Sujet de thèse UMR Ethos - appel à candidatures

 Offre de thèse 2022-2025 Appel à candidature 1. Titre du projet de recherche doctorale : Caractérisation des états émotionnels chez la seiche : physiologie, éthologie et cognition / Characterization of emotional states in cuttlefish: physiology, ethology and cognition 2. Description du projet : Les émotions sont des états subjectifs transitoires, sous-tendus par des phénomènes physiologiques, comportementaux et cognitifs, déclenchés par des stimuli environnementaux. Notre compréhension des émotions est largement basée sur des expériences subjectives humaines évaluées verbalement. Les états émotionnels chez l’animal sont évalués sur la base de paramètres quantifiables, physiologiques (e.g. rythme cardiaque) ou comportementaux (e.g. postures). La plupart des travaux sur les émotions chez l’animal portent sur les mammifères et sur les émotions négatives, plus faciles à induire. Le présent sujet s’intéresse aux émotions positives chez un invertébré, la seiche. L’existence de ces « émotions » chez ces animaux et, a fortiori leurs mécanismes sous-jacents, sont inconnus. Ces questions sont centrales dans le cadre du bien-être animal et constitue le cœur du projet EthicS (ANR PRCI, 2019-2023). Les premiers résultats ont montré que l’expression de certains motifs corporels, sous contrôle direct du cerveau, était modulée en fonction de la valence d’une proie (accessible ou pas). En revanche, ces motifs sont très atténués lors de la capture d’une proie en présence d’un congénère, suggérant un contrôle de ces motifs dans un contexte de compétition. Le projet de thèse s’organise en 3 axes, qui viennent compléter l’approche comportementale précédente : - La mesure d’indicateurs physiologiques : monoamines, dilatation de la pupille, rythme ventilatoire. - L’étude comportementale des signaux polarisés dans les situations décrites précédemment. En effet, le projet s’est focalisé sur les composants chromatiques du manteau de la seiche, or on sait que la seiche émet des signaux polarisés dans certains contextes. - L’étude du biais cognitif : les comportements « optimistes » et « pessimistes » (biais de jugement) dans une situation ambiguë permettent d’avoir accès aux états émotionnels des animaux. -------------------------------- Emotions are transient subjective states triggered by environmental stimuli and controlled by physiological, behavioral and cognitive processes. Our knowledge of emotions is largely based on verbally assessed subjective human experiences. Emotional states in animals are evaluated by quantifiable, physiological (e.g. heart rate) or behavioral (e.g. postures) parameters. Most of the work on emotions in animals focuses on mammals and on negative emotions, which are easier to induce. This proposal focuses on positive emotions in an invertebrate, the cuttlefish. Expression of emotionlike behavior in these animals and their underlying mechanisms remain unknown. In the context of animal welfare, these questions are central and constitute the core of the EthicS project (ANR PRCI, 2019-2023). The first results showed that the expression of certain body patterns, under direct control of the brain, was modulated according to the valence of a prey (accessible or not). Moreover, these patterns components are very attenuated during the capture of a prey in the presence of a conspecific, suggesting a control in a competition context. The PhD proposal is organized in 3 major axes, which complement the previous behavioral approach: - Measurement of physiological indicators: monoamines, pupil dilation, ventilatory rate. - The behavioral study of polarized signals in the situations described above. Indeed, the project focused on the chromatic components of cuttlefish mantle, but we know that the cuttlefish emits polarized signals in certain contexts. - The study of cognitive bias: "optimistic" and "pessimistic" behaviors (judgment bias) in an ambiguous situation provide access to the emotional states of animals. 3. Expérience et formation souhaitées du candidat : Le (la) candidat (e) devra avoir une formation en sciences des comportements et/ou en neurosciences. Une expérience en expérimentation animale et dans l’étude des émotions chez l’animal et/ou du bienêtre animal sera appréciée. Un certain travail en autonomie et de communication scientifique au sein de l’équipe de recherche sera demandé au (à la) futur (e) doctorant (e). Il/elle devra avoir également un solide engagement dans la réalisation de son doctorat pour mener à bien ses projets professionnels. The candidate should be highly motivated with behavioral sciences and neurosciences background. Additional skills in animal experimentation and in animal emotion studies and/or animal welfare would be appreciated. Work in autonomy with solid scientific communication in the research team will be required. The candidate must also have a solid determination to achieve his/her PhD program in order to develop his/her future professional projects. 4. Direction de thèse : Directrice de thèse : Dr Darmaillacq, Anne-Sophie Co-encadrant : Dr Bacqué-Cazenave, Julien Contacts : anne-sophie.darmaillacq@unicaen.fr ; julien.bacque-cazenave@unicaen.fr 6. Unité(s) et équipe(s) d’affectation des membres de la direction de thèse : UMR Ethos – équipe NECC (Neuroéthologie cognitive des céphalopodes) 7. Calendrier : Le-la candidat-e sera auditionné-e en visioconférence par Mme Darmaillacq et Mr Bacqué-Cazenave, après une sélection sur dossier. Ce dossier comprendra un CV, les relevés de notes depuis le baccalauréat et une lettre de motivation. Au cours de l’audition, il sera demandé au candidat de présenter un mini projet de recherche en lien avec le sujet proposé. Le concours de l’école doctorale aura lieu du 29 juin au 1er juillet 2022 à Caen. Date limite pour nous adresser votre dossier de candidature : 29 avril 2022 18h Auditions : semaine du 16 mai 2022

URGENT ! OFFRE DE STAGE de 2 mois (début le plus rapidement possible)

Etude de la répartition des tétées au cours des 72 premières heures de vie du poulain

 

Résumé du stage : Le poulain nouveau-né dépend de la prise de colostrum afin d'assurer son immunité. Ce "premier lait" est ingéré dans les quelques heures suivants la naissance. Ainsi, le comportement de tétée (fréquence et durée) est initié et permet au jeune de s'alimenter mais aussi de stimuler la production lactée de la jument. Nous souhaitons étudier la répartition des tétées au cours des 72 premières heures de vie du poulain. L'analyse des comportements se fera via de l'analyse vidéo ce qui permettra d'étudier les éventuelles différences de comportement entre les phases diurnes et nocturnes. En effet, certaines études mentionnent une diminution de la fréquence de tétée au cours de la nuit mais sans qu'elle soit chiffrée. Cette étude nous permettra de mieux comprendre de quelle manière le comportement de tétée est affecté par les phases nocturnes au cours des premiers jours de vie. Ces données pourraient ensuite être extrapolées au reste de la lactation. Une présence sur site est vivement souhaitée, les observations vidéos pouvant être amenées à être complétées par des observations sur le terrain.

Lieu du stage : Station Expérimentale de Chamberet IFCE (Corrèze)

Début du contrat : le plus tôt possible

 

Possibilité de logement sur place

 

Encadrant : Laurence WIMEL
IFCE- PT Station Expérimentale de CHAMBERET
Domaine de la Valade
1, Impasse des Haras
19370 CHAMBERET
laurence.wimel@ifce.fr
05 55 98 19 00
06 77 02 35 92

 

Profil du candidat recherché : Personne en 3^ème année de Licence ou en Master, avec une expérience en éthologie, ou étudiant en école d’ingénieur (agronome).

 

Pour candidater : envoyer CV et lettre de motivation à laurence.wimelfce.fr

 

OFFRE DE CDD Ingénieur d’étude de 3 mois (entre septembre et décembre 2022) ou OFFRE DE STAGE de 4 mois (entre septembre et décembre 2022)

 

Chiens d’assistance : influence de facteurs intrinsèques et extrinsèques sur l’adéquation à la fonction

 

Résumé du stage : Le présent projet, issu de la collaboration entre l’association Handi’chiens et EthoS, a pour objectif de déceler les facteurs qui peuvent influencer la réussite ou l’échec à devenir un chien d’assistance (pour personnes avec handicap, TSA, en EHPAD...), plus de 30% des chiens formés étant reformés pour des raisons de santé et/ou des problèmes comportementaux. Ce travail sera réalisé à partir d’une base de données électronique issue de celles de l’association recensant les caractéristiques des chiens formés (sexe, race, lignée, origine parentale, données sanitaires) et de leurs conditions de vie depuis leur achat (site d’entraînement ; origine du chien, i.e. éleveur professionnel ou amateur ; caractéristiques de la famille d’accueil : composition, lieu de vie rural ou urbain, présence d’autres animaux ; type d’alimentation). La base actuelle de travail comporte plus de 4000 chiens correspondant à plus de 2000 familles d’accueil. Sur la base d’un premier travail, nous avons pu identifier un certain nombre de facteurs (parmi ceux disponibles dans la base de données) jouant un rôle dans l’inadéquation des chiens à la fonction de chien d’assistance que nous aimerions explorer plus en détails (typologie des centres d’éducation, des élevages dont sont issus les chiens…). Il est possible que la personne recrutée soit, de fait, amenée à contacter les personnes concernées pour avoir accès à ces informations d’intérêt, souvent non mentionnées dans la base de données.

Lieu du stage : Station biologique de Paimpont (majoritairement)

Début du contrat : entre septembre et octobre 2022

 

Encadrants : Séverine Henry, Martine Hausberger, Marine Grandgeorge (EthoS) en collaboration avec l’association Handi’chiens

 

Profil du candidat recherché : Personne ayant une formation en éthologie (niveau Master) ou diplômée d’une école d’ingénieur (Ingénieur agronome). Nous pouvons aussi considérer, selon les candidatures, de sélectionner un stagiaire en 4^ème ou 5^ème année d’étude et ce pour une durée de 4 (ou plus) mois. Dans tous les cas, nous sommes à la recherche d’une personne rigoureuse et organisée, et ayant une bonne maîtrise des analyses statistiques uni- et multi-variées.

 

Pour candidater : envoyer CV et lettre de motivation à severine.henry@univ-rennes1.fr au plus tard le 20/05/2022

 

 

Chaire de Professeur Junior en Ethologie à Toulouse

 Le Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA-CBI)  (https://crca.cbi-toulouse.fr/) à l'Université de Toulouse 3 (https://www.univ-tlse3.fr/ ) propose une Chaire de Professeur·e Junior en Ethologie

Ce poste publié vendredi 22/04/22 sur Galaxie est ouvert jusqu'au 23/05/22.

Vous trouverez ci-jointe la fiche de poste. Les modalités de candidature sont sur le site Galaxie :  https://www.galaxie.enseignementsup-recherche.gouv.fr/ensup/cand_postes_GALAXIE.htm#1EC

Au niveau recherche, le profil est très ouvert: La personne recrutée développera des approches expérimentales utilisant les méthodes de l’éthologie quantitative et/ou cognitive, éventuellement combinées à la modélisation, pour étudier les comportements individuels ou collectifs chez les invertébrés ou les vertébrés. Elle sera encouragée à déployer des approches alliant plusieurs disciplines (biologie, physique, chimie) pour identifier les mécanismes physiologiques, cognitifs et comportementaux impliqués dans l'intégration des signaux sociaux et environnementaux, dans la coordination des activités au sein d’un groupe d'animaux et dans la modulation de l'expression des comportements, notamment en réponse aux interactions sociales.

Field research assistant

Position: Two positions as field research assistants for Yale PhD student at the Lomas Barbudal Monkey Project (capuchins, Costa Rica)

Hiring Organization: Yale University, United States

Project Description: What are white-faced capuchin nutritional goals? How does achieving (or not achieving) these goals relate to lifetime fitness? How does achieving these goals relate to survival during an extreme drought in 2015? We are looking for passionate and hands-on field assistants to complete our team to address these questions! Together, we will collect data, contribute to the Lomas Barbudal Monkey Project’s long-term database, develop invaluable professional (and personal) skills and build a connection with the natural world. This is a perfect steppingstone and opportunity for a future career in ecology or conservation.

Responsibilities: Assistants are on a three-day rotational schedule. We spend two days in the field and one day at home. Field days are generally 12-14 hours, during which time we follow monkeys through the forest. This can be challenging, because it involves hiking and pushing through undergrowth, while also collecting behavioral data, food samples and occasionally collecting fecal samples. It is important that we support each other and remain optimistic when we have the capacity to do so. Every third day, responsibilities involve editing behavioral data, processing food and fecal samples (i.e., weighing, drying, labelling and sealing into bags), completing one daily chore and cooking dinner (and lunch for the following day) for the field team. These are not days off, but they offer the opportunity to recharge and catch up on sleep. Each month, two days are spent conducting phenology surveys (2 days/month), and these field days will be ~8 hours.

*We have and enforce a strict anti-harassment policy, including sexual harrassment.*

Applicants are required to read the field guide for the Lomas Barbudal Capuchin Project to get a sense of the terrain and typical work schedule.

Qualifications/Experience: We are open to different backgrounds and experiences! It’s most important to have a positive attitude, high tolerance for stress and not be afraid of/have an aversion to: insects, heat, humidity, rain and, to be honest, being generally uncomfortable. You must be able to carry a heavy backpack (3-6 liters of water, project equipment, etc.) and hike for long days (but this is something that will also improve with time). Previous field/backpacking/outdoor experience, Spanish language skills, and an interest in primatology, wildlife, ecology or conservation are all a plus but not necessary.

Term of Appointment: A 15-month commitment (June 1, 2022 - August 27, 2023) is necessary.

Compensation: This is a volunteer position. Assistants will receive $520.00/month as a stipend, specifically for the laboratory component of the position (drying and weighing food and fecal samples), because this is generally not a field assistant task. An additional $500.00 bonus will be granted if you arrive at the field site trained on: code tests, speed tests and plant tests (interobserver reliability tests, which I will train you on beforehand). Your flights will be reimbursed if you stay the duration of your contract, which is 15 months (and they will not be reimbursed if you leave before the end-date stated in your contract). Assistants receive room and board with the other project personnel in the town of Pijije near the Lomas Barbudal Biological Reserve. Rent and food is 100% covered, except during vacation and Visa renewal trips (I will explain this in the interview process), during which times, assistants must support themselves. You will also receive essentials, such as snake leggings, bug spray, and sunscreen. If you cannot begin on the start or end date, this is something that we can probably accommodate, and please indicate this in your letter of interest. Everyone receives five days of vacation at the end of the month and ten days of vacation at the end of December. We work on weekends. If there is something that you need to leave for (not during vacation), then please indicate so in your letter of interest. This is something that we can probably accommodate as well. You will receive training in behavioral data collection, laboratory methodologies, population monitoring, ecological monitoring, climate monitoring, and working in a collaborative environment. Assistants have the opportunity to undertake their own ecology research projects under my mentorship. Please indicate if this is something you would like to take advantage of in your letter of interest. This is an opportunity for your development, so share any other ideas that you have, and let’s see what we can do!

You will be responsible for paying for your vaccinations and health insurance. You will also be responsible to purchase your own field clothes, backpack and binoculars and support yourself on vacation and Visa renewal trips. If you are a Yale affiliate then you may be covered by Yale iSOS, and there may be other fellowship stipends available.

COVID restrictions: At this time, the applicant must be fully vaccinated against COVID-19 (including the booster) before the start of the position and must wear a face mask when it is required.

Application materials: To apply, please send the following to alexa.du...@yale.edu with an email header: “Application for field assistant position”:

1.    Letter of interest: Describe your career goals, why you are interested, and your suitability for the project

2.    CV/resume

3.   Unofficial/Official College Transcript: for institutions outside of the US, please include a summary of coursework and grades

4.    References:  Please send the contact information (including email addresses) for 3 or more people who would be willing to write letters of support. We prefer that this list include 

a.    one academic reference

b.    one person who has supervised the applicant’s research or work in the past

c.     one person who has lived with the applicant in a cooperative living situation

If you do not hear back within three days acknowledging the receipt of your application, please send me another email, so I can check my junk mail. If the application looks promising, then a Zoom interview will be conducted. If the interview goes well, then a second interview with the founder of the field site will be required.

Application Deadline: I will begin reviewing applications immediately and will continue until the assistant position is filled.

Contact Information: Alexa Duchesneau, Department of Anthropology, Yale University, 10 Sachem St, New Haven, CT 06511

Telephone Number: (978) 587-1025

Email Address: alexa.du...@yale.edu

Stage de 8 semaines – dates selon disponibilités du stagiaire

 

Stage de 6 mois – 2e semestre 2022

 

Poste ATER à Paris 13

 Section CNU : 69 Profil général : Ce poste d’ATER vient suppléer le départ en retraite d’un enseignant-chercheur rattaché au Département de Psychologie de l’Université Sorbonne Paris Nord pour l’enseignement et au Laboratoire d’Ethologie Expérimentale et Comparée (LEEC, UR 4443) pour la recherche. La personne recrutée sera rattachée à l’UFR LLSHS de l’Université Paris 13 situées sur le campus de Villetaneuse. Profil enseignement : Les enseignements confiés à la personne recrutée seront essentiellement des enseignements de statistiques et accessoirement de neurosciences et d’éthologie, dispensés essentiellement à des étudiants en licence de psychologie. Une formation initiale du ou de la candidat(e) en biologie du comportement et ayant de solides bases en statistiques appliquées est souhaitée. La personne recrutée devra être francophone. Contact : David Sillam-Dussès, Directeur du Département de Psychophysiologie ; Email : sillamdusses@univ-paris13.fr ; tél : 01 49 40 39 54 Profil recherche : Le ou la candidat(e) devra avoir de solides connaissances scientifiques en éthologie / sciences du comportement et une expérience de recherche dans ce domaine validée par une activité de publication dans des revues internationales à comité de lecture conséquente. Il est attendu que les candidat(e)s présentent un projet d’activités de recherche réalisable dans l’année du contrat au sein du LEEC. Ce projet devra s’intégrer aux thématiques développées au LEEC. Merci d’indiquer lors de votre candidature le nom et les coordonnées de deux référents. Des informations complémentaires sur les thématiques développées au sein du LEEC sont consultables à l’adresse suivante : http://leec.univ-paris13.fr/ Laboratoire d’accueil : Laboratoire d’Ethologie Expérimentale et Comparée Contact : Heiko G. Rödel, Directeur du Laboratoire d’Ethologie Expérimentale et Comparée UR 4443 ; Email : heiko.rodel@univ-paris13.fr ; tél : 01 49 40 32 18

Annonce de stage L3 ou M1

Type d’offre : stage M1

Date limite de candidature : jusqu’à attribution du poste

Lieu du stage : Réserve Africaine de Sigean (Aude)

Contexte : Le stage s’intègre dans le cadre d’un projet de thèse CIFRE débutant en janvier 2022. Le projet en question s’intéressera aux liens entre le comportement social des zèbres de Grant élevés en captivité, et le parasitisme gastrointestinal, auquel s’ajoute une approche écologique avec l’étude des effets des vermifuges sur les coléoptères coprophages.

Le projet est au centre d’un partenariat entre l’équipe EBI de l’université de Poitiers, l’équipe du CEFE de l’université de Montpellier, et le parc zoologique de la Réserve Africaine de Sigean.

Projet et mission :

Le stage sera axé sur la problématique suivante : A l’image des chevaux, l’accès à la nourriture de qualité est-il lié à la place hiérarchique au sein d’un groupe de zèbres de Grant ?

Il sera demandé de réaliser une bibliographie en amont du stage.

Le protocole inclus la mise en place de dispositifs expérimentaux sur le terrain, la récolte d’échantillons mais aussi leur traitement en laboratoire et l’analyse de ces échantillons.

Compétences recherchées :

-          Facilité de rédaction

-          Précision et respect des protocoles

-          Capacité à travailler en extérieur

Qualités personnelles :

-          Autonomie de travail

-          Capacité à communiquer

-          Force d’adaptation au sein des équipes du parc zoologique

Vous marquerez des points particulièrement si :

-          Vous êtes sensibles à l’éthologie et au bien-être animal

Conditions : Stage non rémunéré de 8 semaines, à partir de début juillet.

Eventuelles questions, CV et LM à envoyer à l’intention de Cloé Joly, à l’adresse mail suivante : cloejoly42@gmail.com Préciser « Stage Etho » dans l’objet du mail.

 

Annonce thèse

 Titre du Projet de thèse* : Mécanismes et ontogenèse des déplacements collectifs.

Expérimentation et modélisation mathématique en milieu alimentaire homogène et hétérogène.

Mots clés* (6): Déplacements collectifs, développement, socialité, coordination, voisinage

influant, modélisation.

English title of the thesis project*: Mechanisms and ontogeny of collective movements.

Experimental and mathematical modelling approaches in homogeneous and heterogeneous

feeding habitats.

Keywords*: Collective movements, development, sociality, coordination, neighborhood,

modelling

Résumé du projet de thèse*:

L’étude des déplacements collectifs s’incorpore dans le cadre des phénomènes auto-organisés.

Un des fondements de ce cadre théorique réside dans la proposition que des interactions locales

sont suffisantes pour générer des structures complexes au niveau du groupe. La grande majorité

des études de mouvement collectif ont considéré des milieux homogènes (i.e. absence

d’obstacles, distribution spatial uniforme de nourriture, etc). A notre connaissance, tous ces

études, sauf un, concernent des sujets adultes. L’objectifs de cette thèse sont i) d’étudier,

expérimentalement et théoriquement, le développement des mécanismes de coordination dans

les déplacements chez le mouton dans des milieux homogènes, mais aussi hétérogènes, et ii)

aborder l’ontogenèse du mouvement collectif. Nous aborderons ce dernier point en quantifiant

les comportements et les trajectoires au sein de groupes de taille fixe (4, 8 et 16 sujets),

composés de sujets du même stade de développement/âge (2, 4 et 12 mois) ou de deux stades

différents. Expérimentalement, les localisations et trajectoires des animaux seront obtenues

grâce à des GNSS et/ou des capteurs UWB dans des pelouses naturelles. Les données de

comportement seront obtenues par des accéléromètres, même si toutes les expériences seront

filmées. Nous étudierons aussi comment les déplacements des animaux sont affectés par

l’hétérogénéité contrôlée des ressources alimentaires (i.e. en contrôlant la qualité et quantité de

pelouse dans l’espace de déplacement). Au niveau théorique, nous utiliserons des modèles

d’agents avec des variables internes pour représenter l’état comportemental des individus, et

considérerons des taux de transition locales et dépendant de la qualité et quantité de la ressource

alimentaire local. La question des possibles modifications des comportements au cours de

l’ontogénèse sera abordée avec des outils de Reinforcement Learning.

Summary of the thesis project*:

Collective movements in living systems have been the subject of a considerable number of

studies within the scope of self-organization. Within this framework, complex patterns at the

group level emerge from local interactions. Most collective motion studies have considered

homogeneous environments (i.e. no obstacles, homogeneous distributions of food sources, etc).

Furthermore, to the best of our knowledge, all collective motion studies, but one, are restricted

to adults. The objectives of this thesis project are i) to investigate, experimentally and

theoretical, the underlying behavioral rules that lead to coordinated collective displacements in

sheep in homogeneous as well as heterogeneous environments, and ii) to study the ontogeny of

collective motion. To address the latter point we will make use of the fact that lambs exhibit

marked change in sociability and behavior during their first months of life. We will quantify

the behavior and trajectories of groups of fixed size (with 4, 8 and 16 individuals) in the same

developmental phase, considering 2, 4, and 12 months old individuals or of two different

development phases. Experimentally, location and trajectories will be collected using GNSS

and/or UWB sensors. Behavioral data will be obtained using accelerometers, but all trials will

be also filmed. We will also study how collective displacements are affected by heterogeneous

distribution of food sources by controlling the quality and quantity of grass in the experimental

arena. At the theoretical level, we will make use of agent-based models with an internal variable

that describes the behavioral state of the individuals and consider local transition rates that

depend on the quality and quantity of the local food sources. Collective motion ontogeny will

be addressed by making use of concepts of Reinforcement Learning.

Thématique : Comportements collectifs

Domaine : Biologie - Physique

Objectifs : Le projet vise à étudier, dans un environnement contrôlé, les hypothétiques

mécanismes impliqués dans la coordination comportementale, spatiale et temporelle permettant

les déplacements collectifs dans des milieux homogènes et hétérogènes. Nous nous proposons

d’étudier ces questions au cours du développement des animaux. Nous quantifierons les

comportements de déplacement (stationnaire ou non-stationnaire), la vitesse de déplacement,

le nombre de pas en fonction de la taille/masse des individus. Nous mesurerons aussi le temps

passé en alimentation, déplacement, et vigilance, ainsi que le nombre de bouchées. En effet, des

différences anatomiques liée au développement peuvent générer des déplacements ou

exploration différente et en fin de compte soit une absence de cohésion soit une cohésion mais

avec un coût énergétique asymétrique/mutuel dans les groupes composés. Cet objectif pourra

être atteint en comparant des groupes d’individus d’âge identique ou différent. Nous

mesurerons aussi le niveau d’attraction sociale entre individus en mesurant les inter-distances

entre sujets et le degré d’alignement des sujets. Nous utiliserons les outils de quantification et

modélisation des comportements élaborés lors de nos travaux passés sur des groupes de

moutons adultes. Nous intègrerons les hypothèses et mécanismes comportementaux dans un

modèle d’agents dans lequel l’état comportemental de chaque individu est représenté par une

variable interne. Cette approche interdisciplinaire permettra d’apprécier la portée de différentes

hypothèses quant à la nature des interactions ainsi que l’identification du voisinage pour rendre

compte des déplacements collectifs et de leur possible modification au cours du développement

des individus. A notre connaissance, ce travail expérimental sera le second à aborder la genèse

et la quantification des déplacements collectifs au sein d’une même espèce et le premier à

évaluer les potentiels coûts de la cohésion dans le même type de milieu complexe permettant

l’expression d’une diversité de comportements entre individus, sans relation de dominance et

sans compétition par exclusion.

Contexte *: L’étude des déplacements collectifs est à l’interface de la biologie-écologie et de

la physique. Elle vise à identifier les comportements les plus simples, les interactions et les

voisins en interaction (niveau individuel - échelle locale) permettant l’expression de propriétés

collectives (niveau collectif – large échelle). Les modèles actuels reposent sur quelques règles

alternatives permettant de rendre compte des propriétés collectives et de leur modification, et il

est parfois difficile d’identifier la meilleure des hypothèses (Weitz et al 2012 ; Hinz & Polavieja

2017 ; Toulet et al. 2015, Gascuel et al 2021). Presque tous ces travaux théoriques ou

expérimentaux s’intéressent à des individus adultes. Plus rares sont ceux qui ont étudié des

individus juvéniles (Bazazi et al 2012 ; Buhl et al 2006). Les travaux reposent en général sur le

fait que les individus sont très comparables du point de vue comportemental et sensoriel, qu’ils

expriment un nombre limité de comportements, que les animaux interagissent en permanence

entre eux. A notre connaissance un seul travail s’est proposé d’étudier les déplacements dans

une perspective de développement/ontogenèse (Hinz & Polavieja 2017). Notre première

question générale est la suivante : les individus se déplacent-ils collectivement et de la même

façon en fonction de l’âge, depuis des stages juvéniles précoces jusqu’au stade adulte. Si des

différences d’attraction sociales ou de déplacement existent entre individus d’âge différent, cela

affecte t’il le niveau de cohésion sociale? Hinz & Polavieja (2017) ont bien montré que le niveau

d’attraction sociale varie avec l’âge. Par contre, ils n’ont pas abordé la question de la cohésion

au sein de groupes composés d’individus de différents âges et le potentiel coût que cela

engendre. Les espèces de vertébrés grégaires vivent en groupes qui peuvent contenir des sujets

qui diffèrent notamment par la taille ou le statut social et cela peut compromettre la cohésion

socio-spatiale ou nécessiter des compromis (Evers et al 2011, Farine et al. 2017, Harel et al

2021). Nous nous proposons d’étudier les comportements, les interactions et les propriétés des

possibles déplacements collectifs au cours du développement chez le modèle mouton (Ovis

aries). Ce modèle présente tout au long de sa vie l’intérêt d’être grégaire et d’occuper un milieu

très comparable, ce qui n’est pas le cas des espèces présentant des métamorphoses par ex. Chez

les moutons sauvages comme domestiques, comme chez de nombreuses autres espèces, les

groupes peuvent être composés d’individus juvéniles, adultes, et de nouveaux nés. Au cours du

développement, les individus présentent des modifications notables de comportement, de

socialité, notamment au cours du passage de l’alimentation lactée à l’autonomie alimentaire.

Aussi au cours des semaines vers l’autonomie alimentaire, on observe une forte réduction des

activités de jeu, des interactions sociales. Le mouton permet d’étudier expérimentalement

l’influence du développement comportemental, alimentaire, de locomotion et social sur la

dynamique des déplacements. Les travaux peuvent être menés dans des pâturages naturels

homogènes. Il est aussi possible de contrôler la composition des groupes. Nos travaux seront

réalisés en composant des groupes de sujets du même âge et d’âge différents, en enregistrant

les comportements à 3 stades de développement (vers 2 mois période suivant le sevrage

alimentaire, 4 mois - période juvénile, 12 mois – période adulte précoce). Les expériences

seront menées dans des pâturages de pelouse naturelle (steppe de la Crau) mais homogène du

point de vue de la couverture végétale. Nous quantifierons au niveau individuel, le niveau

d’attraction sociale, la façon de se déplacer, les coûts énergétiques métaboliques en fonction de

la masse/taille (Nudds et al 2009), de la vitesse de déplacement et le nombre de pas (Heglund

& Taylor 1988, Dewhirst et al 2017) et l’incidence au niveau collectif (cohésion sociale,

alternance et transition de phases stationnaires et non-stationnaires, possible ségrégation

spatiale, niveau d’exploration). Nous utiliserons le cadre d’un système d’agents apprenant par

renforcement (multi-agent reinforcement learning framework) pour évaluer les possibles

modifications des comportements des individus pouvant affecter la coordination sociale lors

des déplacements (Durve et al 2020). Nous évaluerons comment la coordination sociale et les

déplacements peuvent être affectés par l’hétérogénéité environnementale, cette dernière étant

expérimentalement contrôlée.

Méthode : Les animaux seront élevés dans les mêmes conditions. Ils auront accès aux pâturages

dès le plus jeune âge en suivant leur mère. Suite au sevrage maternel, les animaux seront

introduits dans des parcs de même superficie et homogènes du point de vue de la végétation.

Les animaux se trouveront en groupe de taille égale à 2, 8 ou 16. Nous réaliserons 20

réplications pour chaque taille de groupe. Chaque réplication durera une heure.

Les sujets seront équipés de GPS et/ou d’UWB permettant de les localiser au moins 1

fois/sec. Ils porteront aussi des accéléromètres qui permettront de coder automatiquement les

comportements les plus simples. L’identification des comportements se fera par des méthodes

d’apprentissage (deep learning), ce qui nécessite d’être capable d’identifier les comportements

par des méthodes éthologiques classiques, reposant sur des enregistrements videos. Chaque

réplication sera aussi filmée pour identifier les comportements qui pourraient être difficiles à

identifier automatiquement.

Des analyses par échantillonnage focal (focal sampling) et des comptages continus (all

occurrence sampling) durant des périodes courtes pourront permettre d’évaluer les taux de pas

et de bouchées (Michelena et al 2004).

Nous intègrerons toutes les données dans des modèles d’agents intelligents : les agents

peuvent changer et adapter leur comportement en utilisant une variable interne qui représente

le comportement de l’agent. La variable interne évolue par une chaine de Markov et le

comportement dans l’espace est décrit par une équation de Langevin avec des coefficients

dépendent de la variable interne. Dans la phase de l’étude de l’ontogenèse, nous considérons

des coefficients qui évoluent par une dynamique de Reinforcement Learning.

Résultats attendus : Les brebis adultes testées dans des conditions identiques à celles que nous

nous proposons dans ce projet ont la particularité de rester en un seul agrégat lors d’une activité

quasi-contenue de prise alimentaire. Elles alternent des périodes de déplacement nul/très faibles

avec des périodes de déplacement plus rapide sur quelques mètres et ceci en synchronie.

Lorsque des accélérations durent plusieurs secondes, cela conduit à des déplacements collectifs

manifestes. Nous faisons l’hypothèse que la simple attraction sociale qui est sous-jacente au

suivi des individus en déplacement n’est pas aussi marquée durant les stades les plus précoces,

de sorte que l’on s’attend à moins de cohésion sociale et une synchronisation plus faible des

déplacements. Alternativement, la moindre cohésion sociale peut s’expliquer par une plus

grande diversité comportementale chez les jeunes. En outre, la prise alimentaire étant

probablement moins intense (taux de bouchées), moins longue (durée des bouts ou période

inter-repos) on peut imaginer que des activités de repos, de vigilance, d’interactions sociales

rend la polarisation, l’agrégation et donc la cohésion sociale des groupes moins élevée. Avec

l’augmentation de la part du brout, nous émettons l’hypothèse que la synchronie des

déplacements dans l’espace et le temps croît. En outre, nous nous attendons à ce que le coût

énergétique métabolique de déplacement sera plus élevé chez les sujets jeunes, de faible masse

et plus petits, que les plus âgés sur la base des indicateurs de la locomotion. On s’attend à ce

que dans les groupes avec des individus d’âge différent, le niveau de cohésion sociale soit

moindre et puisse engendrer un coût chez les plus jeunes par une augmentation de la vitesse de

locomotion et moins de prise alimentaire.

Finalement, nous intègrerons tous les données dans des modèles d’agents intelligents.

Le modèle nous permettra de pouvoir évaluer les hypothèses et prédire les comportements dans

plusieurs situations hypothétiques. L’utilisation des techniques de Reinforcement Learning

pour faire évoluer des paramètres dans le modèle proposé va nous permettre d’aborder

l’ontogenèse du mouvement collectif théoriquement.

Références bibliographiques *:

Bazazi S et al. 2012. Vortex formation and foraging in polyphenic spadefoot toad tadpoles.

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Buhl J et al. 2006. From disorder to order in marching locusts. Science, 212:1402-1406.

Dewhirst OP et al. 2017. An exploratory clustering approach for extracting stride parameters

from tracking collars on free-ranging wild animals. J. Exp. Biol. 220, 341-346.

Durve M, Peruani F & CelaniA. 2020. Learning to flock through reinforcement. Phys. Rev. E

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Farine DR et al. 2017. Individual variation in local interaction rules can explain emergent

patterns of spatial organization in wild baboons. Proc. R. Soc. B 284: 20162243

Gascuel H, Bon R & Peruani F. 2021. Identifying interaction neighbours in animal groups.

Anim. Behav. 174, 97-104 .

Ginelli F, Peruani F,… Bon R. 2015. Intermittent collective dynamics emerge from conflicting

imperatives in sheep herds. PNAS 112, 12729-12734.

Harel R, Loftus JC, Crofoot MC. 2021. Locomotor compromises maintain group cohesion in

baboon troops on the move. Proc. R. Soc. B 288: 20210839.

Heglund & Taylor 1988. Speed, stride frequency and energy cost per stride: how do they change

with body size and gait? J Exp Biol. 138: 301-318.

Hinz RC & de Polavieja GG. 2017. Ontogeny of collective behavior reveals a simple attraction

rule. PNAS 114 : 2295-2300.

Michelena P … Bon R. 2004. An experimental test of hypotheses explaining social segregation

in dimorphic ungulates. Anim. Behav. 68, 1371–1380.

Nudds RL et al. 2009. Evidence for a Mass Dependent Step-Change in the Scaling of Efficiency

in Terrestrial Locomotion. PLoS ONE 4(9): e6927

Toulet S, Gautrais J, Bon R, Peruani F. 2015. Imitation Combined with a Characteristic

Stimulus Duration Results in Robust Collective Decision-Making. PLoS ONE 10(10):

e0140188.

Evers et al. 2011. Better Safe than Sorry - Socio-Spatial Group Structure Emerges from

Individual Variation in Fleeing, Avoidance or Velocity in an Agent-Based Model. PLoS

ONE 6(11): e26189.

Candidature

Profil et compétences recherchées* : la personne recherchée devra avoir une formation en

éthologie/comportement animal. Elle devra aussi acquérir de solides compétences en

modélisation pour quantifier la dynamique sociale et les déplacements. Elle devra à cet égard

travailler dans deux universités différentes, celles de rattachement des co-encadrants. En outre,

cette personne devra être capable de conduire des expériences sur le terrain, se former au

gardiennage, accepter des périodes d’astreinte dans le domaine. La personne recherchée devra

travailler dans un contexte zootechnique et d’élevage et se conformer aux règles de travail, sous

l’autorité du directeur du domaine. Le site expérimental étant éloigné de l’université, la

personne devra montrer de l’autonomie, tout en restant en contact étroit avec les directeurs de

thèse, de la résistance physique, de la persévérance et beaucoup de rigueur.

Profile and skills required* : the candidate should have a solid background in ethology/animal

behavior and a strong affinity with quantitative analyses/modelling. The necessity to share time

between the two universities of affiliation of supervisors must be taken into account. The

candidate should have also to conduct experiments in the field with previous formation in

herding sheep, which requires physical resistance, perseverance and rigorousness. During

experiments the candidate should have to care all the animals involved, this requiring

commitment all the week, in conformity with the zootechnical rules of the experimental farm,

cooperating with the community of agents appointed in the farm. Because the field station is

far from the laboratories, the candidate should manifest a strong autonomy but also should keep

permanent contact with both supervisors.

Noldus vacancy

 Nous recherchons un/e nouveau/elle collègue pour renforcer notre équipe à Noldus. Cette personne travaillera en tant que technico-commercial, ce qui comprend aider et conseiller nos utilisateurs ainsi que dispenser les formations à l’utilisation des outils Noldus. Idéalement, nous recherchons quelqu’un parlant français et anglais, ayant un intérêt particulier pour les sciences / la recherche comportementale; quelqu’un qui apprécie les contacts sociaux afin de donner le meilleur service à nos clients (= vous!) et de les aider dans leurs recherches.

Une offre d’emploi officielle sera bientôt publiée, mais d’ici là, nous apprécierions grandement si vous pouviez nous aider à diffuser cette offre et nous aider à trouver quelqu’un au sein de votre réseau. Quiquonque qui serait intéressé est prié de répondre à ce message.

Nous vous remercions sincèrement pour vous aide!

L’équipe Noldus

(Guus Bongers, Lorraine Delisle, Jacqueline Berfelo, Micha Oudakker)

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We are looking for a new colleague to strengthen the Noldus Team. This new colleague will work in a commercial role, but will also advise our customers in their research questions and train them in the use of our tools. Preferably we are looking for somebody speaking both French and English, having a strong interest in science and/or behavioral research and somebody that likes to interact with our users (= you!) helping them to improve their research.

An official vacancy will be opened soon, but we would really appreciate it if you could use your network to find this new colleague and spread this message so we can keep our service at the current high level. Anybody interested is kindly asked to respond to this message.

Thank you in helping us!

Noldus Sales Team

(Guus Bongers, Lorraine Delisle, Jacqueline Berfelo, Micha Oudakker)

Offre de stage volontaire en Éthologie

 Étude de l’impact d’interactions sociales quotidiennes sur le bien-être du cheval et sa coopération/résistance lors du pansage Description détaillée : Chez les espèces sociales, avoir la possibilité d’établir des relations avec des congénères constitue un besoin fondamental et un prérequis à leur bien-être. L’absence de contacts sociaux a des conséquences extrêmement délétères sur le fonctionnement de l’organisme de ces espèces : immunosuppression, apparition de comportements aberrants et stéréotypies, automutilation. Certaines d’entre elles sont néanmoins élevées en isolement social, une situation génératrice de stress chez l’animal. C’est le cas du cheval domestique (Equus caballus) qui, malgré son caractère social, est traditionnellement hébergé de manière isolée. Les conséquences négatives de cet hébergement individuel sur le bien-être et la santé des équidés commencent à être largement connues. Elles pourraient également s’étendre à d’autres domaines tels que la cognition ou encore la relation entre cheval et humain. Afin d’explorer ces potentiels liens, nos travaux portent sur la question suivante : Les contacts sociaux influencentils le bien-être chez le cheval domestique et ses comportements dans la relation avec l’humain lors du pansage ? L’étude a été menée sur 16 chevaux pendant 4 mois. Les individus étaient hébergés en box et la moitié de l’effectif avait la possibilité d’établir des contacts sociaux avec un congénère quotidiennement. Le stage consistera à analyser les vidéos de pansage réalisées tout au long de l’étude. Celui-ci s’intègre dans le projet Bien-être Social mené en collaboration entre l’Unité Mixte de Recherche Physiologie de la reproduction et des comportements (CNRS, INRAE, Université de Tours, IFCE), l’IDELE (service Méthodes et Outils pour les références et le conseil) et la société Horse Stop. Profil recherché : - Etudiant·e à partir de la Licence 3 en Biologie ou stage conventionné par la mission locale - Un intérêt pour l’éthologie est indispensable - Une connaissance des chevaux domestiques serait appréciée - Rigueur scientifique dans la prise de données - Savoir travailler en autonomie - Une expérience préalable d’analyse vidéo est un plus Lieu du stage : Campus CNRS, bâtiment 40, 23 rue du Loess, 67037 Strasbourg Période de stage : Dès que possible, 2 mois Responsables du stage : Odile Petit et Anna Flamand, UMR Physiologie de la Reproduction et des Comportements, équipe NECOS, antenne de Strasbourg. Pour candidater : Envoyer CV et lettre de motivation par e-mail à Odile Petit (odile.petit@inrae.fr) et Anna Flamand (anna.flamand@inrae.fr) au plus tard le 20 avril 2022. Si vos dates ne correspondent pas à celles proposées, merci de ne pas nous écrire, nous ne considèrerons pas votre candidature (pas de réponse)

Offres de stage