Encadrement :
Jean-Baptiste Baudet (Doctorant), Benoit Xuereb (MCF), Romain Coulaud (MCF)
Structure d’accueil :
UMR Stress Environnementaux et BIOsurveillance des milieux aquatiques (SEBIO), site Université Le Havre-Normandie
https://sebio.univ-lehavre.fr
Date et durée du stage :
6 mois ; début dès janvier 2021
Contexte :
Les écosystèmes aquatiques sont généralement considérés parmi les plus productifs en termes de services écosystémiques rendus à l’homme tout en étant également les plus exposés aux pressions anthropiques qui peuvent altérer leur fonctionnement. Ainsi, l’évaluation de la qualité écologique de ces milieux constitue un enjeu majeur. Pour cela, l’utilisation de marqueurs basés sur des mesures biologiques au niveau des organismes chez différentes espèces sentinelles représentatives de la diversité trophique et taxonomique des écosystèmes aquatiques a été proposée ces dernières décennies comme une méthode pertinente. Cependant, en particulier concernant les écosystèmes marins, la grande majorité des efforts de recherche ont été portés sur un petit nombre d’espèces, essentiellement commerciales, de mollusques et de poissons. Dans un objectif d’évaluation global de l’impact des pressions anthropiques sur la faune sauvage, une classification de la qualité des masses d’eau basée uniquement sur de tels taxons semble à la fois peu extrapolable et peu protectrice pour de nombreuses autres espèces. En ce sens, le groupe des crustacés, principal représentant des ecdysozoaires dans les milieux aquatiques, reste encore peu étudié en milieu marin en dépit de son importante représentativité au sein du règne animal et du rôle clé de ses représentants dans les chaines trophiques et les processus écosystémiques. Il apparait alors indispensable de prendre en compte ce groupe clé dans les démarches d’évaluation de la qualité écologique des milieux.
Dans ce contexte, l’UMR I-02 SEBIO travaille depuis quelques années à proposer des indicateurs basés sur l’utilisation des crevettes palémonidés (la crevette rose ou crevette bouquet Palaemon serratus en milieu marin et la crevette blanche Palaemon longirostris en milieu estuarien) pour la biosurveillance des milieux aquatiques. Jusqu’à présent, les travaux ont porté principalement sur le développement et la mise en oeuvre in situ de biomarqueurs sub-individuels (Erraud et al.
2018a,b et 2019a,b1234). Maintenant, il apparait essentiel de développer des outils permettant de diagnostiquer les impacts des activités anthropiques sur des niveaux d’organisation biologique supérieurs plus pertinents d’un point de vue écologique tels que les traits d’histoire de vie (e.g, reproduction, croissance) ou la santé des populations. Cependant, les connaissances sur traits d’histoire de vie de ces espèces restent encore limitées. L’objectif de ce stage résidera donc dans l’étude des traits de vie de la crevette bouquet Palaemon serratus afin 1) d’améliorer les connaissances générales sur cette espèce, 2) en étudiant l’influence de la température et de la qualité de nourriture, de définir des conditions optimales pour l’étude de la reproduction et de la croissance de la crevette bouquet au laboratoire et 3) d’identifier des marqueurs qui pourraient être utilisés dans le cadre de l’étude des impacts des activités anthropiques sur les traits de vie de la crevette bouquet.
Dans un premier temps, le stage sera focalisé sur la réalisation d’une expérimentation au laboratoire sur environ 3 mois. Des couples de crevettes seront placés dans différentes conditions de température en vue de se reproduire. Les femelles durant la phase de développement embryonnaire, puis les larves et juvéniles après la ponte seront nourris avec différentes qualités de nourriture (i.e, différentes teneures en acides gras). Le développement des descendants ainsi produits sera examiné à chaque stade de vie : le stade oeuf, larvaire, et juvénile. Une attention particulière sera portée sur la survie des individus, les temps de développement des différents stades embryonnaires et larvaires, ainsi que sur l’apparition d’éventuelles anomalies morphologiques durant les différents stades. A chaque étape du développement, les organismes seront isolés des autres stades afin de ne pas engendrer de cannibalisme et dans un but d’améliorer la lisibilité, ainsi qu’in fine l’interprétation des paramètres étudiés. Dans un second temps, l’accent sera porté sur l’analyse des résultats de l’expérimentation et les dosages des acides gras dans la nourriture et dans les organismes.
Pour la réalisation de ce stage, les expérimentations envisagées bénéficieront notamment du financement du programme FEAMP (Fonds Européen pour les Affaires Maritimes et la Pêche) GéDuBouq (analyse préalable à une gestion durable des pêcheries de bouquet en Normandie). De plus, le stagiaire pourra s’appuyer sur l’expertise de l’UMR SEBIO sur la biologie et l’écologie des crustacés (en particulier Palaemon serratus) et travaillera en collaboration directe avec un doctorant.
Profil recherché :
- Connaissances en écologie des milieux aquatiques (si possible marins)
- Connaissances en physiologie des crustacés
- Notions d’élevage/maintenance d’organismes en conditions de laboratoire
- Le candidat devra être dynamique, enthousiaste et montrer une bonne autonomie.
1 Erraud et al. (2019a) Signification of DNA integrity in sperm of Palaemon serratus (Pennant 1777): Kinetic responses and reproduction impairment. Marine Environmental Research, 144: 130-140.
2 Erraud et al. (2019b) Assessment of sperm DNA integrity within the Palaemon longirostris (H. Milne-Edwards, 1837) population of the Seine estuary. Environmental Pollution, 245: 485-493.
3 Erraud et al. (2018a) Use of the sperm DNA integrity in Palaemon serratus (Pennant 1777) as an exposure marker to the contamination: intrinsic variability, baseline level and in situ deployment. Water Research 132: 124-134.
4 Erraud et al. (2018b) Assessment of sperm quality in palaemonid prawns using Comet assay: methodological optimization. Environmental Science and Pollution Research 25(12):11226-11237
Formalités de candidature :
Pour candidater : les candidat(e)s intéressé(e)s devront envoyer une lettre détaillée décrivant leurs motivations et leurs compétences et un CV (avec les coordonnés d’un ou deux référents).
Contact : romain.coulaud@univ-lehavre.fr
Vous venez de réussir votre master 2 éthologie, écologie, and coe, ce blog est le vôtre! Il vous permet de retrouver différentes offres de PhD, emplois, stages, et même post doc pour les "anciens"... Outil de mise en réseau des informations, ce blog offre à chacun de la liberté de participer et ainsi permettre à tous de trouver au plus vite sa prochaine étape professionnelle. Si vous avez une offre à poster, transmettez la à : marine.grandgeorge@univ-rennes1.fr
mercredi 21 octobre 2020
Offre de stage Master 2 - influence de la température et de la qualité de nourriture sur le développement embryo-larvaire et la croissance de la crevette bouquet Palaemon serratus
lundi 19 octobre 2020
Office français de la biodiversité AVIS DE STAGE MASTER 2 A COMPTER DU 1 FEVRIER 2021 (DATE FLEXIBLE) (5 MOIS)
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Sujet du stage : |
Hétérogénéité individuelle pour le taux de survie chez les oiseaux (h/f) |
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Affectation : |
Direction générale déléguée Police, Connaissance, Expertise Direction de la Recherche et de l’Appui Scientifique |
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Positionnement hiérarchique : |
Stagiaire sous l’autorité du chef-adjoint de l’Unité Avifaune Migratrice et d’une doctorante (Emilienne Grzegorczyk). |
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Lieu du stage : |
Chizé (79) |
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DESCRIPTION DES MISSIONS Contexte :
L’Office français de la biodiversité (OFB) est né le 1er janvier 2020. Ce nouvel établissement public, placé sous la tutelle des ministres chargés de l’environnement et de l’agriculture, a été créé pour protéger et restaurer la biodiversité. Il intègre les missions, les périmètres d’intervention et les 2 800 agents de l’Agence française pour la biodiversité (AFB) et de l’Office national de la chasse et de la faune sauvage (ONCFS). Il contribue, s'agissant des milieux terrestres, aquatiques et marins, à la surveillance, la préservation, la gestion et la restauration de la biodiversité ainsi qu'à la gestion équilibrée et durable de l'eau en coordination avec la politique nationale de lutte contre le réchauffement climatique (loi n°2019-773 du 24 juillet). Pour remplir ses missions, l’Office s’appuie sur des équipes pluridisciplinaires (inspecteurs de l’environnement, ingénieurs, vétérinaires, techniciens, personnels administratifs, etc.) réparties sur tout le territoire national. Il est organisé de façon matricielle pour prendre en compte tous les milieux, en transversalité, selon une articulation à trois niveaux : - une échelle nationale où se définissent et se pilotent la politique et la stratégie de l’OFB (directions et délégations nationales) ; - une échelle régionale où s’exercent la coordination et la déclinaison territoriale (directions régionales) ; - des échelons départementaux et locaux, de mise en œuvre opérationnelle et spécifique (services départementaux, antennes de façade, parcs naturels marins, etc.).
La Direction de la Recherche et Appui Scientifique (DRAS) est l’une des 2 directions « connaissance » de l’OFB, en charge de la recherche et de l’expertise sur les espèces, sur les milieux, leurs fonctionnalités et leurs usages, ainsi que sur les risques sanitaires en lien avec la faune sauvage. Elle est composée de 10 entités : Unité Ongulés sauvages · Unité Petite faune sédentaire et espèces outre-mer · Unité Avifaune migratrice · Unité Migrateurs amphihalins · Unité Prédateurs déprédateurs et EEE · Unité Flore, végétation · Unité Ecosystèmes lacustres · Unité Ecohydraulique · Unité Sanitaire Faune · Service mobilisation de la recherche axé sur diverses problématiques comme la surveillance et l’évaluation des milieux, l’agriculture et la biodiversité, la pollution des eaux, la restauration des milieux, la gestion des ressources en eau, l’écotoxicologie, les aménagements urbains et la biodiversité, ainsi que des thématiques transversales comme le droit, la gouvernance, la socio-économie, etc…
L’Unité Avifaune Migratrice est en charge des travaux sur les différentes espèces d’oiseaux migrateurs (charadriidés, anatidés, turdidés, alaudidés et colombidés) ainsi que d’espèces proches d’intérêt patrimonial. Elle assure les suivis des populations et les études démographiques permettant leur gestion cynégétique et leur conservation.
Description du stage :
Mission : Le stage consistera à analyser les données de capture-marquage-recapture à long terme sur plusieurs espèces d’oiseaux chassables (fuligule milouin, fuligule morillon, sarcelle d’hiver, canard colvert, bécassine des marais, merle noir, …) afin d’identifier si ces espèces présentent une hétérogénéité individuelle pour les taux de survie.
La présence d’hétérogénéité individuelle pour la survie a déjà été démontrée chez plusieurs espèces d’oiseaux (voir table 1 Gimenez, Cam, et Gaillard 2018) dont la sarcelle d’hiver en Camargue (Guillemain et al. 2014). Il est particulièrement intéressant de s’intéresser à cette problématique chez des espèces chassables car l’hétérogénéité individuelle est l’un des mécanismes qui permet d’expliquer la capacité d’une espèce à compenser la mortalité induite par la chasse. Si l’on prend l’exemple de l’hétérogénéité individuelle pour la survie, une espèce aura une plus grande probabilité de compenser la mortalité induite par la chasse si ce sont les individus qui présentent une probabilité de survie plus faible qui sont préférentiellement prélevés.
Gimenez, Olivier, Emmanuelle Cam, et Jean-Michel Gaillard. 2018. « Individual Heterogeneity and Capture–Recapture Models: What, Why and How? » Oikos 127 (5): 664‑86. https://doi.org/10.1111/oik.04532.
Guillemain, Matthieu, Roger Pradel, Olivier Devineau, Géraldine Simon, et Michel Gauthier-Clerc. 2014. « Demographic Heterogeneity among Individuals Can Explain the Discrepancy between Capture–Mark–Recapture and Waterfowl Count Results ». The Condor 116 (3): 293‑302. https://doi.org/10.1650/CONDOR-13-148.1.
Activités principales :
A l’aide d’une base de données à long terme prête à être analysée :
Réaliser des analyses statistiques au moyen de modèles de capture-recapture afin d’estimer le taux d’hétérogénéité individuel pour les taux de survie.
Participer à la rédaction d’un article scientifique sur le sujet
RELATIONS LIEES AU POSTE Relations internes : Le stagiaire sera en relation avec d’autres chercheurs et étudiants (master et thésards) de l’unité impliqués dans la problématique notamment Matthieu Guillemain, Alain Caizergues, Kévin Le-Rest et Charlotte Francesiaz.
COMPETENCES ET QUALITES REQUISES Connaissances : Statistiques : Modèles de capture-marquage-recapture Des connaissances en dynamique des populations exploitées seraient un plus
Savoir-faire opérationnel : Langage de programmation R Logiciels de CMR (ESurge et/ou Mark) Bon niveau en anglais
Savoir-être professionnel : Sens du relationnel (travail en équipe), autonomie, rigueur
Diplômes – Formation – Expérience : Titulaire d’un master 1 en écologie, biologie ou biostatistique. Etudiant en Master 2 ou dernière année d’école d’ingénieur (spécialités statistiques, biologie des populations biologie de l’évolution et écologie)
Autres (si pertinent) : - Anglais courant écrit ou parlé
CONDITIONS D’EXERCICE / SUJETIONS PARTICULIERES
- Gratification d’environ 570,50 euros par mois.
DEPOSER UNE CANDIDATURE Les personnes intéressées devront adresser leurs candidatures (CV détaillé et lettre de motivation) par courriel sous la référence DRAS/UAM/stage hétérogénéité individuelle à recrutement@ofb.gouv.fr, emilienne.grzegorczyk@ofb.gouv.fr et cyril.eraud@ofb.gouv.fr
La date limite de dépôt des candidatures est fixée au 15/11/2020
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vendredi 16 octobre 2020
ASST BEHAVIOR TECH needed at Chimp Haven
POSITION TITLE: Assistant Behavior Technician
REPORTS TO: Director of Behavior and Research
JOB CLASSIFICATION:
Title Class: Assistant Behavior Technician
Descriptive Title: Assistant Behavior Technician
Shift: Day/Night/Weekend
FLSA: Non-Exempt
Risk Level: 3
ORGANIZATIONAL OVERVIEW: At Chimp Haven we believe we’re not that different, humans and chimpanzees. Chimps have personalities, emotions and relationships, just like us, and we are on a mission to connect them to the happy healthy lives they deserve. That is why we are providing and promoting personalized care for chimpanzees (most of whom were retired from biomedical research) by helping them, for their remaining years, live a good life – the chimp life. Chimp Haven serves as The National Chimpanzee Sanctuary and is located on 200-forested acres in northwest Louisiana just outside of Shreveport. Chimp Haven provides excellent care for more than 300 chimpanzees retired from research or no longer used in the entertainment industry or as pets. As more retired chimpanzees make their way from research institutions to sanctuary, our population continues to grow. Chimp Haven has a well-designed facility to support the physical and emotional well-being of all animals, experienced staff and high standards for operational excellence. Chimp Haven offers a competitive salary, excellent benefits, extensive training and an opportunity for professional advancement. We wish to thank all applicants for their interest and effort in applying for this position, however, only candidates selected for interviews will be contacted.
Chimp Haven is committed to hiring and retaining a diverse workforce. We are
proud to be an Equal Opportunity/Affirmative Action Employer, making decisions
without regard to race, color, religion, creed, sex, sexual orientation, gender
identity, marital status, national origin, age, veteran status, disability or
any other protected class. U.S. Citizenship is required for most positions.
THE OPPORTUNITY:
Provide enrichment and training to chimpanzees and improve chimpanzee well-being via observational studies and evaluation of enrichment and training procedures. Reports to Director of Behavior and Research.
RESPONSIBILITIES AND SCOPE:
Please note this job description is not designed to cover or contain a comprehensive listing of activities, duties or responsibilities that are required of the employee for this job. Duties, responsibilities and activities may change at any time with or without notice.
- Prepare and distribute enrichment items for chimpanzees and/or to husbandry staff for distribution, according to approved schedule.
- Plan enrichment and training schedules according to goals and with senior staff approval.
- Carry out chimpanzee training objectives using positive reinforcement according to approved plans.
- Conduct behavioral observations according to approved schedule.
- May assist with behavioral studies and data entry and summarization.
- May assist with chimpanzee socialization procedures including introductions.
- Maintain and oversee enrichment records.
- May participate in and may lead education programs.
- May concentrate on enrichment, training or behavioral research responsibilities.
- May assist husbandry, veterinary or other departmental staff as directed.
- Assist in training animal care staff on enrichment and operant conditioning procedures.
- Assist other animal care staff in maintaining food preparation areas.
- Order supplies.
- Work with volunteers and visiting scientists.
REQUIRED QUALIFICATIONS:
Entry Level: Minimum requirement of a H.S. diploma, GED, and coursework in a relevant field is required. Intern experience is allowed. One years’ experience providing enrichment and/or training to primates or exotics is required. Primate experience is preferred.
Mid Level: Minimum requirement of an Associates Degree in a relevant field is required. At least 1 year working (paid experience) with chimpanzees. Two years' experience providing enrichment and/or training to nonhuman primates or exotics is required. A combination of education and/or experience may be considered.
Max Level: Bachelor's degree required. At least 4 years (paid experience) working with chimpanzees. Four years' experience in enrichment, training or behavioral study of nonhuman primates required. A combination of 7 years relevant education/experience can be substituted for the education requirement.
Other requirements and working conditions:
- This work will require bending, carrying, kneeling, lifting, listening, pulling, pushing, reading, speaking, squatting, standing, stooping, stretching, walking, watching and writing.
- Must be able to routinely lift and carry 50 lbs for short distances.
- Duties may require driving Chimp Haven vehicles, and must have a valid driver’s license and meet Chimp Haven’s motor vehicle operating standards.
- Work may involve considerable outdoor work in various weather conditions.
- Potential exists for animal bites and scratches.
- Potential exposure to unpleasant odors, animal wastes, animal tissues and body fluids, toxic chemicals, zoonotic diseases (tuberculosis, shigella etc.), infectious agents (Hepatitis B, C, HIV, etc.).
- Weekend, holiday and night work may be necessary.
- Participation in a medical monitoring and surveillance program that includes hepatitis B and other inoculations is required.
- Safety training, equipment, clothing and supplies will be provided.
LOCATION:
Chimp Haven in Keithville, LA