Proposition de stage M1 ou M2 Césure (2 mois)

 

Analyse comparative des comportements épimélétiques chez les animaux à partir de vidéos

Encadrant·e·s

Marie Pelé & Cédric Sueur

Structures de recherche

• Institut Catholique de Lille, Laboratoire ETHICS EA7446, équipe Anthropo-Lab
• DEPE, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg – CNRS

Intitulé du stage

Analyse comparative des comportements épimélétiques chez les animaux à partir de vidéos

Contexte scientifique

Lorsqu’un animal est inconscient, blessé ou vient de mourir, ses congénères peuvent adopter des comportements particuliers à son égard : toilettage, contact physique, garde, exploration, transport, protection, vocalisations, tentatives de réanimation ou encore comportements post-mortem.

Ces comportements, parfois regroupés sous le terme de comportements « épimélétiques », sont documentés chez de nombreuses espèces animales. Ils soulèvent des questions importantes sur la vie sociale, les mécanismes de reconnaissance de l’état d’un congénère, la réponse à la détresse et, plus largement, sur la manière dont les animaux perçoivent et réagissent à la mort ou à la perte d’un partenaire social.

Une première phase de collecte participative a permis de constituer une base de données comprenant actuellement environ 180 vidéos provenant de nombreuses espèces animales, incluant notamment des mammifères, des oiseaux et d'autres groupes zoologiques. Les vidéos proviennent de sources publiques en ligne et documentent des situations variées.

Le stage proposé consiste à exploiter cette base afin de réaliser une première analyse comportementale et comparative.

Objectifs du stage

L’objectif principal sera de caractériser systématiquement les comportements observés dans les 180 vidéos et de rechercher des régularités entre espèces.

Le ou la stagiaire devra notamment :

• visionner et coder les vidéos selon une grille comportementale définie avec les encadrants ;
• identifier les différents types d’interactions dirigées vers le congénère inconscient, blessé ou décédé ;
• relever les caractéristiques de la situation : état apparent du congénère, durée de l’interaction, nombre d’individus impliqués, proximité sociale lorsque celle-ci est identifiable, contexte de l’événement, etc. ;
• distinguer les comportements dirigés vers un individu vivant mais incapacitated, blessé ou inconscient, de ceux observés après la mort ;
• documenter la séquence temporelle des comportements lorsque cela est possible ;
• renseigner et contrôler une base de données standardisée ;
• réaliser des analyses descriptives et, selon l’avancement du stage, des analyses comparatives entre espèces ou groupes taxonomiques.

Une attention particulière sera portée à la reproductibilité du codage et à la distinction entre ce qui est directement observable dans la vidéo et les interprétations possibles du comportement.

Méthodes

Le stage reposera principalement sur l’analyse comportementale de vidéos.

Le ou la stagiaire sera formé·e à une grille de codage permettant de caractériser les comportements observés de manière standardisée. Des outils d’analyse vidéo et de gestion de données pourront être utilisés selon les besoins du projet.

Les données pourront ensuite être analysées statistiquement afin d'examiner, par exemple, la diversité des comportements observés, leur fréquence relative, leur association avec certains contextes ou leur répartition entre groupes taxonomiques.

Le stage pourra également contribuer à la préparation d’une future publication scientifique portant sur la diversité des comportements épimélétiques dans le règne animal.

Profil recherché

Stage ouvert en priorité aux étudiant·es de Master 1 en éthologie, comportement animal, biologie, écologie, neurosciences, sciences cognitives ou disciplines proches.

Nous recherchons une personne :

• intéressée par le comportement animal et les approches comparatives ;
• ayant un intérêt pour l’observation et l’analyse de vidéos ;
• rigoureuse et attentive dans le codage de données ;
• à l’aise avec les outils informatiques et la gestion de bases de données ;
• disposant idéalement de premières connaissances en statistiques ;
• capable de travailler de manière autonome tout en échangeant régulièrement avec les encadrants.

Une expérience préalable en éthologie ou en analyse comportementale constitue un avantage, mais n’est pas indispensable.

Conditions du stage

Durée : 2 mois

Période : entre janvier et juin 2027, selon les disponibilités du/de la stagiaire et des encadrants.

Lieu : Anthropo-Lab, Laboratoire ETHICS EA7446, Institut Catholique de Lille, 14 boulevard Vauban, 59000 Lille.

Gratification : stage d’une durée inférieure à deux mois, sans gratification obligatoire.

Convention de stage : convention établie avec l’Anthropo-Lab / Institut Catholique de Lille.

Permis de conduire ou véhicule : aucune exigence particulière.

Candidature

Les candidat·es intéressé·es sont invité·es à envoyer un CV et une lettre de motivation à :

Marie Pelé — marie.pele@univ-catholille.fr
Cédric Sueur — cedric.sueur@iphc.cnrs.fr

Merci d’indiquer dans l’objet du message : Candidature stage – comportements épimélétiques.

Encadrement

Marie Pelé
Université Catholique de Lille — Laboratoire ETHICS EA7446, Anthropo-Lab

Cédric Sueur
Professeur des Universités, IPHC, Université de Strasbourg – CNRS
Membre de l’Institut Universitaire de France (IUF)

Stage

Date : 08/10/2026
Offre de stage
« Évaluation du bien-être des chèvres laitières en élevages commerciaux : comparaison entre élevages en bâtiment sans accès extérieur et élevages disposant d’une aire d’exercice » (H/F)
Période du stage Stage conventionné de 6 mois, à temps plein
A pourvoir en janvier-février 2027
Localisation Niort (79000)

DESCRIPTION DU STAGE

Entité d’accueil
Le laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort (212 agents) concourt à l’amélioration i) de la santé et du bien-être des volailles, des lapins, des porcs (site de Ploufragan) et des ruminants (site de Niort) ii) de la sécurité sanitaire des aliments qui en sont issus, et iii) de la santé des poissons d’élevage (site de Plouzané).
L’unité PBER, site de Niort, est composée de 18 personnes comprenant 6 scientifiques et 6 techniciens. Elle conduit des activités de recherche centrées sur ces pathologies mais aussi sur l’accompagnement des évolutions des conditions d’élevage et sur le bien-être des petits ruminants. Les travaux menés visent en particulier à raisonner l’utilisation des antiparasitaires pour ralentir l’apparition et la diffusion des parasites résistants.
Objectif et tâches
L’accès à l’extérieur est aujourd’hui encouragé par la société au sein de la filière caprine car il favoriserait l’expression d’un répertoire comportemental plus riche et le bien-être des animaux. Toutefois, l’accès extérieur introduit aussi des défis majeurs (ex. exposition climatique, parasitisme, variations alimentaires, compétition sociale) et l’impact réel sur le bien-être, la santé et les performances reste insuffisamment documenté, en particulier chez la chèvre laitière.
Ce stage s’inscrit dans le cadre du projet WELLFEST du PEPR (Programme et Equipement Prioritaire de Recherche) Elevages Durables (https://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/fr/pepr-elevages-durables-un-programme-pour-accompagner-la-transition-101374). Vous rejoindrez le consortium Goat Out ! qui étudie les bénéfices et inconvénients de l’utilisation d’aires d’exercice en élevage caprin et qui est co-piloté par l’Anses et INRAE (UMR Herbivores, UMR MoSAR, UE FERLUS et UE P3R).
Dans ce contexte, l’étudiant(e) participera à une étude de terrain à grande échelle menée dans des élevages commerciaux caprins, visant à évaluer les bénéfices et les risques associés à l’accès à une aire d’exercice sur le bien-être des chèvres, en comparaison avec des chèvres élevées en bâtiment sans accès extérieur. Pour cela, il/elle réalisera des mesures du comportement des chèvres et évaluera par des indicateurs leur bien-être et leur santé. Il/elle pourra également participer aux entretiens réalisés avec les éleveuses et éleveurs.
Les tâches suivantes lui seront confiées :
- Réalisation d’une étude bibliographique
- Participation à la construction de l’éthogramme
- Préparation des protocoles et fiches de suivi
- Réalisation des observations comportementales sur le terrain
- Participation à l’évaluation du bien-être et de la santé des animaux
- Participation aux entretiens avec les éleveuses et éleveurs
- Analyses statistiques des données
- Rédaction d’un rapport de stage
Conditions
• Encadrement : Anissa Jahoui (post-doctorante - Anses), Marianne Berthelot (chargée de projet - Anses) et Valentin Brunet (ingénieur de recherche – INRAE UMR Herbivores)
• Localisation à Niort (Deux-Sèvres)
• Gratification
• Prise en charge des frais de déplacement
PROFIL RECHERCHÉ
Diplôme en cours Etudiant(e) en éthologie ou ingénieur agronome ou vétérinaire en dernière année d’études (équivalent Master 2 ou thèse d’exercice) ou profil Master 2 équivalent, ou étudiant(e) en césure.
Compétences
• Connaissances et intérêt marqués pour le comportement et le bien-être animal ; une expérience en observation comportementale serait un plus
• Intérêt pour le milieu de l’élevage
• Appétence pour le travail de terrain, impliquant des déplacements fréquents dans les élevages
• Rigueur et autonomie (grande capacité de concentration et d’observation nécessaire)
• Patience (pour la manipulation d’animaux et pour des longues périodes d’observations)
• Bon contact avec les animaux (une expérience avec les chèvres est un plus)
• Capacité d’écoute et sens de la communication
• Maitrise du logiciel R et des outils statistiques
• Capacité rédactionnelle
• Intérêt pour le travail en équipe
• Permis de conduire indispensable.
POUR POSTULER
Date limite de réponse : 02/11/2026
Renseignements sur le stage :
Anissa Jahoui, Anses, post-doctorante (anissa.jahoui@anses.fr)
Adresser les candidatures par courriel (lettre de motivation + cv) en indiquant la référence Stage-2027 à : Anissa Jahoui (anissa.jahoui@anses.fr) et Marianne Berthelot (marianne.berthelot@anses.fr)
Bibliographie en lien avec le sujet :
Berthelot, M., et al., 2024. Welfare Issues in Goat Farming and Management. In The Welfare of Goats (pp. 173-235). Cham: Springer Nature Switzerland.
Brunet, V., et al., 2025. Review - Restricted access to pasture and inadequate grazing in ruminants and equines.EURCAW Ruminants & Equines. https://doi.org/10.5281/zenodo.15698776
Negretti, P., et al., 2020. Effect of additional outdoor yard on behaviour of lactating domestic goats (Capra hircus) in different seasons. J Ethol 38, 61–69. https://doi.org/10.1007/s10164-019-00623-4

Offre de stage

 OFFRE DE STAGE – Suivi et télémétrie des oiseaux d’eau hivernants
Contexte
Bretagne Vivante – SEPNB - CEN Bretagne est une association loi 1901 œuvrant dans le domaine de la protection de la nature et de l'environnement sur les cinq départements de la Bretagne historique. Association de 3 000 membres, elle emploie plus de 80 salariés et gère plus d'une centaine de réserves dont 4 réserves naturelles nationales et 2 régionales. L'association conduit depuis plus de 60 ans de nombreux travaux de connaissances, d'expertise et de gestion sur les milieux naturels de Bretagne et développe une éducation populaire à la nature ainsi que des formations professionnelles.
Une équipe salariée de chargés de projets, de gestionnaires de réserve, d'éducateurs à la nature et d'administratifs ainsi que plusieurs centaines de bénévoles animent aujourd'hui ces actions sur l'ensemble du territoire.
Dans le cadre du programme FONPAL – Fonctionnalité des espaces protégés pour les anatidés et limicoles hivernants et migrateurs, la Réserve naturelle des marais de Séné recherche un(e) stagiaire pour participer au suivi des oiseaux d’eau hivernants dans le golfe du Morbihan. Le programme vise notamment à mieux comprendre l’utilisation des différents habitats par les limicoles et anatidés au cours de leur hivernage, à partir de données de terrain et de télémétrie.
Les suivis et dénombrements concernent l’ensemble des oiseaux d’eau, tandis que la télémétrie cible les espèces suivantes : Chevalier gambette, Huîtrier pie, Pluvier argenté, Barge à queue noire, Vanneau huppé, Courlis cendré, Bernache cravant, Sarcelle d’hiver, Canard siffleur, Canard pilet. 

Missions
Le stage sera principalement consacré au travail de terrain, avec comme missions principales :
 Contribuer aux opérations de capture, baguage et équipement d’oiseaux (filets verticaux, canon-net et autres méthodes variées adaptées aux espèces et aux sites).
 Préparer le matériel de captures et d’équipement (GPS, harnais, bagues) ;
 Participer aux comptages d’oiseaux d’eau et autres suivis de terrain ;
 Saisir et organiser les données collectées.
Le travail de terrain implique des sorties en journée et durant la nuit, en particulier au moment des lunes noires (nouvelles lunes). Les déplacements sont prévus dans le golfe du Morbihan (moins 1h de déplacement en général), en voiture et en bateau pour accéder aux îles du golfe. Pour un(e) stagiaire intéressé(e) par l’analyse de données, il est possible de réaliser un rapport de stage à partir des données de télémétrie. Le programme dispose déjà d’un jeu de données conséquent permettant d’aborder différentes thématiques liées à l’écologie spatiale des espèces étudiées. Le sujet pourra être défini en fonction des intérêts du/de la stagiaire et des données disponibles.
Profil recherché
 Bac+2 minimum
 Bonne connaissance de l’avifaune, notamment des oiseaux d’eau
 Titulaire du permis B
 Expérience dans la manipulation d’oiseaux appréciée
 Goût pour le travail de terrain et aptitude au travail en équipe
Conditions
 Durée : 2 à 4 mois
 Période indicative : novembre 2026 à février 2027 (dates flexibles)
 Lieu : Séné (56) – Réserve Naturelle des marais de Séné
 Indemnité de stage : Gratification légale (environ 4,35 € / heure en 2026)
 Mise à disposition d'un bureau et du matériel informatique nécessaire
 Accès aux données et à la documentation
 Convention de stage obligatoire
Encadrement et accompagnement
Le/la stagiaire sera encadré(e) par Julie Deschamps, chargée d’études avifaune et télémétrie et Guillaume Gélinaud, Conservateur à la réserve naturelle des marais de Séné.
Échéances
Lettre de motivation et CV à faire parvenir pour le 30 octobre 2026 à l'attention de Julie Deschamps, par courriel à julie.deschamps@bretagne-vivante.org en précisant dans l'objet « Candidature Stage Oiseaux d’eau ».
Date limite de candidature : 30 octobre 2026
Date de début de stage souhaitée : à décider selon disponibilité
Contact et renseignements
Pour toute question sur le contenu du stage, vous pouvez contacter :
Julie Deschamps
Email : julie.deschamps@bretagne-vivante.org

Offre de stage

Une offre de 2 stages sur la communication des suricates à Zurich:

Two 6-month research projects available at University of Zurich (January-June 2027)

Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies
Research group Communication and Cognition in Social Mammals

Project 1: Context-dependent vocal activity and flexibility in call usage in wild meerkats

Meerkats (Suricata suricatta) are highly vocal social mammals of Southern Africa.
They are known to exchange information between conspecifics through various call
types, emitted in different behavioural or environmental contexts. While most available
studies focus on the function of a single call type within a specific context, this project
aims to broaden our understanding of vocal communication in this species by
investigating differences in vocal activity across behavioural contexts and by
assessing the degree of functional flexibility in meerkats — that is, their ability to use
the same call type across different contexts and extract different meanings depending
on context, which is considered a prerequisite for studying the evolution of human
language. This work is part of a broader research program, the NCCR Evolving
Language, which aims to address these same questions across different mammalian
species (meerkats, non-human primates, and human infants) and compare them in
order to better understand the evolution of language.
The dataset consists of 20-minute focal follows of one individual combining audio
recordings and behavioural, collected from wild meerkats across five groups at the
Kalahari Research Centre, South Africa. Data collection spanned two years and
covered the full meerkat active day, from emergence to return to the sleeping burrow.
The student will extract behavioural and acoustic data on the focal meerkats through
video and audio recording annotation. Call types will be identified, and acoustic
analyses will be used to extract acoustic features for each call type. Relationships
between behavioural context and vocal activity or call-type usage will then be
investigated through statistical analyses.
Skills gained: behavioural video coding using BORIS software; acoustic recording
annotation in Adobe Audition; acoustic analyses in R and Praat; data management and
statistical modelling in R; scientific writing based on a well-defined dataset from a
long-term wild mammal study and contribution to a large interdisciplinary research
programme.
 

Project 2: How do meerkat pups signal need? Acoustic dynamics of begging calls in a cooperative breeder

From 4 weeks of age, meerkat pups follow older individuals during group foraging and
depend on prey provisioned by them. Pups solicit helpers with near-continuous
begging calls. While the different types of begging calls and their influence on helpers'
behaviour have been documented, variation in the begging calls' acoustic features
with time, hunger level, or pup motivation, as well as their impact on food provisioning,
remain poorly understood.
This project aims to investigate how the acoustic features of meerkat begging calls
change over the course of a begging bout and how they are influenced by the pup's
physiological state. The dataset consists of synchronised audio recordings and video
focal follows of wild, habituated pups from different groups at the Kalahari Research
Centre, South Africa, recorded at three times of day.
The student will extract behavioural data on pups and helpers through video
annotation. Similarly, annotation of audio recordings will allow the labelling of begging
calls, from which acoustic features will subsequently be extracted through acoustic
analyses. Relationships between the extracted variables will then be investigated
through statistical analyses.
Skills gained: behavioural video coding using BORIS software; acoustic recording
annotation in Adobe Audition; acoustic analyses in R and Praat; data management and
statistical modelling in R; scientific writing based on a well-defined dataset from a
long-term wild mammal study.
Supervision: Dr Mathilde Martin, Dr Stephanie Kalberer and Prof Marta Manser
Both projects are desk-based in Zurich and involve no fieldwork.
Requirements: strong interest in animal behaviour and communication, basic R skills,
good English. Previous experience with bioacoustics is a plus.
To apply, please indicate in which of the two projects you are interested in, and send
a motivation letter and CV to mathilde.martin@uzh.ch before October 22, 2026 

P O S T - D O C T O R A L P O S I T I O N I N W I L D B E E C O G N I T I O N

 https://static1.squarespace.com/static/5bdb4caff2e6b1de2d8c79c4/t/6ac6633d2f2d85786842b8e6/1791386429261/postdoc+ad_wild+bee+cognition.pdf

Offre de stage M2

Offre de stage de Master 2 UMR EPOC, équipe Ecotoxicologie Aquatique, Station Marine d’Arcachon
Effets du stress thermique sur la truite arc-en-ciel : conséquences sur l’âge biologique, les capacités de reproduction et la transmission à la descendance 

Contexte scientifique
Le changement climatique, et notamment l’augmentation de la fréquence et de l’intensité des épisodes de vague de chaleur, constitue une source de stress susceptible d’affecter la physiologie, le vieillissement et les performances reproductives des organismes ectothermes. Parmi les marqueurs moléculaires potentiellement sensibles à ces contraintes, la longueur des télomères pourrait constituer un indicateur intéressant du vieillissement biologique. En effet, si le raccourcissement télomérique est généralement associé au vieillissement normal, il pourrait également être accéléré par des conditions environnementales défavorables et ainsi refléter, au moins en partie, le coût physiologique associé à l’exposition au stress.
Au-delà des effets directs sur les individus exposés, la dynamique des télomères pourrait également être impliquée dans la transmission d’effets parentaux à la descendance. Des travaux soulèvent l’hypothèse qu’une accélération du vieillissement biologique pourrait, dans certaines conditions, se maintenir ou s’accumuler au cours des générations. Une telle dynamique pourrait avoir des conséquences sur les performances individuelles et potentiellement, à plus long terme, sur la dynamique des populations.
Objectifs du stage
Dans ce contexte, l’objectif général du stage sera d’étudier les effets de conditions thermiques contrastées sur l’âge biologique de géniteurs de truite arc-en-ciel à travers la mesure de la longueur de leurs télomères, et d’examiner ces résultats en relation avec leurs performances reproductives et les caractéristiques phénotypiques de leur descendance.
Plus précisément, il s’agira dans un premier temps de déterminer si les conditions thermiques auxquelles les géniteurs ont été exposés sont associées à des différences de longueur des télomères. Ces mesures seront ensuite mises en relation avec les données déjà disponibles sur leur morphologie et leur succès reproducteur.
Le projet visera également à explorer l’hypothèse selon laquelle les modifications de la dynamique télomérique chez les géniteurs pourraient être associées à des effets parentaux observables chez la génération F1. Les résultats obtenus sur les géniteurs seront ainsi mis en relation avec les données physiologiques et comportementales disponibles chez les descendants, afin de rechercher d’éventuelles associations entre l’état biologique des géniteurs et les caractéristiques phénotypiques de leur descendance.
Missions du/de la stagiaire
Le/la stagiaire travaillera à partir de tissus déjà prélevés dans le cadre d’une expérimentation menée en 2026 et participera notamment à :
• La mise au point et à la validation du mode opératoire pour mesurer la longueur des télomères en qPCR, sur deux types de tissus ;
• La réalisation des analyses moléculaires ;
• Le traitement, l’organisation et l’analyse statistique des données ;
• La mise en relation des données télomériques avec les données disponibles sur les caractéristiques des géniteurs, la qualité des gamètes et le succès reproducteur ;
• L’analyse des relations potentielles avec les données physiologiques et comportementales obtenues chez la génération F1 ;
• L’interprétation des résultats au regard de la littérature scientifique sur le vieillissement biologique, les télomères, le stress thermique et les effets parentaux ;
Compétences souhaitées :
– Expérience d’extraction et d’approche en biologie moléculaire appréciée
– Maîtrise du logiciel R pour la réalisation des analyses exploratoires et biostatistiques
– Capacité d’analyse et de rédaction
– Capacité à travailler de façon autonome et en équipe
– Rigueur, ouverture d’esprit, initiative
Conditions matérielles : Gratification mensuelle conformément à la législation en vigueur
Le stage sera réalisé au sein de l’UMR EPOC, à la station marine d’Arcachon, avec Cassandre Aimon. Si vous êtes intéressé, veuillez envoyer CV et lettre de motivation à :
cassandre.aimon@u-bordeaux.fr