Structure d’accueil : LEHNA, Laboratoire d’Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
Maitre de stage : Hugo Cayuela (Doctorant, Université Lyon I)
Contact : hugo.cayuela@ univ-lyon1.fr
Durée du stage : 2 mois (du 1er avril au 31 mai 2014, ou du 31 avril au 31 juin)
Salaire: non
Déplacements : pris en charge
Hébergement : sur Lyon, non pris en charge
1. Contexte général et problématique
Le Sonneur à ventre jaune, Bombina variegata (L.), est une petite espèce d’amphibien Anoures distribuée dans une large partie de l’Europe continentale. Au cours des dernières décennies, l’espèce a subi une nette contraction de son aire de répartition dans sa marge occidentale, ayant successivement disparu du Luxembourg et de Belgique (avant sa récente réintroduction), et faisant de ce fait l’objet d’une réglementation européenne (Directive Habitat, Annexe II et IV). En combinaison avec d’autres facteurs, la perte, la dégradation et la fragmentation de l’habitat de reproduction semble être les principaux déterminants susceptibles d’expliquer cette régression. A l’heure actuelle, la majorité des habitats ancestraux de cette espèce semblent avoir disparus, celle-ci effectuant principalement sa reproduction dans des pièces d’eau semi-naturelles (ornières forestières). Si ce nouvel habitat présente de nombreuses similitudes avec l’habitat de reproduction ancestral, sa durée de persistance à l’échelle d’une génération d’animaux semble bien inférieure (processus d’atterrissement accru, remise en état des chemins forestiers après exploitation). En conséquence, la faible prévisibilité interannuelle de l’habitat de substitution est susceptible d’agir comme une nouvelle pression de sélection. Dans un tel contexte, la fitness des individus devrait désormais en partie reposer sur leur propension à émigrer, ainsi que sur leurs capacités à se déplacer dans la matrice paysagère et à immigrer. Comprendre les mécanismes sous-jacents de cette adaptation locale constitue un point crucial pour assurer une meilleure compréhension de l’écologie de cette espèce en déclin. Pour aborder cette question, nous développons une approche comparative reposant sur : i) une démarche descriptive du patron de mouvements (méthode d’observation directe, capture-recapture) et de flux de gènes (à l’aide de marqueurs microsatellites) dans chaque type d’environnement, ii) une démarche expérimentale visant à mesurer le comportement exploratoire des jeunes issus de chaque environnement et élevés en laboratoires.
2. Objectifs du stage
Au cours de ce stage, le stagiaire aura pour mission de :
i) Réaliser l’échantillonnage de matériel génétique sur le terrain, dans quatre populations se reproduisant dans des habitats ancestraux (bord de rivière, départements de l’Ardèche) et dans des habitats semi-naturels (massifs forestiers, départements des Vosges et de l’Isère).
ii) Procéder à l’extraction de l’ADN en laboratoire.
iii) Compléter des analyses préliminaires du patron de mouvements dans l’environnement ancestral de l’espèce à partir de données de capture-recapture.
3. Profil recherché
- Etudiant de niveau MASTER I, LICENCE III
- Permis B obligatoire
- Personne motivée, à l’aise et autonome sur le terrain