vendredi 25 octobre 2024

Research Assistant for Primatology Field Work, Thailand

 The”Technological Primates Research Group” at the Max Planck Institute for Evolutionary

Anthropology in Germany seeks applicants for a

Research Assistant for Primatology Field Work

Application deadline: 15th of November 2024
Preferred start date: As soon as possible

About us:
The Technological Primates Research Group at the Max Planck Institute in Germany
collaborates closely with the National Primate Research Center of Thailand at Chulalongkorn University. We are interested in the evolution of tool use and culture in humans and our primate relatives. Together we compare the tool selection patterns and material records of tool-using primates across several species, including early hominins, apes and monkeys.

Research Assistant position:
We are seeking a research assistant for 12 months for our long-term study of tool behavior of long-tailed macaques in the Ao Phang Nga National Park in Thailand. The work includes the daily follows of a habituated group of long-tailed macaques, collecting behavioral data using focal protocols, operating camera traps, carrying out ecological surveys, and writing reports. Our field site is located in a remote tropical setting, which requires independent work ethics and some resilience to a variety of tropical logistical difficulties (e.g., mosquitoes, periodic intense rain and heat). Preference will be given to candidates who have previous experience with fieldwork in tropical conditions.

Requirements:
- Proficiency in English is essential, and knowledge of Thai would be a significant advantage
- proficient computer skills
- reliable and ready to provide a high level of commitment
- able to report on work progress and communicate effectively
- strong social skills and the ability to work well within a diverse team are essential.

Field conditions are demanding, with long working hours. Team members live in close quarters, requiring an ability to adjust to different personalities and social norms. Please carefully assess your capacity to handle these conditions for an extended period before applying. The research site is in a remote tropical setting with good, though occasionally fluctuating, internet connectivity. Access to the site is via domestic transport, which will be covered after the successful completion of the appointment.

What we offer:
- research assistants are trained by the PhD and post-doctoral fellows on site.
- first-hand field research experience at an established site as part of an international research team
- insight into diverse areas of primatological and archaeological research
- the opportunity to be an active contributor to cutting edge research through participation in all stages of academic research (data collection, analysis and publications)
- salary of 600 euros per month
- visa fees, international and domestic transport to and from field site (after successful
completion of the appointment)
Term of appointment: 12 months, starting as soon as possible.

How to apply:
Please submit your application electronically to Dr. Lydia Luncz (Lydia_Luncz@eva.mpg.de) and Hannah Kitzing (hannah.kitzing@eva.mpg.de).

Your application should include a cover letter (English) and a CV (English).

mercredi 23 octobre 2024

PhD studentship based in Taiwan 2025-2029

 

Environmental effects on extra-pair mating in birds

PhD studentship based in Taiwan 2025-2029


About the Project:

Extra-pair mating occurs when an individual mates with one(s) outside of his or her pair bond. It is a prevalent behaviour in birds and has been reported in more than 75% of studied socially monogamous species. However, the causes and consequences of this common behaviour remain unclear.

In birds, extra-pair mating increases male reproductive success (Dunning et al., 2024), while females face trade-offs, like reduced paternal care from their social partners (Schroeder et al., 2016). Adaptive explanations suggest that females obtain indirect benefits such as good genes and genetic compatibility to offset the costs, but supportive evidence is limited (Hsu et al., 2014; Hsu et al., 2015). 

Alternative hypotheses suggest that extra-pair mating could be initiated and/or sustained by context-dependent paternity benefits, where extra-pair offspring enjoy higher fitness under specific scenarios, or within- or between-sex correlation, such as positive selection on male extra-pair mating and female responsiveness to within-pair copulation. Our preliminary analyses with theoretical modelling highlight the context-dependent paternity effects (Yeh & Hsu, under review), shedding light on the evolution of extra-pair mating in birds. However, more empirical studies to evaluate these effects in wild populations are essential.

Research Objectives

This PhD project aims to understand how various environmental factors influence extra-pair mating. It will explore the biotic factors, including within-species effects and the interaction with other species (e.g. predation risk), as well as abiotic factors, such as bioclimatic effects. The long-term study dataset will provide this project with an ideal opportunity to explore various environmental effects and their interactions with extra-pair mating.

Methodology

Fieldwork will be taken on an offshore UK island where a wild population of house sparrows has been monitored for over twenty years. Activities will involve nest searching, banding, and social interaction observations. The PhD will analyse data using advanced statistical models to explore how environmental conditions impact mating behaviour.

Candidate Profile

This PhD project will be based at the Department of Life Sciences, National Cheng Kung University (NCKU), Taiwan. Applicants must be able to undertake fieldwork in the UK as part of a joint project. Applicants should review the minimum entry requirements for the NCKU 2025 Fall Admission. Ideal candidates are motivated, independent, and interested in evolution and field biology. Experience with fieldwork and statistical analysis is essential.

Funding

This PhD project will be funded by various sources. A successful candidate awarded the competitive Veritas et Conscientia Scholarship from NCKU for the first year will be guaranteed NT$360,000/yr (the basic living expense for taxpayers in Taiwan in 2023 is NT$202,000), supported by both the NCKU scholarship and the supervisor’s research grant for the first three years. From the 4th year onwards, we will support the PhD candidate in applying for the competitive scholarship from NCKU, as well as from various resources.

How to apply

To apply, please send your CV, the name of two referees, a concise statement of your research interests, and the transcripts of your BSc and MSc as a single PDF file to Dr Yu-Hsun Hsu (yuhsunhsu@ncku.edu.tw). All documents should be in English. The deadline for application is 30th November 2024. An online interview will be held soon after that. After the interviews, the successful candidate must go through the official application process for NCKU 2025 Fall Admission (the application platform will be open in January 2025).

For more information concerning this position, please contact Dr Yu-Hsun Hsu (yuhsunhsu@ncku.edu.tw).

Application Information for NCKU: NCKU 2025 Fall Admission and application instructions

Related Information

Dr Yu-Hsun Hsu

Related publication

Yeh, J. D. & Y.-H. Hsu. Extra-pair mating may evolve under changing environments. Under review

Hsu, Y.-H. 2022. Consequences of infidelity in non-human animals in T. Shackelford, and T. DeLecce, eds. The Oxford Handbook of Infidelity. Oxford University Press.

Hsu, Y.-H., M. J. P. Simons, J. Schroeder, A. Girndt, I. Winney, T. Burke, and S. Nakagawa. 2017. Age-dependent trajectories differ between within-pair and extra-pair paternity success. Journal of Evolutinary Biology 30:951-959.

Hsu, Y.-H., J. Schroeder, I. Winney, T. Burke, and S. Nakagawa. 2015. Are extra-pair males different from cuckolded males? A case study and a meta-analytic examination. Molecular Ecology 24:1558-1571.

Hsu, Y.-H., J. Schroeder, I. Winney, T. Burke, and S. Nakagawa. 2014. Costly infidelity: Low lifetime fitness of extra-pair offspring in a passerine bird. Evolution 68:2873-2884.

 

Related collaboration

Dunning, J., A. Sanchez-Tójar, A. Girndt, T. Burke, Y.-H. Hsu, S. Nakagawa, I. Winney, and J. Schroeder. 2024. Extrapair paternity alongside social reproduction increases male lifetime fitness. Animal Behaviour 213:117-123.

Schroeder, J., Y.-H. Hsu, I. Winney, M. J. P. Simons, S. Nakagawa, and T. Burke. 2016. Predictably philandering females prompt poor paternal provisioning. American Naturalist 188:219-230.

Department of Life Sciences in NCKU 

Office of International Affairs in NCKU





PhD in UK

 

The School are accepting applications for a fully-funded 4-year PhD scholarship to start in October 2025.  There are 13 projects available and the application deadline is 15th Nov 2024. It would be great if we could get plenty of applications so I would be grateful if you could pass these onto your networks. The faculty-funded scholarships are yet to be advertised and will be circulated separately.
Details of the scheme:
Bristol Vet School projects on FindaPhD:
List of projects:
1) Investigating the role of global food trade networks in the spread of gastrointestinal diseases
Supervisors: Sion Bayliss, Paul Wigley, Selina Bruns, Tristan Cogan

2) The Intersection of Zoonotic Disease and Climate Change: A Study of Avian Influenza in a Wetland Ecosystem
 
Supervisors: Irene Bueno, Ellen Brooks Pollock, Nicola Rooney

3) Exploring the role of membrane proteins and adhesins in the infective life cycle of tick-borne Anaplasma
Supervisors: Ian Cadby, Jamie Mann, Katja Klein

4) Healthy and sustainable livestock through fine-grained behavioural monitoring using new hybrid AI on wearables and video
Supervisors: Andrew Dowsey, Suzanne Held, Jordana Rivero-Viera, Paul Harris, Neill Campbell, Daniel Enriquez-Hidalgo

5) Improving circularity as a win-win approach: assessing the potential to reduce apple waste and mitigating livestock methane emissions using apple pomace
Supervisors: Daniel Enriquez-Hidalgo, Selina Bruns, Lucy McCarthy, Tristan Cogan

6) Understanding Human-Wolf conflict and coexistence in Europe: A Comparative Study of Public Perception and Stakeholder Solutions in Italy and the Netherlands
Supervisors: María Paula Escobar, Emma Mellor, Krithika Srinivassan

7) Cognitive bias in veterinary decision making
Supervisors: John Fennell, Laszlo Talas, Jasmina Stevanov

8) Bored to death: a comparative study of boredom-like states and their welfare consequences across three non-human animal species
Supervisors: Carole Fureix, Rebecca Meagher, Sara Hintze, Mike Mendl

9) From Cancer Biology to Regenerative Medicine and Beyond: Targeting iPSC Tumorigenicity and Preserving Stemness with a Cutting-Edge Liquid Culture System
Supervisors: Nobue Itasaki, Shahriar Behboudi, Siang Boon Koh

10) Cats’ perspective and welfare associated with outdoor access
Supervisors: Ben Lecorps, Emily Blackwell

11) Investigating capacity for sentience in Galliform birds and Molluscan invertebrates
Supervisors: Elizabeth Paul, Jo Edgar, Sarah Dalesman, Vikki Neville

12) Exploring animal camouflage through digital twin simulations of visual perception
Supervisors: Laszlo Talas, John Fennell, Nick Scott-Samuel, Sarah Lambton

13) Understanding Antimicrobial Resistance (AMR) for conflict and national security
Supervisors: Alex Tasker, Irene Bueno Padilla, Kristen Reyher, Gemma Bowsher

OFFRE DE THESE

 Titre : Etude du microclimat, du comportement de la prairie et des bovins en présence de haies solaires (SOLARBOV)
Encadrants : Catherine Picon-Cochard (INRAE UREP), Véronique Deiss (INRAE UMRH), Marc Saudreau
(INRAE PIAF)
Contacts : catherine.picon-cochard@inrae.fr; veronique.deiss@inrae.fr: marc.saudreau@inrae.fr;
Date début de la thèse : Décembre 2024 ou Janvier 2025
Compétences recherchées : Master ou diplôme d’ingénieur agronome avec des connaissances approfondies sur le comportement animal (herbivore), la prairie (agronomie) et/ou la bioclimatologie.
Des compétences avérées pour l’analyse de données environnementales complexes (séries spatio-temporelles) sont aussi recherchées. Anglais scientifique.
Conditions d’exercice : Accueil dans l’UMR INRAE UREP, 5 chemin de Beaulieu à Clermont-Ferrand ; fréquents déplacements sur le site expérimental situé à Laqueuille (Puy de Dôme) sur le domaine INRAE de l’Unité Expérimentale Herbipole. Interactions fréquentes avec l’UMR Herbivores située sur le site INRAE de Saint-Genès-Champanelle
Résumé
L’installation de parcs agrivoltaiques (AV) n’est pas neutre pour l’environnement et les agroécosystèmes concernés dans lesquels ils sont installés. Ce projet de thèse propose d’obtenir des références scientifiques en bioclimatologie, agronomie et comportement animal en situation AV, utiles pour valider le déploiement de ces systèmes à plus grande échelle appliqués à l’élevage. Nous allons évaluer, au champ et de manière spatio-temporelle, l’effet de deux écartements de rangs de panneaux solaires sur (1) les modifications intra et inter-journalières du microclimat et (2) leurs conséquences sur les services rendus par la prairie et le comportement des bovins. Nous faisons l’hypothèse que la présence des panneaux solaires réduit l’évapotranspiration de la végétation et a peu d’effet à court terme sur la biodiversité et les services rendus par les prairies. La réponse des bovins pourrait dépendre des conditions météorologiques au cours de la journée et au cours des saisons. Des approches expérimentales, sur le microclimat, la végétation et le comportement des bovins, seront combinées grâce des collaborations entre plusieurs UMR du site de Clermont-Ferrand.
Contexte, état de l’art, questionnement scientifique
Afin de mieux répondre aux enjeux climatiques, de sécurité alimentaire et de l’énergie, le concept d’agrivoltaïsme (AV) a été proposé (Dupraz et al., 2011), en associant sur une même parcelle une production agricole et une production d’énergie solaire à partir de panneaux photovoltaïques. Ce système s’avère efficace car il peut présenter une productivité globale plus élevée, entre 35-73% de plus comparée aux systèmes agricoles conventionnels, tout en étant une opportunité économique pour les agriculteurs (Dinesh & Pearce 2016 ; Maia et al., 2020). Cependant, ces systèmes sont encore peu développés et demandent à être mieux caractérisés pour convaincre les différents porteurs d’enjeu des territoires impliqués pour leur déploiement à plus large échelle (ADEME 2021 ; décret de loi, https://www.legifrance.gouv.fr/jorf/id/JORFTEXT000049386027).
L’installation de parcs AV n’est pas neutre pour l’environnement dans lequel ils sont installés. En effet, le chantier nécessaire pour la mise en place de l’infrastructure demande l’intervention d’engins lourds qui sont intrusifs pour les agroécosystèmes. Les panneaux, mis en place pour durer entre deux à trois décennies, peuvent avoir à la fois des effets bénéfiques et adverses pour les productions agricoles par leurs effets parapluie et parasol (par ex. Marrou et al., 2013 ; Weselek et al., 2019 ; Madej et al., 2023). En plus d’apporter de l’ombre qui impacte la quantité et la qualité du rayonnement reçu par les plantes sur tout ou partie de la journée (Sturchio et al., 2022), la présence de panneaux photovoltaïques influence différents paramètres du microclimat : vitesse et direction du vent(Hassanpour Adeh et al., 2018 ; Bruhwyler et al., 2023), température du couvert végétal (Marrou et al., 2013), température et humidité de l’air et du sol (Armstrong et al., 2016 ; Hassanpour Adeh et al., 2018 ; Graham et al., 2021 ; Weselek et al., 2021 ; Madej et al., 2022 ; Sturchio et al., 2022 ; Kannenberg et al., 2023). Ces variations microclimatiques se répercutent sur la végétation à travers la modification de différents paramètres impactant la croissance (somme de températures locales, disponibilité en eau, évapotranspiration, photosynthèse…). En effet, une croissance en hauteur plus importante a été observée dans la zone d’influence des panneaux au détriment du tallage, de la densité du couvert et du ratio feuilles/tiges (Madej et al., 2022 ; Rainon et Dagouneau, 2022). Ceci peut s’expliquer par le phénomène d’étiolement chez les graminées qui recherchent un meilleur accès à la lumière en réponse à l’ombrage. La réponse de la prairie (quantité et qualité du fourrage) est variable selon les études et le type de panneaux solaires implantés sur la prairie. Sur une prairie permanente semi-aride en conditions froides et sèches, Sturchio et al. (2024) ont testé des panneaux disposés en lignes sur un axe nord-sud et suivant la course du soleil d’est en ouest en faisant varier leur inclinaison le long d’un axe horizontal. Conformément aux observations faites la saison précédente (Sturchio et al., 2022), les auteurs ont mesuré un rendement plus élevé côté est des panneaux (y compris par rapport au contrôle), là où l’herbe est au soleil le matin et à l’ombre l’après-midi, et inférieur en dessous des panneaux. L’étude conclut donc au maintien de la productivité et de la qualité fourragère de la prairie suite à l’installation des panneaux photovoltaïques. Concernant la qualité, les études disponibles tendent à montrer une meilleure valeur fourragère des prairies photovoltaïques à travers l’augmentation du taux d’azote/protéines (Madej et al., 2022 ; Sturchio et al., 2024) et, en complément, de la valeur énergétique (Andrew et al., 2021) ou de la digestibilité (Kampherbeek et al., 2023). Pour la teneur en fibres, les résultats sont plus hétérogènes et variables dans le temps. La qualité fourragère de ces prairies par rapport au contrôle non couvert peut néanmoins varier selon la zone considérée, la période de l’année et l’année elle-même (Andrew et al., 2021 ; Madej et al., 2024 ; Sturchio et al., 2024). Outre les propriétés liées à la biomasse, la composition botanique du couvert peut évoluer. Sur une prairie temporaire constituée d’un mélange trèfle-graminées implanté sous une ombrière photovoltaïque, Weselek et al. (2021) ont observé une augmentation de la proportion de trèfle dans le couvert végétal par rapport au contrôle non agrivoltaïque. Une perte de rendement en matière sèche en a découlé, mais une amélioration du taux de protéines et de la digestibilité peuvent être attendues. Armstrong et al. (2016) ont constaté une perte de diversité végétale sous les panneaux, mais au profit des graminées cette fois, les légumineuses étant totalement absentes. La composition botanique des inter-rangées différait également du contrôle mais de manière moins marquée, les légumineuses et les diverses étant bien présentes, et sans conséquences sur le rendement. Là encore, ces résultats doivent être nuancés au regard des conditions d’implantation du couvert. Dans l’expérience de Andrew et al. (2021), l’ensemble des dicotylédones fourragères a semblé désavantagé dans la zone d’influence des panneaux. Ceci a été confirmé par Andrew et al. (2024), l’ombre et le pâturage sélectif nuisant à la persistance des légumineuses. Pour Hassanpour Adeh et al. (2018), la prairie permanente agrivoltaïque présentait moins de diversité et une composition botanique différente mais en faveur d’une espèce plutôt intéressante de par sa bonne appétence. Concernant l’implantation de panneaux solaires verticaux bifaciaux, il n’y a pas de références disponibles en élevage bovin puisque leur implantation n’en est qu’à ces débuts. Le site étudié dans ce projet est unique en France. Ce type de panneaux offre des opportunités de réduction des perturbations sur l’environnement des sites sur lesquels ils sont implantés. L’emprise au sol est beaucoup plus faible qu’avec des panneaux solaires au sol orientés sud, l’impact sur le microclimat lumineux réduit mais celui sur le vent serait marqué (Bruhwyler et al., 2022). De plus, ces panneaux verticaux bifaciaux permettraient d’obtenir une production d’électricité maximale au lever et au coucher du soleil. L’impact des panneaux solaires sur les variables microclimatiques dépend de nombreux facteurs : météorologie, sol, type de panneaux et dimensions de l’infrastructure, période de l’année, année, positionnement des capteurs (hauteur ou profondeur de la mesure, sous ou entre les panneaux inclinés, côté est ou ouest des panneaux verticaux…). Ainsi, les études citées n’aboutissent pas toutes aux mêmes conclusions en termes d’effet sur le microclimat et de quantification de ces effets. Parmi les variables microclimatiques, les modifications de la lumière par les panneaux, notamment dans le PAR, sont accessibles expérimentalement, les capteurs dédiés sont facilement déployables sur le terrain, et par simulation car principalement basé sur des considérations géométriques. Le verrou principal concerne le flux d’air et la question de la modification du vent n'a pas été évaluée de manière approfondie. En se basant sur la littérature relative aux brise-vents, les panneaux verticaux devraient créer, spatialement et temporellement, des turbulences et modifier la vitesse du vent en fonction de la hauteur des panneaux, de la distance entre les rangées, de la direction du vent et de la hauteur de la culture (Baker et al., 2021). La complexité des écoulements induits par les panneaux rend l’approche de modélisation nécessaire. Plusieurs stratégies de modélisations peuvent être mises en œuvre pour appréhender l’impact de structures verticales sur les écoulements. Des modèles de mécanique des fluides peuvent être mis en œuvre pour simuler l’écoulement de la masse d’air et le sillage généré (Nahani et al., 2024). La similitude géométrique entre des haies et des panneaux verticaux permet également d’envisager des solutions moins coûteuses à partir d’approches analytiques dérivées de simulations (Lyu et al., 2020). Cet effet sur le vent devrait modifier la demande en eau de la végétation par évapotranspiration (Bruhwyler et al., 2022), dont l’intensité dépend des conditions ambiantes de la vitesse et de la direction du vent. A défaut de fournir de l’ombre en milieu de journée, les haies photovoltaïques peuvent offrir un abri aux animaux. De nombreuses études ont montré qu’en conditions froides et humides, la réduction de l’exposition au vent peut être bénéfique par l’amélioration des performances animales (ingestion, croissance, reproduction), la réduction des pertes (mortalité, maladies, thermorégulation, stress) et donc l’amélioration du bien-être animal (Fisher, 2007 ; Smith et al., 2021 ; Masters et al., 2023; Schütz et al., 2023). He et al. (2017) ont montré que le niveau de pertes thermiques des ovins est fortement corrélé à la vitesse du vent et à son pouvoir refroidissant. Dans le même sens, Atkin-Willoughby et al. (2022) ont montré que le comportement de recherche d’abri des ovins est lié à ces deux paramètres, les brebis préférant se regrouper dans les zones abritées par temps froid et venteux. A l’inverse, en conditions chaudes, l’exposition au vent peut avoir un effet bénéfique en facilitant la régulation de la température corporelle de l’animal, comme décrit par Mader et al. (2006).
Objectifs principaux et hypothèses testées
L’objectif de la thèse est d’étudier le microclimat aérien et souterrain, le fonctionnement agronomique de la prairie et le comportement des bovins au champ dans un parc AV comportant des haies solaires avec deux dimensions d’inter-rang. Il s’agira d’évaluer si ce système fournit des services ou des dys- services à la prairie pâturée et quelles sont les plus/moins-values pour le bien-être animal. Nous faisons l’hypothèse que la présence des panneaux solaires réduit l’évapotranspiration de la végétation (baisse de la vitesse du vent, fluctuation journalière de la lumière), dont l’intensité varie de manière spatio- temporelle (distance aux panneaux, saisons, conditions météorologiques ambiantes fluctuantes). Ces effets pourraient être plus marqués dans l’inter-rang le moins large car les turbulences pourraient être plus importantes. Mais ces modifications devraient peu impacter sur le court-terme (< 3 ans) la composition botanique et les services de production rendus par les prairies car celles-ci dépendent de variation contrastée de la disponibilité en lumière, eau et azote. En effet, même si la disponibilité en lumière varie dans la journée, la baisse de rayonnement dans les rangs des panneaux est transitoire et non permanente comme avec les panneaux toitures orientés sud. Les effets parasol et parapluie des panneaux verticaux sont modérés. En conditions chaudes et plus sèches l’après-midi, la végétation située coté Est des panneaux pourrait être moins soumise au stress thermique que la végétation située côté Ouest des panneaux, car celle-ci est à l’ombre pendant 3 à 4 heures. En ce qui concerne le comportement des bovins (activités localisées spatialement sur plusieurs saisons), des changements pourraient être attendus si la qualité de la végétation est modifiée et si les animaux ont besoin de s’abriter du vent ou du soleil lorsque les conditions ambiantes sont très venteuses ou chaudes. Les conditions microclimatiques et la disponibilité en fourrage pourraient permettre un allongement de la durée de pâturage, en particulier en début et fin de saison.
Il s’agit de mettre en place une démarche expérimentale sur des suivis de microclimats aérien et souterrain, de la végétation prairiale et des bovins, sur le démonstrateur AV Camélia1 situé à Laqueuill sur une parcelle de 1 ha, gérée par l’UE Herbipole partenaire du projet. Sur ce site, 9 rangs de panneaux solaires sont installés avec 2 inter-rangs différents (12 m et 18 m), avec une orientation Nord-Sud. Les principaux déterminants de la réponse de la végétation prairiale et du comportement animal seront mesurés sur la parcelle AV ainsi que sur une parcelle adjacente suivie depuis 20032 qui servira detémoin sans influence des panneaux. Les microclimats aérien (lumière, température, humidité, vitesse et direction du vent, précipitations) et souterrain (température et humidité) et la croissance de la végétation seront mesurés dans les deux écartements 12 m et 18 m des rangs et à différentes distances des panneaux solaires. La présence des bovins complexifie l’étude puisque des zones de mises en défens sont nécessaires pour les mesures sur la végétation (production, qualité, croissance). Les campagnes de mesure du microclimat aérien seront aussi réalisées en absence des bovins sur la parcelle. Des capteurs d’humidité et de température du sol sont déjà installés dans le sol à différentes distances des panneaux. Des capteurs aériens nécessaires à l’étude permettent de mesurer les fluctuations microclimatiques à différentes distances des panneaux (rayonnement, pluie, température, vent). Pour le comportement animal, les animaux seront équipés de capteurs permettant d’enregistrer simultanément leur activité (debout, couché, déplacement, ingestion, rumination ...), leur position sur la parcelle (GPS), ainsi que leur position par rapport à la lumière (capteurs luxmètre), leur température interne (Bolus). Ces données couplées à des données obtenues par observation directe des animaux (interactions sociales) et le suivi de leur croissance permettront d’estimer leur état de bien-être selon les conditions météorologiques (pas de temps horaire).
La présence des panneaux solaires pourrait apporter des bénéfices à la prairie et aux bovins en atténuant des conditions microclimatiques qui seraient défavorables à la production prairiale et au bien-être animal. Il s’agit d’évaluer le comportement des bovins dans un système qui pourrait modifier la réponse de la prairie. Ce dispositif original, unique en France, fait aussi l’objet depuis son implantation fin 2022 à des présentations à des porteurs d’enjeux du monde agricole (chambres, Idele, agriculteurs…), des milieux naturels (parcs) et des territoires (communes, responsables politiques), ainsi qu’à des journalistes. Les connaissances scientifiques qui en découleront seront utiles aux différents porteurs d’enjeux cités

mardi 22 octobre 2024

PhD position - Wageningen University - social strategies in great tits

 PhD position on social strategies in great tits at the Behavioural Ecology Group of Wageningen University and the Netherlands Institute for Ecology (NIOO-KNAW). Closing date is December 2nd. More details: https://www.wur.nl/en/vacancy/phd-position-behavioural-and-ecological-determinants-of-social-strategies-in-great-tits.htm

lundi 21 octobre 2024

Stage M2

 

Proposition de stage de Master 2 Recherche
[English version below]
Effet de la pollution acoustique sur limpact trophique de la « crevette tueuse »
Dikerogammarus villosus
Contexte du sujet de stage :
Lexpérience envisagée faire partie dun projet de plus grande ampleur sur limpact écologique
de la pollution acoustique des eaux douces qui sera proposé au concours de lécole doctorale
en 2025. Les étudiant(e)s ayant pour objectif de poursuivre en thèse sont donc encouragé(e)s
à candidater.
Mots clés :
Amphipodes ; Eaux douces ; Expériences de playback acoustique ; Impact trophique ;
Invasions biologique ; Réponse fonctionnelle
Etat de lart :
Les eaux intérieures sont des ressources clés pour les territoires compte-tenu des nombreux
services écosystèmes quelles fournissent. Les gestionnaires sinquiètent de la sur-
fréquentation de leau et du nombre croissant de bateaux motorisés thermiques. Ces derniers
génèrent beaucoup démissions sonores, à la fois au-dessus et en dessous de la surface de
leau, qui occasionnent des conflits entre les usages et altèrent la relation Homme Nature.
Plus largement, la pollution acoustique est une préoccupation mondiale avec beaucoup
deffets négatifs sur la vie sauvage et le bien-être humain, bien que les conséquences sur les
eaux douces soient encore méconnues. Les invasions biologiques sont une autre menace pour
les eaux douces, avec un nombre dintroductions qui devrait augmenter dans le contexte de
la mondialisation. Curieusement, la façon dont ces deux menaces (pollution acoustique et
invasions biologiques) interfèrent na pas encore été explorée.
Objectifs de létude :
Nous voulons étudier leffet de la pollution acoustique subaquatique sur le comportement
prédateur de Dikerogammarus villosus, un gammare deau douce originaire du bassin Ponto
Caspien et qui fait partie des pire espèces invasives à léchelle mondiale. En tant que
compétiteur et prédateur agressif, D. villosus surpasse les invertébrés natifs et appauvrit les
ressources benthiques. Dans les locaux du laboratoire ENES, des tests de prédation seront
réalisés avec deux traitement acoustiques : le fond sonore dun lac sans activité humaine et le
même fond sonore sur lequel nous auront ajouté des sons de bateaux à moteurs pour mimer
un trafic nautique réaliste. Nous testerons plusieurs proies et le cadre théorique de la réponse
fonctionnelle, qui consiste à modéliser la relation entre le taux de prédation par individu et la
densité en proies, pour estimer la force des liens trophiques. Nous tiendrons compte du
rythme circadien de D. villosus et du fait que la pollution acoustique par les bateaux se
manifeste essentiellement la journée alors que D. villosus est plus actif la nuit.
Léchantillonnage se fera dans le lac du Bourget, le plus grand lac naturel de France, et qui est
aussi un haut lieu des loisirs nautiques.
Publications internationales de léquipe en rapport avec le sujet :
Fernandez-Declerck M, Rojas E, Prosnier L, Teulier L, Dechaume-Moncharmont FX, Boyer N
& Médoc V (2023) Adding insult to injury: anthropogenic noise intensifies predation risk
by an invasive freshwater fish species. Biological Invasions 25: 27752785.
Hanache P, Spataro T, Firmat C, Boyer N, Fonseca P & Médoc V (2020) Noise-induced
reduction in the attack rate of a planktivorous freshwater fish revealed by functional
response analysis. Freshwater Biology 65: 75-85.
Iltis C, Spataro T & Médoc V (2018) Parasitism may alter functional response comparisons: a
case study on the killer shrimp Dikerogammarus villosus and two non-invasive
gammarids. Biological Invasions 20: 619-632.
Médoc V, Albert H & Spataro T (2015) Functional response comparisons among freshwater
amphipods: ratio-dependence and higher predation for Gammarus pulex compared to
the non-natives Dikerogammarus villosus and Echinogammarus berilloni. Biological
Invasions 17: 3625-3637.
Pellan L, Médoc V, Renault D, Spataro T & Piscart C (2016) Feeding choice and predation
pressure of two invasive gammarids, Gammarus tigrinus and Dikerogammarus villosus,
under increasing temperature. Hydrobiologia 781: 43-54.
Rojas E, Gouret M, Agostini S, Fiorini S, Fonseca P, Lacroix G & Médoc V (2023) From
behaviour to complex communities: Resilience to anthropogenic noise in a fish-induced
trophic cascade. Environmental Pollution 335, 122371.
Encadrement :
Vincent Médoc, Maître de Conférences HDR en Ecologie et Comportement Animal à
lUniversité Jean Monnet de Saint-Etienne
https://vincentmedoc.wixsite.com/ecology
Sur place, létudiant(e) bénéficiera de ressources informatiques et acoustiques, des
infrastructures expérimentales, et de toute lexpertise des membres de lENES en acoustique,
comportement animal, écologie et statistiques.
Structure daccueil :
ENES Bioacoustics Research Lab
Université Jean Monnet de Saint-Etienne
https://www.eneslab.com/
Compétences recherchées :
Motivation pour entreprendre une thèse à lissue du stage de Master 2 ; formation en
écologie, codage sous R, biostatistiques, expérimentation ; compétences rédactionnelles ;
maîtrise de langlais ; goût pour lécologie aquatique, la problématique des invasions
biologique et le problème de la pollution acoustique. Des compétences en acoustique seront
appréciées mais non obligatoires.
Candidature :
CV et LM dès que possible à :
vincent.medoc@univ-st-etienne.fr
Proposal for a Master-2 Internship
Effect of acoustic pollution on the trophic impact of the invasive “killer shrimp”
Dikerogammarus villosus
Important information:
This experiment is part of a bigger project on noise pollution that will be proposed in the 2025
doctoral school competition for PhD scholarships. Highly ranked master students looking for
PhD projects are therefore encouraged to apply!
Key words:
acoustic playback experiments; biological invasions; fresh waters; functional response;
gammarids; noise pollution; trophic impact
Context:
Inland waters are critical resources for territories given the many ecosystem services they
provide. Managers worry about water overcrowding and the increasing number of powerful
fuel-based motor boats. They are associated with a lot of sound emissions, both under and
above water surface, which generate conflicts between users and disturb the human nature
relationship. From a broader perspective, noise pollution is a worldwide concern with many
adverse effects on wildlife and human wellbeing, although the consequences on fresh waters
remain under investigated. Biological invasions pose another threat to fresh waters, with the
number of species introductions expected to increase in the context of globalization.
Interestingly, how these two threats (noise pollution and biological invasions) interact has not
been explored yet.
Aims of the study:
We want to study the effect of underwater noise pollution on the predatory behaviour of
Dikerogammarus villosus, a freshwater gammarid of Ponto Caspian origin that is part of the
world’s worst invasive species. As an aggressive competitor and predator, D. villosus
outcompetes native invertebrates and depletes benthic resources. In the ENES facilities,
predation tests will be carried out under two acoustic treatments: lake background noise
alone and lake background noise supplemented with boat sounds to mimic a real boat traffic.
We will test various prey items and use functional response derivation, which consists in
modeling the relationship between per capita predation rate and prey density, to estimate the
strength of the trophic links. We will account for D. villosus’ circadian rhythm and the fact that
noise pollution from boats mostly occurs during the day while D. villosus is more active at
night. Sampling will take place in Lake Bourget, the biggest French natural lake, which is also
a hot spot for recreational boaters.
Related papers from the team:
Fernandez-Declerck M, Rojas E, Prosnier L, Teulier L, Dechaume-Moncharmont FX, Boyer N
& Médoc V (2023) Adding insult to injury: anthropogenic noise intensifies predation risk
by an invasive freshwater fish species. Biological Invasions 25: 27752785.
Hanache P, Spataro T, Firmat C, Boyer N, Fonseca P & Médoc V (2020) Noise-induced
reduction in the attack rate of a planktivorous freshwater fish revealed by functional
response analysis. Freshwater Biology 65: 75-85.
Iltis C, Spataro T & Médoc V (2018) Parasitism may alter functional response comparisons: a
case study on the killer shrimp Dikerogammarus villosus and two non-invasive
gammarids. Biological Invasions 20: 619-632.
Médoc V, Albert H & Spataro T (2015) Functional response comparisons among freshwater
amphipods: ratio-dependence and higher predation for Gammarus pulex compared to
the non-natives Dikerogammarus villosus and Echinogammarus berilloni. Biological
Invasions 17: 3625-3637.
Pellan L, Médoc V, Renault D, Spataro T & Piscart C (2016) Feeding choice and predation
pressure of two invasive gammarids, Gammarus tigrinus and Dikerogammarus villosus,
under increasing temperature. Hydrobiologia 781: 43-54.
Rojas E, Gouret M, Agostini S, Fiorini S, Fonseca P, Lacroix G & Médoc V (2023) From
behaviour to complex communities: Resilience to anthropogenic noise in a fish-induced
trophic cascade. Environmental Pollution 335, 122371.
Supervisor:
Vincent Médoc, Associate Professor in Ecology and Animal Behaviour
https://vincentmedoc.wixsite.com/ecology
Research lab:
ENES Bioacoustics Research Lab
University of Saint-Etienne
https://www.eneslab.com/
Skills:
R coding, statistics, experimental design, field sampling, writing, skills in acoustics are
welcome but not requested
How to apply?
CV and cover letter at
vincent.medoc@univ-st-etienne.fr
as soon as possible…