Contexte :
Ce stage s’inscrit dans le cadre d’un projet européen Interreg dont l’objectif principal est de développer des biotests innovants permettant d’améliorer l’évaluation des risques liés aux perturbateurs endocriniens. Plusieurs centaines de substances chimiques utilisées dans les secteurs maritime, pharmaceutique ou encore cosmétique sont à ce jour présumées ou suspectées d’être un danger pour l’environnement et la santé humaine, ce en interagissant avec les fonctions endocriniennes. Cependant, davantage de recherches sont nécessaires pour aboutir à une réglementation de leur utilisation et une réduction de la pollution par ces substances. La contribution de l’Université de Caen Normandie à ce projet couvre notamment la recherche d’effets toxicologiques de type comportementaux chez la seiche commune Sepia officinalis en réponse à l’exposition à six perturbateurs endocriniens potentiels. Les paramètres comportementaux principalement visés sont la locomotion et le camouflage (changements de couleur et de pattern au niveau du manteau). Les possibles effets toxicologiques sont recherchés chez des seiches nouveaunés.
Pour plus d’informations : https://redpol-interreg.com/
Objectifs : Contribuer 1° à l’analyse de données acquises durant la saison dernière chez des seiches nouveau-nés exposées à deux des six perturbateurs endocriniens, et 2° à l’optimisation du protocole expérimental sur base des résultats et à l’acquisition de nouvelles données avec les nouveau-nés de la saison prochaine.
Missions : Etant contraints par le rythme saisonnier des naissances de seiches, les expériences sont typiquement effectuées à partir de mai-juin sur les premiers-nés de l’été. Par conséquent, le stage débutera par l’analyse d’images acquises la saison dernière pour se terminer par des expériences avec les nouveau-nés de la saison prochaine. Les analyses d’images en question se feront à l’aide de deux logiciels libres : ImageJ et DeepLabCut. Divers paramètres de locomotion seront relevés sur base d’un vidéo-tracking automatique qui sera réalisé sous DeepLabCut après un processus de deep learning assisté par le logiciel. Les analyses de camouflage seront quant à elles effectuées sous imageJ à l’aide d’un protocole semi automatisé actuellement en cours de développement. Les résultats obtenus permettront d’ajuster les conditions expérimentales avant d’appliquer un protocole optimisé à de nouveaux animaux et d’autres polluants. Le stagiaire participera également aux soins apportés quotidiennement aux animaux.
Laboratoire d’accueil : Laboratoire de Neuro-Ethologie Cognitive des Céphalopodes, UMR 6552 EthoS (Ethologie animale et humaine) https://ethos.univ-rennes1.fr/neuro-ethologie-cognitive-descephalopodes-necc
Encadrants : Cécile Bellanger, maître de conférences (cecile.bellanger@unicaen.fr) et Anaïd Gouveneaux, post-doctorante (anaid.gouveneaux@unicaen.fr)
Durée du stage : 5-6 mois, de janvier à juin 2022, avec gratification
Candidature : Les candidatures avec CV et lettre de motivation sont à envoyer à anaid.gouveneaux@unicaen.fr avant le 31.10.2021.
Effect of endocrine disruptors on locomotion and camouflage of the common cuttlefish Sepia officinalis Master 2 internship
Context: This internship is part of a European Interreg project whose main objective is to develop innovative biotests to improve risk assessment of endocrine disruptors. Several hundred chemical substances used in the maritime, pharmaceutical or cosmetic sectors are currently presumed or suspected to be a danger for the environment and human health by interacting with endocrine functions. However, more research is needed to regulate their use and reduce pollution by these substances. The contribution of the University of Caen Normandie to this project covers in particular the research of behavioural toxicological effects in the European common cuttlefish Sepia officinalis in response to exposure to six potential endocrine disruptors. The main behavioural parameters targeted are locomotion and camouflage (changes in colour and pattern of the mantle). Possible toxicological effects are being investigated in newborn cuttlefish. For more information: https://redpol-interreg.com/
Objectives: To contribute to 1° the analysis of data acquired during the last season with newborn cuttlefish (hatchlings) exposed to two of the six endocrine disruptors, and 2° to the optimisation of the experimental protocol based on the results and to the acquisition of new data with hatchlings of the next season. Missions: Being constrained by the seasonal rhythm of cuttlefish births, the experiments are typically performed from May-June on the first born of the summer. Therefore, the internship will start with the analysis of images acquired last season and will end with experiments on the hatchlings of the next season. The analysis of these images will be done with two opensource software: ImageJ and DeepLabCut. Various locomotion parameters will be recorded on the basis of automatic video-tracking which will be performed under DeepLabCut after a software-assisted deep learning process. Camouflage analysis will be performed under imageJ using a semi-automated protocol currently under development. The results obtained will allow to adjust the experimental conditions and to develop an optimized protocol that will be applied to new animals and other pollutants. The intern will also participate in the daily care of the animals.
Host laboratory: Laboratoire de Neuro-Ethologie Cognitive des Céphalopodes, UMR 6552 EthoS (Ethologie animale et humaine) https://ethos.univ-rennes1.fr/neuro-ethologie-cognitive-descephalopodes-necc
Supervisors: Cécile Bellanger, lecturer (cecile.bellanger@unicaen.fr) and Anaïd Gouveneaux, postdoctoral fellow (anaid.gouveneaux@unicaen.fr)
Duration of the internship: 5-6 months, from January to June 2022, with a bonus
Application: Applications with CV and cover letter should be sent to anaid.gouveneaux@unicaen.fr before 31.10.2021