2 PhD projects in deer - open to UK and international students

 We are advertising two fully funded PhD projects on red and fallow deer behaviour within the NERC DTP QUADRAT. The scholarship offers a stipend for 3.5 years and covers fees, including fees for international students. Interested students should contact the lead supervisor to discuss the project.

1. Sleep in the landscape of fear

Lead supervisor: Dr Isabella Capellini (I.CapelliniATqub.ac.uk)

Sleep is essential to health in all mammals, however we know nearly nothing about wild animals accommodate time for sleep over the 24 hours cycle. Using state of the art biologgers on wild red deer under risk of predation by wolf, this project investigate a long-standing question: how do animals alter their sleep time and pattern when under greater risk of predation? For full project description please see here.

2. The role of social phenotype in bystander behaviour during fallow deer fights

Lead supervisor: Dr Domhnall Jennings (D.JenningsATqub.ac.uk)

Contests and fights are widespread in animals since individuals need to secure resources for their own survival and reproductive success. In social species, life fallow deer, some individuals observe ongoing fights and may decide to intervene, disrupting those fights. This project will investigate how individuals' social networks influence their decision to intervene or not. For full project description please see here.

Deadline for applications: ***17th of January 2024*** .

How to apply: please see instructions in QUADRAT here.

PhD Opportunity: Sleep in the Landscape of Fear in Red Deer

A Ph.D. project opportunity in collaboration with our colleagues, focusing on sleep in the landscape of fear in red deer. 

The project is open for applications, and you can find more details here: https://www.quadrat.ac.uk/projects/sleep-in-the-landscape-of-fear/. The application deadline is Wednesday, January 17th. 

This opportunity is available to students and includes full coverage of fees and scholarships. The primary supervisor is Dr. Isabella Capellini from Quenn´s University Belfast, in collaboration with Luca Borger (University of Swansea), Miloš Ježek (Czech University of Life Sciences, Prague), and Oleg Lyamin (University of California, Los Angeles).

Two PhD opportunities: Social evolution in African wasps

 Love social evolution? Keen on fieldwork? Ready to brave the odd sting in the name of science?

We are looking to recruit two excellent and initiative-taking students to conduct PhDs in animal behaviour and evolution. You will conduct field experiments with social wasps across Africa to tackle open questions in the evolution of conflict and cooperation, based in the friendly and dynamic School of Biological Sciences at the University of Bristol (UK).

We are delighted that PhD opportunity 2 (see below) is part of the University of Bristol's new PhD Scholarship for UK home-fee students of Black or mixed Black heritage. For more information on this scholarship, please feel free to get in touch via email.
 
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PhD OPPORTUNITY 1 (open to applicants worldwide): “Social wasps across Africa: exploring how societies evolve at a continental scale”

A major goal amongst evolutionary biologists is to uncover the links between climate and cooperation. In this PhD, you will use the extraordinarily wide distribution of Africa’s Belonogaster wasps – which span the continent south of the Sahara – to investigate key links between climate and sociality.
 
To find out more about this project, see the project description at www.tinyurl.com/AfricanWasps and contact the lead supervisor at patrick.kennedy@bristol.ac.uk. This project is advertised as part of a competition-funded ‘Doctoral Training Partnership’ (DTP) in the UK, and will involve fieldwork, theory, and working with specimens at the Natural History Museum, London.
 
Deadline for DTP application: 9th January 2024 (contact the supervisor well before this deadline to discuss the project and your suitability)
 
Lead supervisor: Patrick Kennedy (Bristol)
Co-supervisors: Gavin Broad (Natural History Museum), Andy Higginson (Exeter), Andy Radford (Bristol), Stephen Montgomery (Bristol)
 
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PhD OPPORTUNITY 2 (Bristol Scholarship for UK students of Black or mixed Black heritage): “Power games in the wild: the social evolution of dominance”

Animal social groups are often profoundly unequal. In this PhD, you will explore how social power evolves and is maintained, and develop evolutionary theory to explain why different species and populations evolve to have radically different types of power structure. You will have a rare opportunity to combine evolutionary theory and fieldwork: you will develop theoretical models using both evolutionary game theory and computational simulations, and test predictions by devising creative behavioural experiments with social wasps at our field sites in Africa.
 
To find out more about this project, see the project description at www.tinyurl.com/WaspPower and contact the lead supervisor at patrick.kennedy@bristol.ac.uk. This project is advertised as part of the new competition-funded Bristol Scholarship for UK home-fee students of Black or mixed Black heritage.
 
Deadline for full application: 8th January 2024 (contact the supervisor well before this deadline to discuss the project and your suitability)
 
Lead supervisor: Patrick Kennedy (Bristol)
Co-supervisor: Stephanie King (Bristol)
 
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Entry requirements: The successful applicants will have a demonstrable passion for evolution and ecology. You must have a first or upper second-class degree (or international equivalent) in a discipline related to the PhD project. Applicants with additional relevant experience and/or a master's degree are strongly encouraged to apply.

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Patrick Kennedy, School of Biological Sciences, University of Bristol

https://tinyurl.com/BristolWaspsLab

Proposition de stage

 INTITULE DU STAGE : Impact de l’enrichissement sur le bien-être des vaches laitières Contexte et problématique : Malgré une intensification de l’élevage des animaux de ferme, les éleveurs souhaitent fournir un environnement approprié à leurs animaux en relation avec les futures exigences de conformité, tout en essayant de mieux comprendre les besoins des animaux et notamment leur bien-être. Nos projets se concentrent sur un objectif principal : améliorer les systèmes actuels de logement par l’enrichissement de l’environnement. Notre question de recherche principale concerne alors : comment enrichir l’environnement de la vache (enrichissement social ou environnemental par ex) pour améliorer son bien-être et mieux répondre à ses besoins comportementaux et ses attentes ? Pour parvenir à répondre à cette question, plusieurs réponses des animaux seront étudiées, notamment les aspects cliniques avec le confort thermique, l’analyse de la démarche par ex, et les aspects comportementaux avec la robustesse comportementale, les émotions etc. Objectifs généraux du stage / Résultats attendus : Volet clinique : Évaluer les aspects cliniques du bien-être comme la démarche des vaches et la température corporelle. Volet comportement : Mesurer les émotions (tests de réactivité par ex) et comportements (budget-temps) des vaches face à différentes formes d’enrichissement. Projet dans lequel s’insère le stage : Le stage fait partie de la programmation scientifique de la Chaire de recherche-innovation en Bien-être animal et Intelligence artificielle WELL-E. ACTIVITES DOMINANTES CONFIEES AU STAGIAIRE : - Préparation et participation aux expérimentations en cours au moment du stage - Utilisation de logiciels pour le codage des comportements (The Observer) ou des paramètres cliniques - Analyses à l’aide du logiciel R - Rédaction d’un compte-rendu de stage sous la forme d’un papier scientifique - Présentations orales lors de rencontres de laboratoire PROFIL REQUIS : - Connaissances : intérêt pour l’étude du comportement et du bien-être en élevage - Compétences opérationnelles : analyse de jeux de données et codage sous R - Langues : anglais, français (optionnel) - Permis de conduire (le cas échéant) : AVANTAGES PROPOSES (le cas échéant) : - bourse : 2000CAD/mois CO-ENCADREMENT SCIENTIFIQUE ET TECHNIQUE Partenaire 1 : Elsa Vasseur, Professeur, Université de McGill Partenaire 2 : Marjorie Cellier, Chercheuse post-doctorale, Université de McGill CONTACT DU RESPONSABLE SCIENTIFIQUE : Nom et fonction du responsable scientifique à contacter : Marjorie Cellier Adresse : Macdonald-Stewart Building, Macdonald Campus, 21111 Lakeshore Road, Ste Anne de Bellevue, QC, H9X 3V9, Canada Site web (équipe et/ou projet) : www.cowlifemcgill.com et www.well-e.org Email : marjorie.cellier@mcgill.ca DATES DU STAGE : Nombre de semaines à déterminer avec l’encadrante (attention, les demandes de visa peuvent prendre du temps) LIEU DU STAGE : Département des Sciences Animales, Université de McGill, Campus Macdonald, Ste Anne de Bellevue, QC, H9X 3V9, Canada

PhD position

PhD-position on measurements and modeling of noise in offshore windfarms

https://www.jobbnorge.no/en/available-jobs/job/253237/phd-research-fellow-in-environmental-impacts-underwater-noise-of-floating-offshore-wind-turbines

Funded PhD studentship on the UK pool frog reintroduction

 I'm recruiting a PhD student at Swansea University to use genomic and ecological techniques help boost the success of the reintroduction of pool frogs; the UK's rarest amphibian.

Reintroduction is a vital conservation tool, used to re-establish species following local extinction. However, only around 30% of reintroductions are successful, so a key priority is to understand how to boost success. We will work with project partners the Amphibian and Reptile Conservation (ARC) Trust and the Institute of Zoology (IOZ) to enhance the reintroduction of the pool frog (Pelophylax lessonae). This species was reintroduced to the UK in 2005 following extinction in the 1990s, and populations are breeding, although there are issues with small population sizes and breeding pool abandonment. This PhD will take a comprehensive approach to understanding reintroduction success, combining ecological, physiological and behavioural data (collected in the field with ARC) with health, disease and genomic data (collected in conjunction with IOZ). We will (1) investigate whether genomic diversity is stable or reducing in the reintroduced populations (2) investigate links between genomic diversity, reproductive fitness and health (3) explore how pool frogs use different habitats within the reintroduction sites and (4) establish how pool management techniques can boost breeding pool use. The results will directly inform ARC in genomic and habitat management strategies in UK pool frogs and will more broadly shape future reintroduction projects in the UK and globally.

Due to the funding requirements, we can only accept applications from students eligible for UK tuition fee rates (e.g. UK nationals or residents).

Application deadline: 8^th December 2023

Position starts: October 2024

Please see our website for more details and information on how to apply: https://www.swansea.ac.uk/postgraduate/scholarships/research/biological-sciences-sures-phd-informing-2024-rs464.php

Please contact Dr Hazel Nichols (h.j.nichols@swansea.ac.uk) if you'd like to discuss the position further.

Offre de stage

 Offre de stage M2 sur l'effet des liens sociaux sur la réponse aux chatouilles chez le bonobo (Labo ENES, St Etienne).

Nous proposons un stage M2 de 6 mois sur

L'EFFET DE LA FAMILIARITÉ SUR LA RÉPONSE AUX TICKLING À BONOBOS

Période approximative : janvier à juin 2024

Chez l'homme, les gros chatouilles induisent une réponse comportementale complexe qui inclut le retrait de l'acteur, l'abri des zones chatouilles, le tortillement et les rires incontrôlables. Une telle réponse est socialement modulée, car les chatouilles peuvent être perçues comme soit

agréable ou désagréable selon la qualité relationnelle partagée entre les joueurs.

Pour cette raison, chez notre espèce, les gros chatouilles ont été liés à l'émergence de la distinction de soi et de l'intersubjectivité primaire. Bien que de gros chatouilles aient été signalées chez les grands singes, ce comportement a reçu une attention rare et le peu d'informations disponibles se limite aux chimpanzés.

Le but de cette étude est d'étudier en bonobos (Pan paniscus) si la réponse aux chatouilles varie en fonction du niveau de familiarité qu'ils partagent avec le sujet qui effectue une telle action ludique, en informant éventuellement de la présence/l'étendue des capacités intersubjectives chez cette espèce. Une importance particulière sera accordée à l'expression des signaux communicatifs (par exemple, gestes, expressions faciales, vocalisations).

Plus précisément, le stagiaire abordera la question de recherche suivante :

LA RÉPONSE DE BONOBOS AUX TICKLINS EST-ELLE AFFECTÉ PAR LA FORCE DU LIEN SOCIAL ?

Le candidat retenu sera basé au laboratoire de recherche en bioacoustique ENES, Université Jean Monnet, Saint-Etienne ( https://www.eneslab.com ). Le travail consistera à coder de

enregistrements vidéo et audio qui ont été collectés au sanctuaire Lola ya Bonobo (Kinshasa, RD Congo) à l'été 2023. Le stagiaire développera des compétences en observation éthologique (BORIS

logiciel) du comportement social et de la bioacoustique (logiciel PRAAT).

Nous recherchons un étudiant hautement motivé, patient et méticuleux (le codage vidéo et audio peuvent être difficile ! ).

Ce stage fait partie du "JOUONS ! ” projet financé par le LabEX ASLAN du CNRS - Université de Lyon.

Plus d'infos ici : https://aslan.universite-lyon.fr/projet-let-s-play-245355...

Cette offre durera jusqu'à ce qu'un bon candidat soit trouvé. Alors n'attendez pas pour postuler. Premier arrivé, premier servi !

Pour les candidats intéressés, veuillez envoyer votre CV et lettre de motivation par e-mail aux deux : - Elisa Demuru : elisa.demuru@cnrs.fr

- Florence Levréro : florence.levrero@univ-st-etienne.fr

PhD - Mapping the happy brain

PhD that is available with Alistair Lawrence and his group at Edinburgh / SRUC.

'Mapping the happy brain' https://www.findaphd.com/phds/project/eastbio-mapping-the-happy-brain-brain-activation-in-response-to-positive-emotional-states-in-the-rat/?p161236

Job

 We're looking for a new Research Technician to work in a team based at the National Pig Centre, one of the UK’s leading research intensive Universities.

The NPC is the UK’s largest and most advanced facility for research into pig nutrition, behaviour, health & health and production systems.

 

Apply here:  https://jobs.leeds.ac.uk/vacancy.aspx?ref=FBSBY1181

Proposition de stage libre / Césure niveau Licence 3 – Master

 Titre du stage : "Capacités attentionnelles visuelles des enfants et adolescents avec et sans Trouble du Spectre de l’Autisme (TSA) en présence d’animaux : approche comportementale et eye-tracking". En collaboration avec les associations Handi’Chiens et Umanima, financé par la Fondation Pierre et Adrienne Sommer. Périodes : 11 mars au 10 mai 2024 Date de fin des candidatures : 12/12/2023 Encadrantes : Manon Toutain (Doctorante), Dr Marine Grandgeorge (Maitre de conférences), Dr Laurence Henry (Maitre de conférences) Structure de recherche : Laboratoire Ethos, Station biologique de Paimpont Numéro de téléphone : 02.99.61.81.59 (Manon Toutain) Adresse : Laboratoire Ethos, Station biologique de Paimpont Lieu du stage : Laboratoire Ethos, Station biologique de Paimpont, LD Beauvais, 35380 Paimpont Résumé du stage : Ce projet s’inscrit dans les recherches menées par l’équipe CIRCE sur la compréhension des mécanismes impliqués dans les interactions Homme-Animal, et plus précisément dans le cadre d’un projet de doctorat qui vise à mieux comprendre l’attention visuelle des enfants et adolescents sur des cibles humaines et animales. L’attention visuelle joue un rôle clé dans le développement d’un individu (mémoire, apprentissage, imitation, représentation du monde), particulièrement dans ses interactions sociales et pseudo-sociales (reconnaissance des émotions, perception d’autrui). Le stage proposé est une étude de l’attention visuelle d’enfants et d’adolescents, lors de rencontres avec différentes espèces animales. La caractérisation de l’exploration visuelle d’une face animale et humaine au cours d’une rencontre n’a jamais encore été étudiée bien qu’essentielle dans la compréhension de l’information faciale. Le stage consistera à caractériser l’attention visuelle de deux groupes d’enfants et d’adolescents dans différents contextes à l’aide d’une approche comportementale doublée d’eyetracking embarqué. Mission du stage : Le stage ne comporte pas de terrain et repose sur une analyse d’une base de données déjà récoltée. Il s’agira majoritairement de codage comportemental de vidéos préexistantes (via The Observer) et de codage de données eye-tracking (Tobii). Frais pris en charge : Matériel fourni par le laboratoire et frais de mission s’il y en a. Les autres frais seront à assurer par l’étudiant. Profil candidat (e) : - Rigueur et minutie dans les analyses. - Capacité à rester concentré sur un écran pendant plusieurs heures, les tâches de codage sont répétitives. - Formation en éthologie, biologie, ou biostatistique requise - Maitrise du logiciel R appréciée. - Connaissances en eye-tracking et sur le logiciel The Observer sont un atout mais non nécessaires. - Permis de conduire et voiture conseillée (compte tenu du lieu de stage). Candidature : Adressez un CV et une lettre de motivation par e-mail avant le 15/10/2023 à manon.toutain@univ-rennes.fr ; marine.grandgeorge@univ-rennes.fr et laurence.henry@univ-rennes.fr Publications: Correia‐Caeiro, C., Lawrence, A., Abdelrahman, A., Guo, K., & Mills, D. (2022). How do children view and categorise human and dog facial expressions?. Developmental Science, e13332. Grandgeorge, M., Degrez, C., Alavi, Z., & Lemonnier, E. (2016). Face processing of animal and human static stimuli by children with autism spectrum disorder: a pilot study. Human-Animal Interaction Bulletin, 4(2), 39-53. Guillon, Q., Hadjikhani, N., Baduel, S., Kruck, J., Arnaud, M., & Rogé, B. (2014). Both dog and human faces are explored abnormally by young children with autism spectrum disorders. Neuroreport, 25(15), 1237-1241. Dollion, N., Toutain, M., François, N., Champagne, N., Plusquellec, P., & Grandgeorge, M. (2021). Visual exploration and observation of real-life interactions between children with ASD and service dogs. Journal of Autism and Developmental Disorders, 51(11), 3785-3805

Offre de stage visant préférentiellement un ou une stagiaire niveau M1

 Intitulé du stage : reconnaissance de soi chez le Diamant Mandarin (Taeniopygia guttata) Durée du stage : 2 mois, avril-mai 2024 Lieu du stage : Laboratoire Ethologie Cognition Développement, Université Paris Nanterre, 200 avenue de la République, 92000 Nanterre Encadrant du stage : Sébastien Derégnaucourt Détails du stage : la reconnaissance de soi est une composante importante de la conscience chez les animaux. La diffusion du propre chant de l’oiseau (« Bird’s Own Song » : BOS) est couramment utilisée en neuro-éthologie pour identifier les bases cellulaires et moléculaires du contrôle neural du chant chez les oscines. Au cours d’une expérience de conditionnement opérant visant à étudier les bases de la reconnaissance individuelle chez le Diamant Mandarin, nous avons entrainé des mâles à discriminer des chants familiers (produits par des individus du groupe social) de chants non familiers (produits par des individus inconnus pour les sujets). Nous avons ensuite testé la réponse des oiseaux pour leur propre chant et observé que la majorité d’entre eux a considéré le BOS comme un stimulus familier. Le but de cette étude est de mesurer la préférence de mâles de Diamant Mandarin pour leur propre chant. Les oiseaux seront placés dans une cage individuelle et auront la possibilité de contrôler la diffusion de leur propre chant et d’un autre stimulus grâce à une procédure automatisée. Au cours de ce stage, la personne recrutée devra réaliser des expériences avec des oiseaux en laboratoire. Elle sera initiée à l’analyse d’enregistrements audio et vidéo. Elle devra être motivée, rigoureuse, et avoir une bonne capacité d’organisation et de travail en autonomie. Merci d'envoyer CV, lettre de motivation, et relevé de notes à : Sébastien Derégnaucourt : sebastien.deregnaucourt@parisnanterre.fr

Offre de Stage M2

 We are offering a 6-month M2 internship on THE EFFECT OF FAMILIARITY ON THE RESPONSE TO TICKLING IN BONOBOS Approximate period: January to June 2024 In humans, heavy tickling induces a complex behavioural response that includes withdrawing from the actor, sheltering the ticklish areas, wriggling and laughing uncontrollably. Such response is socially modulated as tickling can be perceived as either pleasant or unpleasant depending on the relationship quality shared between the players. For this reason, in our species, heavy tickling has been linked to the emergence of self-other distinction and primary intersubjectivity. Although heavy tickling has been reported in great apes, this behaviour has received scarce attention and the little information available is restricted to chimpanzees. The aim of this study is to investigate in bonobos (Pan paniscus) whether the response to tickling varies as a function of the level of familiarity they share with the subject performing such playful action, possibly informing about the presence/extent of intersubjective abilities in this species. Particular importance will be given to the expression of communicative signals (e.g., gestures, facial expressions, vocalizations). More specifically, the trainee will address the following research question: IS BONOBOS’ RESPONSE TO TICKLING AFFECTED BY THE STRENGTH OF THE SOCIAL BOND? The successful candidate will be based at the ENES Bioacoustics Research Lab, Université Jean Monnet, Saint-Etienne (https://www.eneslab.com). The work will consist in coding of video and audio recordings that were collected at the Lola ya Bonobo sanctuary (Kinshasa, DR Congo) in summer 2023. The trainee will develop skills in ethological observations (BORIS software) of social behaviour and bioacoustics (PRAAT software). We are seeking for a highly motivated, patient and meticulous student (video- and audiocoding can be challenging!). This internship is part of the “LET’S PLAY!” project funded by the LabEX ASLAN of the CNRS - University of Lyon. More info here: https://aslan.universite-lyon.fr/projet-let-s-play245355.kjsp This offer will run until a good candidate is found. So don't wait to apply. First come, first served! Any interested candidates, please email your CV and letter of motivation to both: - Elisa Demuru: elisa.demuru@cnrs.fr - Florence Levréro: florence.levrero@univ-st-etienne.fr Feel free to distribute widely

Post doc en Suisse

 a postdoc (2 years, 100%), in case you know any suitable candidate. The project is on the use of oxytocin to explore positive welfare in pigs!

Here is the link to the add https://www.jobs.ethz.ch/job/view/JOPG_ethz_WXJnKkS37jLaPFE861

PhD position, United Kingdom (deadline December 01)

 4-year PhD Studentship: Assessing long-lasting pain following hot-iron disbudding in dairy calves

Bristol Veterinary School, University of Bristol

Bristol, United Kingdom

Although freedom from pain is a key pillar of animal welfare, painful procedures are still common on most dairy farms. For instance, despite being painful, hot-iron disbudding is still performed on the vast majority of calves. Although the procedure may be performed in a way that limits intra-operative pain (using a combination of anaesthetics and analgesics), recent reports suggest that calves may experience pain for days or weeks after the procedure. However, limited information is yet available on the long-term emotional impact of the procedure and on ways to mitigate it. This PhD project will therefore aim to 1) develop the tools to assess the emotional component of long-lasting pain and 2) develop new ways to tackle pain over long periods of time. For this, we will develop methods based on pain relief as animals are expected to work to access pain relief solutions if they experience pain. These will include novel explorations of the use of cold therapy as a means of providing non-pharmaceutical pain control. We expect that this project will deepen our understanding of what calves’ experience after hot-iron disbudding and contribute to inform on potential innovative and low-cost solutions to tackle the pain.

Supervisors: Mike Mendl (primary supervisor), Benjamin Lecorps

PhD position, United Kingdom (deadline December 01) (applied-ethology.org)

Two fully funded PhD scholarships

Two fully funded PhD scholarships to come work with me and my team, the British Carnivore Project, here in the Psychology department at the University of Hull. Both projects will be looking at the relationships between wild animal psychology, human-wildlife interactions, and environmental issues in the UK and beyond (e.g., biodiversity crisis and climate change).

The first scholarship (Ocean Literacy) will compare terrestrial carnivores and sharks, while the second scholarship (Leverhulme) will focus exclusively on terrestrial carnivores (e.g., foxes, badgers, pine martens). Both projects will involve fieldwork to understand wild animals' relationship with water, and human surveys/interviews to understand public attitudes and engagement with the natural world.  

PhD Scholarship 1: https://www.hull.ac.uk/study/postgraduate/research/phd/funded/using-animal-psychology-to-promote-pro-environmental-attitudes-and-enhance-wider-ocean-literacy

PhD Scholarship 2: https://www.hull.ac.uk/study/postgraduate/research/phd/funded/leverhulme-doctoral-scholarships-centre-for-water-cultures-animal-psychology

For more information about the British Carnivore Project, please visit: https://www.blakemorton.co.uk/case-studies/

For all inquiries, please email me directly at b.morton@hull.ac.uk  

Offre de stage M2 ou équivalent – CHICKENRUN - Liens entre les capacités cognitives précoces des poussins et l’exploration ultérieure de leur environnement dans les systèmes d'élevage en plein air + possibilité de 2 mois de CDD

 Titre : Liens entre les capacités cognitives précoces des poussins et l’exploration ultérieure de leur environnement dans les systèmes d'élevage en plein air Laboratoire d’accueil : INRAE Nouzilly Lieu de stage : INRAE Magneraud Encadrants : Vitor Ferreira (Chargé de Recherche, INRAE Nouzilly), Karine Germain (Ingénieur de recherche, INRAE Magneraud), Ludovic Calandreau (Directeur de Recherche, INRAE Nouzilly) et Vanessa Guesdon (Enseignante-chercheuse JUNIA) Durée : 6 mois de stage (entre mi-février/début mars et mi-août/fin août 2024) + possible CDD de 2 mois (entre mi-août et mi-octobre 2024) Contexte et objectif : La forte demande sociétale pour de meilleures conditions de vie des animaux d'élevage pousse de plus en plus l’élevage vers le développement de systèmes tels que l’élevage plein air, considéré comme plus respectueux du bien-être animal. Cependant, il est important de garder à l'esprit que, bien que l'offre d'un accès extérieur (parcours), puisse avoir un réel intérêt pour le bien-être des animaux (par exemple, en permettant des comportements plus naturels, tels que le fourragement et le bain de poussière, et en donnant aux animaux plus de choix, comme celui de rester à l'intérieur ou à l'extérieur du bâtiment d’élevage), cette offre ne garantit pas que tous les animaux utiliseront cet espace de manière homogène. Pour les poules pondeuses et poulets de chair élevés en plein air, l'utilisation du parcours peut varier de 15% à 87% des individus du lot qui utilisent effectivement l'espace. En effet, il est connu que certains individus ne quittent jamais le bâtiment d’élevage, même s'ils en ont la possibilité. Si la densité (nombre d'individus/m2) dans le bâtiment d’élevage est maintenue à des niveaux élevés au fil du temps, elle peut devenir une source de divers problèmes de santé et de comportement, tels qu'un risque augmenté de parasitisme et de picage de plumes entre les individus. Des études réalisées dans nos dispositifs expérimentaux ont montré que les poulets de chair qui utilisent le moins le parcours (low rangers) ont une perception et des performance cognitives différentes comparés aux poulets qui utilisent le plus le parcours (high rangers). En effet, les low rangers ont une meilleure mémoire spatiale et sont plus aptes à inhiber les réponses comportementales impulsives que les high rangers. De plus, ces différences comportementales interindividuelles semblent être présentes dès le plus jeune âge et montrent une consistance intra-individuelle au cours du cycle de production : les poussins qui fourragent plus, avant l'accès au parcours, utilisent davantage le parcours plus tard, au cours de leur vie, par rapport aux poussins qui fourragent moins. Bien que ces résultats soient intéressants pour une meilleure compréhension de la façon dont les poulets élevés en plein-air perçoivent leur environnement physique (et la relation entre cette perception et l’utilisation du parcours), ils sont principalement basés sur des tests individuels et ne prennent pas en compte les influences sociales que les poulets ont les uns sur les autres. Afin de mieux comprendre la relation entre comportement, cognition et utilisation du parcours, les objectifs de ce stage sont de 1) comprendre si et comment la variation interindividuelle de l'utilisation du parcours est liée à la dynamique sociale des individus et 2) approfondir l'étude de la cognition sociale au niveau individuel, en se focalisant sur comment les oiseaux les plus et les moins explorateurs du parcours interprètent les informations sociales. Lieu d’accueil du stagiaire : Ce projet est un projet collaboratif entre l’Unité Expérimentale Systèmes d’Elevage Avicoles Alternatifs (EASM) d’INRAE du Magneraud (17), l’équipe de recherche CEB (Cognition, Ethologie, Bien-être animal) d’INRAE de Nouzilly (37), et l’équipe de recherche CASE (Comportement Animal et Systèmes d’Elevage) de JUNIA (59). Le stagiaire passera tout son temps à Surgères (40 km de la Rochelle, INRAE du Magneraud). • L’Unité Expérimentale Systèmes d’Elevage Avicoles Alternatifs (EASM) de l’INRAE située au Magneraud (17) met en place des expérimentations dans le cadre d'actions d'appui à la recherche, avec une attention renforcée vis-à-vis des programmes se rapportant aux modes d’élevage alternatifs chez les volailles (personne impliquée Karine Germain). • L’équipe de recherche CEB (Cognition, Ethologie, Bien-être animal) d’INRAE de Nouzilly (37) étudie les processus mentaux impliqués dans les émotions, la relation homme-animal et les capacités d’apprentissage des animaux domestiques (personnes impliquées Vitor Ferreira et Ludovic Calandreau). • L’équipe de recherche CASE (Comportement Animal et Systèmes d’Elevage) de JUNIA (59) a pour objectif entre autres, par ses activités de recherche, de participer à l’amélioration de la prise en compte des besoins et du comportement des animaux dans la gestion des élevages et la conception des bâtiments (personne impliquée Vanessa Guesdon). Mission / aspects pratiques : Le/la stagiaire sera en charge du développement des protocoles expérimentaux pour l’exécution des tests cognitifs/comportementaux. Le/la stagiaire devra s’occuper de toutes les phases d’un projet scientifique : recherche bibliographique, appropriation de l’expérience via la littérature, création du protocole expérimentale, mise en œuvre l’expérience, collecte et analyses de données et rédaction d’un mémoire. Conditions : Stage d’une durée de 6 mois avec un démarrage entre mi-février/début mars 2024. Le/la stagiaire sera localisé à Surgères (40 km de la Rochelle). Stage indemnisé selon la législation en vigueur. Selon la disponibilité, l’INRAE du Magneraud peut proposer des logements type chambre individuelle avec cuisine, douche, sanitaires et espaces communs (prix≈ 5 euros par nuit). Un CDD de 2 mois peut être envisagé à la suite du stage. Profil recherché : étudiant/e en cinquième année (niveau M2) cursus universitaire ou d’école agri/agro/véto. Intérêt pour la recherche et les thématiques du bien-être des animaux d’élevage et/ou du comportement animal. Bonnes capacités d’analyse, rédactionnelles (français et anglais) et statistiques. Impératif d’interagir et manipuler les animaux calmement et délicatement. La/le stagiaire participera à des tests demandant des efforts physiques éprouvants pour le dos, les jambes et les bras. Permis de conduire B nécessaire. Véhicule personnel est recommandé. Contact : Pour plus d’information ou pour envoyer votre candidature (lettre de motivation et cv): Vitor Ferreira (vitor.ferreira@inrae.fr). Les candidatures sont ouvertes jusqu'à ce que le stage soit pourvu

PhD: The Interplay of Memory and Cooperation, University of St Andrews

 We have an open 4-year PhD position on the cognitive mechanisms of cooperation in rats at the University of St Andrews. Further information and details about how to apply can be found in the link: https://www.findaphd.com/phds/project/eastbio-recollections-and-reciprocity-the-interplay-of-memory-and-cooperation/?p161511.

The application deadline is 27 November 2023.

Internship at the Max-Planck-Institute for Biological Intelligence, campus Seewiesen, (Germany) on behavioural plasticity in courtship behaviour in ruffs (Calidris pugnax).

We are looking for a student/intern to join our team at the Max-Planck-Institute for Biological Intelligence under the supervision of Dr. Clemens Küpper (team leader) and Dr. Giovanni Spezie (postdoc). The project focuses on the courtship behaviour of a captive population of ruffs (Calidris pugnax) held at our facilities. Ruffs are a unique and fascinating model system for the study of courtship behaviour, as male ruffs exhibit three morphs with distinct phenotypes and reproductive strategies (Independent, Satellite, Faeder males). The aim of the project is to investigate whether the social environment plays an important role in regulating the expression of courtship behaviours of the three male reproductive morphs in this species.

 

Duration: 2-3 months; start date should be no later than 25^th-30^th April 2024.

Activities: the intern will participate in an experiment that will take place between April and July 2024 at the Seewiesen campus (Eberhard-Gwinner-Straße, 82319 Starnberg, Germania). The intern will be trained to handle the birds, release them into the experimental units, operate the synchronized video-camera system to record their courtship behaviour and social interactions in the aviaries. It is highly recommended that the student stays at the guesthouse of the campus, as the experiments start early in the day (6:00 am) in order to release the birds into the experimental units, as connections via public transport is not available in the early morning. Experimental activities are however limited to the morning hours.

Costs: the expenses for travel and accommodation will have to be covered by the intern. We do however encourage the candidate to apply for funding through the Erasmus program.

Requirements: there are no particular requirements; prior experience with bird handling is preferred.

 

In case of interest, please contact and send a brief CV to: Giovanni Spezie; giovanni.spezie@vetmeduni.ac.at

 

 

 

 

 

 

Internship with possibility of thesis on elaborate courtship displays in the spotted bowerbird at the University of Vienna.

We are looking for a master’s student to join our team at the University of Vienna under the supervision of Prof. Leonida Fusani (team leader), Morgan Job Knoester (PhD candidate) and Giovanni Spezie (postdoc). The project focuses on the elaborate movements and postures that male spotted bowerbirds (Chlamydera maculata) perform during courtship displays. The aim of the project is to analyse video recordings that have been collected in previous field seasons.

 

Duration: 2-4 months; start date is negotiable.

Activities: the intern will have to use AI-based techniques to track body movements of male birds during courtship, in order to address research questions related to social learning, but the intern will also have the opportunity to develop research questions independently. The analyses will be conducted using the software Loopy (http://loopb.io, Loopbio, GmbH, Austria), a kit of video analysis tools including behavioural scoring, deep learning, etc. The intern will be trained to use Loopy and other video analysis software before working on video processing and analysis autonomously.

Costs: the expenses for travel and accommodation will have to be covered by the intern. We do however encourage the candidate to apply for funding through the Erasmus program.

Requirements: Good knowledge of R is required. The intern will have to process and analyze large datasets independently in R. Prior experience with AI-based techniques is not necessary but preferred.

 

In case of interest, please contact and send a brief CV to: Giovanni Spezie and Morgan Job Knoester; giovanni.spezie@vetmeduni.ac.at; job.knoester@univie.ac.at

 

 

 

 

 

 

Two PhD positions in Bern, Switzerland

 At the Division of Animal Welfare (Prof. Hanno Würbel, PD Dr. Bernhard Voelkl), University of Bern, Switzerland, we are seeking two PhD students to study how inbreeding affects developmental robustness and stress resilience in laboratory mice, and how this impacts the replicability of research findings and animal welfare (funded by the Swiss National Science Foundation, SNSF). We are a dynamic team of scientists and technicians involved in national and international research projects aimed to promote rigorous and responsible animal research. For further information on our team and research, visit our website.

 

PhD student 1 will analyse large public databases to investigate the effects of homozygosity on phenotypic plasticity and on environmental and mutational robustness in laboratory mice and conduct a systematic review and meta-analysis on the effect of inbreeding on stress resilience and the replicability of research with mice.

 

PhD student 2 will experimentally test whether homozygous (inbred) mice are developmentally less robust and less resilient to stressors by assessing morphological asymmetries and behavioural, physiological, and cellular measures of stress using a representative population of inbred, F1 hybrid, and outbred mice.

 

Candidates need a university degree in biology or biomedical sciences and advanced training in statistics. Expertise in data analysis and quantitative genetics (for PhD 1), or morphometrics and experience with laboratory mice (PhD 2), will be a plus.

We offer an attractive academic environment, opportunities for academic career development, and a competitive salary based on the Swiss National Science Foundation (SNSF) scheme.

 

Please send your application letter together with a motivation statement, your CV, copies of relevant study certificates, and contact details of one or two reference persons (reference letters are not required at this stage) merged into one single pdf-file to: hanno.wuerbel@unibe.ch.

 

The deadline for application is November 30, 2023. The position will be available from January 2024 or at your earliest convenience. Please indicate your preferred, as well as your earliest possible start date in the application letter.

PhD position Plymouth, UK - Cryptic speciation

 We are currently recruiting for a 3.5 year fully funded ARIES PhD studentship based at the University of Plymouth, UK.

 

Project title: Investigating cryptic speciation in the beadlet sea anemone Actinia equina

 

Closing date: 10th January 2024

Studentship start date: 1st October 2024.

 

Project description:

Organisms inhabiting the intertidal zone experience stressors from both the aquatic and aerial environments they straddle, providing an “early warning system” for the impacts of climate change. However, our ability to monitor changes in these communities is hampered by our lack of knowledge surrounding the genetic diversity of their inhabitants, in particular due to the presence of cryptic species which are morphologically identical. The beadlet anemone Actinia equina is one of the most common animals found along the UK’s rocky shores, but despite becoming a model system for research across a range of fields, knowledge about its basic biology is severely lacking. Once assumed to be a single species, A. equina is now thought to represent a cryptic species complex, but to date only one “cryptic” species has been identified in UK populations. Furthermore, there is debate as to whether “cryptic” species within this complex can actually be identified by body colour due to the diverse phenotype of A. equina. This project aims to increase our understanding of intertidal biodiversity by systematically examining the genetic structure of A. equina populations along the South West coast and exploring their responses to environmental stresses relevant to climate change.

 

The project will involve; (1) systematic surveys of A. equina populations; (2) the use of survey software to compile spatial distribution maps; (3) verification of the existence of cryptic species using molecular and bioinformatics analyses; (4) lab experiments to characterise differences between morphs in behavioural and physiological responses to environmental stressors.

 

Training: The student will gain training in a range of different laboratory techniques (including molecular, physiological and behavioural analyses), alongside species distribution mapping using GIS. They will develop communication and networking skills, with the opportunity to attend research group meetings across the wider school, present data at international conferences, and engage in outreach activities.

 

Candidate requirements:

We are looking for an enthusiastic candidate with a degree in a relevant biological subject, an interest in the field and relevant experience in molecular ecology. A positive attitude towards problem solving, independence and initiative are essential, experience with GIS, R and bioinformatics is desirable. Applicants should have a first or upper second class honours degree or a relevant Masters qualification. We are looking for an enthusiastic candidate with a degree in a relevant biological subject, an interest in the field and relevant experience in molecular ecology. A positive attitude towards problem solving, independence and initiative are essential, experience with GIS, R and bioinformatics is desirable.

 

If your first language is not English, you will need to meet the minimum English requirements for the programme, IELTS Academic score of 6.5 (with no less than 5.5 in each component test area) or equivalent. Successful candidates who meet UKRI’s eligibility criteria will be awarded a NERC studentship, which covers fees, stipend (£18,622 p.a. for 2023/24) and research funding. International applicants are eligible for fully-funded ARIES studentships including fees. Please note however that ARIES funding does not cover additional costs associated with relocation to, and living in, the UK.

NB: The studentship is supported for 3.5 years of the four-year registration period. The subsequent 6 months of registration is a self-funded ‘writing-up’ period.

Excellent applicants from quantitative disciplines with limited experience in environmental sciences may be considered for an additional 3-month stipend to take advanced-level courses.

ARIES is committed to equality, diversity, widening participation and inclusion in all areas of its operation. We encourage applications from all sections of the community regardless of gender, ethnicity, disability, age, sexual orientation and transgender status. Academic qualifications are considered alongside significant relevant non-academic experience.

 

If you wish to discuss this project further informally, please contact Dr Sarah Lane, sarah.lane@plymouth.ac.uk .

 

For more information on the project and how to apply please visit: https://www.findaphd.com/phds/project/investigating-cryptic-speciation-in-the-beadlet-sea-anemone-actinia-equina/?p163316

Stage 2024 ; L3, M1 ou césure

 Stage 2024 ; L3, M1 ou césure : Les effets des polluants sur les relations hôtes-parasites Unité d’accueil : Sorbonne Université (UMR 7619 METIS), CEREP-ECOTRON Encadrement : Aurélie Goutte et Léa Lorrain-Soligon (UMR 7619 METIS) Contact : aurelie.goutte@ephe.psl.eu; llorrain.lea@gmail.com, en précisant vos périodes de disponibilité Dates et durée du stage : 2 mois entre janvier et juillet 2024 (plusieurs périodes de stage possibles) Les écosystèmes aquatiques sont particulièrement exposés aux pollutions d’origine urbaine et agricole. Les risques écotoxicologiques sont généralement étudiés à l’échelle des individus et des populations, mais les perturbations des interactions biotiques restent encore peu explorées. Certains parasites intestinaux, les acanthocéphales, présentent la remarquable capacité d'accumuler des polluants depuis leur hôte. Nos précédents résultats montrent une atténuation de certains effets écotoxicologiques chez un poisson d'eau douce, le chevesne (Squalus cephalus), parasité par des acanthocéphales. Ces parasites pourraient s’avérer utiles pour leur poisson-hôte si les bénéfices associés à la séquestration des polluants contrebalancent les coûts de l’infection parasitaire. Ce projet vise à tester cette hypothèse, en étudiant les effets des polluants sur les acanthocéphales, sur les chevesnes parasités ou non, et les relations hôtes-parasites. Une étude expérimentale sera menée en mésocosmes au sein de l'unité de service CEREEP-ECOTRON IleDeFrance, et notamment au sein de la Plateforme Nationale Expérimentale en Ecologie Aquatique (PLANAQUA). Des chevesnes adultes seront exposés à différentes concentrations de polluants, afin de suivre les réponses comportementales et physiologiques des chevesnes en fonction de leur statut parasitaire. Le stage consistera à l’aide au maintien des individus en élevage, à l’aide aux manipulations, ainsi qu’à la récolte et à l’analyse de données. L’étudiant.e pourra être hébergé.e au CEREEP. Profil recherché : Ce stage est idéal pour un.e étudiant.e en césure, licence 3 ou master 1 intéressé.e par les réponses des organismes aux perturbations environnementales d’origine anthropique et qui souhaite acquérir des connaissances en écotoxicologie, écologie aquatique, évolution des interactions biotiques. Connaissances et compétences requises : Attrait particulier pour les expériences en conditions contrôlées sur la faune sauvage et pour le travail en équipe. Rigueur et dynamisme. Compétences en analyses de données

Offre de stage M2 au LBMC

Titre du master Étude des forces qui s’appliquent dans le membre postérieur du chien pendant la marche à l'aide d'un système de capture du mouvement sans marqueur et d'un modèle musculosquelettique. Titre du master en anglais Study of the forces applied in the dog's hind limb during walking using a markerless motion capture system and a musculoskeletal model. Lieu de travail principal Laboratoire de Biomécanique et Mécanique des Chocs LBMC UMR_T9406 (Université Lyon 1, Université Gustave Eiffel) Encadrant Noémie Petitjean, MCF, LBMC UMR_T9406 noemie.petitjean@univ-lyon1.fr Benoit Gillet, MCF, VetAgro Sup, UPSP ICE 2021.A104 benoit.gillet@vetagro-sup.fr

Contexte

Depuis quelques années, le nombre d’études cinématiques de la locomotion du chien sain ou avec une pathologie ne cesse d’augmenter. Ces études permettent de différencier les patrons de marche de chiens de différentes races ou d’identifier l’impact d’une pathologie osseuse, articulaire ou musculaire sur la locomotion. Cependant, ces données cinématiques ne permettent pas d’évaluer les forces qui s’exercent au niveau des articulations. Ainsi, les études évaluant des techniques chirurgicales orthopédiques avec ou sans implants sont généralement expérimentales (ex vivo) ou cliniques. Cela constitue une limite importante au développement des techniques et outils vétérinaires puisque le nombre d’essais est limité. L’optimisation de techniques ou implants pourrait être réalisée via des modèles biomécaniques. Récemment, un modèle musculosquelettique a été développé dans un laboratoire allemand pour évaluer le chargement des articulations du chien lors de la locomotion (Stark et al., 2021). D’autre part, une méthode d’acquisition de mouvement sans marqueur du chien a été développée en collaboration entre l’école vétérinaire de Lyon (VetAgro Sup) et le LBMC pour alléger le protocole de suivi de la marche.

Objectif du stage

L’objectif de ce stage est d’évaluer les forces qui s’appliquent sur les articulations du membre postérieur du chien en utilisant un modèle musculosquelettique et à l’aide de données obtenues par un système d’analyse du mouvement sans marqueur couplé à une plateforme de force.

Travail attendu

Ce travail de recherche consiste à :

• réaliser une revue de la littérature sur l’analyse des forces exercées aux niveaux des articulations du membre postérieur du chien et sur les techniques utilisées pour réaliser ces mesures et ces simulations numériques ;

• suivre une collecte de données avec le système de caméras sans marqueur, des électrodes EMG (gastrocnémien, vaste latéral, biceps fémoral) et une plateforme de force ;

• construire un modèle musculosquelettique du membre postérieur du chien à partir des données récoltées et de la géométrie articulaire et musculaire publiée dans la littérature ;

• estimer les forces et moments inter-segmentaires (par dynamique inverse), les bras de levier musculaires puis les forces musculo-tendineuses et les forces de contact articulaire (par optimisation statique) en intégrant directement la cinématique mesurée ;

• vérifier la cohérence des résultats de forces musculo-tendineuses avec les mesures électromyographiques ;

• comparer ces résultats avec la littérature.

Mots-clefs : cinématique, modélisation musculosquelettique, contraintes mécaniques, articulations, chien.

Plateforme de forces

Cinématique markerless

Modèle musculosquelettique