectrum disorder: a pilot study. Human-Animal Interaction Bulletin, 4(2), 39-53. Guillon, Q., Hadjikhani, N., Baduel, S., Kruck, J., Arnaud, M., & Rogé, B. (2014). Both dog and human faces are explored abnormally by young children with autism spectrum disorders. Neuroreport, 25(15), 1237-1241. Dollion, N., Toutain, M., François, N., Champagne, N., Plusquellec, P., & Grandgeorge, M. (2021). Visual exploration and observation of real-life interactions between children with ASD and service dogs. Journal of Autism and Developmental Disorders, 51(11), 3785-3805

Offre de stage visant préférentiellement un ou une stagiaire niveau M1

 Intitulé du stage : reconnaissance de soi chez le Diamant Mandarin (Taeniopygia guttata) Durée du stage : 2 mois, avril-mai 2024 Lieu du stage : Laboratoire Ethologie Cognition Développement, Université Paris Nanterre, 200 avenue de la République, 92000 Nanterre Encadrant du stage : Sébastien Derégnaucourt Détails du stage : la reconnaissance de soi est une composante importante de la conscience chez les animaux. La diffusion du propre chant de l’oiseau (« Bird’s Own Song » : BOS) est couramment utilisée en neuro-éthologie pour identifier les bases cellulaires et moléculaires du contrôle neural du chant chez les oscines. Au cours d’une expérience de conditionnement opérant visant à étudier les bases de la reconnaissance individuelle chez le Diamant Mandarin, nous avons entrainé des mâles à discriminer des chants familiers (produits par des individus du groupe social) de chants non familiers (produits par des individus inconnus pour les sujets). Nous avons ensuite testé la réponse des oiseaux pour leur propre chant et observé que la majorité d’entre eux a considéré le BOS comme un stimulus familier. Le but de cette étude est de mesurer la préférence de mâles de Diamant Mandarin pour leur propre chant. Les oiseaux seront placés dans une cage individuelle et auront la possibilité de contrôler la diffusion de leur propre chant et d’un autre stimulus grâce à une procédure automatisée. Au cours de ce stage, la personne recrutée devra réaliser des expériences avec des oiseaux en laboratoire. Elle sera initiée à l’analyse d’enregistrements audio et vidéo. Elle devra être motivée, rigoureuse, et avoir une bonne capacité d’organisation et de travail en autonomie. Merci d'envoyer CV, lettre de motivation, et relevé de notes à : Sébastien Derégnaucourt : sebastien.deregnaucourt@parisnanterre.fr

Offre de Stage M2

 We are offering a 6-month M2 internship on THE EFFECT OF FAMILIARITY ON THE RESPONSE TO TICKLING IN BONOBOS Approximate period: January to June 2024 In humans, heavy tickling induces a complex behavioural response that includes withdrawing from the actor, sheltering the ticklish areas, wriggling and laughing uncontrollably. Such response is socially modulated as tickling can be perceived as either pleasant or unpleasant depending on the relationship quality shared between the players. For this reason, in our species, heavy tickling has been linked to the emergence of self-other distinction and primary intersubjectivity. Although heavy tickling has been reported in great apes, this behaviour has received scarce attention and the little information available is restricted to chimpanzees. The aim of this study is to investigate in bonobos (Pan paniscus) whether the response to tickling varies as a function of the level of familiarity they share with the subject performing such playful action, possibly informing about the presence/extent of intersubjective abilities in this species. Particular importance will be given to the expression of communicative signals (e.g., gestures, facial expressions, vocalizations). More specifically, the trainee will address the following research question: IS BONOBOS’ RESPONSE TO TICKLING AFFECTED BY THE STRENGTH OF THE SOCIAL BOND? The successful candidate will be based at the ENES Bioacoustics Research Lab, Université Jean Monnet, Saint-Etienne (https://www.eneslab.com). The work will consist in coding of video and audio recordings that were collected at the Lola ya Bonobo sanctuary (Kinshasa, DR Congo) in summer 2023. The trainee will develop skills in ethological observations (BORIS software) of social behaviour and bioacoustics (PRAAT software). We are seeking for a highly motivated, patient and meticulous student (video- and audiocoding can be challenging!). This internship is part of the “LET’S PLAY!” project funded by the LabEX ASLAN of the CNRS - University of Lyon. More info here: https://aslan.universite-lyon.fr/projet-let-s-play245355.kjsp This offer will run until a good candidate is found. So don't wait to apply. First come, first served! Any interested candidates, please email your CV and letter of motivation to both: - Elisa Demuru: elisa.demuru@cnrs.fr - Florence Levréro: florence.levrero@univ-st-etienne.fr Feel free to distribute widely

Post doc en Suisse

 a postdoc (2 years, 100%), in case you know any suitable candidate. The project is on the use of oxytocin to explore positive welfare in pigs!

Here is the link to the add https://www.jobs.ethz.ch/job/view/JOPG_ethz_WXJnKkS37jLaPFE861

PhD position, United Kingdom (deadline December 01)

 4-year PhD Studentship: Assessing long-lasting pain following hot-iron disbudding in dairy calves

Bristol Veterinary School, University of Bristol

Bristol, United Kingdom

Although freedom from pain is a key pillar of animal welfare, painful procedures are still common on most dairy farms. For instance, despite being painful, hot-iron disbudding is still performed on the vast majority of calves. Although the procedure may be performed in a way that limits intra-operative pain (using a combination of anaesthetics and analgesics), recent reports suggest that calves may experience pain for days or weeks after the procedure. However, limited information is yet available on the long-term emotional impact of the procedure and on ways to mitigate it. This PhD project will therefore aim to 1) develop the tools to assess the emotional component of long-lasting pain and 2) develop new ways to tackle pain over long periods of time. For this, we will develop methods based on pain relief as animals are expected to work to access pain relief solutions if they experience pain. These will include novel explorations of the use of cold therapy as a means of providing non-pharmaceutical pain control. We expect that this project will deepen our understanding of what calves’ experience after hot-iron disbudding and contribute to inform on potential innovative and low-cost solutions to tackle the pain.

Supervisors: Mike Mendl (primary supervisor), Benjamin Lecorps

PhD position, United Kingdom (deadline December 01) (applied-ethology.org)

Two fully funded PhD scholarships

Two fully funded PhD scholarships to come work with me and my team, the British Carnivore Project, here in the Psychology department at the University of Hull. Both projects will be looking at the relationships between wild animal psychology, human-wildlife interactions, and environmental issues in the UK and beyond (e.g., biodiversity crisis and climate change).

The first scholarship (Ocean Literacy) will compare terrestrial carnivores and sharks, while the second scholarship (Leverhulme) will focus exclusively on terrestrial carnivores (e.g., foxes, badgers, pine martens). Both projects will involve fieldwork to understand wild animals' relationship with water, and human surveys/interviews to understand public attitudes and engagement with the natural world.  

PhD Scholarship 1: https://www.hull.ac.uk/study/postgraduate/research/phd/funded/using-animal-psychology-to-promote-pro-environmental-attitudes-and-enhance-wider-ocean-literacy

PhD Scholarship 2: https://www.hull.ac.uk/study/postgraduate/research/phd/funded/leverhulme-doctoral-scholarships-centre-for-water-cultures-animal-psychology

For more information about the British Carnivore Project, please visit: https://www.blakemorton.co.uk/case-studies/

For all inquiries, please email me directly at b.morton@hull.ac.uk  

Offre de stage M2 ou équivalent – CHICKENRUN - Liens entre les capacités cognitives précoces des poussins et l’exploration ultérieure de leur environnement dans les systèmes d'élevage en plein air + possibilité de 2 mois de CDD

 Titre : Liens entre les capacités cognitives précoces des poussins et l’exploration ultérieure de leur environnement dans les systèmes d'élevage en plein air Laboratoire d’accueil : INRAE Nouzilly Lieu de stage : INRAE Magneraud Encadrants : Vitor Ferreira (Chargé de Recherche, INRAE Nouzilly), Karine Germain (Ingénieur de recherche, INRAE Magneraud), Ludovic Calandreau (Directeur de Recherche, INRAE Nouzilly) et Vanessa Guesdon (Enseignante-chercheuse JUNIA) Durée : 6 mois de stage (entre mi-février/début mars et mi-août/fin août 2024) + possible CDD de 2 mois (entre mi-août et mi-octobre 2024) Contexte et objectif : La forte demande sociétale pour de meilleures conditions de vie des animaux d'élevage pousse de plus en plus l’élevage vers le développement de systèmes tels que l’élevage plein air, considéré comme plus respectueux du bien-être animal. Cependant, il est important de garder à l'esprit que, bien que l'offre d'un accès extérieur (parcours), puisse avoir un réel intérêt pour le bien-être des animaux (par exemple, en permettant des comportements plus naturels, tels que le fourragement et le bain de poussière, et en donnant aux animaux plus de choix, comme celui de rester à l'intérieur ou à l'extérieur du bâtiment d’élevage), cette offre ne garantit pas que tous les animaux utiliseront cet espace de manière homogène. Pour les poules pondeuses et poulets de chair élevés en plein air, l'utilisation du parcours peut varier de 15% à 87% des individus du lot qui utilisent effectivement l'espace. En effet, il est connu que certains individus ne quittent jamais le bâtiment d’élevage, même s'ils en ont la possibilité. Si la densité (nombre d'individus/m2) dans le bâtiment d’élevage est maintenue à des niveaux élevés au fil du temps, elle peut devenir une source de divers problèmes de santé et de comportement, tels qu'un risque augmenté de parasitisme et de picage de plumes entre les individus. Des études réalisées dans nos dispositifs expérimentaux ont montré que les poulets de chair qui utilisent le moins le parcours (low rangers) ont une perception et des performance cognitives différentes comparés aux poulets qui utilisent le plus le parcours (high rangers). En effet, les low rangers ont une meilleure mémoire spatiale et sont plus aptes à inhiber les réponses comportementales impulsives que les high rangers. De plus, ces différences comportementales interindividuelles semblent être présentes dès le plus jeune âge et montrent une consistance intra-individuelle au cours du cycle de production : les poussins qui fourragent plus, avant l'accès au parcours, utilisent davantage le parcours plus tard, au cours de leur vie, par rapport aux poussins qui fourragent moins. Bien que ces résultats soient intéressants pour une meilleure compréhension de la façon dont les poulets élevés en plein-air perçoivent leur environnement physique (et la relation entre cette perception et l’utilisation du parcours), ils sont principalement basés sur des tests individuels et ne prennent pas en compte les influences sociales que les poulets ont les uns sur les autres. Afin de mieux comprendre la relation entre comportement, cognition et utilisation du parcours, les objectifs de ce stage sont de 1) comprendre si et comment la variation interindividuelle de l'utilisation du parcours est liée à la dynamique sociale des individus et 2) approfondir l'étude de la cognition sociale au niveau individuel, en se focalisant sur comment les oiseaux les plus et les moins explorateurs du parcours interprètent les informations sociales. Lieu d’accueil du stagiaire : Ce projet est un projet collaboratif entre l’Unité Expérimentale Systèmes d’Elevage Avicoles Alternatifs (EASM) d’INRAE du Magneraud (17), l’équipe de recherche CEB (Cognition, Ethologie, Bien-être animal) d’INRAE de Nouzilly (37), et l’équipe de recherche CASE (Comportement Animal et Systèmes d’Elevage) de JUNIA (59). Le stagiaire passera tout son temps à Surgères (40 km de la Rochelle, INRAE du Magneraud). • L’Unité Expérimentale Systèmes d’Elevage Avicoles Alternatifs (EASM) de l’INRAE située au Magneraud (17) met en place des expérimentations dans le cadre d'actions d'appui à la recherche, avec une attention renforcée vis-à-vis des programmes se rapportant aux modes d’élevage alternatifs chez les volailles (personne impliquée Karine Germain). • L’équipe de recherche CEB (Cognition, Ethologie, Bien-être animal) d’INRAE de Nouzilly (37) étudie les processus mentaux impliqués dans les émotions, la relation homme-animal et les capacités d’apprentissage des animaux domestiques (personnes impliquées Vitor Ferreira et Ludovic Calandreau). • L’équipe de recherche CASE (Comportement Animal et Systèmes d’Elevage) de JUNIA (59) a pour objectif entre autres, par ses activités de recherche, de participer à l’amélioration de la prise en compte des besoins et du comportement des animaux dans la gestion des élevages et la conception des bâtiments (personne impliquée Vanessa Guesdon). Mission / aspects pratiques : Le/la stagiaire sera en charge du développement des protocoles expérimentaux pour l’exécution des tests cognitifs/comportementaux. Le/la stagiaire devra s’occuper de toutes les phases d’un projet scientifique : recherche bibliographique, appropriation de l’expérience via la littérature, création du protocole expérimentale, mise en œuvre l’expérience, collecte et analyses de données et rédaction d’un mémoire. Conditions : Stage d’une durée de 6 mois avec un démarrage entre mi-février/début mars 2024. Le/la stagiaire sera localisé à Surgères (40 km de la Rochelle). Stage indemnisé selon la législation en vigueur. Selon la disponibilité, l’INRAE du Magneraud peut proposer des logements type chambre individuelle avec cuisine, douche, sanitaires et espaces communs (prix≈ 5 euros par nuit). Un CDD de 2 mois peut être envisagé à la suite du stage. Profil recherché : étudiant/e en cinquième année (niveau M2) cursus universitaire ou d’école agri/agro/véto. Intérêt pour la recherche et les thématiques du bien-être des animaux d’élevage et/ou du comportement animal. Bonnes capacités d’analyse, rédactionnelles (français et anglais) et statistiques. Impératif d’interagir et manipuler les animaux calmement et délicatement. La/le stagiaire participera à des tests demandant des efforts physiques éprouvants pour le dos, les jambes et les bras. Permis de conduire B nécessaire. Véhicule personnel est recommandé. Contact : Pour plus d’information ou pour envoyer votre candidature (lettre de motivation et cv): Vitor Ferreira (vitor.ferreira@inrae.fr). Les candidatures sont ouvertes jusqu'à ce que le stage soit pourvu

PhD: The Interplay of Memory and Cooperation, University of St Andrews

 We have an open 4-year PhD position on the cognitive mechanisms of cooperation in rats at the University of St Andrews. Further information and details about how to apply can be found in the link: https://www.findaphd.com/phds/project/eastbio-recollections-and-reciprocity-the-interplay-of-memory-and-cooperation/?p161511.

The application deadline is 27 November 2023.

Internship at the Max-Planck-Institute for Biological Intelligence, campus Seewiesen, (Germany) on behavioural plasticity in courtship behaviour in ruffs (Calidris pugnax).

We are looking for a student/intern to join our team at the Max-Planck-Institute for Biological Intelligence under the supervision of Dr. Clemens Küpper (team leader) and Dr. Giovanni Spezie (postdoc). The project focuses on the courtship behaviour of a captive population of ruffs (Calidris pugnax) held at our facilities. Ruffs are a unique and fascinating model system for the study of courtship behaviour, as male ruffs exhibit three morphs with distinct phenotypes and reproductive strategies (Independent, Satellite, Faeder males). The aim of the project is to investigate whether the social environment plays an important role in regulating the expression of courtship behaviours of the three male reproductive morphs in this species.

 

Duration: 2-3 months; start date should be no later than 25^th-30^th April 2024.

Activities: the intern will participate in an experiment that will take place between April and July 2024 at the Seewiesen campus (Eberhard-Gwinner-Straße, 82319 Starnberg, Germania). The intern will be trained to handle the birds, release them into the experimental units, operate the synchronized video-camera system to record their courtship behaviour and social interactions in the aviaries. It is highly recommended that the student stays at the guesthouse of the campus, as the experiments start early in the day (6:00 am) in order to release the birds into the experimental units, as connections via public transport is not available in the early morning. Experimental activities are however limited to the morning hours.

Costs: the expenses for travel and accommodation will have to be covered by the intern. We do however encourage the candidate to apply for funding through the Erasmus program.

Requirements: there are no particular requirements; prior experience with bird handling is preferred.

 

In case of interest, please contact and send a brief CV to: Giovanni Spezie; giovanni.spezie@vetmeduni.ac.at

 

 

 

 

 

 

Internship with possibility of thesis on elaborate courtship displays in the spotted bowerbird at the University of Vienna.

We are looking for a master’s student to join our team at the University of Vienna under the supervision of Prof. Leonida Fusani (team leader), Morgan Job Knoester (PhD candidate) and Giovanni Spezie (postdoc). The project focuses on the elaborate movements and postures that male spotted bowerbirds (Chlamydera maculata) perform during courtship displays. The aim of the project is to analyse video recordings that have been collected in previous field seasons.

 

Duration: 2-4 months; start date is negotiable.

Activities: the intern will have to use AI-based techniques to track body movements of male birds during courtship, in order to address research questions related to social learning, but the intern will also have the opportunity to develop research questions independently. The analyses will be conducted using the software Loopy (http://loopb.io, Loopbio, GmbH, Austria), a kit of video analysis tools including behavioural scoring, deep learning, etc. The intern will be trained to use Loopy and other video analysis software before working on video processing and analysis autonomously.

Costs: the expenses for travel and accommodation will have to be covered by the intern. We do however encourage the candidate to apply for funding through the Erasmus program.

Requirements: Good knowledge of R is required. The intern will have to process and analyze large datasets independently in R. Prior experience with AI-based techniques is not necessary but preferred.

 

In case of interest, please contact and send a brief CV to: Giovanni Spezie and Morgan Job Knoester; giovanni.spezie@vetmeduni.ac.at; job.knoester@univie.ac.at