Impact des facteurs environnementaux sur des ingénieurs et des bio-indicateurs des agrosystèmes : les isopodes terrestres.

L’objectif de la thèse est de mettre en évidence les mécanismes impliqués dans la dynamique des populations de crustacés isopodes terrestres. En effet, ces espèces de la faune du sol sont des décomposeurs de la matière organique et sont utilisés comme bio-indicateurs des agro-écosystèmes. Ces caractéristiques les rendent incontournables à la réalisation de diagnostiques écologiques et à l’amélioration naturelle de la qualité du sol. De plus, ces isopodes terrestres sont reconnus comme modèle établi et sont propices à l’étude de la coévolution hôte parasite et aux conséquences de la féminisation des mâles sur la dynamique des populations. L’originalité de notre sujet prend en considération les facteurs qui influencent la croissance et la qualité des populations c'est-à-dire le choix du partenaire sexuel et son impact sur le sexe ratio au sein des populations. Les premiers résultats montrent que si les femelles sont infectées par une bactérie féminisante (Wolbachia), elles sont moins attractives. Au cours de la thèse, le candidat devra effectuer dans un premier temps des tests comportementaux pour caractériser les choix des partenaires sexuels selon le statut infectieux des individus. Ensuite, il s’agira de caractériser les mécanismes impliqués dans la discrimination sexuelle chez les isopodes terrestres. Une approche pluridisciplinaire relative à l’écologie comportementale, l’écologie chimique et la biologie moléculaire est nécessaire pour aborder la thématique proposée. L’implication de signaux chimiques dans les mécanismes de reconnaissances sera fortement considérée. Ce sujet de thèse s’inscrit dans les programme de recherche AgroBioDiv financé par la région Poitou-Charentes et les Champs de Biodiversité financé par la Fondation de recherche sur la Biodiversité et la société LU (Kraft Foods) explorant de nouvelles approches pour mieux utiliser et préserver la biodiversité dans les espaces agricoles.

Le (ou la) candidate devra être fortement motivé(e) par la recherche et attiré par le domaine de l’éthologie qui fera appel en particulier à des observations comportementales fines. Il est demandé de faire preuve d’autonomie et d’être ouvert à l’apprentissage de nouvelles techniques complémentaires à l’approche éthologique. Des connaissances solides en anglais sont indispensables.

Une lettre de motivation et un CV comportant au moins deux personnes référentes sont requis. La date limite de candidature est fixée au 15 Mai. Entretiens téléphoniques le mercredi 16 Mai 2012.

Contacts et envoi du dossier à:

FJ. Richard, Maître de conférences & C. Souty-Grosset, Chargée de recherche, CNRS

Laboratoire Ecologie & Biologie des Interactions

Equipe Ecologie Evolution Symbiose - UMR CNRS 7267

Université de Poitiers

freddie.jeanne.richard@univ-poitiers.fr , catherine.souty@univ-poitiers.fr

Rhesus monkey research on Cayo Santiago, Puerto Rico

Hiring Organization:

Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology

Date Posted:
2012-05-07

Position Description:
We are looking for an intern to assist on a project examining kin recognition on a semi free-ranging rhesus macaque population on Cayo Santiago, Puerto Rico (USA). The project is being undertaken in the Lab of Prof. Dr. Anja Widdig and Dr. Dana Pfefferle (Leipzig University & Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Leipzig, Germany; see http://www.eva.mpg.de/pks/index.html) The volunteer will work alongside Dr. Pfefferle (http://www.eva.mpg.de/pks/staff/pfefferle/).
The successful applicant will be expected to work on Cayo Santiago for 5-6 days a week, and may also be required to undertake data entry and/or processing in the later afternoon and early evenings. On Cayo Santiago, the primary task will be to assist carrying out playback experiments. In order to do so, appropriate training will be provided. This position is ideal for graduate students or recent graduates looking to gain experience in fieldwork and data collection.

Qualifications/Experience:
Applicants should have a Bachelor in Biology, Ecology, Animal Behavior, Physical Anthropology, Primatology, or a related field. Previous field experiences (preferably in the tropics) and knowledge of Spanish is helpful, but not necessary. In general, carrying out playback experiments can be a protracted and patience challenging task, including many hours of waiting for the correct situation. Thus you must be able to maintain a positive attitude. Applicants also must be in good physical and mental condition; feel comfortable being far away from family and friends; be emotionally mature, energetic, and very patient; have an excellent eye for detail; don’t be afraid of approaching monkeys (!); willing to work in a small team setting and follow instructions; be able to maintain a positive and humorous attitude towards challenging and tiring work. Although the work can be demanding and tiring, being close to habituated primates is very rewarding and a great experience.
The language in our team is English. The successful candidate must have medical insurance, a valid IACUC certificate (www.citiprogram.org) and will have to provide medical test in order to be allowed to work on Cayo Santiago (information will be provided after acceptance).

Salary/funding:
Initially no support will be provided. However, AFTER SUCCESSFUL COMPLETION of the internship, depending on experience, performance as well as on final costs for housing and travel, the field assistant can receive partial compensation.

Costs that have to be expected:
-Round-trip to Puerto Rico (cost varies)
-Transportation from and to the airport (transportation might be arranged privately, otherwise approx. 60 US$/trip)
-Housing (depending whether houses can be shared between 200-500 US$)
-Medical insurance (cost varies, proof needs to be provided)
-Medical tests required to work on Cayo Santiago (costs vary)
-Field clothes and personal expenses

Support provided for internship/volunteer positions (travel, meals, lodging):
AFTER SUCCESSFUL COMPLETION of the internship the field assistant can receive partial compensation.

Term of Appointment:
From Mid of September 2012 till end November 2012 (most likely 15th of September – 18th of November).

Application Deadline:
12th of June 2012

Comments:
To apply, candidates should email a brief cover letter outlining their interests, experience, and why they wish to undertake work on the project. They should attach a CV that includes at least contact details of two academic references. If asked, it will be the responsibility of candidates that academic references are send to danapfefferle@gmail.com. All documents should be submitted as one PDF file. Please only send email applications.

Contact Information:
Dana Pfefferle
Germany

E-mail Address:
danapfefferle@googlemail.com

Déplacements collectifs auto-organisés chez les vertébrés : transferts d’information et décision individuelle

Sujet de doctorat proposé sur l'ED SEVAb:
- les détails du sujets, c'est par ici
- les détails pour postuler, c'est par là

concours doctoral du Muséum national d'Histoire naturelle

Je vous rappelle que des offres de thèse sont ouvertes au concours doctoral du Muséum national d'Histoire naturelle http://www.mnhn.fr/museum/foffice/science/science/Enseignement/ecoleDoctorale/somthese.xsp

Parmi les offres ouvertes au concours, le sujet "Utilisation des grandes bases internationales de données de biodiversité pour l'analyse des risques d'extinction d'espèces" est proposé. Pour candidater, merci d'envoyer un CV et une lettre de motivation avant le 20 mai à Philippe Clergeau: philippe.clergeau@mnhn.fr et moi même Sandrine Pavoine: pavoine@mnhn.fr

Stage – Ecologie alimentaire Oiseaux Marins, Australie (Août 2012 – Janvier 2013)

Deakin University, Burwood (Melbourne), Victoria

Recherche Volontaires en Biologie/Ecologie pour un stage de terrain en Australie (Victoria) de août 2012 à Janvier 2013 (le travail pouvant s’échelonner de 1 à plusieurs mois selon la disponibilité des stagiaires).

Intitulé du projet - Répartition des ressources et succès reproducteur de deux espèces sympatriques : le rôle de la productivité marine et de la variabilité environnementale.

Contenu du projet :

-       Suivi de la reproduction du manchot pygmée (Eudyptula minor)

-       Capture, mesures et prises de sang des oiseaux

-       Pose de loggers (GPS, enregistreurs de plongée, accéléromètres)

Lieu : Australie, Griffith Island (sud ouest de Victoria) et Gabo Island (sud est de Victoria).

Pas de rémunération (avion et logement à Melbourne non pris en charge ; hébergement à disposition sur les sites d’étude – le terrain est divisé en plusieurs sessions de 1 à 2 semaines par mois). Prévoir également les démarches pour une demande de VISA (working holiday visa).

Profil recherché :

-       Volontaire(s) en biologie/écologie ayant un intérêt particulier pour l’écologie animale et marine.

-       Sociable et autonome, rigoureux dans le suivi de protocoles scientifiques, ayant déjà manipulés des animaux (de préférence des oiseaux)

-       Une bonne maîtrise de l’anglais est indispensable

-       Passeport en règle nécessaire pour les démarches de demande de VISA

Envoyer CV et lettre de motivation par email à :

Melle Maud Berlincourt

Deakin University

mberlinc@deakin.edu.au

Sujet de thèse « Etude de la mortalité avifaune par collision de l’ensemble des lignes électriques HT et THT en France »

Thèse démarrant le 1^er octobre 2012, financée par RTE (Réseau de Transport d’Electricité)

Besoins de RTE :

Etre en mesure de quantifier l’impact de l’ensemble du réseau de transport d’électricité sur la mortalité avifaune par collision. En effet, des chiffres sont souvent repris dans la presse (« des millions d’oiseaux meurent chaque année sur le réseau électrique ») mais d’une part ces chiffres englobent le réseau de Transport et de Distribution d’électricité et d’autre part ils ne sont basés sur aucune étude scientifique poussée. Ces chiffres sont souvent le résultat de la multiplication de la mortalité d’un tronçon particulièrement dangereux par la longueur totale du réseau. Par ailleurs, des suivis ont été réalisés et montrent une mortalité mesurée sur le terrain bien plus faible : 4895 cas de morts par collision et électrocution sur le réseau d’électricité Français recensés par les naturalistes sur 20 ans[1]. RTE souhaite disposer de données robustes scientifiquement, qui permettraient de quantifier l’impact du réseau de transport d’électricité sur l’avifaune au niveau national et pouvoir au mieux le limiter.  

Axes de recherche :

L’impact des lignes haute et très haute tension sur l’avifaune peut largement varier d’un milieu à l’autre. Certains, comme les zones humides, les vallées, ou les couloirs de migration sont particulièrement sensibles pour l’avifaune. Cet impact varie également en fonction de la configuration du réseau : niveau de tension, armement, présence de câble de garde ou non, présence d’un équipement avifaune ou non…

Voici les pistes de travail que nous envisageons pour quantifier l’impact de l’ensemble du réseau de transport d’électricité sur la mortalité avifaune par collision :

·         Dans un premier temps, l’objectif de cette étude sera de définir de façon exhaustive les situations (milieu X configuration de ligne) que l’on peut rencontrer en France. Pour cela, il est envisagé de croiser toutes les données d’entrée existantes et pertinentes :

Ø  atlas des oiseaux nicheurs de France à la maille 10km/10 km (mis à jour en 2013, projet piloté par la LPO), qui permettra d’identifier les zones de forte mortalité potentielle,

Ø  système d’information géographique (SIG) de RTE qui permet de situer tous les ouvrages RTE (et leur configuration) dans l’environnement,

Ø  les études déjà réalisées par RTE sur l’avifaune (suivis avifaune, études d’impact…)

Ø  réseau Natura 2000 (ZPS) et autres habitats sensibles : vallées, zones humides…

Ø  connaissance des couloirs migratoires. Il est envisagé d’exploiter les données migratoires issues d’oiseaux équipés de balises Argos (donc informations indépendantes de la pression d’observation au sol par les ornithologues).

Les bilans de ces analyses seront confrontés aux expertises a priori sur les zones sensibles, par observation directe ou basées sur les reprises d’oiseaux bagués morts par collision, ou encore obtenues grâce aux multiples données de comptages d’oiseaux en migration active (projet collaboratif de la Mission Migration, www.migraction.net).

·         Dans un second temps, il sera fait un plan d’échantillonnage de tronçons de lignes représentatifs des différentes situations identifiées lors de la première étape du projet. Le plan d’échantillonnage sera fait de façon à obtenir la puissance statistique nécessaire  pour assurer la robustesse scientifique de l’étude et permettre de dissocier le réseau de transport de celui de distribution (enjeux différents).

·      Ensuite, un suivi de la mortalité avifaune sera réalisé sur ces tronçons sélectionnés. Ce suivi pourrait faire l’objet d’une mobilisation des réseaux d’observateurs existants dans les associations ornithologiques. Cette phase inclura aussi l’analyse du comportement de grands oiseaux à proximité des lignes HT et THT, grâce à des données GPS en 3 dimensions, telles qu’elles sont déjà disponibles pour quelques vautours fauves et aigles de Bonelli ; le financement du projet inclut d’ailleurs la participation à l’acquisition de quelques balises pour les programmes qui accepteraient de collaborer.

·      Pour finir, une extrapolation scientifique de ces résultats à tout le réseau RTE sera réalisée.

Pour compléter ces travaux, des données de suivi GPS de grands oiseaux sur leur territoire de reproduction seront analysées en 3 dimensions, pour mieux comprendre l’utilisation de l’espace qui est faite près des lignes existantes. Il sera aussi envisagé de poser des émetteurs GPS 3D sur des rapaces dont le territoire comprend des lignes HT et THT équipées ou non de dispositifs anticollision, pour étudier le comportement de vol près des câbles électriques.

Personne à contacter :

Frédéric JIGUET, UMR7204, MNHN Paris

tel 0140793080, email fjiguet@mnhn.fr

Co-direction scientifique : Frédéric Jiguet (MNHN) et Olivier Duriez (Université Montpellier 2)

Envoyez un CV, une lettre de motivation et un état de vos résultats actuels de M2. Des auditions seront organisées en juin.

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[1] KABOUCHE Benjamin, BAYEUL Julie, ZIMMERMANN Laurent, BAYLE Patrick (2006). La mortalité des oiseaux sur le réseau électrique aérien : enjeux et perspectives en Provence-Alpes-Côte d’Azur. Rapport DIREN PACA - LPO PACA, Hyères : 109 p.