Projets doctoraux

 

Nous sommes fiers d'annoncer le lancement officiel du Réseau Doctoral VoCS - Voice Communication Sciences financé par une Action Marie-Sklodowska-Curie de l'Union Européenne.

 

Nous allons recruter 19 Doctorante.s pour des projets interdisciplinaires en Sciences de la Communication Vocale au sein d'un consortium international de 22 partenaires académiques et non-académiques.

 

L'appel à candidature ouvrira en Février 2025 pour des projets débutant à l'Automne 2025. Plus d'information sur vocs.eu.com

PhD position in Bielefeld University

 

We are looking for a PhD student to study the impact of anthropogenic noise on fitness-related behaviours, gene expression profiles, and gut microbiome in birds

Location: Department of Behavioural Ecology, Bielefeld University, Germany
Start Date: 01.06.2024
Duration: 3 years
Application Deadline: 03.01.2025

Link to the advertisement: https://www.uni-bielefeld.de/fakultaeten/biologie/forschung/arbeitsgruppen/behav_eco/news/PhD_opportunity.pdf

Background

Anthropogenic noise has become an ever-present pollutant across ecosystems, posing significant threats to wildlife. Birds are especially vulnerable due to their dependence on acoustic cues for communication, navigation, and mate selection. Despite the widespread impacts of noise pollution, our understanding of the exact physiological, behavioural, and molecular mechanisms through which it affects bird populations remains limited. This project aims to bridge this gap by examining how anthropogenic noise influences fitness-related behaviours, gene expression profiles, and gut microbiota in birds.

Job Description

We are seeking a highly motivated, passionate PhD candidate to investigate how anthropogenic noise affects avian species, employing a comprehensive approach, integrating physiological, behavioural, and molecular analyses. This highly collaborative project requires frequent, reciprocal interactions and exchanges among partner institutions, fostering a vibrant, stimulating environment.  that supports the growth and development of early-career researchers. PhD students will have the opportunity to work at the intersection of multiple disciplines, including molecular biology, ecophysiology and animal behaviour.

The successful candidate will work on:

• Conducting behavioural and physiological experiments on captive zebra finches
• Employing multi-omic analyses, including transcriptomics and microbiome profiling

Qualifications

• A Master’s degree (or equivalent) in Biology, Ecology, Animal Behavior, or a related field
• Strong interest in behavioural ecology, molecular biology
• Proficiency in data analysis and a strong command of R
• Excellent written and verbal communication skills in English
• Strong organisational and communication skills and commitment to the research goals are essential,
• Strong motivation, critical thinking, and an ability to work independently
• Ability to work as a part of an international, multidisciplinary team

Preferable qualifications

• Previous experience with molecular techniques, behavioural experiments
• Papers in peer-reviewed international journals
• Previous experience in working with animals and/or attendance of animal experimentation course (Felasa or similar) is an advantage

What We Offer

• Access to state-of-the-art research facilities and resources for laboratory work
• Training in cutting-edge multi-omic technologies and behavioral ecology techniques
• Salary according to Remuneration level 13 TV-L (65%)
• Fixed-term employment limited to three years
• A stimulating, open and pleasant working atmosphere
• The opportunity to contribute to cutting-edge research with implications for animal conservation
• Funding for travel, conference attendance, and publication costs

The student will be supervised by Dr. Öncü Maraci and Prof. Barbara Caspers. The working language is English.

Application Procedure: We look forward to receiving your application via our application portal: https://jobs.uni-bielefeld.de/job/apply/3865/research-position-phd-candidate?page_lang=en

For further information about our department, please see the webpage: https://www.uni-bielefeld.de/fakultaeten/biologie/forschung/arbeitsgruppen/behav_eco/index.xml

Do not hesitate to contact Öncü Maraci regarding your questions about the position, working group and Bielefeld via email: oncu.maraci@uni-bielefeld.de

Bielefeld is an equal-opportunity employer. We particularly welcome applications from people from underrepresented groups, including but not limited to women and people with disabilities. Given equal suitability, qualifications and professional achievement, people from underrepresented groups will be given preference unless particular circumstances apply.

PhD opportunities at Harper Adams University

Four PhD studentships currently being advertised at Harper Adams University under the MIBTP programme. 

Individuality in animals: applying personality profiles to evidence-based management of small mammals in education - https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/mibtp/phd/supervisors/ewilliams/

Beyond Vertebrates: Developing Validated Welfare Standards and Ethical Guidelines for Invertebrate Management in Captivity, Farming and Research - https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/mibtp/phd/supervisors/hcampbell/

Improving the Welfare of Farmed Fish by Personality and Physiological Profiling in Aquaculture Settings - https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/mibtp/phd/supervisors/therath/

Improving Welfare of Salmonids: Impact of Stress on Behaviour and Host-Pathogen Dynamics During Early Life Stages - 

https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/mibtp/phd/supervisors/therath/

For further information see the links above, or our blog, which details the projects: https://www.harper-adams.ac.uk/blog/post/3145/midlands-integrative-biosciences-training-partnership-mibtp-phd-opportunities-with-the-animal-behaviour--welfare-research-group. 

If you have any questions then please email me on ewilliams@harper-adams.ac.uk. 

Research assistant (f/m/d) Great Ape Cognition and Curiosity

 

Background

This position is based at the Development and Evolution of Cognition Research Group at the Max Planck Institute of Animal Behavior in Konstanz, Germany. Our team to date includes 3 Postdocs, 2 PhD students, 2 Technicians, as well as Master and Bachelor students. This research project is part of a collaborative project which is partly funded by the VW Freigeist Foundation and aims at testing the cognitive performance and curiosity in orangutans, chimpanzees and humans.

 

The research

Humans deliberately innovate, even in the absence of any problem to solve. This desire to learn and know, i.e. curiosity, seems to set humans apart from other species. Being curious has powerful consequences on the individual level. Through increased innovation rates, curious individuals transform their cognitive capacity into skills and knowledge faster than uncurious individuals. As such, curiosity may be a key psychological trait that makes cognitive potential visible for natural selection. Therefore, to fully understand cognitive evolution, aside from external factors, it is crucial to take key psychological motivations and their development within individuals into account. The project will investigate the interplay between cognitive performance and the psychological motivation of curiosity in wild, sanctuary- and zoo-housed orangutans and chimpanzees, as well as in humans from different societies. 

 

Your tasks and your profile

The research assistant will assist with data collection and independently collect data on cognitive performance and curiosity in captive chimpanzees and orangutans in different European zoos. In addition, the candidate will code the collected data using a video coding software. 

Applicants should hold a bachelor’s degree in Biology or Comparative Psychology, or related field. We seek a highly motivated candidate with a detail-oriented way of working, patience, a strong sense of responsibility and excellent observation skills. Experience conducting cognitive experiments with great apes, other primates or large-brained birds in captivity/wild is required. We are looking for a candidate that is able to work independently and has excellent team working skills. The position further requires excellent organizational skills. Very good spoken and written English skills are required. German skills to communicate effectively with zoo staff and a driver's license is highly desirable. Technical knowledge to repair test equipment if needed and experience in coding behavioral data is desirable but not required. The candidate must be willing to travel and live close to the respective zoo for several weeks/months during the data collection phase.

 

Our offer

The position will start in January/February 2025 and is planned to last ca. 6-9 months. 

We offer an interesting job in an open-minded team, a responsible and varied workplace in an interdisciplinary and international research institute. 

The Max Planck Institute endeavors to employ more severely disabled people. Applicants of severely disabled persons are expressly welcome. The Max Planck Society strives for gender and diversity equality. We welcome applications from all backgrounds.

Are you interested? Then we look forward to receiving your application until December 18th with your CV containing your academic track record, the contact information of two references and a motivation letter. Please send your application to: ilaumer@ab.mpg.de

Éthosph’R recherche un·e volontaire en service civique

Votre mission :
Le respect de l’animal et de son bien-être : retraite des animaux de laboratoire et sensibilisation des publics à l’éthique animale.
Objecifs :
- Développer la réhabilitation des animaux de laboratoire : organiser la sortie des animaux de laboratoires de recherche à la fin de leurs protocoles expérimentaux, afin de leur offrir une « retraite ».
- Promouvoir le respect et le bien-être animal : sensibiliser le public en utilisant les méthodes de l’éthologie pour favoriser la compréhension du comportement des animaux et encourager leur respect.
- Développer l’enseignement de l’éthique animale à l’école primaire, particulièrement pour les CP dans le cadre de la loi contre la maltraitance.
Actions :
- Organiser la sortie des animaux : identifier les animaux en fin de protocole expérimental, coordina7on avec les structures d’accueil, assurer la transition vers leur retraite.
- Recherche de nouvelles structures partenaires : identifier et développer des partenariats avec de nouvelles structures (parcs, refuges, familles d’accueil) pour garantir des possibilités d’accueil supplémentaires pour les animaux sortis des laboratoires.
- Suivi et évaluation des actions menées : assurer un suivi des animaux réhabilités auprès des structures et des adoptants.
- Sensibilisa7on du public : animer des ateliers et des séances découverte sur l’éthologie et le respect du bien-être animal, en expliquant comment observer et comprendre le comportement des animaux dans leur milieu.
- Développement d’outils pédagogiques spécifiques à l’enseignement de l’éthique animale au CP, conçus à la fois pour les élèves et pour les professeurs des écoles.
- Communication et évènementiel : participer à des événements de sensibilisation et à des campagnes de communication pour informer des activités associatives.
Ce service civique nécessite un intérêt pour la recherche scientifique et l’éthique animale.
Dates de la mission : 6 mois (février à juillet 2025), 25 heures hebdomadaires
Lieu de la mission : Eurométropole de Strasbourg
Contact : presidence@ethosphr.com et cheyenne.zellenka@ethosphr.com
(www.ethosphr.com)

Stage

OFFRE DE STAGE MASTER 2
TITRE « SUIVI ACOUSTIQUE DES POPULATIONS D’ELEPHANTS DE FORET DANS UN CONTEXTE DE BRACONNAGE ET
D’EXPLOITATION FORESTIERE »

L’UMR 7204 "Centre d’Écologie et des Sciences de la Conservation"(CESCO) est une UMR (unité mixte de recherche) du Muséum national d’Histoire naturelle, du CNRS et de Sorbonne Université. Le CESCO développe des recherches pour la conservation de la biodiversité, en mobilisant des approches d’écologie et d’évolution ainsi que des interfaces avec les sciences humaines et sociales.
L’Agence Nationale des Parcs Nationaux (ANPN) est l’établissement public gabonais en charge de la gestion des 13 parcs nationaux du Gabon et autre aires protégées sous sa juridiction, qui couvrent environ 11,5 % du territoire national terrestre et 26 % des eaux marines du pays. L’ANPN agit également pour valoriser le patrimoine naturel et culturel tout en soutenant le développement durable à travers des politiques de conservation et de recherche scientifique.
Depuis 2021, le CESCO collabore avec l’ANPN pour l’étude de l’écologie des éléphants de forêt et participe au renforcement et à la formation du personnel de l’ANPN pour l’aider à mener à bien ses missions de suivi de la biodiversité.
Contexte scientifique
Les grands herbivores façonnent la structure et le fonctionnement des paysages et des environnements dans lesquels ils se trouvent, mais aujourd’hui, 60 % des herbivores de grande taille sont menacés d’extinction. La majorité de ces espèces font face à une réduction de leur aire de répartition, principalement en raison de la perte d’habitat et de leur surexploitation. La disparition de ces ingénieurs des écosystèmes a des répercussions à grande échelle sur le paysage, entraînant des conséquences telles qu’un changement dans la structure et la composition des communautés végétales.
La capacité des forêts tropicales exploitées à maintenir diverses fonctions écologiques et socio-économiques à long terme est incertaine. L’éléphant de forêt d’Afrique (Loxodonta cyclotis) est une espèce centrale pour le bon fonctionnement des forêts du Bassin du Congo. Sa disparition pourrait entraîner de graves conséquences sur la structure des forêts et leur capacité à stocker le carbone. Les populations d’éléphants font face à un déclin dramatique en raison du braconnage pour le commerce de l’ivoire et de la réduction d’habitat. Le Gabon abrite plus de 60 % des éléphants de forêt restants, mais l’espèce, qui vit aussi bien à l’intérieur qu’en dehors des aires protégées est menacée par les activités humaines légales et illégales.
Pour les espèces qui occupent des habitats fermés et difficiles d’accès, les observations directes sont rares, et les activités humaines sont difficiles à mesurer, en particulier lorsqu’elles sont illégales. Bien que les patrouilles de lutte contre le braconnage assurent la surveillance des aires protégées, de vastes zones restent insuffisamment surveillées en raison du manque de ressources humaines et matérielles. L’intensification des industries extractives, notamment l’exploitation forestière, constitue également une perturbation importante pour les éléphants au Gabon.
Le suivi acoustique est une méthode non invasive efficace de monitoring des populations d’éléphants. Il permet également de détecter les activités humaines, et de mesurer l’efficacité des actions de lutte anti-braconnage.
Cependant, la grande quantité de données à analyser nécessite l’utilisation d’outils innovants basés sur
l’apprentissage automatique. 

Objectifs du stage et rôle du stagiaire
Depuis 2023, des enregistreurs acoustiques (SongMeter Mini2, Wildlife Acoustics) sont déployés aux abords du Parc National de Moukalaba-Doudou au Gabon pour échantillonner les paysages sonores dans différents contextes de perturbations humaines (zone villageoise, zone d’exploitation forestière, parc national).
Le/la stagiaire s’occupera de l’organisation des données acoustiques et participera au développement/adaptation des méthodes pour leur analyse à l’aide de méthodes de pattern matching et de machine learning (i.e. BirdNet, Kahl et al. 2021, Koogu, Madhusudhana 2022). Il/elle sera également amené.e à utiliser des logiciels de visualisation et de traitement des données acoustiques (i.e. Kaleidoscope, Audacity).

Il/elle contribuera à l’analyse des données pour produire des indices d’activités humaines et explorer leur impact sur le comportement des éléphants.
Il/elle sera amené(e) à travailler avec les différentes personnes impliquées dans ce projet.
Compétences requises
- Expérience avec R et/ou langage de programmation Python, en particulier pour l’analyse de données et
machine learning ;
- Expérience en écoacoustique serait appréciée ;
- Capacité à travailler en équipe, rigueur scientifique et autonomie.
Période envisagée : Février-Juillet
Lieu : CESCO – Campus Buffon, 43 rue Buffon, 75005 Paris
Rémunération : gratification de stage
Encadrement :
CESCO: Marie Sigaud.
ANPN : Stéphanie Bourgeois
Merci d’adresser votre candidature (CV et lettre de motivation) à :
marie.sigaud@mnhn.fr
stephanieBourgeois@anpngeneticlab.org
Pour toute demande d’informations, contactez Marie Sigaud et/ou Stéphanie Bourgeois
Références :
Yoh, N., W. Mbamy, B. L. Gottesman, G. Z. L. Froese, T. Satchivi, M. Obiang Ebanega, L. Carlson, S. E. Koto, M. Özdoğan, D. J. I. Seaman, V. Maicher, H. Malinowski, J. Poulsen, A. Ebang Mbélé, and Z. Buřivalová. 2024. Impacts of logging, hunting, and conservation on vocalizing biodiversity in Gabon. Biological Conservation 296:110726.
Hedwig, D., and A. Kohlberg. 2024. Call combination in African forest elephants Loxodonta cyclotis. PLOS ONE 19:e0299656.
Swider, C. R., C. F. Gemelli, P. H. Wrege, and S. E. Parks. 2022. Passive acoustic monitoring reveals behavioural response of African forest elephants to gunfire events. African Journal of Ecology 60:882–894.
Wrege, P. H., F. B.-D. Bambi, P. J. F. Malonga, O. J. Samba, and T. Brncic. 2024. Early detection of human impacts using acoustic monitoring: An example with forest elephants. PLOS ONE 19:e0306932.
Kahl, S., C. M. Wood, M. Eibl, and H. Klinck. 2021. BirdNET: A deep learning solution for avian diversity monitoring. Ecological Informatics 61:101236.
Madhusudhana, S., B. S. Miller, M. G. Aulich, and N. Kelly. 2022. Automated detection of blue whale D-calls using deep learning with a double-observer performance assessment. The Journal of the Acoustical Society of America 151:A29.