PhD position: Social organisation and vocal communication in wild zebra finches

 

Location	Wageningen, the Netherlands and Fowlers Gap, Australia
End date	Mon 27 May 2024
Respond	Click here for the University link and to  apply

 

 

We offer a 4 year PhD Position (1.0 FTE) to undertake research on social organisation and vocal communication in wild zebra finches within the Behavioural Ecology chair group at Wageningen University, the Netherlands in cooperation with Macquarie University in Sydney, Australia.

Project details

The aim of this project is to determine the nature of multi-level societies and the role of vocal signalling in their dynamics, using wild zebra finches in the Australian arid zone as model. Zebra finches are the best-studied avian model organism under laboratory conditions, yet their social organisation and communication in nature are poorly understood. Here we will use a long-term monitored Australian field population at the Fowlers Gap Research Station in NSW Australia, to determine their social organisation using automatized solar-powered radio tracking, combined with various bioacoustics approaches as well as breeding data.

This unique field project will provide key advances in our understanding of social organisation and communication in animals breeding under ecologically challenging and unpredictable climatic conditions. It will also open new doors for understanding social functions of elaborate signals and for laboratory studies on behavioural mechanisms using ecologically relevant conditions. The project will also include the opportunity to conduct aviary studies at the University Bielefeld (Germany), where the social environment can be experimentally controlled and tested. The field work in Australia will start in September 2024 by tracking juveniles and their parents to determine the social structure during the song learning period by the offspring. This field period also offers the opportunity to address additional related research questions which will be developed with the candidate. As a PhD candidate, you will play a pivotal role in organizing and conducting the field and aviary research.

The project is supervised by Dr. Lysanne, Snijders, Dr. Chris Tyson at Wageningen University in collaboration with Dr. Sabine Kraus at Bielefeld University, with the overall project being embedded in the research groups by Prof. Marc Naguib in Wageningen and Prof. Simon Griffith at Macquarie University in Sydney. The field research will be conducted at a well-established zebra finch population at Fowlers Gap Research Station in New South Wales, Australia.

You will work here

The research is embedded within the chair Behavioural Ecology (Behavioural Ecology Group - WUR), which is led by Prof. Marc Naguib (prof.dr. M (Marc) Naguib - WUR). You will be co-supervised by dr. Lysanne Snijders and dr. Chris Tyson.

Your qualities

You have:

·         a MSc-degree in Biology with specialization in Animal Behaviour / Behavioural Ecology or equivalent experience;

·         strong experimental and analytical skills;

·         good organisational skills;

·         good (written and spoken) communication skills in English;

·         proven ability to collaborate with others;

·         the ability and willingness to conduct and organize extensive ornithological fieldwork at a remote location;

·         the willingness to travel internationally, to attend conferences and visit other institutes;

·         A valid driving licence;

For this position your command of the English language is expected to be at C1 level. Sometimes it is necessary to submit an internationally recognised Certificate of Proficiency in the English Language. More information can be found here.

We offer you

Wageningen University & Research offers excellent terms of employment. A few highlights from our Collective Labour Agreement include:

·         Partially paid parental leave;

·         working hours that can be discussed and arranged so that they allow for the best possible work-life balance;

·         the option to accrue additional compensation / holiday hours by working more, up to 40 hours per week;

·         there is a strong focus on vitality and you can make use of the sports facilities available on campus for a small fee;

·         a fixed December bonus of 8.3%;

·         excellent pension scheme.

In addition to these first-rate employee benefits, you will receive a fully funded PhD position and you will be offered a course program tailored to your needs and the research team.

The gross salary for the first year is € 2.770 - per month rising to € 3.539,-  in the fourth year in according to the Collective Labour Agreements for Dutch Universities (CAO-NU) (scale P). This is based on a full-time working week of 38 hours. We offer a temporary contract for 18 months which will be extended for the duration of the project if you perform well.

There are plenty of options for personal initiative in a learning environment, and we provide excellent training opportunities. We are offering a unique position in an international environment with a pleasant and open working atmosphere.

You are going to work at the greenest and most innovative campus in Holland, and at a university that has been chosen as the “Best University” in the Netherlands for the 19th consecutive time.

Coming from abroad

Wageningen University & Research is the university and research centre for life sciences. The themes we deal with are relevant to everyone around the world and Wageningen, therefore, has a large international community and a lot to offer to international employees.

Our team of advisors on Dutch immigration procedures will help you with the visa application procedures for yourself and, if applicable, for your family.

Feeling welcome also has everything to do with being well informed. Wageningen University & Research's International Community page contains practical information about what we can do to support international employees and students coming to Wageningen. Furthermore, we can assist you with any additional advice and information about for example helping your partner to find a job, housing, or schooling. Finally, certain categories of international staff may be eligible for a tax exemption on a part of their salary during the first five years in the Netherlands.

Do you want more information?

For more information about this position, please contact Marc Naguib or Chris Tyson (marc.naguib@wur.nl or chris.tyson@wur.nl ).

For more information about the procedure, please contact Noorien Abbas, corporate recruiter, noorien.abbas@wur.nl.

Do you want to apply?

You can apply directly using the apply button on the vacancy page on our website which will allow us to process your personal information with your approval.

This vacancy will be listed up to and including the 27th of May 2024.

Equal opportunities 

Wageningen University & Research (WUR) employs a large number of people with very different backgrounds and qualities, who inspire and motivate each other. We want every talent to feel at home in our organisation and be offered the same career opportunities. We therefore especially welcome applications from people who are underrepresented at WUR. A good example of how WUR deals with inclusiveness can be read on the page working at WUR with a functional impairment.

We are

The mission of Wageningen University & Research is “To explore the potential of nature to improve the quality of life”. Under the banner Wageningen University & Research, Wageningen University and the specialised research institutes of the Wageningen Research Foundation have joined forces in contributing to finding solutions to important questions in the domain of healthy food and living environment. With its roughly 30 branches, 7,600 employees (6,700 fte) and 13,100 students and over 150,000 participants to WUR’s Life Long Learning, Wageningen University & Research is one of the leading organisations in its domain. The unique Wageningen approach lies in its integrated approach to issues and the collaboration between different disciplines.

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2 PhD Positions (m/f/d) | The Evolution of Behaviour in Darwin’s Dreamponds

 Lire ces 2 offres : https://www.ab.mpg.de/575694/job_full_offer_21581373?c=322153

Space use in salmonids – Field internship position

 Hosting structure: Department of Aquaculture & fish Biology, Hólar University - Iceland Dates: June/July 2024 to August/September 2024 – 2 to 4 months internship Context of the study: Territoriality, foraging mode and social interactions are all parts of animals’ space use. Territoriality is often described as an area with resources such as food or shelter defended by an individual. However, individuals display great within-population variability, which drives the establishment of a social hierarchy with dominants and subordinates. This leads to unequal access to resources such as food, shelter, or mates and eventually influences the population distribution. However, this social organisation is not permanent and could be affected by parameters such as predation risk, food abundance and distribution, or modification of the environmental conditions. Stream fish, particularly salmonids, are known to be highly variable in their behaviour among individuals, populations, and species. This project aims to repeatedly estimate space use patterns (territory size, foraging mode, spatial organisation) for the three salmonids native to Icelandic streams: Arctic charr, brown trout and Atlantic salmon. Specifically, we will conduct field experiments to estimate how these space use patterns, and their individual repeatability, vary between (i) related species, (ii) day and night and (iii) under different environmental conditions. The research project involves a collaboration between Dr. Stefan O. Steingrimsson, Dr. Camille Leblanc, Dr. David Benhaim at Holar University, Dr. James W.A. Grant at Concordia University in Montréal, Canada, Dr. Laura K. Weir at St. Mary´s University, in Halifax, Canada and Dr. Arnar Plason at University of Iceland, Reykjavik, Iceland. Student project: The student task will be to collect data regarding space use via snorkeling or direct observation from the riverbank and to measure the habitat used by the fish and the available habitat in each section. The student will collaborate closely with a PhD student, Gabrielle Laduree. Organizational details: The working language is English. Accommodation is around 68.000ISK (around 450€) per month in a shared house and is at the student’s charge. Commuting between the lab and the accommodation place will be at the lab's charge, and meals during fieldwork are at the project charge. The student will also have free access to the University gym, pool, hot pot and cold pot. Hólar also provides wonderful sceneries for hiking in the mountains and the forest. This internship is not gratified, but Iceland is eligible for Erasmus+ grants. Requirements: The candidates must be enrolled in a degree in the fields of neurosciences, behavioral ecology, ethology, or relevant equivalent fields. A valid driving license is a requirement. Application: Applicants should send an application letter and CV as a single pdf to Gabrielle Laduree (gabrielle@holar.is). Requests for further information can be sent to the same email address

offre de thèse

 OFFRE DE THESE sur le comportement animal : Exploration du concept d’agentivité chez l’animal dans un contexte d’amélioration du bien-être

 

 

L’équipe cognition éthologie bien-être animal du Centre INRAE Centre Val de Loire propose une thèse financée à 100% sur la cognition animale, à partir de fin 2024.

 

Unité/Equipe d’accueil : UMR PRC 7247 - INRAE Centre Val de Loire, Equipe Cognition, Ethologie, Bien-être animal

 

Encadrants : Léa Lansade (Directrice de Recherche, HDR, INRAE Nouzilly) et Ludovic Calandreau (Directeur de Recherche, HDR, INRAE Nouzilly)

 

Date limite de candidature : 15 mai 2024

 

Début de doctorat : Novembre ou décembre 2024

 

Durée : 3 ans

 

Salaire : 1874,41 € brut mensuel

 

Résumé : Les nouvelles approches du bien-être animal incluent désormais la notion d’état mental positif. Ainsi, plutôt que de simplement chercher à limiter les évènements négatifs (stress …), on cherche à induire des situations génératrices d’états affectifs positifs, en s’inscrivant dans une démarche de « positive welfare ». Une des théories émergentes du positive welfare repose sur la notion d’agentivité. Selon cette théorie, le fait pour les animaux d’avoir un contrôle sur leur environnement, d’être plus à même de prédire ce qui leur arrive et de faire des choix éclairés serait à même de susciter un état mental positif. Le projet vise à évaluer le niveau d'agentivité des animaux d'élevage (bovidés) et à proposer des améliorations environnementales en conséquence. Les deux premières années permettront de tester les compétences des animaux en termes d’agentivité. Le doctorant développera des tests de cognition innovants afin de déterminer le niveau d’agentivité dont ils sont capables. En dernière année, le but sera de proposer des enrichissements cognitifs qui seront en adéquation avec les niveaux d'agentivité identifiés, et nous évaluerons leur impact sur le bien-être.

 

Profil idéal du candidat : L’étudiant devra avoir un cursus en lien avec l’éthologie et la cognition (M2 validé), et une envie prononcée de travailler avec les animaux d’élevage et d’en savoir plus sur leurs capacités cognitives. Un gout et une efficacité pour l’analyse statistique et surtout pour la rédaction scientifique (écriture d’articles) sont des atouts essentiels. Un permis de conduire est requis.

 

Liens :

https://umrprc-ethologie-cognition.val-de-loire.hub.inrae.fr/

Réseaux sociaux : https://x.com/EquipeCEB

https://www.researchgate.net/profile/Ludovic-Calandreau

https://www.researchgate.net/profile/Lea-Lansade-2

Pages facebook :   Ethology Lea Lansade    ;     Equipe CEB - Cognition Ethologie Bien-être Animal

 

Si vous pensez avoir le profil idéal et que vous avez envie de nous rejoindre pour trois ans, n’hésitez pas à nous contacter (idéalement avant le 15 mai) par mail, et à envoyer CV (incluant vos notes/mentions/classements) + lettre de motivation à : lea.lansade@inrae.fr

 

Offre de stage / Projet COLOCAVO

 Observer et analyser le comportement des veaux laitiers en logements collectifs Contexte : En élevage bovin laitier, la pratique courante consiste à loger les veaux individuellement durant leurs premières semaines de vie. Cette pratique a pour objectif de réduire les risques de transmission de maladies, mais aussi de faciliter la gestion de l‘allaitement, la surveillance et les soins des veaux par les éleveurs. Seuls les élevages en Agriculture Biologique ont l’obligation de loger les veaux collectivement dès 8 jours d’âge. Or, lors d’une récente consultation, l’EFSA (Autorité européenne de sécurité des aliments) a publié un avis scientifique portant sur les questions autour du bien-être des veaux et notamment sur les impacts du logement individuel et de l’espace disponible par individu. Les experts de l’EFSA ont conclu que le logement en groupe des animaux dès les premières semaines de vie, sous réserve d’une prise colostrale adéquate et de bonnes conditions d’hygiène, était préférable pour le bien-être des animaux. Par conséquent, dans l’état actuel, ces recommandations impliqueraient une généralisation à terme du logement collectif de veaux dans tous les élevages laitiers. Le travail du stage est intégré au projet de recherche COLOCAVO, qui a pour finalité de mettre au point des itinéraires d’évolution vers un logement collectif des veaux laitiers. L’objectif est de construire en stations expérimentales des itinéraires techniques optimisés (aménagements des logements, évolutions de conduites) visant à garantir le bien-être des veaux dans les logements en groupe (2 au minimum) et adaptés aux contraintes des élevages (répartition des sexes et des vêlages, contraintes matérielles liées aux structures existantes, contraintes humaines : temps et de conditions de travail). Dans ce contexte, la ferme expérimentale des Trinottières (49) va mettre en place un essai zootechnique sur la prochaine campagne des vêlages, afin de répondre aux interrogations que pose le passage en logement collectif. Le stage portera sur la mise en place de l’essai et l’analyse des comportements et des performances zootechniques des veaux. Ainsi, pourront être étudiés les effets à court et moyen termes du « pair housing » (logement par 2) pendant les premières semaines suivies d’un élevage en groupe. Les objectifs du stage : - Caractériser/analyser le comportement des veaux laitiers dans différentes situations sociales : analyser les comportements entre des animaux pour lesquels le lien social est maintenu tout au long de la phase d’élevage, et des animaux pour lesquels le lien social est rompu et qui sont inclus dans un nouveau groupe. - Analyser les performances zootechniques (croissances, ingestion, état sanitaire) - Proposer des évolutions de protocoles et de modalités à tester au vu des résultats obtenus et des conclusions des observations réalisées. Contenu du stage et méthode : - Bibliographie sur le comportement des veaux et les différentes conditions de logement et d’enrichissement. - Mise en place et participation au dispositif expérimental : installation des caméras sur la station et dépouillement des vidéos à l’aide d’un logiciel, observations comportementales visuelles, recueil et saisies de données, participation aux travaux d’élevage autour des veaux. - Traitement des données. - Rédaction d’un rapport. Conditions d’accueil : Durée du stage : 6 mois à partir du 02/09/24 Lieu : Ferme expérimentale des Trinottières (49) Indemnité : Niveau légal Logement : Pas de logement sur place Profil souhaité : - Étudiant ingénieur ou master (césurien ou non) - Bon relationnel - Intérêt marqué pour le comportement animal - Maîtrise des outils informatiques (Word, Excel, PowerPoint, R) - Maîtrise d’outil de traitement de données de comportement à partir de vidéos (BORIS) est un plus Permis B obligatoire : déplacements à prévoir Co-encadrement : - Camille ROY et Lucile OBLE (Ferme expérimentale laitière des Trinottières) - Domitille FOUVEZ (Chambre d’Agriculture de Bretagne) Merci d’envoyer votre candidature (CV + lettre de motivation) par mail aux adresses suivantes : trinottieres@pl.chambagri.fr et domitille.fouvez@bretagne.chambagri.fr en indiquant « candidature COLOCAVO » dans l’objet du mail

offre de thèse

 Un financement de thèse dans le cadre d’un contrat doctoral établissement est à pourvoir dès le mois de septembre 2024 au sein du Laboratoire de Psychologie Cognition, Communication et comportement (LP3C). 

La thèse sera co-encadrée par Nathalie Marec-Breton (PU en Psychologie du développement) et Nathalie Bonneton-Botté (MCF HDR en Psychologie du développement et de l’éducation)

**Titre de la thèse**

L’installation de la compassion pour la biodiversité marine chez l’enfant d’âge scolaire

**Disciplines**

Psychologie du développement / de l’éducation 

**Le projet de thèse**

La littératie environnementale fait référence à la façon de penser le monde en fonction de l'interdépendance des systèmes naturels et humains. Elle nécessite de considérer les répercussions de l'activité humaine sur le milieu naturel et son interaction avec ce milieu. L’enfant en développement raisonne sur le monde à partir de ses conceptions (Labrell, 2023), de ses intuitions, de ses expériences et de ses affects. L’empathie peut être définie comme la capacité à comprendre l’état mental d’autrui. Les travaux de Decety et ses collaborateurs rendent compte des différentes composantes de ce concept, notamment, de la distinction entre empathie émotionnelle et l’empathie cognitive, et de son développement chez l’enfant. Les recherches menées portent le plus souvent sur l’étude de l’empathie de l’enfant à l’égard de ses congénères. Cependant des travaux rapportent l’importance de l’empathie dans le champ de la littératie environnementale (Blythe et al., 2021) et précisent les caractéristiques empathiques dont les humains peuvent faire preuve pour les autres espèces (Begue-Shankland, 2022). A ce jour, la capacité d’agir pour protéger une espèce, et qui constitue une dimension de l'empathie, reste peu explorée. La compassion, moins connue et très peu étudiée, peut se définir comme la capacité à mettre en place des gestes de protection à l’égard d’autrui (Miralles et al., 2018 ; Decety et Holvoet, 2021). Le développement de la compassion pourrait être un déterminant essentiel à la mise en œuvre durable d’actions de préservation et de restauration de la biodiversité (Miralles et al., 2018). 

L’objectif de cette thèse sera de:

i) Caractériser le degré d’empathie et de la compassion des enfants de 6 à 11 ans à l’égard de la biodiversité marine.

ii) Identifier les moyens de développer des gestes compassionnels adaptés à l’égard de la biodiversité marine chez des enfants de différents âges.

iii) Innover pour une éducation à la biodiversité marine grâce à la conception d’un jeu sous format numérique.

**Contexte de réalisation de la thèse**

La/le doctorant·e recruté.e réalisera sa thèse au Laboratoire

La thèse sera supervisée par Nathalie Marec-Breton, Professeur des Universités en Psychologie et Nathalie Bonneton-Botté, Maître de Conférences HDR en Psychologie. La thèse s’inscrit dans le programme de recherche COMPATEER (Développement de la COMpassion à l’égard du PATrimoine marin et Education à l’Environnement en Région bretagne).  Il s’agit d’un projet initié dans le cadre d’un partenariat avec Océanopolis (Brest), la Région Académique Bretagne, l’université Rennes 2 et l’université de Bretagne Occidentale.

**Activités principales**

La/le doctorant·e recruté·e participera à l’ensemble des étapes du projet :recherche bibliographique, conceptualisation d’un jeu à visée éducative, recueil de données, analyses statistiques, rédaction d’articles scientifiques,   communications sur les avancées de la recherche, collaboration avec les partenaires.

**Profil**

• Titulaire d’un master en psychologie (et disciplines connexes), sciences cognitives, sciences de la vie et de l’environnement: éthologie.

• Solides connaissances en psychologie cognitive et/ou en psychologie du développement, attestées par les relevés de notes de Master et/ou solides connaissances en éthologie.

• Bonne connaissance des outils statistiques • Bonne maîtrise de l’anglais écrit

• Qualités rédactionnelles scientifiques et d’analyse

• Savoir collaborer avec des chercheurs d’autres disciplines

• Autonomie et prise d’initiative.

Une expérience dans la science participative et/ou dans la mise en place de jeux sérieux pourrait être aussi un réel atout.

Modalités de candidature

Les candidats intéressés doivent prendre contact avec Nathalie Bonneton-Botté (nathalie.bonneton@inspe-bretagne.fr) et Nathalie Marec-Breton (nathalie.marec-breton@univ-rennes2.fr) (dans la mesure du possible avant le 15 mai), car les dépôts des candidatures se feront sur la plateforme Amethis jusqu’au 31 mai. Une audition des candidats aux contrats doctoraux établissement aura lieu à partir du 14 juin. 

Le dossier devra être constitué d’un CV, du relevé de notes le plus récent, d’une lettre de motivation démontrant un intérêt particulier pour la recherche et le projet, ainsi que du mémoire de master ou à défaut d’une production écrite mettant en avant les compétences du candidat. Une lettre de recommandation peut également être jointe à la candidature. Toutes les précisions sur les documents nécessaires sont également disponibles sur la plateforme Amethis.

N’hésitez pas à nous contacter par mail pour toute demande complémentaire concernant le projet ou votre candidature.

Offre de thèse

 Titre : Compréhension et modélisation du comportement de nage et d’échappement des poissons dans les engins de pêche Contexte scientifique et Objectifs L'utilisation de caméras sous-marines permet d'étudier le comportement des espèces interagissant avec les engins de pêche dans leur environnement et de distinguer deux processus, la tentative d'échappement et sa probabilité de réussite. La prise en compte des réponses comportementales spécifiques des espèces ont permis d’évaluer et d’améliorer la conception d’engins de pêchés 1 . Pour les engins de pêche actifs, le comportement de certaines espèces, dans des zones spécifiques du chalut, a été étudié (e.g. poissons et calmars à l’entrée du chalut ; gadidés et poissons plats dans l'extension et le cul de chalut 2 ) afin de réduire les captures non désirées. Grâce à son approche générique et intégrée, le projet ESCAPE dans lequel s’inscrit cette thèse, a pour ambition de franchir un cap important dans les connaissances du déterminisme de la capture et de l’échappement de poissons. Par une approche multidisciplinaire associant technologie des pêches, éthologie appliquée, intelligence artificielle, écologie fonctionnelle et écologie quantitative, le projet vise à comprendre, quantifier et modéliser les différentes étapes des processus de capture et d’échappement. Il s’agira principalement d’appréhender les lois comportementales sous-jacentes liées au déterminisme morphologique, fonctionnel et social des espèces et des individus. Une fois formalisées, les différentes hypothèses de stratégies d’échappement seront testées à l’aide d’outils numériques de modélisation couplée animaux-engins de pêche. Les résultats basés sur la combinaison d’observations in situ et la modélisation permettront d’estimer les propriétés de sélectivité intra et inter des engins de pêche afin de contribuer à la conception d’engins de pêche innovants pour une exploitation plus durable des ressources marines. Plan de la thèse La thèse se structure autour de deux axes de travail. Le premier vise à analyser les données de vidéos sous-marines récoltées dans les chaluts de pêche afin d’identifier les facteurs influents la capture et les échappements de différentes espèces. Le second vise à modéliser les comportements mis en évidence à l’aide d’un outil numérique de modélisation couplée animaux-engins de pêche. Chapitre 1. Compréhension des comportements et leurs déterminismes L’observation in situ génère d’importantes quantités de vidéo, dont le traitement manuel est chronophage. Les nombreuses vidéos collectées, nécessitent l’utilisation d’un traitement automatique du signal. La première partie de la thèse visera à extraire, de façon automatique grâce à des réseaux de neurones (intelligence artificielle, IA), les trajectoires de différentes espèces de poissons dans le chalut. Ces données serviront à caractériser l’utilisation de l’espace par les différentes espèces, ainsi que sa variabilité temporelle (durée de traine), spatiale (cul/rallonge) et en fonction des types de maille. L’effet de stimuli lumineux, afin de déclencher un changement de comportement chez certaines espèces (attraction ou répulsion), sera également étudié. Les poissons ont tendance à rester à l'écart du filet et hésitent à passer à travers les mailles, alors même qu'ils pourraient facilement passer à travers. Un échappement réussi nécessite un comportement actif 3 , probablement impulsé par un fort niveau de stress et/ou d’encombrement. Dans un second temps, l’analyse fines des trajectoires individuelles et de groupe à microéchelle (< 1 m) testera dans quelles mesures la vitesse de nage, la fréquence et angle des virages, l’angle de contact avec les mailles sont reliées aux capacités visuelles et natatoires des espèces et des individus (taille) et permettent de déterminer l’effet de l’encombrement (spatial et/ou social) sur le déclenchement des échappements à travers le maillage, ainsi que sur leur probabilité de succès. Enfin pour mieux comprendre les règles de comportement sous-jacentes, la dynamique temporelle des tentatives d’échappement sera étudiée. Des modèles numériques (e.g., de survie) seront adaptés afin d’inférer sur le caractère stationnaire ou avec mémoire (dépendant du temps) des comportements observés 4 , dans différentes zones de l’engin de pêche. Chapitre 2. Modélisation couplée poisson-engin L’étude de la dynamique des filets de pêche s’effectue à l’aide d’une plateforme de simulation « multiengins » de pêche, FineLab (extension du logiciel DynamiT 5 ). Cette plateforme permet de faire interagir des individus (modèles IBM, Individual Based Model) avec un engin de pêche. La puissance des modèles IBM réside dans leur flexibilité de représentation des processus naturels observés, par exemple les comportements de nage et d’échappement des poissons, mais également dans leur capacité d’étudier le lien entre les comportements individuels et les dynamiques collectives qui en résultent. Cette approche permet d’estimer les principaux paramètres de sélectivité des engins, tels que la taille à 50 % d’échappement ou la « gamme de sélection », selon l’environnement, les espèces présentes et de leurs comportements spécifiques. Le modèle « poisson » implémente des règles de comportement, inspirés des Boids 6 : évitement, alignement et cohésion des individus, évitement de l’engin. D’autres comportements sont également intégrés comme une vision orientée, un nombre maximum de tentatives d’échappement, une préférence d’échappement vers le haut ou le bas, une vitesse de nage de « croisière », une vitesse de fuite et des paramètres d’état comme l’énergie pouvant conduire à l’épuisement de l’individu. Les valeurs de paramètres actuelles permettent de retrouver par simulation des comportements réalistes observés en mer comme la concentration de poissons devant le milieu du bourrelet. Plus récemment la prise en compte de la résistance à l’ouverture des mailles contre la poussée d’un poisson cherchant à s’échapper 7 a permis d’établir une courbe de sélectivité réaliste. Cependant ces travaux sont exploratoires et des analyses de sensibilité aux valeurs de paramètres montrent que les règles de comportement doivent être approfondies et faire l’objet d’optimisation. La seconde partie de la thèse visera à optimiser les variables du modèle IBM jusqu’à obtenir des ensembles de trajectoires comparables aux observations in situ. L’environnement graphique de la plateforme permettra la visualisation des trajectoires afin de faciliter la compréhension des interactions engin/individus. En se basant sur les résultats du chapitre 1, les principales hypothèses sur les mécanismes comportementaux et sociaux sous-jacents seront testées et leurs effets sur la probabilité d’occurrence et/ou de succès des échappements au niveau populationnel estimés. Candidatures Le(a) candidat(e) devra détenir un Master 2 en bio statistique et modélisation, biologie-écologie, de préférence marine ou discipline associée (halieutique) ou éthologie avec de fortes compétences en écologie quantitative et en modélisation. Compétences en intelligence artificielle (deep Learning), analyses d’image appréciées. Intérêt pour l’halieutique et la gestion des écosystèmes marins. CV, lettre de motivation et lettre de recommandation à envoyer à : dorothee.kopp@ifremer.fr , marianne.robert@ifremer.fr et sur la plateforme de l’ED SML Durée et localisation : Octobre 2024-October 2027 Encadrement scientifique : Marianne Robert, Benoit Vincent, Robin Faillettaz, Dorothée Kopp Laboratoire d’accueil : Laboratoire de Technologie et Biologie halieutique – Ifremer Lorient Membre de Unité Halgo : Halieutique grand Ouest et de l’UMR Decod : Durabilité et dynamique des écosystèmes : de la source à l’océan Bibliographie 1 Thomsen B et al. 2010. Fish Pots: Fish Behavior, Capture Processes, and Conservation Issues. In: He P, editor. Behavior of Marine Fishes. Oxford, UK: Wiley-Blackwell. 2 Krag LA et al. 2009. The vertical separation of fish in the aft end of a demersal trawl. ICES J Mar Sci. 3 Glass CW et al. 1993. Behavioural studies of the principles underlying mesh penetration by fish. ICES mar Sei Symp. 4 Robert M, et al. (2020). A methodological framework for characterizing fish swimming and escapement behaviors in trawls . Plos One 5 Peake SJ, Farrell AP. 2006. Fatigue is a behavioural response in respirometer‐confined smallmouth bass. Journal of Fish Biology 6 Nguyen, T.X., Winger, P.D. 2016. Numerical Modeling - A Comparison of Different Methods for Simulating Bottom Trawls. Fish. Technol. 7 Craig W. Reynolds 1987. Flocks, herds and schools : A distributed behavioral model. ACM SIGGRAPH Computer Graphics. 8 Vincent B et al., 2022. Exploring the mechanics of fish escape attempts through mesh. Fish. Res

PhD position | LEEC - Université Sorbonne Paris Nord

 PhD position: Effects of mother’s age and parity on offspring behavioral phenotype and stress neuroendocrinology in the mound-building mouse Application deadline: May 07th 2024 Applications to: rodel@univ-paris13.fr We are looking for a highly motivated and competent candidate for a 3-year PhD thesis in the Laboratoire d’Ethologie Expérimentale et Comparée (LEEC), Université Sorbonne Paris Nord (Campus Villetaneuse) to study “Effects of mother’s age and parity on offspring behavioral phenotype and stress neuroendocrinology in the mound-building mouse”. Context. Characteristics of the mother, such as her age and her parity are well known to influence phenotypic traits of her offspring, as exemplified by reported effects on offspring growth, health, and survival. However, the impact of maternal age and parity on offspring behavioral phenotype and on related individual differences in physiological stress responses, despite its potential significance for an individual’s later life, have rarely been explored. Experimentation will be conducted on mound building mice (Mus spicilegus) of wild origin, bred in our animal facilities. This small rodent shows distinct cohorts of mothers of different ages under natural conditions, with old, overwintered mothers occurring early in the breeding season, and young mothers mainly occurring during the later season. Research questions. In an experimental approach, the effects of mother’s age (young versus old mothers) and of her parity (primiparous versus multiparous) on the emergence of offspring behavioral phenotypes (consistent individual differences in behavior), and on parameters of sympathetic stress response and hypothalamic-pituitary-adrenocortical (HPA) axis activity will be investigated. The comparison of within-litter variation in these parameters of behavior and stress responsiveness between offspring from young and old and from primi- and multiparous mothers will also be a main aspect of the project. Furthermore, to obtain deeper insights into the potential mechanisms driving such purported differences in offspring phenotype, it is planned to explore age-dependent and parity-dependent differences in mothers’ behavioral phenotypes including in aspects of maternal behavior, as well as differences in such mothers’ physiological stress responses. Methods. Behavioral phenotyping will be carried out by batteries of repeated standardized behavioral tests, to quantify different traits such as exploration, boldness and sociability. Short-term, sympathetic stress responses will be assessed by recordings of fine-scaled changes in body surface temperature using infrared thermography. HPA axis stress responses will be quantified via corticosteroid concentrations in blood and corticosteroid metabolite concentrations in feces by ELISA. In addition, aspects of neuroendocrine control will be assessed by determining expression in the brain of key genes involved in HPA axis regulation by qPCR. Candidate. We are seeking a creative and motivated candidate with a Master in ethology, behavioral sciences or in a related field, with experience in behavioral observations and animal experimentation. The candidate should have very good English communication skills (min. B2); proficiency in French is not required. A good knowledge in applied statistics (preferably using R) will be advantageous. Supervision. Prof. Heiko G. Rödel and Dr. Cédric Zimmer, Laboratoire d’Ethologie Expérimentale et Comparée (LEEC), Université Sorbonne Paris, France. Email: rodel@univ-paris13.fr | website: http://leec.univ-paris13.fr Application Procedure. Applicants will be pre-selected based on their qualifications. Please send a short CV (incl. the marks of bachelor and master, and names + contact data of 2 referees) and a letter of interest by email to H.G. Rödel before/until the 07 May 2024. Do not hesitate to request further information by email. The chosen candidate will then apply with this project to the Ecole Doctorale Galilée (Université Sorbonne Paris Nord) for funding of a 3-year contract. Candidates should be willing to come in person for the interview by the Ecole Doctorale on the 11th June 2024. The thesis will start in September 2024

Research Assistant position Ozouga Chimpanzee Project (OCP), Gabon

 We still have ONE vacancy for a motivated Research Assistant (RA) to collect behavioral data on central chimpanzees (Pan troglodytes troglodytes) living in the Loango National Park, Gabon. The OCP is a long-term field site conducting research on many aspects of chimpanzee behaviour, health, and cognition (For more information see: https://en.ozouga.org/)

Responsibilities include:

The RA will receive an initial training of one week at the Comparative BioCognition Group, Institute of Cognitive Science (IKW) in Osnabrück, Germany, by members of the OCP on the data collection methods and health and safety protocols. After the initial training, the RA will travel to the Loango National Park in Gabon. The RA will be responsible for conducting daily focal animal follows on the habituated chimpanzees of the OCP. This entails following a focal chimpanzee all day long, observing and documenting aspects of their behaviour. The RA will also collect fecal and urine samples, demographic and nutritional information and potentially other data needed for specific projects (e.g., audio or video recordings). Assistance with phenology transects and camera trap maintenance will also be required. The RAs are locally supervised by the OCP field-site manager and remotely by a team of experts.

Qualifications include:
The RA should have a Bachelor/Master in Biology, Anthropology, Zoology and/or Psychology with a strong interest in behavioral ecology/animal behavior. Field experience and knowledge of behavioral data collection will be a strong advantage.

Living conditions are extremely basic. There is no running water, very limited phone coverage and internet access, and only basic solar power for electricity. Satellite phones are available in the event of an emergency. Team members live in wooden huts and the food is local and basic. Additionally, the challenging aspects of living in remote tropical conditions, coupled with the necessity of both living and collaborating with team members, underscore the importance of stress resilience, excellent social skills, and maintaining professionalism in the work environment. Working with the chimpanzees is also physically demanding, so excellent physical and psychological conditions are necessary. The RA needs to speak French AND English, and needs to be able to work independently after the training in the forest. Note that the OCP adheres strictly to gender equality and will not tolerate any form of sexual harassment.

Compensation and training:
We offer the initial training of about 1 week (depending on existing knowledge and experience) by experts from the OCP in Osnabrück, Germany. Afterwards we expect a tenure of 12 months in the Loango National Park. The research assistant receives free accommodation and a compensation of 200€ per month for living expenses etc and a contribution of 50€ towards health insurance costs. After the successful tenure, we reimburse return international flights from Düsseldorf to Libreville, as well as visa costs (to a max of 1000 €).

Application:
Please apply by sending a motivation letter, a CV (including your experience with behavioural data collection), and contact information for two referees to Dr. Tobias Deschner (tdeschner@uos.de) and Prof. Simone Pika (spika@uos.de), and state “RA OCP 2024” in the subject line.

We will start evaluating the applications on April 15th, 2024 and continue until the position is filled. Start of the appointment will be as soon as possible.

PhD position

 

Offre de doctorat / PhD position (see below for English version)

 

Titre : Origines développementales et évolutives de l’empathie chez les primates

Université : Rennes (France)

Unité de recherche : Ethologie animale et humaine

Encadrants : Marine Grandgeorge, Alban Lemasson, Maël Leroux

Financement : CDD de 3 ans

Résumé de la thèse :

L’empathie est notre capacité à comprendre et partager l’état affectif d’autrui. L’empathie intègre des réponses automatiques mais aussi conscientes, où les réactions affectives aux stimuli émotionnels perçus sont modulées par des processus cognitifs descendants amenant à des comportements prosociaux de consolation par exemple. Ces capacités cognitives avancées trouvent leur origine dans des composantes émotionnelles plus simples qui ne sont pas le propre de l’humain. Cette thèse aura pour objectif d’étudier, via une approche comparative, les trajectoires développementale et évolutive des capacités empathiques et d’analyser les mécanismes de transmission et de contagion émotionnelle entre individus avec pour questions centrales, la pertinence de différentes modalités sensorielles et les facteurs sociaux susceptibles de moduler ces processus. Pour le volet évolutif, nous comparerons l’humain au primate non-humain, notamment le mangabey à collier qui présente une socialité complexe et un riche répertoire de signaux visuels et vocaux. Pour le volet développemental, nous comparerons des humains aux développements typique et atypiques (i. e. trouble du spectre autistique, où la communication émotionnelle et sociale atypique est associée à un déficit d’attention). Nous utiliserons des méthodes observationnelles et expérimentales pour explorer les phénomènes de contagion visuelle et sonore des émotions (niveau d’excitation, valence émotionnelle) entre individus présentant des liens degrés de familiarité différents en contextes intra- et interspécifiques. La thèse se déroulera en plusieurs temps, afin d’en garantir son succès et sa valorisation au cours des 3 ans : 1/ réalisation d'une revue de la littérature pour établir les choix méthodologiques les plus pertinents pour les modèles étudiés, 2/ obtention des autorisations éthiques, 3/ études sur des primates non humains (singes hébergés à la Station Biologique de Paimpont), 4/ études sur des humains (d'âges variés).

Pour plus d’information et pour candidater : https://amethis.doctorat-bretagneloire.fr/amethis-client/prd/consulter/offre/285

Compétences requises : Diplôme de Master d’éthologie obligatoire, Expérience en recherche sur la communication des primates souhaitable, Bonne maitrise du français et de l’anglais

Date limite de candidature : 3 juin 2024

Date de début du doctorat : 01/10/2024

Contact: marine.grandgeorge@univ-rennes.fr

 

 

 

 

Thesis title: Developmental and evolutionary origins of empathy in primates    

University: Rennes (France)

Unit / team: EthoS

Supervisor’s name: Marine Grandgeorge, Alban Lemasson & Maël Leroux

Summary:

Empathy is our ability to understand and share the affective state of others. Empathy incorporates both automatic and conscious responses, where affective reactions to perceived emotional stimuli are modulated by top-down cognitive processes leading to prosocial behaviours such as consolation. These advanced cognitive capacities are rooted in simpler emotional components that are not unique to humans. Using a comparative approach to study the developmental and evolutionary trajectories of empathic capacities, this PhD aims to investigate the mechanisms of emotional transmission and contagion between individuals and assess the relevance of different sensory modalities and the social factors likely to modulate these processes. For the evolutionary aspect, we will compare humans with non-human primates, in particular red-capped mangabeys, which has a complex sociality and a rich repertoire of visual and vocal signals. For the developmental component, we will compare humans with typical and atypical development (i.e. autism spectrum disorder, where atypical emotional and social communication is associated with attention deficit). We will use observational and experimental methods to explore the phenomena of visual and oral contagion of emotions (level of arousal, emotional valence) between individuals with different degrees of familiarity in intra- and interspecific contexts. The thesis will be carried out in several stages, in order to guarantee its success and value over the course of 3 years: 1/ carrying out a literature review to establish the most relevant methodological choices for the models studied, 2/ obtaining ethical authorisations, 3/ studies on non-human primates (monkeys housed at the Paimpont Biological Station), 4/ studies on humans (of various ages).

To have more information and to apply:

https://amethis.doctorat-bretagneloire.fr/amethis-client/prd/consulter/offre/285

Skills required:

Master's degree in ethology required, experience in primate communication research desirable. Fluent in French and English.

Application dead line: June 3rd 2024

PhD beginning: October 1st 2024

Contact: marine.grandgeorge@univ-rennes.fr