Research Coordinator

 

The Ozouga Chimpanzee Project (https://www.ozouga.org/; OCP) is seeking a passionate and dedicated Research Coordinator/Camp manager for our ongoing long-term project in the Loango NP, Gabon. The person will be in charge of camp management, logistics, communication and coordination of data collection for different research projects. This includes organizing working schedules and payments for local field assistants, organizing food and other supplies, maintenance of camp infrastructure, communication with the National Park authorities (ANPN) and the National Research Institute (CENAREST). The camp manager is also in charge of processing and maintaining the sample collection ranging from urine, feces, plants, tissue and bones on a daily basis. The living conditions at this project are basic. Our camp has only basic amenities (no running water, solar power for electricity, no Internet). The Loango National Park is located on the coast of Gabon and consists of several ecosystems including coastal forest and swamps.

 

Qualifications:

Essential requirements are: (1) profound experience with behavioral data collection and analysis of chimpanzees, (2) field experience preferentially with primates and in tropical/remote areas, (3) proficient language skills (French and English), (4) above average resistance to social/psychological stress, (5) practical and technical skills required to maintain the camps technical infrastructure (e.g., solar electricity, satphone, cybertracker software), (6) the ability to achieve tasks by improvisation, and flexibility, using limited resources that are available, (7) the capacity to live and work with an international team of students, assistants and local staff. Candidates should have strong social skills, a sense of leadership, a strong motivation to take responsibility and tolerance to local costumes. (8) Qualification in zoology, biology will be preferred, (9) Experience driving a quad bike is an asset.

 

The successful candidate will be required to have basic health insurance that also covers emergency repatriation and liability. They must also provide valid proof for vaccinations against measles, yellow fever, hepatitis A and B, polio, and meningitis and a negative TB test.

 

Note that the OCP adheres strictly to gender equality and will not tolerate any form of sexual harassment.

 

Salary/funding:

2.500 Euro/month

 

Support provided for position

-        per diem for travel

-        lap top

-        food and accommodation in a single hut at the field site

-        domestic transportation

-        international return flight (reimbursement ONLY AFTER SUCCESSFUL COMPLETION OF A 12 MONTHS TERM OF APPOINTMENT)

 

Term of Appointment: min. 12 months, starting March 2026-Feb. 2027

 

Application deadline: 05.02.2026

 

Contact Information:

Please apply by sending a motivation letter, a CV (including your experience with behavioural data collection and management), and contact information for two references to Dr. Tobias Deschner (td@ozouga.org) and Prof. Simone Pika (sp@ozouga.org). We will start evaluating the applications on February 10th, 2026 and continue until the position is filled.

Two Field Assistant Positions

 

Join the Ozouga Chimpanzee Project Team! Two Field Assistant Positions Available

 

The Ozouga Chimpanzee Project (https://www.ozouga.org/; OCP) is seeking two passionate and dedicated field assistants to join our team to help in collecting behavioural data on wild Central-African chimpanzees (Pan troglodytes troglodytes). Together with an international and local team, the candidates will be responsible for the collection and management of research data, as well as for the day-to-day maintenance of equipment

About Us:

The OCP is a research initiative committed to the conservation and study of chimpanzees in their natural habitat. Located in the Loango National Park, our project aims to unravel the complexities of chimpanzee behavior, behavioural diversity, cognition, social dynamics, and ecological interactions.

The Loango National Park is located along the Atlantic coast of Gabon and consists of several ecosystems including primary and secondary forests, coastal forests, swamps and mangroves. The Ozouga field sites is roughly 40 km from the nearest village, Iguela, on an open savannah surrounded by forest. 

Living conditions are extremely basic. There is no running water, very limited phone coverage and internet access, and basic solar power for electricity. Team members live in wooden huts and food is local and basic.

The Position

We are looking for two enthusiastic, disciplined, positive and patient persons that are eager to spend a one-year period in observing and documenting the lives of the Rekambo chimpanzee community. This is a unique opportunity to gain field experience and contribute to cutting-edge research in one of Africa’s most beautiful rainforests.

The work is physically and mentally demanding, with typical days consisting of approximately 10 hours walking in the forest, often through swamps, with an average of 10-15 km per day, including rain, high air humidity and sunshine. We conduct field work from dusk till dawn given the safety protocol in respect to forest elephants. Field assistants will always be accompanied by an experienced eco-guide who will assure safety during work. Note that the OCP adheres strictly to gender equality and will not tolerate any form of sexual harassment.

Responsibilities

As a field assistant, you will be responsible for:

·       Following and observing chimpanzee groups daily in their natural habitat

·       Record behavioral data, social interactions, and ecological observations

·       Assist in the collection and storage of samples mostly for genetic and endocrinological studies

·       Save, store and annotate behavioural data on electronic devices

·       Monthly check of the camera traps placed in the research area

·       Monthly phenological data collection

·       Preliminary analyses of camera trap videos

·       Collaborate with the research team to ensure the smooth operation of the project

Qualifications:

1.     Bachelor's degree in biology, primatology, veterinary medicine, or related field (or equivalent experience)

2.     Previous field experience with primates or other animal species in tropical or remote environments

3.     Proficiency in written and spoken English; basic knowledge of French

4.     Physical and mental fitness, ability to work in remote and ecologically challenging locations

5.     Capacity to live and work collaboratively with an international and local team

6.     Good communication skills with other team members, project manager and (remotely) with project directors

7.     Excellent communication skills and motivation to manage multiple responsibilities

8.     Demonstrate tolerance to customs and practices of local communities

 

Beneficial qualifications (please indicate these clearly in your application, if present):

 

·         Experience with equipment such as GPS, video cameras and camera traps.

·         Experience with animal behavioral observation and data collection

·         Familiarity with sample collection and storage methods.

·         Proficiency in MS Excel, Cybertracker, GIS, BaseCamp and/or MapSource4

·         Experience driving a quad bike.

Support provided:

·         Small monthly stipend and reimbursment of expenses (see details below)

·         Training for data collection and work in challenging environment

·         Opportunity to gain in-depth field experience on chimpanzee behaviour

·         Data collection equipment (waterproof phones, GPS and video cameras) and binoculars. We can also offer advice about what items are necessary for daily life in a tropical dry forest. However, the candidates will need to provide their own backpack, field clothing, and footwear.

 

Funding and Compensation:

This is a training position, so there is no formal salary, but there is an extra monthly stipend of 200 EUR, in addition to 50 EUR for health insurance reimburse.

One round-trip airfare* from your home city to Libreville and living support while conducting fieldwork will be provided (e.g., travel, meals, lodging, visa* trips every 6 months).

The project will provide emergency travel health insurance, but the assistants needs to have their own basic healthcare plan.

The assistants will be responsible for covering expenses during vacations (3 weeks of vacation after 6 months’ time). Gabon requires specific vaccination against yellow fever to enter the country, but the assistants will be responsible for securing any recommended vaccinations by the Ozoga Chimpanzee Project to ensure safety of both chimpanzees and human observers.

 

*       Reimbursement only after successful completion of a 12-month term of appointment

 

Term of Appointment:

Minimum 12 months starting in March/April 2026 (to be discussed at the interview stage). Possibility to extend stay with the project is available, pending performance.

 

How to Apply:

Please apply by sending a motivation letter, a CV (including your experience with behavioural data collection), and contact information for two references to Dr. Tobias Deschner (tdeschner@uni-osnabrueck.de) and Prof. Simone Pika (simone.pika@uni-osnabrueck.de). We will start evaluating the applications on February 10th, 2026 and continue until the position is filled.

 

Annonce poste CRCN Bien-être

 

l’offre de poste INRAE (concours ouvert) pour un(e) chargé(e) de recherche au sein de l’UMR Herbivores équipe CARAIBE sur l’agentivité et le bien-être des ruminants d’élevage ?

https://jobs.inrae.fr/concours/concours-charges-recherche-classe-normale-profil-h-f/cr26-phase-4

 

Personnes à contacter : Claudia Terlouw claudia.terlouw@inrae.fr et Romain Lardy romain.lardy@inrae.fr

 

Equitation Science PhD course

Offre de stage - élevage de corneilles

 MSc theses and internship opportunities
Tasks include:
•
Feeding, weighing and maintenance of the chicks
•
Preparing clean artificial nests
•
Audio / behavioural data collection (master thesis available)
Time commitment:
•
Minimum three weeks of intense hand-raising, expected to start late April or early May. A flexible availability between mid-April and mid-June is ideal.
•
Day and night shifts shared between the members of the team.
This internship is ideal for highly-motivated students interested in gaining a unique hands-on hand-raising experience or looking for a master thesis. No previous experience required, training will be provided for all necessary skills.
If you are interested and want more information, please contact: valentine.comin@univie.ac.at
Poster valid until March 31st 2026
Where: Haidlhof research station, Bad Vöslau, Austria
Supervision: Valentine Comin and Prof. Barbara Klump
Help us hand-raise crows to investigate their vocal, motor and social development

Post-doctoral Researcher Position 2026

 

The impact of global change on parental care systems and population resilience

Department of Zoology, University of Veterinary Medicine Budapest (UVMB), Budapest, Hungary (https://univet.hu/)

 

Rapid global change, including human disturbance and climate warming, poses mounting risks to wild animal populations. Successful parental care strategies may buffer against the negative consequences of global change. However, both human disturbance and climate warming may disrupt parental behaviour, accentuate the costs of care and sexual conflict, interfere in parental cooperation and ultimately cause lethal and non-lethal damage to offspring. Yet we currently lack information on how global change may influence sex roles in care and parental cooperation, the physiological impacts on parents and offspring, and its consequences for the viability of populations.

 

Our project will examine how climate change and human disturbance shape parental strategies and its consequences for population productivity by utilising (1) large scale studies across multiple species exhibiting diverse patterns of parental care in varied climatic regions, (2) field experiments of climate and disturbance in natural populations, and (3) detailed studies within populations to determine how climate change and human disturbance may interact to shape parental care strategies and the consequences for population resilience and productivity.

 

We will achieve this by combining fieldwork, behavioural research, experimentation, population monitoring, movement tracking and molecular lab research across multiple populations of a diverse avian group (shorebirds). Shorebirds are an ideal group to investigate the impact of global change on parental care as they provide a wide variety of parental care systems, are globally distributed, reproduce in varying climatic environments and are facing threats globally due to climate variability and human encroachment.

 

We seek to recruit a post-doctoral researcher to contribute to this project.

 

Who are we

Our international team led by Dr Grant C. McDonald (UVMB, Hungary) in collaboration with Dr Mike Weston (Deakin University, Australia), Prof. Andrew McKechnie (University of Pretoria, South Africa), Prof. Tamás Székely (University of Bath, UK) and Dr András Kosztolányi (UVMB, Hungary) comprises diverse experience in reproductive strategies research, investigating the detailed evolutionary and social underpinnings of parental care strategies, the impacts of climate on behaviour and physiology, and the impact of human disturbance on avian populations both on local population and global scale.

 

Main responsibilities of the post-doctoral researcher

> Organising and conducting avian fieldwork at selected study locations (e.g. Africa, Asia and Europe) in association with collaborators for several months per year

> Conduct experiments and behavioural observations in the field

> Blood sample collection and close cooperation with molecular laboratory collaborators

> Coordinate data collection by collaborating international research teams

> Conduct statistical analyses of datasets to address within- and between-population questions

> Writing manuscripts targeted towards top-ranked journals in the field

> Support the supervision of students and research assistants

> Work in partnership with locally based conservation NGOs and participating institutions

> Communicate results at international conferences, to stakeholders and to the broader public

> Support additional scientific activities that are important for the success of the project

 

What we are seeking

> PhD in life sciences (evolutionary biology, zoology or comparable field)

> Foundational knowledge in behavioural ecology, animal behaviour or evolutionary ecology

> Hands-on experience conducting international fieldwork with wild populations, preferably in birds

> Firm skills in data management and statistical analysis using R 

> Track record of converting scientific research into peer review publications

> Excellent written and oral communication skills in English

> Ability to work independently and collaborate as part of international team

> Openness to live in different cultures during extensive fieldwork periods 

>  Strong project management and leadership skills

> Valid driving licence

 

What we offer

> A 2.5 year position (with the possibility of extension) based at the University of Veterinary Medicine Budapest

> Fieldwork in multiple locations across the globe (incl. Cabo Verde, and sites in Europe and Asia)

> Extensive opportunities for networking and mentoring with international research teams

> Competitive local salary (including paid holiday, fieldwork per diem)

> English speaking research team

> Opportunity to contribute to conservation and collaborations with NGOs at the different field sites

> Opportunities to present research at national and international meeting

> Support to develop follow-up projects and independent research fellowship applications

 

How to apply

Interested candidates should contact Grant C. McDonald (grant.mcdonald@univet.hu). The application should include a max two pages cover letter, a CV with list of publications, and the name and contact details of at least two referees from research, academia or conservation. 

 

Deadline: Application deadline is 28 February 2026. Interviews will be held in March 2026.

Start Date: Start dates are negotiable but could be as early as April 2026.

 

Selected publications

Engel, N., G. C. McDonald, B. K. Sandercock, R. Rice, R. Moreno, S. Ratão, and T. Székely. 2023. Long-term decline in nest survival of a ground-nesting shorebird on a tropical island. Glob. Ecol. Conserv. 45:e02522.

Halimubieke, N., K. Kupán, J. O. Valdebenito, V. Kubelka, M. C. Carmona-Isunza, D. Burgas, D. Catlin, J. J. H. St Clair, J. Cohen, J. Figuerola, M. Yasué, M. Johnson, M. Mencarelli, M. Cruz-López, M. Stantial, M. A. Weston, P. Lloyd, P. Que, T. Montalvo, U. Bansal, G. C. McDonald, Y. Liu, A. Kosztolányi, and T. Székely. 2020. Successful breeding predicts divorce in plovers. Sci. Rep. 10:15576.

 

McDonald, G. C., Z. Barta, B. A. Caspers, T. Székely, and A. Kosztolányi. 2024. Sex roles in parental care in a species with precocial offspring and frequent brood desertion. Anim. Behav. 215:211–225.

 

McDonald, G. C., I. C. Cuthill, T. Székely, and A. Kosztolányi. 2023. Remating opportunities and low costs underlie maternal desertion. Evolution 77:97–109.

 

McDonald, G. C., N. Engel, S. S. Ratão, T. Székely, and A. Kosztolányi. 2020. The impact of social structure on breeding strategies in an island bird. Sci. Rep. 10:13872.

 

McDonald, G. C., K. Tasman, N. Engel, T. Székely, and A. Kosztolányi. 2025. Inconsistent fear: repeatability in flight initiation distance and neophobic behaviour differs in a ground-nesting bird. Anim. Behav. 225:123224.

 

Roast, M. J., G. C. McDonald, T. Székely, A. Kosztolányi, and I. Maggini. 2025. No detectable deployment impacts of solar-powered GPS devices for long-term use on a small shorebird. J. Avian Biol. 2025:e03508.

 

Székely, T., M. C. Carmona-Isunza, N. Engel, N. Halimubieke, W. Jones, V. Kubelka, R. Rice, C. E. Tanner, Z. Tóth, J. O. Valdebenito, K. Wanders, and G. C. McDonald. 2024. The causes and implications of sex role diversity in shorebird breeding systems. Ibis 166:357–385.

Proposition de stage de M1

 

Nous recherchons une personne intéressée pour effectuer un stage de 2 mois maximum (M1 ou césure, non gratifié), disponible pour commencer dès mars 2026 au Laboratoire Ethologie, Cognition, Développement (LECD) à l'Université Paris Nanterre.

Exploration & régularités temporelles sonores chez le diamant mandarin

Le cadre théorique de ce stage est celui des régularités temporelles et de ses bénéfices. Chez l’humain, les régularités temporelles apparaissent soutenir la mobilisation de l’attention, notamment au cours du développement précoce. Mais aucun argument fort ne semble soutenir un effet équivalent chez les espèces animales non humaines. Or, on sait que les oiseaux capables d’apprentissage vocal sont compétents à traiter les régularités temporelles. L’idée de cette étude est que les régularités temporelles de l’environnement puissent soutenir la mobilisation des individus, ici les diamants mandarins, pour explorer un nouvel environnement.

La personne stagiaire aura pour missions :

1.       prioritairement de réaliser les passations ,

2.       de participer aux analyses vidéos

3.       et si l’avancement le permet, de participer au traitement statistique des données.

Compétences recherchées

×          Solides connaissances dans les domaines de l’éthologie et des sciences cognitives.

×          Autonomie et rigueur nécessaire à l’expérimentation et aux analyses.

×          Maîtrise des logiciels d’analyse vidéo (Boris) et de traitement statistique (type R).

Encadrement : Anne Bobin-Bègue (LECD)

https://lecd.parisnanterre.fr/

Modalité de candidature : envoyer parcours académiques, expériences et motivation à abobinbe@parisnanterre.fr

Merci par avance pour la diffusion de cette annonce.

Anne Bobin-Bègue

Maître de Conférences en Psychologie du Développement
Laboratoire Ethologie, Cognition, Développement, Université Paris Nanterre

@LecdNanterre
01 40 97 74 70 (pas de répondeur ni affichage de numéro)

Offre de poste : Chargé.e de mission

 Dans le cadre de son développement, Akongo recrute !
En étroite collaboration avec l’équipe du bureau d’études, vous êtes en charge de l’analyse des données collectées dans les différents projets scientifiques relatifs à l’évaluation du bien-être des animaux en captivité, et vous serez pleinement impliqué dans l’évolution et le développement de notre outil de suivi du bien-être animal.
Présentation des activités de l’entreprise
AKONGO est un bureau d’études spécialisé dans le conseil pour le suivi et l’amélioration du bien-être animal. Nous travaillons avec des parcs zoologiques, des fermes pédagogiques et des laboratoires en France et en Europe. Notre mission est d’accompagner les équipes dans une approche OneWelfare, et d’effectuer un suivi du bien-être des animaux en utilisant des outils d’évaluation basés sur des paramètres zootechniques, nutritionnels et comportementaux. Notre équipe travaille de façon pluridisciplinaire et collaborative afin de développer et systématiser des pratiques plus respectueuses de l’animal, de l’environnement et de l’humain.
Missions principales
• Analyse des données collectées en parcs zoologiques (données comportementales et questionnaires d’évaluation du bien-être, analyses descriptives et statistiques)
• Coordonner le support et gérer les retours utilisateurs sur l’outil de suivi
• Assurer une veille scientifique et réaliser des synthèses bibliographiques notamment sur les pratiques en parcs zoologiques et laboratoires et les aspects réglementaires relatifs au bien-être des animaux
• Participation au développement et à l’évolution de notre outil de suivi du bien-être animal
• Appui à l’équipe sur les projets scientifiques (planification, préparation, analyses de données, mise en forme des résultats, bilan…) et les audits (préparation des audits, saisie et analyse des données, rédaction de rapports d’expertises).
• Rédaction scientifique (publications scientifiques, communications écrites et orales)
• Rédaction de notes, recommandations, dossiers techniques et argumentaires à destination des professionnels
• Encadrement de stagiaires
• Participation à la formation continue des professionnels : création de contenu, mise en application
Profil et compétences requises
– Diplômé.e Master ou Doctorat, de formation scientifique, cursus universitaire (éthologie, biologie) ou ingénieur agronome
– Grandes capacités d’organisation et de gestion
– La personne recrutée travaillera sur plusieurs projets en même temps
Compétences opérationnelles :
• Savoir coordonner différents projets et en assurer l’expertise technologique et scientifique
• Savoir réaliser des analyses descriptives et statistiques des données (ex : mise en forme de jeux de données, utilisation du logiciel R)
• Rigueur scientifique, excellente capacité d’analyse et de synthèse
• Capacités pour synthétiser et vulgariser des sujets
• Maîtrise du français et de l’anglais
Compétences comportementales
• Gérer les relations avec des interlocuteurs très variés
• Ouverture d’esprit et curiosité intellectuelle
• Aptitude pour le travail en autonomie comme en équipe
• Faire preuve de pédagogie
• Appétence pour la communication et la vulgarisation scientifique
Conditions de travail
• CDI, temps complet
• Poste de bureau basé à Nantes
• Déplacements sur le territoire français et/ou en Europe possibles (formations, conférences)
• Prise de poste souhaitée : printemps 2026
• Salaire basé sur le barème Syntec, Ingénieurs et cadre, échelon 1.2 - coefficient 100 - échelon 2.1 - coefficient 115, en fonction de l’expérience
Clôture des candidatures
Offre ouverte jusqu’à ce que le poste soit pourvu. Les dossiers seront examinés au fur et à mesure de la réception des candidatures.
Contact
Merci d’envoyer un CV, une lettre de motivation, ainsi que le nom et l’adresse électronique de 1 personne pouvant fournir des références à contact@akongo.fr

Postdoc position in bioacoustics

 

We are looking for a Postdoc with experience in Bioacoustics to join our team on the ANIML project, where the goal is to study the complex units of budgerigar (Melopsittacus undulatus, a small parrot species) warble song. In prior work, we showed that these song units contain subunits that are similar to consonants and vowels in human speech. However, our recordings were limited to mostly male songs that were produced directly by willing individuals into an experimenter’s microphone.This project has been running for 1.5 years with a team with backgrounds in signal processing/machine learning to develop a pipeline to record individual budgerigar vocalizations while they are all vocalizing naturally together in a group. We are now looking for someone with expertise to study this dataset as it becomes available. 

This project is being hosted at the Acoustics Research Institute, which is an interdisciplinary institute with researchers of many fields (e.g., biology, phonetics, mathematics, physics, psychoacoustics etc). This allows us to address interdisciplinary problems in acoustics and is a unique work environment.

Deadline: February 15

Start date: June 2026 (with some flexibility)

The position is limited to 2 years but a short-term (max 12 months) extension may be possible. 

For details and how to apply, see: https://www.oeaw.ac.at/en/oeaw-home/jobs?jh=a16ucy4z9sicr0g4bj0wvv3ritd0kml

Offre de Stage de 2 mois – Réentraînement et Optimisation du Modèle de Reconnaissance Faciale des Macaques Japonais de Kōjima

 Contexte
L'identification individuelle joue un rôle clé dans la conservation des espèces et l'étude des réseaux sociaux animaux. Notre équipe a développé avec succès un premier modèle de reconnaissance faciale des macaques japonais (Macaca fuscata) de l'île de Kōjima (Japon) basé sur YOLO (Paulet et al., 2024, Primates). Ce modèle a atteint une précision de 82,2% pour la détection faciale et 91% pour l'identification individuelle de 42 individus. Ce stage vise à améliorer significativement ces performances en réentraînant les modèles avec de nouvelles données et en optimisant les hyperparamètres, afin de permettre une génération automatique et fiable de réseaux sociaux à partir de vidéos de terrain.
Missions
1. Enrichissement et annotation de la base de données
• Extraire de nouveaux frames à partir du répertoire vidéo existant de Kōjima
• Annoter les visages des macaques sur Roboflow (détection et identification individuelle)
• Équilibrer le dataset pour améliorer la représentativité de tous les individus
• Appliquer des techniques d'augmentation de données adaptées
2. Réentraînement et optimisation des modèles YOLO
• Réentraîner le détecteur de visages (YOLOv8) avec le dataset enrichi
• Réentraîner le classificateur individuel avec les nouvelles annotations
• Explorer différents hyperparamètres (batch size, learning rate, epochs) pour optimiser les performances
• Tester différentes versions de YOLO (v8 Nano, Small, Medium) selon les ressources disponibles
3. Évaluation comparative des performances
• Mesurer la précision, l'IoU (Intersection over Union) et produire des matrices de confusion
• Comparer les résultats avec le modèle initial (Paulet et al., 2024)
• Analyser les erreurs de classification (faux positifs/négatifs) et proposer des améliorations
4. Documentation et valorisation
• Documenter le pipeline de traitement et les choix méthodologiques
• Préparer un rapport technique détaillé avec recommandations
• Contribution potentielle à une publication scientifique
Profil Recherché
Formation :
• Étudiant(e) en Master 1 ou Master 2 en informatique, IA, mathématiques appliquées ou vision par ordinateur
Compétences techniques requises :
• Expérience en deep learning et vision par ordinateur
• Maîtrise d'un framework de deep learning (PyTorch ou TensorFlow)
• Connaissance de YOLO (YOLOv5/v8) et d'Ultralytics
• Expérience avec Roboflow ou outils d'annotation similaires (LabelImg, CVAT)
• Programmation Python (OpenCV, pandas, numpy)
Compétences appréciées :
• Connaissance des métriques d'évaluation en computer vision
• Expérience avec Google Colab ou environnements GPU cloud
• Intérêt pour l'éthologie et la biologie comportementale
Qualités personnelles :
• Rigueur dans l'annotation des données
• Autonomie et capacité à tester différentes approches
• Sens de la documentation et de la reproductibilité scientifique
Conditions du Stage
• Durée : Moins de 2 mois (8 semaines maximum)
• Gratification : Non rémunéré (stage < 2 mois)
• Période : Libre
• Lieu : Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg-
CNRS, Strasbourg
• Type : Stage de License, de Master 1 obligatoire ou stage volontaire
• Ressources techniques :
o Accès à Google Colab Pro (GPU A100)
o Dataset vidéo existant de Kōjima (+ de 5985 frames annotés)
o Code source GitHub disponible (https://github.com/AxelCodaeMolina/AI-Saru)
Encadrement
• Cédric Sueur – Professeur à l'Université de Strasbourg (directeur de stage)
• Julien Paulet – Doctorant à l'Université de Strasbourg (encadrant principal, premier
auteur de l'article)
• Collaboration scientifique :
o Benoit Naegel (Professeur, expert en traitement d'images)
o Jérôme Pansanel (Ingénieur de recherche CNRS)
o Takafumi Suzumura et Shinya Yamamoto (Wildlife Research Center, Kyoto University)
Atouts du Stage
✅ Travail concret : Suite directe d'une publication scientifique récente (Primates, 2024)
✅ Impact visible : Amélioration mesurable d'un système déjà fonctionnel
✅ Données réelles : Dataset unique de primates sauvages étudiés depuis 60 ans
✅ Valorisation : Possibilité de co-signature sur une future publication
✅ Compétences IA : Expérience pratique en deep learning appliqué à la conservation
✅ Collaboration internationale : Lien avec le Wildlife Research Center de Kyoto University
Candidature
Envoyer à cedric.sueur@iphc.cnrs.fr :
• CV détaillé (mentionner vos expériences en deep learning et computer vision)
• Lettre de motivation (expliquer votre intérêt pour ce projet spécifique)
• Exemples de projets en vision par ordinateur (GitHub, rapports, etc.) si disponibles

Offre de Stage de 2 mois – Annotation Comportementale et Entraînement IA pour l'Étude Automatique des Comportements Culturels du Macaque Japonais avec LabGym2

 Contexte
Le macaque japonais (Macaca fuscata) présente des comportements culturels transmis socialement depuis plus de quatre décennies, notamment la manipulation de pierres (stone-handling) et le toilettage social (grooming). L'étude de ces comportements nécessite traditionnellement des centaines d'heures d'observation manuelle et d'annotation vidéo, un processus chronophage et coûteux pour les chercheurs.
Notre équipe a développé avec succès un premier pipeline d'analyse automatique basé sur LabGym2 (Ardoin & Sueur, 2024), un outil de deep learning permettant la détection et la classification automatique de comportements animaux sans nécessiter de GPU. Les résultats préliminaires sont prometteurs avec un détecteur de macaques atteignant 95,4% de précision (mAP@0.5).
Ce stage vise à enrichir massivement le dataset d'entraînement pour améliorer la reconnaissance automatique des comportements de toilettage et de manipulation de pierres, en vue d'une publication dans l'American Journal of Primatology.
Missions
1. Annotation comportementale intensive avec LabGym2
Détection des macaques et objets :
• Annoter des macaques japonais sur des milliers d'images issues de vidéos de Kōjima (format COCO)
• Annoter les pierres manipulées lors des comportements de stone-handling
• Utiliser Roboflow pour l'annotation et la gestion du dataset
• Participer à l'amélioration du détecteur existant (actuellement à 95,4% mAP@0.5)
Classification des comportements :
• Annoter finement les séquences de toilettage social (grooming) :
• Annoter les séquences de manipulation de pierres (stone-handling) :
Objectifs quantitatifs :
• Enrichir le dataset existant
• Créer au minimum 2000 nouvelles annotations comportementales
• Équilibrer les classes sous-représentées (transitions, comportements rares)
2. Support à l'entraînement des modèles LabGym2
Détecteur (Detector) :
• Contribuer à l'entraînement/réentraînement du détecteur de macaques
• Tester la robustesse du détecteur sur différents contextes (luminosité, arrière-plans, poses)
• Documenter les performances (mAP, IoU, matrices de confusion)
Catégoriseur (Categorizer) :
• Participer à la création des datasets d'entraînement pour le categorizer
• Extraire et labelliser des "animations" (séquences de frames) représentant chaque comportement
• Générer des "pattern images" (images de patrons de mouvement) pour la classification
3. Validation et tests sur vidéos réelles
• Tester le pipeline complet LabGym2 sur de nouvelles vidéos
• Identifier les erreurs de classification et proposer des améliorations
• Produire des statistiques comportementales automatiques
• Documenter les limites et perspectives du système
4. Documentation scientifique
• Rédiger un rapport technique détaillé avec protocoles d'annotation
• Contribuer à la préparation d'un manuscrit
• Créer du matériel supplémentaire (vidéos annotées, guides méthodologiques)
Profil Recherché
Formation :
• Étudiant(e) en License ou Mastr en éthologie, biologie comportementale, écologie, sciences cognitives, ou informatique appliquée à la biologie
Compétences requises :
Compétences biologiques :
• Connaissances en éthologie et comportement animal (primates particulièrement apprécié)
• Capacité à identifier et discriminer des comportements complexes
• Intérêt pour la culture animale et la transmission sociale
Compétences techniques :
• Rigueur et précision dans l'annotation de données
• Expérience avec des outils d'annotation d'images (Roboflow, LabelImg, CVAT, ou similaires)
• Notions de base en Python (apprécié mais non obligatoire)
• Familiarité avec les concepts de machine learning et computer vision (souhaité)
Compétences organisationnelles :
• Excellentes capacités de gestion de projet et coordination d'équipe
• Aisance relationnelle pour encadrer des volontaires bénévoles
• Autonomie et sens de l'organisation pour gérer un volume important d'annotations
Qualités personnelles :
• Patience et minutie (l'annotation est chronophage et répétitive)
• Motivation pour contribuer à un projet innovant en conservation
• Curiosité scientifique et créativité pour résoudre des problèmes méthodologiques
Conditions du Stage
• Durée : Moins de 2 mois (8 semaines maximum)
• Gratification : Non rémunéré (stage < 2 mois)
• Période : Libre
• Lieu : Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg-CNRS, Strasbourg
• Type : Stage de de License, de Master 1 obligatoire ou stage volontaire
Ressources techniques disponibles :
• Accès à Roboflow pour l'annotation collaborative
• Plateforme LabGym2 installée sur machine virtuelle CNRS (16 processeurs Intel® Xeon® Gold 6242 + NVIDIA Tesla T4 GPU)
• +65 minutes de vidéos de comportements sociaux de macaques japonais (Kōjima)
• Dataset existant de 1862 images annotées (détecteur à 95,4% mAP)
• Guides d'annotation et protocoles déjà développés
• Réseau de volontaires potentiels pour le projet citoyen
Encadrement
Équipe d'encadrement :
• Cédric Sueur – Professeur à l'Université de Strasbourg (directeur de stage)
• Julien Paulet – Doctorant à l'Université de Strasbourg (encadrant principal, premier auteur de l'article)
Collaborations scientifiques :
• Dr. Yujia Hu (créatrice de LabGym2, Georgia Institute of Technology, USA)
• Dr. Bing Ye (créateur de LabGym2, Life Sciences Institute, University of Michigan, USA)
Atouts du Stage
✅ Projet innovant : Première utilisation de LabGym2 pour l'étude comportementale des primates
✅ Impact concret : Vos annotations alimenteront directement une publication scientifique (co-signature possible)
✅ Collaboration internationale : Travail avec les créateurs de LabGym2 (USA)
✅ Science citoyenne : Expérience unique de coordination d'un projet participatif
✅ Compétences transférables : Annotation de données (compétence très recherchée en IA)
✅ Terrain virtuel : Travailler sur des données de primates sauvages étudiés depuis 60 ans à Kōjima (Japon)
✅ Accessibilité technique : LabGym2 ne nécessite pas de GPU, approche plus accessible que d'autres outils IA
✅ Culture animale : Contribution à l'étude de comportements culturels transmis socialement
Candidature
Envoyer à cedric.sueur@iphc.cnrs.fr :
Dossier de candidature :
1. CV détaillé (mentionner toute expérience en éthologie, annotation de données, ou gestion de projet)
2. Lettre de motivation expliquant :
o Votre intérêt pour l'éthologie et les comportements culturels
o Votre expérience avec l'annotation ou l'observation comportementale
o Votre motivation pour un travail minutieux et répétitif

Offre de Stage de 2 mois – Intelligence Artificielle pour la Reconnaissance Faciale des Gorilles de Montagne et Orangs-outans

 Contexte
L’identification individuelle joue un rôle clé dans la conservation des espèces menacées. Les méthodes classiques impliquent souvent des marquages invasifs, tandis que l’intelligence artificielle (IA) permet aujourd’hui une reconnaissance faciale non intrusive à partir d’images et de vidéos. Nous avons déjà développé un modèle basé sur YOLO pour la reconnaissance faciale des macaques japonais (Macaca fuscata) avec succès. Ce stage vise à adapter et développer ces outils pour identifier automatiquement les gorilles de montagne (Gorilla beringei beringei) du Parc National des Virunga et les orangs-outangs (Pongo pygmaeus) en Indonésie, en collaboration avec la Borneo Orangutan Survival Foundation (BOS).
Missions
• Adapter et entraîner des modèles de deep learning (YOLO, Faster-RCNN, etc.) pour la détection et la reconnaissance individuelle des gorilles et orangs-outangs.
• Collecter et annoter des bases de données d’images et vidéos fournies par nos partenaires.
• Évaluer la performance des modèles et optimiser l’algorithme pour minimiser les erreurs de reconnaissance.
• Intégrer ces modèles dans des outils pratiques pour le suivi et la conservation des populations de primates.
Profil Recherché
• Étudiant(e) en Master 1 ou Master 2 en mathématiques appliquées, biologie computationnelle, informatique ou IA.
• Expérience en deep learning, vision par ordinateur et frameworks comme TensorFlow ou PyTorch.
• Connaissance en traitement d’images et en annotations de bases de données tel que Roboflow.
• Intérêt pour l’éthologie et la conservation des primates.
• Capacité à travailler de manière autonome tout en intégrant une équipe de recherche.
Conditions du Stage
• Durée : Moins de 2 mois (8 semaines maximum). Pas de gratification
• Période : Libre
• Lieu : Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg-CNRS, Strasbourg.
• Encadrement : Cédric Sueur (Professeur à l’Université de Strasbourg) et Julien Paulet (doctorant à l’Université de Strasbourg). Collaboration avec Benoit Naegel (Professeur à l’Université de Strasbourg) et Jérôme Pansanel (Ingénieur de recherche CNRS).

• Type de stage : Stage de License ou de Master 1 obligatoire ou stage volontaire (non
rémunéré).
 

Candidature
Envoyer CV et lettre de motivation à cedric.sueur@iphc.cnrs.fr.

PhD studentship

Mutation load dynamics in banded mongooses.
Supervisors: Prof Joe Hoffman (Bielefeld University, Germany) and Dr Hazel Nichols (Swansea University, United Kingdom).
An outstanding opportunity is available for a PhD student to work on mutation load dynamics in a cooperatively breeding mammal, the banded mongoose. The position is available in Joe Hoffman’s research group (www.thehoffmanlab.com) at the Department of Evolutionary Population Genetics at Bielefeld University and is co-supervised by Hazel Nichols at Swansea University. The position is fully
funded for three years.
The PhD project
Ever since Darwin, inbreeding depression has been recognized as a major evolutionary force affecting individual fitness and population viability. Consequently, in an era of unprecedented anthropogenic impacts on wild populations and global species declines, understanding the mechanisms underlyinginbreeding depression is more pressing than ever. Traditional studies used genome-wide inbreeding as a proxy for the effects of deleterious mutations on fitness, but the specific contributions of these mutations remain poorly understood. Fortunately, advances in genome sequencing and bioinformatics now allow the prediction of deleterious mutations from whole-genome data, enabling investigation of their dynamics in wild populations.
This project will explore how predicted deleterious mutations influence fitness in the banded mongoose (Mungos mungo), a cooperatively breeding African mammal. In this species, inbreeding occurs at unusually high rates, with around 9% of pups resulting from father-daughter or brother-sister matings,offering a rare opportunity to study the dynamics of deleterious mutations. The PhD student will analyse their contributions to inbreeding depression using a long-term dataset spanning three decades, which includes molecular data from ~2,000 individuals, a multigenerational pedigree, and detailed behavioural and life-history data.
This PhD offers a unique opportunity to combine cutting-edge genomic approaches with rich ecological and behavioral data to uncover the genetic basis of fitness variation in a wild population.
Applicant’s profile
We seek a bright and highly motivated student with a good first degree and an M.Sc. or equivalent in a relevant topic (e.g. population genomics, bioinformatics, molecular ecology, behavioural ecology). The ideal candidate will have strong quantitative skills, including proficiency in working in R and experience ofwriting custom scripts. Practical experience of handling, analysing and interpreting next generation sequence (NGS) data is strongly preferred, although additional training will be provided as needed. The candidate should also be able to work both independently and as part of a multidisciplinary team, and must demonstrate a high standard of spoken and written English.
The working environment
The PhD student will be based at the Department of Evolutionary Population Genetics at Bielefeld University, Germany (www.thehoffmanlab.com). Our group is located in the newly constructed Verhaltensforschung building, which features modern offices and state-of-the-art, fully equipped laboratories. The building currently hosts 11 principal investigators and more than 30 postdocs and PhDstudents. It offers a stimulating, supportive and highly international research environment. The working language of the department is English.
Bielefeld is a city of 325,000 inhabitants with an attractive historical centre and easy access to the Teutoberger Wald for hiking and other outdoor pursuits. It is an affordable and pleasant city to live in and is well connected to most major European cities.
This project will be mainly carried out at Bielefeld University, but the PhD student will also have the opportunity to spend some time at Swansea University (https://www.swansea.ac.uk/staff/h.j.nichols). The successful applicant will therefore benefit from excellent opportunities for international travel and collaboration, while receiving a rigorous integrative training that will prepare her/him very well for a scientific career in evolutionary genetics / population genomics / molecular ecology / behavioural ecology.
Remuneration
This generous PhD studentship is funded by the German Science Foundation (DFG) for a period of threeyears and includes health insurance, pension contributions etc. The pay scale is TVL E13 (65%). Funding
will also be available for the student to attend workshops and conferences.
Application procedure
To apply for this position, please provide: (i) a letter of motivation; (ii) a CV; (iii) copies of relevant degree certificates, (iv) a maximum 2-page statement of your research interests, including your relevant skills and experiences; (v) a publication list, if applicable, (vi) two confidential referee statements. All materials should be submitted to the online portal of Bielefeld University via the following link:
https://jobs.uni-bielefeld.de/job/apply/4737/research-position-m-f-d-phd-canddiate?page_lang=en
The reference for the position is: Wiss25540.
The application deadline is 30th January 2026 and online interviews will take place shortly afterwards. For further information, please see www.thehoffmanlab.com and http://hazelnichols.weebly.com. We also
encourage you to contact Joe Hoffman (joseph.hoffman@uni-bielefeld.de) and / or Hazel Nichols (H.J.Nichols@Swansea.ac.uk) with any informal inquiries.
Bielefeld University has received a number of awards for its achievements in the provision of equal opportunity and has been recognized as a family friendly university. The University welcomes applications from women. This is particularly true with regard both to academic and technical posts as well as positions in Information Technology and Trades and Craft. Applications are handled according to the provisions of the state equal opportunity statutes. Applications from suitably qualified handicapped and severely handicapped persons are explicitly encouraged.
Representative publications
Wells, D., et al. (2018) A high quality pedigree and genetic markers both reveal inbreeding depression for
quality but not survival in a cooperative mammal. Molecular Ecology, 27: 2271-2288. Doi: 10.1111/mec.14570.
Wells, D.A. et al. (2020) Inbreeding depresses altruism in a cooperative society. Ecology Letters, 23: 1460- 1467. Doi: 10.1111/ele.13578.
Chen, R.S. et al. (2025) Predicted deleterious mutations reveal the genetic architecture of male reproductive success in a lekking bird. Nature Ecology and Evolution, 9: 1924–1937. Doi: 10.1038/s41559-025-02802-8.
Chen, R.S. et al. (2025). Early-life viability selection targets deleterious mutations in exons. Current Biology, 35: 5908–5914. Doi: 10.1016/j.cub.2025.10.043.

Stage

Thème : Détermination de signaux de qualité chez les femelles d’une espèce d’oiseau
chanteur monomorphique.
Période : < 2 mois, début entre mi-janvier et mi-février
Lieu du stage : Laboratoire Ethologie Cognition Développement (LECD), Université Paris Nanterre,
Nanterre.
Encadrement : Lucie Rigaill, Maîtresse de conférence, et Mathieu Amy, Professeur des Universités.
Contexte théorique : Ce stage s’inscrit dans les recherches menées au LECD sur la communication et les signaux sexuels chez les oiseaux chanteurs. Afin de guider leurs choix reproducteurs, les individus émettent des signaux reposant sur différentes modalités sensorielles (vocalisations, postures, odeurs, etc.), susceptibles d’informer leurs partenaires sur leur statut reproducteur ou leur qualité individuelle. Les travaux sur la sélection sexuelle se sont historiquement concentrés sur les signaux émis par les mâles, en lien avec une vision traditionnelle de la sélection sexuelle (compétition entre mâles et choix exercé par les femelles). En revanche, les signaux émis par les femelles restent encore peu étudiés, en particulier chez les espèces d’oiseaux chanteurs monomorphiques.
Chez les espèces socialement monogames, dans lesquelles les deux sexes participent à l’élevage des jeunes, mâles et femelles ont tout intérêt à être sélectif·ve·s dans le choix de leur partenaire afin d’éviter d’investir leurs ressources énergétiques dans des individus de moindre qualité. Dans ce contexte, les femelles pourraient bénéficier de signaux honnêtes indiquant leur qualité reproductive et susceptibles d’influencer le choix des mâles. De récentes études menées au LECD ont mis en évidence des variations interindividuelles dans l’émission de signaux sexuels chez les femelles canaris : certaines femelles produisent systématiquement davantage de signaux que d’autres, indépendamment de la qualité du chant du mâle auquel elles sont exposées (Le Gal et al., 2024). Le projet de ce stage vise à déterminer si ces variations de signaux multimodaux (postures de sollicitation à la copulation, vocalisations de type trills) constituent des indicateurs honnêtes de la qualité des femelles, susceptibles d’être utilisés par les mâles lors du choix du partenaire.
Missions : Le ou la stagiaire participera à la mise en place et la conduite d’expériences comportementales standardisées, à la collecte de données comportementales, acoustiques et vidéo chez des femelles canaris et à l’organisation et la pré-analyse descriptive des données au LECD.
Qualifications : Niveau équivalent à Bac +3 (en cours ou acquis) en biologie, éthologie, psychologie ou sciences du comportement. Intérêt pour le comportement animal et la communication. Qualités requises : sens de l’observation, rigueur, patience, curiosité scientifique. Convention de stage obligatoire
Indemnité mensuelle : Aucune
Contact : Envoyer un CV et une lettre de motivation par email à Lucie Rigaill (lrigaill@parisnanterre.fr) et à Mathieu Amy (mamy@ parisnanterre.fr) avant le 23 janvier.
Bibliographie
Le Gal et al. 2024. Intra‐individual modulations and inter‐individual variations of female signals in the domestic canary (Serinus canaria). Ethology, e13502.
Amy et al. 2015. Female signalling to male song in the domestic canary, Serinus canaria. Royal Society Open Science, 2: 140196.
Hargitai et al. 2018. Effects of food limitation on the intensity of blue-green and brown eggshell coloration: an experimental study with the canary. Journal of Avian Biology, 41(1): jav-01486