mercredi 8 décembre 2021

offre de stage de 2 mois

TITRE DU SUJET DE STAGE : EXPRESSION DE LA VARIABILITE COMPORTEMENTALE INTERINDIVIDUELLE AU SEIN D’UN GROUPE DE MULETS : COMPARAISON ENTRE DES GROUPES MONO- ET PLURISPECIFIQUES 


PORTEURS : Tatiana Colchen, Alexandre Carpentier, Thomas Trancart, Vincent Bels, Eric Feunteun 

Établissement d’appartenance : Université Rennes 1 – MNHN – BOREA, Equipe BIOPAC 

E-mail : tatiana.colchen@univ-rennes1.fr ; alexandre.carpentier@univ-rennes1.fr 

DESCRIPTIF DU STAGE : Chez les Téléostéens, il existe deux types de structures de groupe : l’agrégation « shoal » et le banc « school ». L’agrégation, étant issue du regroupement des décisions de chaque individu, permet de réduire le risque de prédation individuel (effet de dilution ; Delcourt & Poncin, 2012). Les poissons en banc présentent un schéma de nage synchrone avec des individus adoptant la même direction de nage (Delcourt & Poncin, 2012) permettant également de diminuer le risque de prédation via l’effet de confusion (Tosh et al., 2006) mais aussi grâce à l’accélération de la transmission des signaux d’alerte (l’effet Trafalgar ; Foster & Treherne, 1981). Le « school » étant une forme particulière de « shoal », la transition d’une forme à une autre peut se faire suite à des variations biotiques et/ou abiotiques. Une étude précédente a permis de démontrer l’existence de ces deux types de structures de groupe respectivement chez deux espèces de mulets Chelon labrosus et Chelon ramada. Ces deux espèces ont une morphologie et une écologie très similaires et peuvent se déplacer en groupes mono- et plurispécifiques (Arechavala-Lopez et al., 2010). Grâce à de bonnes capacités d’osmorégulation (Daverat et al., 2011), elles se répartissent largement sur les espaces côtiers adoptant un régime alimentaire de type limnivore (Carpentier et al., 2014). Contrairement à d’autres espèces amphihalines telles que l’anguille, le saumon ou encore les lamproies et les aloses, les mulets ne semblent pas encore souffrir du déclin de leurs populations ni être trop impactés par les changements globaux. Cela en fait des modèles d’intérêts dans un objectif global de conservation et de compréhension de la biologie des amphihalins. Le stage a pour but d’étudier l’impact de la variabilité comportementale individuelle sur la structure de groupe, qu’elle corresponde à un « shoal » ou à un « school », respectivement décrite pour C. ramada et C. labrosus. Après avoir étudié les capacités métaboliques de ces deux espèces lors de notre expérimentation précédente, cette nouvelle étude aura pour but de poursuivre l’exploration des mécanismes proximaux pouvant expliquer ces structures de groupe différentes : la variabilité comportementale interindividuelle. Elle sera explorée au travers de différents tests (test individuel vs. test en groupe) permettant de mettre en évidence (i) des traits de personnalité individuels avec un test en labyrinthe et un test de prise de risque en groupe et (ii) la réponse individuelle mise en place dans un groupe face à un prédateur et si celle-ci induit une modification de la structure. Les individus testés seront capturés en marais salés puis transportés à la station marine de Dinard dans des mésocosmes (0.7 m3), quatre semaines avant le début de l’expérimentation. Chaque mois, un contrôle de croissance sera réalisé. Avant de commencer les tests, une marque individuelle de type Pit-tag (Biomark®) leur sera implanté afin de faciliter leur suivi. Les 90 poissons permettront de tester trois modalités de groupe différentes, chacune composée de 10 poissons, en triplicat : 3 x (5 C. labrosus + 5 C. ramada) ; 3 x (10 C. labrosus) ; 3 x (10 C. ramada). Avant de tester la variabilité comportementale interindividuelle, il sera nécessaire de caractériser la structure du groupe (Colchen et al., 2017) filmée dans un canal hydrodynamique (3 m de long, 50 cm de large) à la station marine de Dinard. Par la suite, les poissons seront testés individuellement dans un labyrinthe en croix afin de déterminer leur personnalité en mesurant l’audace, l’exploration et l’activité (Colchen et al., 2020) puis en groupe dans un test de prise de risque (zone sombre vs. zone lumineuse) (Ferrari et al., 2015). Ce dernier test sera réalisé avant et après la simulation d’une confrontation à un prédateur (test anti-prédateur). Le stagiaire participera avec les techniciens de la station au maintien des poissons en élevage (nourrissage et entretien), aux tests dans le canal hydrodynamique et en labyrinthe ainsi qu’à l’analyse des vidéos et des données de comportements. Le stagiaire devra assurer l’analyse de ces vidéos (phase analytique) en parallèle des tests dans le canal hydrodynamique et le labyrinthe (phase technique). 

CONNAISSANCES OU COMPETENCES ACQUISES A L’ISSUE DU STAGE : Le stagiaire aura acquis les notions correspondant à la structure du groupe et à la personnalité animale ainsi que les techniques expérimentales et analytiques pour étudier ces comportements. Il saura gérer un système d’élevage ainsi que des structures expérimentales tout en prenant en compte le bien-être des animaux élevés. 

CARACTERISTIQUES DU STAGE : - Nombre de mois prévus : 2 mois - Dates prévues : stage à pourvoir entre avril et juin 2022 - Formation prévue sur les logiciels d’analyse de comportement - Les candidatures (CV + lettre de motivation) sont à envoyer aux deux adresses mails suivantes avant le 31/12/2021 : tatiana.colchen@univ-rennes1.fr ; alexandre.carpentier@univrennes1.fr - Pour les dossiers retenus, un entretien sera programmé au mois de janvier - Le stage se déroulera à la station marine de Dinard, CRESCO 

BIBLIOGRAPHIE : 

Arechavala-Lopez, P., Uglem, I., Sanchez-Jerez, P., Fernandez-Jover, D., Bayle-Sempere, J. T., & Nilsen, R. 2010. Movements of grey mullet Liza aurata and Chelon labrosus associated with coastal fish farms in the western Mediterranean Sea. Aquaculture Environment Interactions, 1(2), 127-136. Carpentier A, Como S, Dupuy C, et al. 2014. Feeding ecology of Liza spp. in a tidal flat: Evidence of the importance of primary production (biofilm) and associated meiofauna. Journal of Sea Research 92:86–91. https://doi.org/10.1016/j.seares.2013.10.007 Colchen, T., Teletchea, F., Fontaine, P., Pasquet, A. (2017). Temperature modifies activity, inter-individual relationships and group structure in fish. Current Zoology. 163, 175-183. 10.1093/cz/zow048. Colchen, T., Gisbert, E., Ledoré, Y., Teletchea, F., Fontaine, P., Pasquet, A. (2020). Is a cannibal different from its conspecifics? A behavioural, morphological, muscular and retinal structure study with pikeperch juveniles under farming conditions. Applied Animal Behaviour Science, 224. 10.1016/j.applanim.2020.104947. Daverat, F., Martin, J., Fablet, R., & Pécheyran, C. (2011). Colonisation tactics of three temperate catadromous species, eel Anguilla anguilla, mullet Liza ramada and flounder Plathychtys flesus, revealed by Bayesian multi-elemental otolith microchemistry approach: Colonisation tactics of juvenile catadromous species. Ecology of Freshwater Fish, 20(1), 42–51. https://doi.org/10.1111/j.1600-0633.2010.00454.x Delcourt, J., & Poncin, P. (2012). Shoals and schools: back to the heuristic definitions and quantitative references. Reviews in Fish Biology and Fisheries, 22(3), 595-619. Ferrari, S., Millot, S., Leguay, D., Chatain, B., & Bégout, M. L. (2015). Consistency in European seabass coping styles: a life-history approach. Applied Animal Behaviour Science, 167, 74-88. Foster, W. A., & Treherne, J. E. (1981). Evidence for the dilution effect in the selfish herd from fish predation on a marine insect. Nature, 293(5832), 466-467. Huntingford, F. A., Andrew, G., Mackenzie, S., Morera, D., Coyle, S. M., Pilarczyk, M., & Kadri, S. (2010). Coping strategies in a strongly schooling fish, the common carp Cyprinus carpio. Journal of Fish Biology, 76(7), 1576-1591. Tosh, C. R., Jackson, A. L., & Ruxton, G. D. (2006). The confusion effect in predatory neural networks. The American Naturalist, 167(2), E52-E65

Funded PhD and postdoctoral positions available

 The Department of Ecology and Environmental Science at Umeå University (Sweden) is recruiting multiple PhD students and one postdoctoral researcher to join a study investigating the effects of environmental contaminants on animal behavior. This project will use acoustic monitoring and soundscape analysis to evaluate the extent to which emerging contaminants might affect terrestrial and aquatic ecosystems, with a focus on soil and water invertebrates. The successful applicant is expected to have a background in bioacoustics and soundscape analysis or should have relevant experience studying animal behavior, toxicology, and/or acoustic sensor development.


Applications will start being reviewed in January 2022 and the positions will remain open until filled. The preferred start date is early 2022, but this is negotiable. If you have questions regarding the position, please contact Professor Jonatan Klaminder, Jonatan.klaminder@umu.se

For full description and how to apply see: https://umu.varbi.com/en/what:job/jobID:454415/

mardi 7 décembre 2021

Canine enrichment PhD position - Texas Tech University

 Dr. Anastasia Stellato and Dr. Nathaniel Hall, in the Department of Animal and Food Sciences at Texas Tech University, are currently seeking a PhD student, with expected start date Fall 2022.

 

POSITION DESCRIPTION:

The successful applicant will join a research project to assess the influence of enrichment (e.g., toys) on the behavior and welfare of domestic dogs. General responsibilities will include: organizing, coordinating and conducting experiments, coordinating with dog owners/shelters, supervising research assistants, data collection and management, data analyses, and manuscript writing.

 

QUALIFICATIONS:

  • Strong leadership skills
  • Ability to supervise and mentor research assistants
  • Ability to organize and coordinate research projects
  • Knowledge and skills working with Microsoft suite (Excel, Word, PowerPoint)
  • Knowledge and skills working with statistical programs, such as STATA, SAS, or R.

 PREFERRED QULIFICATIONS:                                                                                     

  • Minimum of a Master’s degree in animal science, animal welfare, applied ethology, animal biology, or related field
  • Interest and experience working with dogs (e.g., handling experience)
  • Interest and/or experience in animal welfare science
  • Experience coding behavior (e.g., using Noldus Observer software) from video recordings (considered an asset, but not required)

 

POSITION AVAILABLE:

The start date for this appointment is Fall 2022.

 

FUNDING:

Stipend support is available.

 

TO APPLY:

Applicants should submit a cover letter and curriculum vitae to Dr. Anastasia Stellato (Anastasia.stellato@ttu.edu) and Dr. Nathaniel Hall (Nathaniel.J.Hall@ttu.edu). Applicants should also provide contact information for two references.

 

lundi 6 décembre 2021

PhD opportunity - modelling hoarding decision making in chickadees and titmice

 Could you please draw the attention of any promising final-year undergraduates or master's students to a PhD opportunity in my research group at Newcastle University? The deadline is 7 January 2022, 5pm GMT. Please distribute to any mailing lists you think are appropriate.


Supervised by me (Tom Smulders), Prof. Phil Stephens (Ecology - Durham University), Dr. Alison Johnston (Statistics - St-Andrews University) and Dr. Stephen McGough (Computing - Newcastle University), the student will build on an existing agent-based model to explore the rules used by food-hoarding birds to decide whether to forage, retrieve or rest, and whether to eat or hoard a given food item. The model aims to be realistic in terms of the information the birds have actual access to (temperature, circadian time, fat reserves, stomach contents, etc). We also plan to use a citizen-science approach to collect data on hoarding intensity across seasons and across a wide geographical range, to provide data against which to test the model's predictions.

We are looking for a student with either a background of evolutionary biology/behavioural ecology/animal behaviour with an interest in modelling, or a computer science student with a strong interest in biological evolution.

The PhD is fully funded for 3.5 years for British applicants. Candidates coming from outside the UK will have to separately apply for the Newcastle University Overseas Research Scholarship (NUORS), which covers the difference in tuition fees between UK applicants and overseas applicants.

All details of the Studentship opportunity, including how to apply, can be found here: https://www.iapetus2.ac.uk/studentships/what-makes-tits-hoard-food-environmental-regulation-of-food-hoarding-in-titmice/

Social behaviour, demography and conservation in shorebirds

 PhD studentship based in České Budějovice, Czech Republic 2022–2025

Supervisors: Dr Vojtěch Kubelka (University of South Bohemia, CZ) Prof Tamás Székely (University of Bath, UK)

 

Sex roles (i.e. courtship, competition for mates, pair bonding and parenting) are among the most diverse social behaviour. Recent research is uncovering key elements of sex role variation, but significant gaps remain. Appropriate sexual behaviour is essential for reproduction, and thus understanding the causes and implications of sex roles are at the core of evolutionary biology and fundamental for the study of life history evolution, physiology and population biology. Understanding sex roles and demography (reproduction and mortality rates) is also important for biodiversity conservation since disruptions to normal sexual behaviour due to environmental changes reduce the viability of wild populations.

Our group is running an international project ÉLVONAL Shorebird Science: https://elvonalshorebirds.com/ with teams distributed worldwide to investigate sex role evolution in shorebirds. This PhD project will focus on sex role behaviour and demography in shorebirds. Using behavioural observations in wild populations it will investigate causes of courtship behaviour, pair bonding and parenting. The PhD student will test whether (i) sex role behaviours are induced by ambient environment, demographic parameters or social environment, (ii) explore the relationship between different sex role components, and (iii) test the fitness implications of sex role variations. We are also interested in the conservation implications of shorebird field biology and the particular targeting of the PhD project will be developed together with a successful applicant.

The ideal candidate has a strong interest in evolutionary biology, behavioural ecology and field biology, willing to work in remote areas, e.g. Arctic regions, South America, South Africa or elsewhere. He/she needs to have a solid background in data analyses preferably in R, and statistical modelling. A condition of the application is a Master degree (or equivalent) in biology, zoology or a similar subject. Experience in field ornithology and bird ringing or the use of comparative methods is desirable but not essential. The studentship can start during March – September 2022. We are preferably seeking candidates willing to raise their own funding but there are other options too.

České Budějovice is a vibrant medium-sized city and centre of South Bohemian region with an international university community. The University of South Bohemia is the biggest higher education institution in the region with more than 9,000 students, numerous leading departments in natural sciences and field research stations at Svalbard or Papua New Guinea. Five institutes of the Czech Academy of Sciences are situated on the same campus, forming the Biological Centre and representing outstanding cooperation opportunities. The surrounding of České Budějovice has diverse natural and cultural landscapes, including Šumava National Park, two UNESCO biosphere reserves and numerous protected areas with impressive wildlife.

Interested candidates should contact Vojtěch Kubelka kubelkav@gmail.com. Applications that include a CV (max 3 pages) and a max 2 pages cover letter with personal motivation and the name and contact details of two references (both documents in English) should be sent to Vojtěch Kubelka before the deadline.

Deadline of application: 15 December 2021.

Selected References

Carmona-Isunza, M C, C Küpper, M A Serrano-Meneses & T. Székely. 2015. Courtship behavior differs between monogamous and polygamous plovers. Behavioral Ecology & Sociobiology 69: 2035–2042.

Liker A., Freckleton R. P. & Székely T. 2015: The evolution of sex roles in birds is related to adult sex ratio. Nature Communications 4 (1587).

Vincze, O., A. Kosztolányi, … & T. Székely. 2016. Parental cooperation in a changing climate: fluctuating environments predict shifts in care division. Global Ecology and Biogeography 26: 347–358.

Kubelka V., Šálek M., Tomkovich P., Végvári Z., Freckleton R. P. & Székely T. 2018: Global pattern of nest predation is disrupted by climate change in shorebirds. Science 362: 680–683.

Kubelka V., Sandercock B., Székely T. & Freckleton R. P. 2021: Animal migration to northern latitudes: environmental changes and increasing threats. Trends in Ecology & Evolution DOI: 10.1016/j.tree.2021.08.010

jeudi 2 décembre 2021

offre de stage