IDELE recrute un(e) Stagiaire

Analyse des comportements à l’abreuvoir des ovins 

Organisme de recherche-développement, l’Institut de l’Élevage est à la convergence de la recherche et du conseil. Sa vocation est d’améliorer la compétitivité des élevages herbivores et de leurs filières, tout en apportant des éléments de réponse aux questions sociétales. Ses travaux proposent des solutions techniques aux éleveurs de bovins, ovins, caprins et équins et aux acteurs économiques des filières Contexte L’Institut de l’Elevage recherche un stagiaire Ethologue ou Data Scientist. Le stagiaire sera intégré au service Data’Stat, équipe constituée de 12 DataScientists. Ces missions s’inscriront dans le cadre de la réalisation d’un projet Européen (https://techcare-project.eu/francais/) visant à apporter des solutions numériques aidant au suivi des animaux. Parmi les objectifs du projet, Idele est impliqué dans le développement d’une solution du suivi du comportement des ovins à l’abreuvoir à l’aide de boucles RFID UHF. Pour valider ce dispositif, l’analyse vidéo des comportements à l’abreuvoir est nécessaire. Descriptif du poste En lien avec un référent Data Scientist, la personne recrutée sera chargée : • De « taguer » des données vidéos en lien avec des comportements d’animaux à l’abreuvoir • De réaliser l’analyse des données Profil recherché De formation en Ethologie OU Data sciences de niveau Licence / Master • Être à l’aise avec l’analyse vidéo (minimum 50% du temps de travail) • Bonne aptitude au travail d’équipe • Organisation, rigueur, esprit d'initiative, autonomie • Une maitrise du logiciel R est un plus Type de contrat : Stage – 3 mois minimum Localisation : Paris MNE Entrée en fonction : dès que possible Date limite des dépôts de candidatures : Gratification : 591,51€ / mois (brut) Candidatures : Uranie JEAN-LOUIS : uranie.jean-louis@idele.fr

Offre de stage

 

Sujet de thèse – Comportement, cognition et neurobiologie chez l’oiseau domestique, la caille japonaise (Coturnix japonica)

 Titre : Relations entre le niveau de sociabilité de l’individu, les comportements sociaux, les capacités cognitives et les bases neurobiologiques associées chez l’oiseau domestique Unité/Equipe d’accueil : UMR PRC 7247 - INRAE Centre Val de Loire, Equipe Cognition, Ethologie, Bien-être animal Encadrants : Ludovic Calandreau (Directeur de Recherche, HDR, INRAE Nouzilly) et Vitor Ferreira (Chargé de Recherche, INRAE Nouzilly) https://www6.val-de-loire.inrae.fr/umrprc-ethologie-cognition/L-equipe https://www.researchgate.net/profile/Ludovic-Calandreau https://www.researchgate.net/profile/Vitor-Ferreira-38 https://twitter.com/EquipeCEB Informations pratiques Date limite de candidature : 19 mars 2023 Début de doctorat : Octobre 2023 Durée : 3 ans Financement : Acquis. Le processus de sélection est divisé en deux étapes : Tout d'abord, les encadrants sélectionneront trois candidats parmi toutes les candidatures reçues. Cette sélection aura lieu entre le 20 mars jusqu’au 14 avril 2023. Deuxièmement, le jury de l'école doctorale procédera à des auditions entre le 14 et le 15 mai 2023 afin de déterminer le/la candidat.e retenu.e pour la thèse. Salaire : 1874,41 € brut mensuel Résumé : Chez les oiseaux et les mammifères, des études comparatives ont démontré que les espèces qui établissent davantage de liens sociaux, ou des liens de meilleure qualité, possèdent des capacités cognitives plus élaborées. Or, au sein d’un même groupe, les individus peuvent différer dans leur niveau de sociabilité, définie comme l'aptitude à établir des liens sociaux. Par ailleurs, des études récentes montrent que des traits de comportements stables, appelés trait de personnalité, peuvent moduler les capacités cognitives des individus. Pourtant, des liens possibles entre trait de sociabilité et capacités cognitives restent encore mal connus, en particulier chez les oiseaux. Ce projet vise ainsi, dans sa première partie, à étudier, grâce à un modèle unique de cailles japonaises génétiquement sélectionnées depuis plus de 75 générations sur leur niveau sociabilité (lignée à haute ou faible sociabilité), l’influence de ce trait sur des comportements importants pour l’organisation et la dynamique de groupe. Ensuite, nous étudierons, grâce à ses lignées, si le niveau de sociabilité d’un individu influence sélectivement les capacités cognitives en lien avec le traitement d’informations sociales ou plus généralement d’autres capacités cognitives, sans lien apparent avec les informations sociales. Enfin, pour conforter ces expériences de comportement et de cognition, nous étudierons si, au sein de régions du cerveau connues pour être impliquées dans les comportements sociaux ou la cognition, l’expression de marqueurs de plasticité est elle aussi modulée par le niveau de sociabilité de l’individu. Outre son intérêt fondamental, ce projet permettra d'accroître nos connaissances sur le comportement social d'une espèce d'élevage. En effet, certaines altérations comportementales majeures rencontrées dans les systèmes de production avicole (picage sévère, agressivité) sont liées au comportement social. Une meilleure compréhension de ces comportements chez les oiseaux domestiques nous permettra de proposer des solutions potentiellement plus efficaces et plus précises. Profil recherché : Le ou la candidate peut être issu.e d'une formation en éthologie, neuroscience, psychologie, ou d’école agri/agro/véto, avec un grand intérêt pour le comportement et la cognition animale, ainsi que la neurobiologie. Bonnes capacités d’analyse, rédactionnelles (français et anglais) et statistiques. Les candidats étrangers doivent avoir un niveau de français intermédiaire avancé (B2). Permis de conduire B nécessaire. Véhicule personnel recommandé. Contact : Pour plus d’information ou pour envoyer votre candidature (lettre de motivation, CV, notes) : Vitor Ferreira (vitor.ferreira@inrae.fr). En plus d’un premier contact avec les encadrants, les candidatures doivent être déposées sur ADUM (https://collegedoctoral-cvl.fr/as/ed/proposition_Setab.pl?site=CDCVL) à partir du 20 février 2023 et jusqu’au 19 mars 2023.

PhD thesis - Behavior, cognition and neurobiology in the domestic bird, the Japanese quail (Coturnix japonica) Title: Relationships between the level of sociability of the individual, social behaviors, cognitive abilities and associated neurobiological bases in the domestic bird Host Unit/Team: UMR PRC 7247 - INRAE Centre Val de Loire, Cognition, Ethology, Animal Welfare Team Supervisors: Ludovic Calandreau (Research Director, HDR, INRAE Nouzilly) and Vitor Ferreira (Research Associate, INRAE Nouzilly) https://www6.val-de-loire.inrae.fr/umrprc-ethologie-cognition/L-equipe https://www.researchgate.net/profile/Ludovic-Calandreau https://www.researchgate.net/profile/Vitor-Ferreira-38 https://twitter.com/EquipeCEB Practical information Application deadline: March 19, 2023 Start of PhD: October 2023 Duration: 3 years Funding: Acquired. The selection process is divided into two stages: First, the supervisors will select three candidates from all applications received. This selection will take place between March 20 and April 14, 2023. Second, the jury of the doctoral school will hold auditions between May 14 and 15, 2023 to select the candidate for the thesis. Salary: 1874,41 € gross per month Summary: Comparative studies in birds and mammals have shown that species that are more socially connected, or have connections of better quality, have more sophisticated cognitive abilities. However, within the same group, individuals may differ in their level of sociability, defined as the ability to form social bonds. Moreover, recent studies show that stable behavioral traits, called personality traits, can modulate the cognitive abilities of individuals. However, possible links between sociability traits and cognitive abilities are still poorly understood, especially in birds. This project aims, in its first part, to study, through a unique model of Japanese quails genetically selected for more than 75 generations on their sociability level (high or low sociability line), the influence of this trait on important behaviors for the organization and the dynamics of group. Then, we will study if the level of sociability of an individual selectively influences the cognitive capacities related to the processing of social information or, more broadly, other cognitive capacities without apparent link with social information. Finally, to support these behavioral and cognitive experiments, we will study whether, within brain regions known to be involved in social behavior or cognition, the expression of plasticity markers is also modulated by the individual's level of sociability. In addition to its fundamental interest, this project will increase our knowledge on the social behavior of a farmed species. Indeed, some major behavioral alterations encountered in poultry production systems (feather pecking, aggressiveness) are related to social behavior. A better understanding of these behaviors in domestic birds will allow us to propose potentially more effective and more precise solutions. Profile requirements: The candidate may have a background in ethology, neuroscience, psychology, or come from an agro-, agricultural/veterinary school/university, with a strong interest in animal behavior, cognition, and neurobiology. Good analytical, writing (French and English) and statistical skills. Foreign candidates must have an upper-intermediate level of French (B2). Driving license B required. Personal vehicle recommended. Contact: For more information or to send your application (cover letter, CV, grades): Vitor Ferreira (vitor.ferreira@inrae.fr). In addition to a first contact with the supervisors, applications must be submitted on ADUM (https://collegedoctoral-cvl.fr/as/ed/proposition_Setab.pl?site=CDCVL) from February 20, 2023 until March 19, 2023.

Offre de thèse en Ecologie Comportementale – Despotisme & Hyène Tachetée (Berlin)

 Nous recrutons un.e étudiant.e en thèse pour travailler avec Oliver Höner et moi-même sur les déterminants des styles de dominance et des propriétés hiérarchiques chez la hyène tachetée. L’étudiant.e sera basé.e au sein de notre groupe de recherche Ngorongoro Hyena Project (https://hyena-project.com/) à l’institut Leibniz-IZW de Berlin (Allemagne).

 

Ce projet s’intègre dans une collaboration avec Elise Huchard et Marie Charpentier de l’ISEM (Montpellier) et Dieter Lukas de l’Institut Max-Planck en Anthropologie Évolutive (Leipzig) pour l’étude de l’évolution des sociétés despotiques chez les mammifères (“DESPOT”), avec un co-financement ANR-DFG pour 3 ans.

L’étudiant.e aura à sa disposition un jeu de données exceptionnel compilant 27 années de données démographiques, écologiques, sociales et comportementales sur les huit clans de hyènes qui composent la population vivant sur le plancher du Cratère du Ngorongoro (Tanzanie). L’étudiant.e aura aussi la possibilité de collecter des données sur le terrain.

 

La position est à temps-plein pour un salaire confortable dans la gamme 1600-1800 euros net par mois (traduction du jargon administratif indiqué par la mention « 65 % TVöD (Bund) E13 » dans l’annonce officielle).

La date limite de dépôt de candidature est le 10 mars 2023 pour un début de projet le 1er juin 2023.

Une description (en anglais) détaillée de l’offre et de la procédure de candidature est disponible sur la plateforme de candidature: https://short.sg/j/28105318

 

Merci de faire circuler cette annonce dans vos réseaux. N’hésitez pas à me contacter (Eve Davidian: davidian.ceve[at]gmail.com) ainsi que Oliver Höner (hoener[at]izw-berlin.de) pour plus d’information.

  

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Dear colleagues,

We are recruiting a PhD student to work with Oliver Höner and myself on the determinants of dominance styles and hierarchical properties in the spotted hyena. The student will be based at the Leibniz-IZW in Berlin (Germany) as part of our research group Ngorongoro Hyena Project (https://hyena-project.com/).

 

This project is part of an international collaboration with Elise Huchard and Marie Charpentier from the ISEM (Montpellier) and Dieter Lukas from the Max-Planck-Institute for Evolutionary Anthropology (Leipzig) to study the evolution of despotic societies in mammals ("DESPOT"), which is co-funded by the French (ANR) and German (DFG) research foundations for 3 years.

The student will have at their disposal an exceptional individual-based dataset compiling 27 years of demographic, ecological, social and behavioral data on the eight clans of spotted hyenas that make up the population living on the floor of the Ngorongoro Crater (Tanzania). The student will also have the opportunity to do fieldwork in Tanzania and contribute to data collection.

 

This is a full-time position with a comfortable salary in the range of 1600-1800 euros netto per month (translation of the administrative jargon indicated by the mention "65% TVöD (Bund) E13" in the official announcement).

The application deadline is 10 March 2023 for a start date on 1 June 2023.

A detailed description of the offer and the application procedure is available on the online platform: https://short.sg/j/28105318

 

We would be grateful if you circulated this announcement in your networks. Feel free to contact me (Eve Davidian: davidian.ceve[at]gmail.com) and Oliver Höner (hoener[at]izw-berlin.de) for more information.

 

Fully funded PhD opportunity at the University of Bristol: Heat impacts on pregnancy outcomes: an interdisciplinary and cross-species approach

 4-year stipdendship + research costs; open to international applicants.

More information: https://www.jobs.ac.uk/job/CWZ394/phd-studentship-heat-impacts-on-pregnancy-outcomes-an-interdisciplinary-and-cross-species-approach

Supervisors:

Dr Sinead English (School of Biological Sciences) - https://evelab.org

Dr Eunice Lo (Cabot Institute for the Environment) - https://www.climatebristol.org/research/

Dr Kate Birchenall (Bristol Medical School) - https://research-information.bris.ac.uk/en/persons/kate-a-birchenall

The project:

There is increasing appreciation that extreme weather events such as heatwaves increase mortality risks in humans and a range of organisms. Less well understood, however, is how such events affect other aspects of health, particularly those in potentially heat-vulnerable categories such as pregnant women. Recent research across a range of organisms has shown that fecundity outcomes are even more sensitive to temperature variation than survival. Moreover, there is emerging evidence that pregnant women exposed to heat are more likely to have miscarriages or give birth pre-term. We can gain powerful insights by using animal models to understand underlying physiological mechanisms in tandem with epidemiological studies in human populations.

Heatwaves are increasing in frequency and intensity across the globe and miscarriage and pre-term birth have major consequences for short- and long-term wellbeing of mothers and children. Taken together, a new understanding of how heat affects pregnancy outcomes is important for estimating how climate change will impact human health in the future.  

We propose an exciting PhD project that will use an interdisciplinary approach to understand the consequences of heat exposure on pregnancy outcomes in humans and other organisms. This project will also investigate whether such effects depend on the timing in pregnancy (heat exposure around conception, or in a particular trimester).

The aims are:  

(1) Understand the physiological mechanisms by which heat affect pregnancy outcomes, and how these depend on the timing when these were experienced.  

The student will conduct heat simulation experiments in Diploptera punctata – a viviparous cockroach, and a non-human experimental model of pregnancy – to test how heat exposure affects both phenotypic (size and gestational age at birth) and molecular outcomes (DNA methylation and gene expression) in offspring, and any long-term consequences of such exposure.  

(2) Investigate how temperature variations are linked to pregnancy outcomes in humans.  

The student will use large-scale human cohort studies such as ALSPAC and UK Biobank, and link these data with UK Met Office climate observations based on the participants' locations during their pregnancy, to establish how patterns of temperature are linked to pre-term birth and size for gestational age. Molecular insights into such associations will also be available by conducting both GWAS and EWAS studies.  

(3) Project future impacts to inform adaptation based on physiological and observational insights.  

The student will combine both the biological and mechanistic insights gained from the experimental approach (Objective 1) and epidemiological analyses (Objective 2) to (i) project future birth outcomes and long-term morbidity patterns (due to, e.g., higher pre-term birth) in humans associated with climate change; (ii) develop potential heat adaptation strategies for pregnant women at stages of pregnancy when they are particularly vulnerable, for public health policy consideration.  

Candidate experience and qualifications

o upper second-class honours degree (or equivalent) in biological sciences or related discipline  

How to apply to the University of Bristol

When applying for this project please choose ‘Biological Sciences (PhD)' (https://www.bristol.ac.uk/study/postgraduate/apply/start-application/) in the 'find a programme' box. You should refer to the project title and supervisor in your application.

Application deadline: 28 February 2023

Interviews will be held the week commencing 17 April 2023.

General Enquiries: Dr Eunice Lo (eunice.lo@bristol.ac.uk)

Offre de stage 8 semaines

 Proposition de stage M1 ou autre stage de 8 semaines sur la période mars-juin.

Etude de l’effet des plasmas (gaz ionisés) hors équilibre à la pression atmosphérique sur le comportement du blob (Physarum Polycephalum)

Les plasmas, connus sous le nom de quatrième état de la matière, sont des gaz ionisés de manière naturelle (aurore boréale, foudre, étoile, …) ou artificielle (décharge électrique, tube fluorescent, écran plasma, …). Ils peuvent être générés à partir de n’importe quel gaz ou mélange de gaz dans une très grande gamme de pressions allant de quelques mbar à plusieurs dizaines de bars et à des températures pouvant aller de quelques degrés Celsius à des millions de degrés Celsius. Ce sont des milieux complexes qui contiennent des espèces chargées (électrons, ions), des espèces dans des états excités et des radicaux. Ils émettent du rayonnement de l’UV à l’infrarouge et peuvent générer localement des champs électriques intenses. Ils peuvent de ce fait induire une physicochimie extrêmement riche. Parmi tous les plasmas, il existe une catégorie dite « plasma hors équilibre à basse température » dans laquelle la température du gaz ou du mélange de gaz est proche de la température ambiante, présentant donc un intérêt particulier pour le traitement de surfaces sensibles, notamment biologiques.

Les deux dernières décennies ont vu une augmentation impressionnante des travaux dédiés aux applications de ces plasmas hors équilibre à la pression atmosphérique, en particulier dans des domaines liés à la biologie et à la médecine, conduisant à de nombreux travaux incluant des expériences in-vivo. L'utilisation de modèles animaux dans les expériences pose de plus en plus de problème dans la recherche translationnelle en médecine, en particulier en Europe. Dans ce contexte, des efforts sont faits pour trouver des alternatives à la phase in-vivo. Actuellement, les structures cellulaires organoïdes et 3D in-vitro sont de plus en plus utilisées dans la recherche translationnelle, mais elles n'imitent qu'une partie de l'organisme à l'étude, et non l'organisme entier.  Le myxomycète Physarum polycephalum (PP), aussi appelé blob, pourrait potentiellement être utilisé comme un nouveau système modèle, particulièrement dans l’utilisation des plasmas. PP est un grand organisme unicellulaire polynucléé (jusqu'à plusieurs centaines de centimètres carrés) qui réagit à son environnement et présente des comportements complexes.

Le stage sera dédié à l’étude des effets de l’exposition d’un PP à un plasma non thermique à la pression atmosphérique et au champ électrique pulsé associé. Les expériences sur PP LU352, DW et Malu, seront essentiellement réalisées avec un jet, pulsé µs, de plasma d’hélium fonctionnant dans une gamme de fréquences allant jusqu'à 20 kHz et des hautes tensions allant jusqu'à 20 kV. Des expériences seront aussi réalisées avec un autre type de décharge appelé DBD (Dielectric Barrier Discharge). Une attention particulière sera portée à la fois sur la viabilité et la croissance de PP LU352 en interaction avec le plasma en fonction des paramètres de décharges (fréquences, tension, gaz ou mélange de gaz contenant ou non de l’oxygène) et des temps d’exposition. On s’intéressera au stress oxydatif généré au sein de l’organisme et à sa réponse à court et moyen terme.

Le stage s’effectuera au sein Groupe de Recherche sur l’Energétique des Milieux Ionisés (GREMI), UMR7344 Université d’Orléans/CNRS à Orléans (ce laboratoire de physique des plasmas est équipé d’une salle de biologie de classe L2 équipée) en collaboration avec le Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA), UMR5169 Université Toulouse III/CNRS, Centre de Biologie Intégrative (CBI). Ce stage s’adresse tout particulièrement à un-e étudiant-e  attiré-e par les expériences et aimant les aspects multidisciplinaires.

Responsables de Stage : Éric Robert (eric-robert@univ-orleans.fr) et Audrey Dussutour (audrey.dussutour@cnrs.fr),  avec la participation de Jean-Michel Pouvesle (jean-michel.pouvesle@univ-orleans.fr)