2 Positions – Master’s Student Internship in Porcine Research

 Duration: 5 to 9 months, between January 2027 and September 2027
Location: Animal Centered Environment group, Department of Biosystems and Technology – SLU (Alnarp, Sweden)
Supervisor: Associate Professor Maria Vilain Rørvang – https://www.slu.se/en/profilepages/r/maria-vilain-rorvang/
Application deadline: 4th October 2026 or until the right candidates have been found.
Projects Overview
1 - Project Tail: What does the tail communicate in pigs? We have seen a range of tail swishing, tail flicking and tail raising when pigs explore odours (sniff) in a social setting. There is a lot of information about tail postures in relation to tail biting and other damaging behaviour, but no one has looked at what tail movement and postures mean in a more positive setting such as exploring odours. This project explores tail postures and movement in finishing pigs when they explore natural odours under controlled settings. The project will be on already recorded video material and will consist of developing and ethogram, observing video, validating the ethogram, and analysing the behaviour in relation to the odours.
2 - Project Snout: What causes snout damage in pigs? During a long-term study on finishing pigs provided olfactory enrichment, snout damage was found along with other welfare related outcomes. Snout damage or irritation is currently not included in welfare assessment, and more knowledge is needed on why snout damage occurs. This project explores behaviour of finishing pigs with snout damage and without snout damage. The project seeks to elucidate if behaviour differs and if behaviour might be an indicator for the underlying issue causing gate snout damage. The project will be onalready recorded video material and will consist of developing and ethogram, observing video, and analysing the behaviour in relation to pig welfare state and odours.
Profile Sought
I am seeking enthusiastic students completing an MSc degree in behavioral ecology, ethology, or physiology. Proficiency in English is required, as the team is international. Basic knowledge of statistical analysis and R programming would be appreciated but is not mandatory.
Place and Conditions of the Internship
The internship will be hosted at the SLU Research Campus of Alnarp, Sweden. Unfortunately, direct financial assistance cannot be provided in Sweden. Non-Swedish applicants must secure travel grants, research grants, or join an exchange program such as Erasmus to cover living expenses in Sweden. We do not accept students unless we are confident they can maintain a decent standard of living throughout their stay.
Important: The data have already been collected, so there is no fieldwork associated with this project. This means you are guaranteed high-quality data from the outset. There may be opportunities during your stay in Sweden to assist other researchers on their projects or to organize some farm visits.
Team and Supervision Support
Under the guidance of Maria Vilain Rørvang, you will be welcomed into a vibrant research environment, with the opportunity to engage in research group activities, weekly meetings, and collaborative discussions.
Key Responsibilities
• Develop specialized ethograms.
• Code pig behavior using specialized software.
• statistical analyses.
Requirements
• Currently enrolled in a Master's program in a relevant field (animal sciences, veterinary degree, physiology, etc.).
• If you are in a gap year, you must be associated with a university/organism that can provide an internship contract.
• A funding source – travel/mobility or research grant, or an exchange program such as Erasmus.
• Previous knowledge of pig behaviour would be appreciated but not mandatory.
Benefits
• Training in behavioral coding software.
• Insight into farm animal behavior and welfare research.
• Mentorship from experienced researchers.
• Potential for authorship on academic publications.
Application Process
To apply, please email Maria Vilain Rørvang at mariav.rorvang@slu.se with the subject line “Pig behaviour internship
2027 – Project tail/snout”, including:
• Precise in the Email which of the two projects you are applying to.
• A cover letter outlining your interest in the project, relevant experience, and how your skills align with the requirements above.
• A current CV highlighting your academic background and any research experience.
Application deadline: 4th of October 2026

Position – Master’s Student Internship in Equine Research

 Duration: 5 to 9 months, between January 2027 and September 2027
Location: Animal Centered Environment group, Department of Biosystems and Technology – SLU (Alnarp, Sweden)
Supervisor: Dr. Océane Liehrmann – oceane-liehrmann.webador.fr/internships
Application deadline: 4th October 2026
Project Overview
This internship offers an exceptional opportunity to contribute to the advancement of equine welfare assessment through the application of state-of-the-art electroencephalogram (EEG) technology. Working under the guidance of experienced researchers, participants will investigate the intricate relationship between positive emotions and cerebral activity. Through analysis of videos and data collected during experiments conducted on horses in 2026, interns will acquire invaluable skills in behavioral coding, data extraction from EEG recordings, and statistical analysis methods.
Profile Sought
I am seeking enthusiastic students completing an MSc degree in behavioral ecology, ethology, or physiology. Previous experience with horses and knowledge of equine behavior will be preferred. Proficiency in English is required, as the team is international. Basic knowledge of statistical analysis and R programming would be appreciated but is not mandatory.
Place and Conditions of the Internship
The internship will be hosted at the SLU Research Campus of Alnarp, Sweden. Unfortunately, direct financial assistance cannot be provided in Sweden. Non-Swedish applicants must secure travel grants, research grants, or join an exchange program such as Erasmus to cover living expenses in Sweden. I will not accept students unless I am confident they can maintain a decent standard of living throughout their stay.
Important: The data have already been collected, so there is no fieldwork associated with this project. This means you are guaranteed high-quality data from the outset. There may be opportunities during your stay in Sweden to assist on a similar project with cows so you can get some field experiments using the same material as the one used to collect the data you are going to work with.
Team and Supervision Support
Under the guidance of Dr. Océane Liehrmann, you will be welcomed into a vibrant research environment, with the opportunity to engage in research group activities, weekly meetings, and collaborative discussions.

Key Responsibilities
• Train for the EquiFACS certification
• Code horse behavior using specialized software.
• Extract and analyze heart rate variations and EEG data.
• Assist with statistical analyses to identify correlations between behavioral responses, heart rate and cerebral activity.
Requirements
• Currently enrolled in a Master's program in a relevant field (animal sciences, veterinary degree, physiology, etc.).
• If you are in a gap year, you must be associated with a university that can provide an internship contract.
• A funding source – travel/mobility or research grant, or an exchange program such as Erasmus.
• Good knowledge of horse behavior is a plus.
Benefits
• Hands-on experience in research using EEG on animals.
• Training in behavioral coding software.
• Insight into farm animal behavior and welfare research.
• Mentorship from experienced researchers.
• Potential for authorship on academic publications.
Application Process
To apply, please email oceane.liehrmann@slu.se with the subject line “EEG internship 2027”, including:
• A cover letter outlining your interest in the project, relevant experience, and how your skills align with the requirements above.
• A current CV highlighting your academic background and any research experience.
Application deadline: 4th of October 2026

Internship 2026-2027 Master

 Title of the internship: Investigation on deleterious genomic variation in Asian elephants

Supervisor(s): Elisa Somenzi & Nikolaos Smit

Institute: University of Turku (Finland) - Biology department

Summary: This project will investigate putatively deleterious genomic variation in Myanmar Timber elephants using existing whole-genome sequencing data. By combining functional variant annotation, measures of genetic diversity, and analyses of genomic inbreeding, the study will characterise individual genetic burden and explore how potentially harmful variation relates to patterns of homozygosity.

The project will provide hands-on training in bioinformatics, population genomics, and conservation genetics, covering whole-genome data processing, variant annotation, statistical analysis, and genomic visualization. Students will gain practical experience with command-line tools and R, while developing skills to interpret genomic variation in the context of elephant conservation and genetic management.

Other information (if applicable):

Contact (name and email): Elisa – elisa.somenzi@utu.fi Nikos - nikolaos.smit@utu.fi 

Insertion within an ongoing research project: no 

Publications in the field of research (up to 3): 

-    Divergence and serial colonization shape genetic variation and define conservation units in Asian elephants (https://doi.org/10.1016/j.cub.2024.08.062)
-    Massive Genetic Diversity Loss Within Asian Elephant Subspecies: New Insights for Determining Conservation Priorities (https://doi.org/10.1093/gbe/evag183)
-    Genetic load and viability of a future restored northern white rhino population (https://doi.org/10.1111/eva.13683)

Internship 2026-2027 Master

 
Title of the internship: Exploratory Analyses of the Gut Microbiome in Asian Elephants
Supervisor(s): Diogo Franco dos Santos & Elisa Somenzi

Institute: University of Turku (Finland) - Biology department

Summary: This project will investigate gut microbiome diversity and composition in Asian elephants, focusing on how microbial communities vary during early life. Using existing microbiome sequencing data, the study will characterise microbial diversity and community composition and explore changes associated with the taming process, diet, and management. The findings will be interpreted in the context of elephant health, welfare, and conservation.

The project will provide hands-on training in bioinformatics and metagenomics, including microbiome sequence processing, taxonomic profiling, diversity analysis, and statistical interpretation. Students will gain practical experience with command-line tools and R, including data manipulation, visualization, multivariate analyses, and interpretation of microbiome data in an animal health and conservation context.

Other information (if applicable):

Contact (name and email): Diogo - diogo.francodossantos@utu.fi Elisa – elisa.somenzi@utu.fi 

Insertion within an ongoing research project: no 

Publications in the field of research (up to 3): 

Adair, K. L., & Douglas, A. E. (2017). Making a microbiome: The many determinants of host-associated microbial community composition. Current Opinion in Microbiology, 35, 23–29. https://doi.org/10.1016/j.mib.2016.11.002

Klinhom, S., Sriwichaiin, S., Kerdphoo, S., Khonmee, J., Chattipakorn, N., Chattipakorn, S. C., & Thitaram, C. (2023). Characteristics of gut microbiota in captive Asian elephants (Elephas maximus) from infant to elderly. Scientific Reports, 13, 23027. https://doi.org/10.1038/s41598-023-50429-1

Zhu, L., Wang, J., & Bahrndorff, S. (2021). Editorial: The wildlife gut microbiome and its implication for conservation biology. Frontiers in Microbiology, 12, 697499. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.697499

STAGE TERRAIN - CAPTURE-MARQUAGE-RECAPTURE MARMOTTES ALPINES SAVOIE (73) – MAI À JUILLET 2027
Type de contrat : Stage Niveau d’études : BAC+2 minimum Localisation : Réserve naturelle de la Grande Sassière, Tignes, Savoie (73) Durée : 44 jours effectifs entre le 13 mai et le 16 juillet 2027
DESCRIPTION DE L’OFFRE
Le département Écologie Évolutive du Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (Université Claude Bernard Lyon1) suit une population de marmottes alpines depuis plus de 35 ans. Nous sommes à la recherche de stagiaires pour participer à la campagne annuelle de terrain.
Le travail consistera à participer à un suivi à long terme (initié en 1990) d'une population de marmottes alpines située dans la réserve de la Grande Sassière (2400m d'altitude, Vanoise), dans les Alpes françaises entre les communes de Tignes et Val d'Isère (Savoie 73).
Ce suivi combine un protocole de capture-marquage-recapture, des mesures biométriques, un protocole de comptage et des protocoles d'observations comportementales, dans l'objectif d'acquérir des données visant à répondre à la fois à des questions de biologie évolutive et de dynamique des populations.
Durant le stage, l'étudiant·e acquerra de nombreuses compétences de terrain telles que les techniques de capture, de manipulation et d'observations de la faune sauvage. Il·elle sera encadré·e par les agents de terrains responsables de l’équipe sur place.
Attention, il s'agit ici uniquement de travail de terrain, et non d’un stage pouvant conduire à de l'analyse de données ou à la rédaction d'un rapport (impossible d’y allouer du temps sur le terrain).
MISSION
La mission des stagiaires consistera en un travail de recherche de terrain et d’acquisition de données : capture-marquage-recapture des individus, gestion des cages-pièges, des captures et des relâchers, aide à la manipulation des marmottes (anesthésie, mesures biométriques, prélèvements biologiques, marquages...), comptage et observations comportementales.
PROFIL DES CANDIDAT·ES
Nous recherchons 5 stagiaires et ne pouvons recruter que des étudiant·e·s car une convention de stage (issue d’une formation diplômante) est OBLIGATOIRE. Nous recherchons des étudiant·e·s de filières biologie-écologie-environnement ayant un niveau d’étude supérieur ou égal à un BAC+2.
→ Motivation : Il s'agit d'un travail exigeant et difficile, qui ne laisse pas (ou peu) de temps pour soi. Les journées sont longues et le travail paraît souvent répétitif. Une forte motivation est nécessaire.
→ Rigueur, adaptation, dynamisme, disponibilité et flexibilité : le travail implique des animaux sauvages, les horaires de travail dépendent donc des marmottes et du climat.
→ Aimer le travail en équipe, être facile à vivre et aimer la vie en communauté.
→ Apprécier la montagne et la nature : le travail implique d'être dehors toute la journée, le froid et les conditions de vie rudimentaires ne doivent pas faire peur.
INDEMNISATION
Le stage n’est pas indemnisé, mais le transport depuis Lyon, ainsi que la nourriture, et l’hébergement sur place sont pris en charge.
CONDITIONS DE TRAVAIL
Stages de 44 jours effectifs, entre le 13 mai et le 16 juillet, répartis en deux périodes séparées par une interruption d’environ une semaine début juin. Les dates sont variables à quelques jours près et seront ajustées en fonction des conditions climatiques. La première période sera consacrée à la capture des adultes, la seconde à celle des jeunes de l’année. La présence des stagiaires sur l’ensemble des deux périodes est indispensable.
Pas d'horaires fixes, les heures de travail dépendent des animaux et sont conséquentes.
Vous serez intégré·e à une équipe de 6 à 8 personnes sur le terrain, hébergées ensemble dans un petit chalet d’alpage, où l’eau, le gaz, l’électricité et la connexion réseau sont des denrées rares et précieuses.
ATTENTION : Les conditions de ce stage de terrain sont très difficiles, à cause du climat montagnard, de la charge de travail importante, de la promiscuité au quotidien avec les autres membres de l’équipe et des conditions rudimentaires de l’hébergement.
CONTACT
Pour postuler, adressez votre candidature à Rébecca Garcia et Nicolas Blache via l’adresse mail stagiaire-terrain.lbbe@univ-lyon1.fr, en indiquant dans l’objet : « Assistant·e de terrain Sassière 2027_NOM Prénom ». Merci de joindre un CV et une lettre de motivation au format PDF (intitulés avec vos NOM et Prénom). Les formats Word, OpenOffice ou autres ne seront pas pris en compte.
Les candidatures sont à envoyer avant le 6 novembre 2026. Dans votre lettre, veillez à préciser vos motivations personnelles pour un tel stage et ce que vous en attendez. Les entretiens des candidat·e·s présélectionné·e·s se tiendront du 16 au 27 novembre 2026.
ENTREPRISE
Nom : Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive
Thématique : Recherche et environnement
Adresse : LBBE - UMR5558 Université Claude Bernard Lyon 1 Bâtiment Grégoire Mendel 43 bd du 11 novembre 1918 69622 Villeurbanne cedex
Site web : https://lbbe.univ-lyon1.fr/fr/suivis-ecologique-long-terme-sur-la-marmotte-alpine

Pandora formicae, un champignon manipulateur des fourmis : manipulation de l’hôte et réponse des colonies - CRCA, Toulouse, Fr -- date limite candidature : 6 Sep 2026

 Responsable du stage: Enikő Csata, CR CNRS – Centre de Recherche sur la Cognition Animale, Centre de Biologie Intégrative, Université Toulouse – eniko.csata@utoulouse.fr
Co-encadrement: Cassandre Krafft, IE CNRS – Centre de Recherche sur la Cognition Animale, Centre de Biologie Intégrative, Université Toulouse – cassandre.krafft@utoulouse.fr

Proposition de stage : Pandora formicae, un champignon manipulateur des fourmis : manipulation de l’hôte et réponse des colonies

Contexte scientifique
Pandora formicae est un champignon entomopathogène spécialisé qui infecte les fourmis du genre Formica. Avant de mourir, les fourmis infectées sont manipulées par le champignon : elles grimpent sur un brin d’herbe et s’y fixent à l’aide de leurs mandibules, une stratégie qui favorise la dispersion des spores. Bien que ce phénomène soit connu chez certains champignons manipulateurs, les mécanismes de l’infection ainsi que les réponses comportementales des colonies face à Pandora restent encore largement méconnus.

Objectifs du stage
Ce stage vise à étudier, en laboratoire, les interactions entre Pandora formicae et ses fourmis hôtes.
Il s’agira notamment d’observer les différents stades de l’infection et de la sporulation, d’étudier les réponses comportementales des colonies face à des congénères infectés, et de participer à des expériences de transmission ainsi qu’à des essais de culture du champignon.

Méthodologie proposée
● Observation des différents stades de l’infection et de la sporulation.
● Étude du comportement des colonies face à des congénères infectés.
● Réalisation d’expériences de transmission.
● Participation à des essais de culture du champignon.
● Analyse des données obtenues.

Compétences souhaitées
● Intérêt pour l’écologie comportementale, l’éthologie et les interactions hôte–parasite.
● Connaissances de base en analyse statistique avec R/RStudio.
● Bon niveau d’anglais, à l’oral comme à l’écrit.
● Rigueur, patience et intérêt pour le travail expérimental.
● Goût pour le travail en équipe.

Niveau requis : Étudiant·e en troisième année de licence de biologie (L3).
Durée : 8 semaines.
Début du stage : 5 octobre 2026.
Date limite de candidature : 6 septembre 2026.
Documents à fournir : CV, relevé de notes et lettre de motivation, à envoyer aux deux responsables du stage.