mardi 12 mars 2019

sujet de thèse ecophysiologie et comportement animal

Recherche de candidat pour concours bourse de thèse Ecole Doctorale 414, Université de Strasbourg et Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, France.
Hétérogénéité sociale et vieillissement : étude de la variabilité individuelle chez deux mammifères sociaux
Nous recherchons actuellement un(e) candidat(e) motivé(e) pour concourir à une bourse de thèse en écophysiologie et comportement animal à l'Ecole doctorale 414 de Strasbourg. Le concours aura lieu début Juillet 2019. 
Afin de concourir, ce(tte) candidat(e) doit:
- Avoir complété un Master de biologie avec une forte composante en écophysiologie, écologie comportementale et biologie évolutive
- Se situer dans le premier tiers du classement de sa promotion (moyenne minimum de 14/20)
Nous assisterons le candidat dans la préparation du concours de l'école doctorale.
Le concours consiste en une présentation d'environ 10-15 minutes du sujet de Master et projet de thèse du/de la candidat(e) face à un jury de 20-25 professeurs/chercheurs en biologie (allant de la biologie moléculaire, génétique, physiologie animale et végétale, écologie et évolution), suivi d'une session de question/réponses  de 15 minutes environ.
En cas de succès, le/la candidat(e) se verra attribué(e) une bourse de 3 ans afin de compléter une thèse à l'Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien sous la co-supervision de VA Viblanc, C Schradin et F Criscuolo sur le sujet décrit ci-dessous:
En biologie évolutive, le vieillissement peut s’apparenter à la senescence, définie comme la diminution du succès reproducteur et des chances de survie au cours de l’âge. Plus que la nature des mécanismes du vieillissement per se, c’est l’observation de la variabilité individuelle du taux de vieillissement (et donc de l’âge d’entrée en sénescence) qui interpelle. C’est dans le contexte de l’explication de cette variabilité que les déterminants mécanistiques prennent tout leur intérêt. Les études actuelles révèlent que les télomères, séquences d’ADN génomiques protectrices des extrémités des télomères linéaires, et leur enzyme réparatrice la télomérase, prédisent la longévité et la qualité intrinsèque des individus. Avoir de longs télomères et réduire leur érosion au cours du temps, semble être l’apanage des individus les plus performants. Parmi les facteurs modulant l’érosion des télomères, le stress environnemental, y compris celui induit par les congénères (stress social), est un facteur largement étudié chez l’Homme, mais sous-évalué chez l’animal sauvage et dont l’impact sur les mécanismes évolutifs reste inconnu. Ces interrogations font parties d’un projet de recherche commun des chercheurs de l’équipe EpE (http://www.iphc.cnrs.fr/-Ethologie-et-Physiologie-Evolutive-EPE-.html). Ce projet s’appuie sur le suivi à long-terme de populations d’animaux sociaux sauvages. Les données individuelles comportementales et sociales, de trajectoire de vie et physiologiques de souris rayées (Rhabdomys pumilio) et de spermophiles de Colombia (Urocitellus colombianus) collectées depuis plusieurs années seront utilisées. Cette thèse évaluera (i) la contribution de l’environnement asocial et social sur la dynamique d’érosion des télomères dans un milieu aride ou un milieu alpin en analysant des échantillons collectés lors de saisons aux conditions environnementales contrastées (i.e. sécheresse); (ii) la force prédictive de la taille et l’érosion des télomères sur la survie des individus, en particulier chez la souris rayées dont 70% ne vivent pas plus d’un an ; (iii) l’impact de l’environnement social sur les télomères chez la souris rayée, dont la structure sociale varie d’individus solitaires à des groupes familiaux, et chez le spermophile où la densité locale d’individus appariés (mères –filles) affecte le stress social. Au cours de la 1ère année, le/la doctorante s’appuyera sur des échantillons déjà collectés en 2016-2018 (500 échantillons au total) et devra réaliser les analyses télomères et télomérase. Il/elle exploitera ses résultats en préparation de la 2nd année. Il/elle devra s’initier aux méthodes d’analyse des relations sociales (modèles statistiques) et leurs conséquences physiologiques (stress via la mesure de glucocorticoïdes plasmatique, glucose, stress oxydatif). Ceci permettra de tester les liens de causalité entre socialité et vieillissement (approche path-analysis, expérimentation). La 2nd année verra la réalisation à la fois de ce 2nd chapitre d’analyse et de l’expérimentation sur le terrain. La 3ème année de thèse sera partagée entre la réalisation de mesures complémentaires, et l’exploitation des résultats. La thèse nécessitera des missions de terrain de plusieurs mois au Canada et en Afrique Sud. Le/la candidat(e) travaillera dans l’équipe Ethologie et Physiologie Evolutive de l’IPHC et au département Ecologie, Physiologie et Ethologie. L’équipe comprend 5 chercheurs collaborant sur la coévolution des traits d’histoire de vie et de la socialité. Le/la doctorant sera encadré par VA Viblanc et C Schradin pour les aspects évolutifs, sociaux et stress, et par F Criscuolo et S Zahn (ingénieure) pour la partie sur le vieillissement. Il/elle s’appuyera sur une méthodologie déjà développée pour ces deux espèces pour la mesure en qPCR des télomères, et sur une mise en place actuelle d’un protocole de mesure de l’activité télomérase par Digital Droplet qPCR avec l’Université de Vienne.
Strasbourg, capitale Européenne, est une citée vivante et attractive située à 1h45 de Paris en train, 1h by d'Amsterdam ou des pays Scandinaves en avion, et aux portes (30 minutes de vélo) de l'Allemagne. La ville possède un riche patrimoine historique et architectural, le centre historique de Strasbourg étant listé au patrimoine mondial de l'UNESCO. Sa diversité multiculturelle, son centre piéton et les quelques 500km de pistes cyclables en font une citée agréable à explorer et découvrir. Vibrante et abordable, Strasbourg est une ville étudiante par excellence, où il fait bon vivre et étudier (quelques informations sur la vidéo du New York Time: 36 Hours in Strasbourg).
Les candidatures doivent inclure 1) une lettre de motivation, 2) un curriculum vitae détaillé, 3) les relevés de notes du Master. Merci de tout compiler en un seul fichier pdf à envoyer à vincent.viblanc @iphc.cnrs.frcarsten.schardin@iphc.cnrs.fr, francois.criscuolo@iphc.cnrs.fr
Littérature conseillée
  • Criscuolo, F., et al. (2018) Experimental manipulation of telomere length: does it reveal a corner-stone role for telomerase in the natural variability of individual fitness?. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2018, vol. 373, no 1741, p. 20160440.
  • Viblanc, VA., et al. (2016) Kin effects on energy allocation in group‐living ground squirrels. Journal of Animal Ecology, 2016, vol. 85, no 5, p. 1361-1369.
  • Schoepf, I., et al. (2017). The pathophysiology of survival in harsh environments. Journal of Comparative Physiology B 187(1): 183-201.