Stage

OFFRE DE STAGE MASTER 2
TITRE « SUIVI ACOUSTIQUE DES POPULATIONS D’ELEPHANTS DE FORET DANS UN CONTEXTE DE BRACONNAGE ET
D’EXPLOITATION FORESTIERE »

L’UMR 7204 "Centre d’Écologie et des Sciences de la Conservation"(CESCO) est une UMR (unité mixte de recherche) du Muséum national d’Histoire naturelle, du CNRS et de Sorbonne Université. Le CESCO développe des recherches pour la conservation de la biodiversité, en mobilisant des approches d’écologie et d’évolution ainsi que des interfaces avec les sciences humaines et sociales.
L’Agence Nationale des Parcs Nationaux (ANPN) est l’établissement public gabonais en charge de la gestion des 13 parcs nationaux du Gabon et autre aires protégées sous sa juridiction, qui couvrent environ 11,5 % du territoire national terrestre et 26 % des eaux marines du pays. L’ANPN agit également pour valoriser le patrimoine naturel et culturel tout en soutenant le développement durable à travers des politiques de conservation et de recherche scientifique.
Depuis 2021, le CESCO collabore avec l’ANPN pour l’étude de l’écologie des éléphants de forêt et participe au renforcement et à la formation du personnel de l’ANPN pour l’aider à mener à bien ses missions de suivi de la biodiversité.
Contexte scientifique
Les grands herbivores façonnent la structure et le fonctionnement des paysages et des environnements dans lesquels ils se trouvent, mais aujourd’hui, 60 % des herbivores de grande taille sont menacés d’extinction. La majorité de ces espèces font face à une réduction de leur aire de répartition, principalement en raison de la perte d’habitat et de leur surexploitation. La disparition de ces ingénieurs des écosystèmes a des répercussions à grande échelle sur le paysage, entraînant des conséquences telles qu’un changement dans la structure et la composition des communautés végétales.
La capacité des forêts tropicales exploitées à maintenir diverses fonctions écologiques et socio-économiques à long terme est incertaine. L’éléphant de forêt d’Afrique (Loxodonta cyclotis) est une espèce centrale pour le bon fonctionnement des forêts du Bassin du Congo. Sa disparition pourrait entraîner de graves conséquences sur la structure des forêts et leur capacité à stocker le carbone. Les populations d’éléphants font face à un déclin dramatique en raison du braconnage pour le commerce de l’ivoire et de la réduction d’habitat. Le Gabon abrite plus de 60 % des éléphants de forêt restants, mais l’espèce, qui vit aussi bien à l’intérieur qu’en dehors des aires protégées est menacée par les activités humaines légales et illégales.
Pour les espèces qui occupent des habitats fermés et difficiles d’accès, les observations directes sont rares, et les activités humaines sont difficiles à mesurer, en particulier lorsqu’elles sont illégales. Bien que les patrouilles de lutte contre le braconnage assurent la surveillance des aires protégées, de vastes zones restent insuffisamment surveillées en raison du manque de ressources humaines et matérielles. L’intensification des industries extractives, notamment l’exploitation forestière, constitue également une perturbation importante pour les éléphants au Gabon.
Le suivi acoustique est une méthode non invasive efficace de monitoring des populations d’éléphants. Il permet également de détecter les activités humaines, et de mesurer l’efficacité des actions de lutte anti-braconnage.
Cependant, la grande quantité de données à analyser nécessite l’utilisation d’outils innovants basés sur
l’apprentissage automatique. 

Objectifs du stage et rôle du stagiaire
Depuis 2023, des enregistreurs acoustiques (SongMeter Mini2, Wildlife Acoustics) sont déployés aux abords du Parc National de Moukalaba-Doudou au Gabon pour échantillonner les paysages sonores dans différents contextes de perturbations humaines (zone villageoise, zone d’exploitation forestière, parc national).
Le/la stagiaire s’occupera de l’organisation des données acoustiques et participera au développement/adaptation des méthodes pour leur analyse à l’aide de méthodes de pattern matching et de machine learning (i.e. BirdNet, Kahl et al. 2021, Koogu, Madhusudhana 2022). Il/elle sera également amené.e à utiliser des logiciels de visualisation et de traitement des données acoustiques (i.e. Kaleidoscope, Audacity).

Il/elle contribuera à l’analyse des données pour produire des indices d’activités humaines et explorer leur impact sur le comportement des éléphants.
Il/elle sera amené(e) à travailler avec les différentes personnes impliquées dans ce projet.
Compétences requises
- Expérience avec R et/ou langage de programmation Python, en particulier pour l’analyse de données et
machine learning ;
- Expérience en écoacoustique serait appréciée ;
- Capacité à travailler en équipe, rigueur scientifique et autonomie.
Période envisagée : Février-Juillet
Lieu : CESCO – Campus Buffon, 43 rue Buffon, 75005 Paris
Rémunération : gratification de stage
Encadrement :
CESCO: Marie Sigaud.
ANPN : Stéphanie Bourgeois
Merci d’adresser votre candidature (CV et lettre de motivation) à :
marie.sigaud@mnhn.fr
stephanieBourgeois@anpngeneticlab.org
Pour toute demande d’informations, contactez Marie Sigaud et/ou Stéphanie Bourgeois
Références :
Yoh, N., W. Mbamy, B. L. Gottesman, G. Z. L. Froese, T. Satchivi, M. Obiang Ebanega, L. Carlson, S. E. Koto, M. Özdoğan, D. J. I. Seaman, V. Maicher, H. Malinowski, J. Poulsen, A. Ebang Mbélé, and Z. Buřivalová. 2024. Impacts of logging, hunting, and conservation on vocalizing biodiversity in Gabon. Biological Conservation 296:110726.
Hedwig, D., and A. Kohlberg. 2024. Call combination in African forest elephants Loxodonta cyclotis. PLOS ONE 19:e0299656.
Swider, C. R., C. F. Gemelli, P. H. Wrege, and S. E. Parks. 2022. Passive acoustic monitoring reveals behavioural response of African forest elephants to gunfire events. African Journal of Ecology 60:882–894.
Wrege, P. H., F. B.-D. Bambi, P. J. F. Malonga, O. J. Samba, and T. Brncic. 2024. Early detection of human impacts using acoustic monitoring: An example with forest elephants. PLOS ONE 19:e0306932.
Kahl, S., C. M. Wood, M. Eibl, and H. Klinck. 2021. BirdNET: A deep learning solution for avian diversity monitoring. Ecological Informatics 61:101236.
Madhusudhana, S., B. S. Miller, M. G. Aulich, and N. Kelly. 2022. Automated detection of blue whale D-calls using deep learning with a double-observer performance assessment. The Journal of the Acoustical Society of America 151:A29.

Offre de stage

Offre de stage en Éthologie
Évaluation du bien-être des animaux de l’aquarium de Lyon et médiation
auprès du public

 
INFORMATIONS GÉNÉRALES
Durée du stage : 4 à 6 mois, démarrage entre janvier et mars (en fonction du calendrier
de la formation)
Lieu du stage : Aquarium de Lyon
Établissement de recherche de rattachement : Aix-Marseille Université, UMR
TELEMMe
Candidatures : CV + Lettre de motivation (1 page) à remettre à anne-
sophie.tribot@univ-amu.fr au plus tard le 4 décembre 2024. Pour les dossiers
retenus, un entretien en visio aura lieu le 5 ou le 6 décembre.
Gratification : Le montant horaire de la gratification est fixé à 15 % du plafond horaire
de la sécurité sociale défini en application de l’article L.241-3 du code de la sécurité
sociale, soit 4,35 €/heure.
Encadrement :
- Anne-Sophie Tribot, Professeur junior en écologie et sciences sociales de la
conservation, UMR TELEMMe (Aix-Marseille Université/CNRS)
- Jérôme Mourin, Conservateur de l’aquarium de Lyon et spécialiste du comportement
des animaux aquatiques captifs.
- Collaborations avec les soigneurs animaliers et le service pédagogique de l’aquarium.
- Échanges possibles avec d’autres sites, notamment l’aquarium de La Rochelle
engagée dans une démarche comparable.
PRÉSENTATION DU PROJET DE MASTER
L’aquarium comme espace de transition :
bien-être animal et médiation
Les aquariums publics occupent des fonctions stratégiques pour la conservation de
la biodiversité marine (UICN CSE, 2023), articulées autour de l'éducation, de la
conservation ex-situ, de la recherche scientifique et de la sensibilisation
environnementale. Ces institutions exercent une influence considérable sur la
construction des représentations et connaissances autour des milieux sous-marins, et
donc sur les comportements favorables à leur conservation (Routman et al., 2022).
Elles contribuent également à la structuration du rapport affectif et émotionnel des
individus à la biodiversité marine (Ernst, 2018). Dans cette perspective, certains
conservateurs d’aquariums replacent aujourd’hui le bien-être animal et la
représentativité des milieux au cœur de leurs missions, afin de s’adapter aux nouvelles
attentes sociétales (Binding et al., 2020). L’aquarium de Lyon a par exemple entamé
une démarche novatrice en proposant une nouvelle représentation du milieu marin,
plus réaliste, respectueuse du bien-être animal, moins spectaculaire : des individus
plus petits, moins nombreux, avec un soin particulier apporté à la reconstitution du
milieu. En parallèle, l’aquarium a développé une grille d’évaluation du bien-être des
individus captifs, basée sur une série de critères physiques, fonctionnels et mentaux.
Toutefois, cette démarche nécessite d’être accompagnée à travers une évaluation
scientifique interdisciplinaire mobilisant l’éthologie et la médiation :
- il n’existe à ce jour aucune réglementation ou guide de référence officiel concernant
le bien-être des animaux en aquarium. La littérature scientifique à ce sujet reste
parcellaire, en particulier au sujet du bien être mental (Binding et al. 2020). L’aquarium
de Lyon nécessite donc d’être accompagné par un.e éthologue chargé.e (i) d’évaluer
la grille (sur la base d’une revue de la littérature existante), puis (ii) de l’utiliser pour
évaluer le bien-être des animaux en mobilisant les méthodes scientifiques de
l’éthologie, et (iii) d’en analyser les résultats.
- la démarche doit être accompagnée par un effort de médiation auprès des visiteurs.
La transition d’un aquarium "spectacle" à une approche plus réaliste et respectueuse
du bien-être animal peut ne pas correspondre aux attentes de certains visiteurs
(D’Cruze et al., 2019). Travailler sur la médiation pour mettre en avant l’aspect
précurseur de cette approche paraît essentiel. L’étudiant.e sera donc chargé.e de
tester et proposer différents dispositifs de médiation. A travers l'empathie, cette
thématique constituerait d'ailleurs une porte d'entrée privilégiée pour communiquer sur
ces animaux et leur écologie (Lumber et al., 2017).
Ce projet de recherche se situe à l’interface entre l’évaluation du bien-être animal et le
regard du visiteur, dans une perspective novatrice de médiation scientifique et
d’éthique environnementale. Il fera l’objet d’un rapport scientifique à destination de
l’aquarium de Lyon mais aussi de l’ensemble de la profession, de la communauté
scientifique en ichtyologie et en éducation à l’environnement.
Projet en lien avec la thèse d’Alicia Pasquet-Forster « Expériences Sensibles du Milieu
Marin : Nouvelles Perspectives Interdisciplinaires et Artistiques pour la Conservation
des Océans » (Financement ANR, rattachement UMR TELEMMe, AMU).
Le stage est financé par l’Institut OCEAN d’Aix-Marseille Université.

Références :
Binding, S., Farmer, H., Krusin, L., & Cronin, K. (2020). Status of animal welfare
research in zoos and aquariums: Where are we, where to next? Journal of Zoo
and Aquarium Research, 8(3), 166–174. https://doi.org/10.19227/jzar.v8i3.505
D’Cruze, N., Khan, S., Carder, G., Megson, D., Coulthard, E., Norrey, J., & Groves, G.
(2019). A Global Review of Animal–Visitor Interactions in Modern Zoos and
Aquariums and Their Implications for Wild Animal Welfare. Animals, 9(6), 332.
https://doi.org/10.3390/ani9060332
Ernst, J. (2018). Zoos’ and Aquariums’ Impact and Influence on Connecting Families
to Nature: An Evaluation of the Nature Play Begins at Your Zoo & Aquarium
Program. Visitor Studies, 21(2), 232–259.
https://doi.org/10.1080/10645578.2018.1554094
Lumber, R., Richardson, M., & Sheffield, D. (2017). Beyond knowing nature: Contact,
emotion, compassion, meaning, and beauty are pathways to nature
connection. PLOS ONE, 12(5), e0177186.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0177186
Routman, E. O., Khalil, K., Wesley Schultz, P., & Keith, R. M. (2022). Beyond
inspiration: Translating zoo and aquarium experiences into conservation
behavior. Zoo Biology, 41(5), 398–408. https://doi.org/10.1002/zoo.21716
UICN CSE. 2023. Prise de position sur le rôle des jardins botaniques, aquariums et
zoos dans la conservation des espèces. Commission pour la Sauvegarde des
Espèces (CSE) de l’IUCN, Gland, Suisse. 8 pp.
ACTIVITES CONFIEES
- A l’aide de la grille d’évaluation développée par l’aquarium de Lyon : évaluation du bien-être
des poissons sur les domaines physiques/fonctionnels et mentaux. L’évaluation est réalisée à
l’aide d’observation d’indicateurs comportementaux, fonctionnels et physiologiques.
- Participer au développement de l’outil et proposer des recommandations pour
améliorer/compléter la grille existante, notamment sur les aspects du bien-être mental basé sur
des critères comportementaux.
- Analyser les résultats obtenus et émettre des conclusions sur le statut de bien-être des
individus étudiés.
- En parallèle : médiation auprès des visiteurs. Communication sur la démarche mise en place
par l’aquarium, évaluation des attentes et de la perception par les visiteurs. Cette partie pourra
être réalisée par des entretiens, ou des échanges informels avec les visiteurs.
- Proposer à l’aquarium différents dispositifs de médiation axés sur le bien-être animal en
aquarium.
- Rédaction d’un rapport à destination de l’aquarium et de l’ensemble de la profession des
conservateurs d’aquariums détaillant :
les résultats de l’étude et les recommandations en matière de bien-être animal
(notamment sur le domaine mental)
les recommandations pour l’évaluation du bien-être mental des animaux aquatiques
captifs
les propositions de médiation pour accompagner la démarche de sensibilisation des
visiteurs au bien-être animal
Présentation d’un poster scientifique du projet de recherche et des résultats préliminaires lors
d’un évènement à venir en 2025 de l’Institut OCEAN qui se tiendra à Marseille.
COMPETENCES A ACQUERIR OU A DEVELOPPER
- Savoir évaluer le bien-être physique et mental d’animaux aquatiques captifs sur la base de
critères comportementaux, fonctionnels et physiologiques.
- Être capable d’émettre des recommandations en matière de bien-être animal
- Savoir communiquer auprès du public (adulte et enfant)
- Collaborer et s’adapter à différents publics (conservateurs, chercheurs, soigneurs,
médiateurs, grand public, etc.)
COMPETENCES REQUISES
• Connaissance du comportement des poissons
• Connaissance des méthodes d’observation et d’évaluation du bien-être des animaux
captifs
• Intérêt pour la conservation de la biodiversité marine
• Aisance relationnelle auprès du grand public et intérêt pour la médiation
• Capacité à collaborer et s’adapter à différents publics (conservateurs, chercheurs,
soigneurs, médiateurs, grand public, etc.)
• Rigueur et autonomie

Lead Animal Behavior Management

 

Here's is the link to apply directly: https://staff-emory.icims.com/jobs/138467/job

Description

The Behavioral Management Unit within the Emory National Primate Research Center at Emory University is currently seeking a full-time Lead Animal Behavioral Management Specialist (Social Housing focus) to join our team. Our work consists of the development, implementation, and evaluation of behavioral management techniques for our population of nonhuman primates. These techniques include behavioral assessments, environmental enrichment, social housing, and animal training to address behavioral and welfare needs. Our work is science based, and our goal is to improve captive primate welfare and support essential biomedical science. We share our research findings with the scientific community via publications, presentations, webinars, and workshops.

 

The ideal candidate should be experienced with macaque pair housing and social behavior, proficient in database entry and record keeping, motivated, dependable, detail-oriented, have a positive attitude and passion for animals and research. The Lead Animal Behavioral Management (Social Housing Specialist) will assist in determining potential nonhuman primate social partners, complete social introductions and reintroductions, and assess new and established pairs. This position entails data entry, compilation and analysis as well as producing data summaries, charts, and graphs. The position is responsible for maintaining social housing equipment inventory. The position requires use of independent judgment in applying or adapting empirical approaches to social housing and behavioral management techniques and may assist in research protocol design. The position requires reading published literature on social housing and applying that to our program. This position demonstrates and trains others in proper behavioral management and social housing techniques and the use of relevant equipment. The candidate needs to be a team player who is willing to learn on the job and collaborate with colleagues within and outside of the Behavioral Management Unit. The Animal Behavioral Management, Lead will work to ensure the highest quality of animal welfare and behavioral management implementation and support, and will have excellent communication skills with co-workers, the management team, animal care, veterinary medicine, research staff, students, and other support services.

Collaborate. Innovate. Serve. These three simple words capture what we do at EPC to help advance science and improve the health and well-being of humans and non-human primates. If you are someone with non-human primate experience who is familiar with direct application and assessment of behavioral management techniques such as behavioral observations, enrichment, social housing, and animal training this is an amazing opportunity to indirectly save and change lives and make a positive impact in the science and research community by enhancing animal welfare. 

 

Dedicated to discovering causes, preventions, treatments, and cures of disease, Emory National Primate Research Center (EPC) is improving human and animal health and lives worldwide. One of seven NPRCs funded by the NIH, EPC conducts studies that make breakthrough discoveries possible. Learn more at http://enprc.emory.edu

KEY RESPONSIBILITIES:

• Participates in an integrated program of animal care and environmental enrichment with enrichment, animal care, and veterinary staff members.
• Positions within the Emory National Primate Research Center will be working with nonhuman primates, while employees in the School of Medicine Division of Animal Resources will be working with other laboratory animals, such as pigs and ferrets.
• Responsible for ordering supplies needed for enrichment program.
• Organizes and performs technical duties, such as the preparation, maintenance and distribution of enrichment materials, devices, and equipment.
• Oversees and performs assembly, repair, and distribution of foraging devices, puzzles, and other objects for animals to eat, manipulate and explore.
• Maintains inventory of supplies.
• Designs, develops, and tests enrichment techniques, new ideas for enhancing captive environments, and interventions in terms of practicality, use by animals, and efficacy for improving behavior.
• Determines potential social partners, completes social introductions, monitors progress, and makes decisions about outcomes of introductions for social species.
• Monitors social interactions of group-living animals.
• Designs, develops, and implements specific animal training procedures that employ behavioral modification techniques.
• Identifies animals that need specialized therapy for observed behavioral problems.
• Coordinates documentation of enrichment procedures and generates written and numeric progress reports on the behavioral management program.
• Assists in conducting behavioral research that evaluates environmental enrichment.
• Collects observational data for enrichment studies.
• Assists in planning and scheduling research procedures.
• Records results of studies, compiles, and analyzes data, and prepares charts and graphs.
• Uses independent judgment in applying or adapting scientific techniques.
• May assist in research protocol design.
• Demonstrates and trains others in proper research techniques and use of equipment.
• Troubleshoots and performs routine repair and maintenance of equipment.
• Reviews literature for related research developments and techniques and compiles findings.
• Indoor and outdoor work environment, exposure to biohazards and potentially dangerous animals.
• Employees in this classification may be required to work with, take specific precautions against and/or be immunized against potentially hazardous agents.

MINIMUM QUALIFICATIONS:

• Bachelor's degree in relevant field such as Biology, Psychology, Zoology, Anthropology, Wildlife Management, or equivalent combination of experience, education, and training.
• At least two years' experience in enrichment and/or behavioral research.
• Strong oral and written communication skills.
• Ability to work independently as well as in collaboration with a wide variety of personnel.
• Excellent time management and organizational skills.
• Must gain or attempt to gain LAT Certification through AALAS within one year of beginning this position.
• The ability to lift up to 45 pounds.

PREFERRED/DESIRED QUALIFICATIONS:

• Experience with pair housing and understanding of macaque social behavior.
• Excellent interpersonal and written and verbal communication skills.
• Proficient in Microsoft Excel.
• Ability to multitask.
• Attention to detail.
• The ability to lift up to 50 lbs.

WORKING ENVIRONMENT:

• Work environment both seated at desk/computer and standing inside animal areas.
• Work environment around biohazardous blood and tissues although this is not typical.
• Work environment involves some exposure to hazards or physical risks, which require following basic safety precautions.
• Indoor and outdoor work environment, exposure to biohazards and potentially dangerous animals.
• Requires the ability to bend, kneel, and/or squat.

PRE-EMPLOYMENT SCREENING STATEMENT:

The Emory National Primate Research Centre (EPC), in conjunction with Emory University, conducts pre-employment screenings for all positions. These screenings may include an Information Network Associates (INA) and criminal background check, and verification of work history, academic credentials, licenses, and certifications. In addition, the process may include a drug screening with health assessment, and review and mandate for various vaccinations. Updated COVID-19 vaccinations may be necessary for specific research projects. 

 

NOTE: Position tasks are generally required to be performed in-person at an Emory University location.  Remote work from home day options may be granted at department discretion. Emory reserves the right to change remote work status with notice to employee.

Emory Supports a Diverse and Inclusive Culture

Emory University is dedicated to providing equal opportunities and equal access to all individuals regardless of race, color, religion, ethnic or national origin, gender, genetic information, age, disability, sexual orientation, gender identity, gender expression, and veteran's status. Emory University does not discriminate in admissions, educational programs, or employment on the basis of any factor stated above or prohibited under applicable law. Students, faculty, and staff are assured of participation in University programs and in the use of facilities without such discrimination. Emory University complies with Executive Order 11246, as amended, Section 503 of the Rehabilitation Act of 1973, the Vietnam Era Veteran's Readjustment Assistance Act, and applicable executive orders, federal and state regulations regarding nondiscrimination, equal opportunity and affirmative action. Emory University is committed to achieving a diverse workforce through application of its affirmative action, equal opportunity and nondiscrimination policy in all aspects of employment including recruitment, hiring, promotions, transfers, discipline, terminations, wage and salary administration, benefits, and training. Inquiries regarding this policy should be directed to the Emory University Department of Equity and Inclusion, 201 Dowman Drive, Administration Building, Atlanta, GA 30322.

Emory University is committed to providing reasonable accommodations to qualified individuals with disabilities upon request. To request this document in an alternate format or to request a reasonable accommodation, please contact the Department of Accessibility Services at 404-727-9877 (V) | 404-712-2049 (TDD). Please note that one week advance notice is preferred.

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Offres de stage

 

1. A l’ONF

 

Offre de Stage - M2

L’Office National des Forêts (ONF) est à la recherche d’un(e) stagiaire pour une étude des impacts et des stratégies de gestion des ongulés féraux de la Martinique.

Ce stage de 6 mois débutera à partir de fin février / début mars 2025 et s’intéressera aux populations de chèvres et cochons féraux présentes sur les volcans et pitons de la Martinique, classés depuis 2023 au Patrimoine Mondial de l’UNESCO, et suspectées de dégrader fortement la qualité du sous-bois et de limiter la régénération de la forêt par le surpâturage.

 Localisation : Fort-de-France, Martinique
 Date limite de candidature : 10/12/2024

 Compétences recherchées :
- Écologie et suivi des populations animales
- Maîtrise des logiciels R et ArcGIS
- Autonomie et esprit d'équipe
- Aptitude au travail de terrain en conditions tropicales

 

 Missions clés :

• Mettre en place une estimation des impacts des ongulés ensauvagés sur les RBI à l'aide de systèmes enclos/exclos
• Déterminer les méthodes de lutte et de capture de ces espèces, et tester leur mise en œuvre sur le terrain

 

L'offre est à retrouver sur le site de l'ONF : https://recrutement.altays-progiciels.com/onf/fr/offres/stage-m2-etude-des-impacts-et-des-strategies-de-gestion-des-ongules-feraux-de-martinique-hf-2543002.html?NoSource=2

 

 

2. A l’OFB

 

Offre de Stage - M2

L’Office français de la biodiversité (OFB) est à la recherche d’un(e) stagiaire pour une étude sur la distribution et l'occupation de l'espace des ongulés en Martinique. Ce stage de 6 mois, débutant le 1er mars 2025, se penchera sur l'impact des chèvres et cochons féraux, soupçonnés de dégrader la qualité du sous-bois et de freiner la régénération forestière par le surpâturage, sur les pitons de Martinique, classés au Patrimoine Mondial de l'UNESCO.

 Localisation : Les Trois-Ilets, Martinique
 Date limite de candidature : 30/11/2024

 Compétences recherchées :
- Écologie et suivi des populations animales
- Maîtrise des logiciels R et QGIS
- Autonomie et esprit d'équipe
- Aptitude au travail de terrain en conditions tropicales

 Missions clés :

• Etudier la distribution et l'abondance des ongulés ensauvagés dans le cœur de bien UNESCO au moyen d'un suivi par pièges photographiques;
• Mettre en œuvre un suivi télémétrique sur ces espèces dans le but de modéliser leurs déplacements et habitats préférentiels.

Rejoignez-nous dans notre mission de préservation de la biodiversité !

Pour plus de détails et pour postuler, consultez l'annonce complète ici : https://ofb.gestmax.fr/2874/1/stage-m2-etude-de-la-distribution-et-de-l-occupation-de-l-espace-des-ongules-martinique-h-f

 

Postdoctoral Scientist position

 

The Dian Fossey Gorilla Fund seeks to recruit a full-time Postdoctoral Scientist to support an NIH-funded international collaborative project on “Great apes and the evolutionary origins of long life: the influences of early life adversity on lifespan and individual frailty in wild chimpanzees and gorillas” (https://reporter.nih.gov/project-details/10936791).  The overarching goal of this project is to examine how variation in prevalence of and resilience to early life adversity shapes the capacity to achieve long life spans in diverse environments, focusing on human’s closest living relatives. The project leverages detailed life course data (including behavior, demography, ecology and physiology) from three of the most extensively studied populations of wild African great apes, which show differences in behavior, ecology and life span: Virunga mountain gorillas studied by the Fossey Fund’s Karisoke Research Center in Rwanda, and eastern chimpanzees studied by the Gombe Stream Research Center in Tanzania and the Kibale Chimpanzee Project in Uganda. 

 

The Postdoctoral Scientist will join a productive and highly collaborative team of international and interdisciplinary researchers representing all three great ape study sites.  Specifically, this position will support analyses of physiological biomarkers and their integration with other life course datasets.  In the first year of the position, the ideal Candidate will spend time based at the University of Michigan in the U.S.A. and at the Fossey Fund’s Ellen DeGeneres Campus in Rwanda, and would work with Principal Investigators to lead validation and analyses of physiological biomarkers (e.g., measures of stress, inflammation, oxidative stress) from wild mountain gorillas. In subsequent years, more time would be spent engaged in research, data analysis and other activities based in Rwanda. Depending on the applicant’s skill set and interest, we also anticipate opportunities to participate in comparative analyses across study sites in subsequent years.

 

The ideal start date for this position is January-February 2025, with flexibility, and it is anticipated to last for up to three years subject to annual renewal of funds.  To apply, please send an email to Dr. Shannon McFarlin (smcfarlin@gorillafund.org), including a cover letter, CV, and contact information for three references. Applications will be accepted on a rolling basis, but applicants are encouraged to submit their materials by December 15, 2024 for full consideration.

 

Minimum Qualifications:

• Completed PhD in biology, zoology, evolutionary anthropology or a related field, or anticipated PhD degree completion within six months of the start date.
• Strong skills in statistical analysis, including coding in R.
• Strong written and verbal communication skills.
• Strong organizational, project management, and record-keeping skills.
• Strong collaborative skills, and/or experience working as part of a diverse, multicultural and/or international team.
• Ability to travel, including extended periods based in Rwanda.

 

Desired Qualifications: 

The following experience would be advantageous; candidates with one or more of these qualifications are especially encouraged to apply.

• Experience in quantification and analysis of physiological datasets from vertebrate animal populations (e.g., for characterization of stress physiology or other hormone biomarkers, physiological indicators of immune function, physiology of aging), especially experience with enzyme immunoassays (ELISA).
• Experience in the analysis of detailed longitudinal databases generated from vertebrate animal populations.
• Expertise in the behavioral ecology and/or physiology of social mammals (primates or other taxonomic groups).
• Demonstrated record of peer-review publication.

 

The Dian Fossey Gorilla Fund provides equal employment opportunities to all employees and applicants for employment and prohibits discrimination and harassment of any type without regard to race, color, religion, age, sex, national origin, disability status, genetics, protected veteran status, sexual orientation, gender identity or expression, or any other characteristic protected by federal, state or local laws.

Research Assistant

 The Behavioral Services Unit at the Oregon National Primate Research Center is seeking a Research Assistant to collect behavioral data on groups of captive rhesus macaques for a study on social connectedness and health. Some positive reinforcement training will also be involved. This is a full-time position with funding for 1-2 years. Prior experience with non-human primates preferred but not required.

For more details and to apply: https://externalcareers-ohsu.icims.com/jobs/32244/research-assistant-2/job?hub=6&_gl=1*rzj0s7*_ga*MTM1ODE2NDgxMC4xNzMwMTMwMTQ4*_ga_5Y2BYGL910*MTczMTk2OTQxMi43LjEuMTczMTk2OTQ0NC4yOC4wLjA.&mobile=false&width=1252&height=500&bga=true&needsRedirect=false&jan1offset=-480&jun1offset=-420

Contact Dr. Kris Coleman (colemank@ohsu.edu) with any questions.

offre de stage

 NOTRE AMBITION
A l’interface entre la recherche fondamentale et le terrain, l’Itavi apporte aux professionnels des filières
avicole, cunicole et piscicole des expertises et des outils pour anticiper et s’adapter aux évolutions
structurelles.
Itavi oriente ses activités techniques en vue de répondre aux objectifs suivants :
o Evaluer et promouvoir les innovations technologiques ;
o Maîtriser la qualité des produits ;
o Apporter des références et réaliser des expertises ;
o Explorer de nouveaux systèmes de production ;
o Anticiper les évolutions structurelles.
Pour mener à bien nos missions, ce ne sont pas moins de 30 experts à l’écoute des problématiques
rencontrés par les professionnels de l’élevage intervenant sur 9 thématiques :
 Economie
 Alimentation et Techniques d’élevage
 Bâtiment et Energie
 Bien-être animal
 Santé Hygiène
 Environnement
 Qualité des produits
 Elevage de précision
 Durabilité
TRANSMETTRE NOS SAVOIRS
Vous préparez un diplôme agri/agro ou un master (bac + 5), voir un niveau inférieur et vous avez envie
de découvrir un univers scientifique passionnant, riche en challenges et en opportunités ? Nous vous
offrons l’opportunité de réaliser votre stage à l’Itavi en vue d’accompagner nos experts dans leur
mission et de vous enrichir d’une expérience au plus près de l’innovation scientifique.
Evaluation du bien-être des poissons : Validation des indicateurs et de
l’applicabilité d’un outil dédié aux fermes truiticoles
Contact
Merci d’adresser un CV et une lettre de motivation à :
Joanna Litt, Responsable thématique bien-être animal – Contact : 06 46 15 72 38, litt@itavi.asso.fr,
Aurélien Tocqueville, Responsable du service pisciculture – Contact : 06 07 03 51 91,
tocqueville@itavi.asso.fr,
Domaine : pisciculture, bien-être animal, évaluation multicritère
Contexte et objectif du projet dans lequel s’inscrit le stage
La prise en compte et l’amélioration du bien-être animal sont devenues centrales ces dernières années
pour les filières de production animale, y compris les poissons d’élevage. Conscients de cet enjeu, l’ITAVI
et la filière piscicole se sont engagés dans une démarche de progrès visant à améliorer les conditions de
vie des animaux en fournissant aux pisciculteurs un outil scientifiquement validé pour objectiver le bien-
être des truites en élevage. C’est dans cette optique qu’a été développée une première version de l’outil
EBENE®, constituant une première avancée significative pour l’amélioration des pratiques d’élevage
dans cette filière.
Cet outil, développé par ailleurs pour les volailles de chair, les poules pondeuses, les palmipèdes gras et
les lapins, repose sur cadre générique structuré et couvrant l’ensemble des principes et critères de bien-
être animal. Il permet à un observateur formé d’évaluer de façon rapide, simple et instantanée le bien-
être des truites directement en élevage, en collectant un ensemble d’indicateurs sanitaires et
comportementaux.
En vue de finaliser l’outil et de le déployer sur le terrain, une dernière étape reste à conduire visant à
s’assurer de la bonne applicabilité de la méthode en conditions terrain réelles et à vérifier certaines
qualités des indicateurs sur un échantillon de fermes. C’est le travail que nous proposons de réaliser dans
le cadre de ce stage.
Objectif du stage et missions :
Le stage proposé vise :
1. à s’assurer de la bonne applicabilité de la méthode en conditions terrain réelles
2. à vérifier certaines qualités des indicateurs sur un échantillon de fermes, telles que leur fiabilité
(importance de l’écart entre des mesures réalisées par deux observateurs réalisant une même
évaluation ou entre deux évaluations successives réalisées par un même observateur), leur
sensibilité (capacité à détecter des écarts signifiants entre systèmes de production), et leur
redondance (relations d’interdépendance entre indicateurs)
3. à proposer le cas échéant des améliorations à l’outil.
Il s’inscrit dans un objectif plus large de progrès et d’accompagnement au changement dans la filière
piscicole.
Pour ce faire, le ou la stagiaire aura pour missions :
- de constituer avec l’aide de ses encadrants un échantillon d’élevages à suivre et de planifier les
visites à réaliser en contactant les éleveurs et en préparant les équipements nécessaires en
amont des visites. Certaines visites nécessiteront l’appui d’un second observateur avec qui il
faudra se coordonner.
- de collecter, saisir et enregistrer les données recueillies lors des visites en suivant
scrupuleusement le protocole pré-défini.
- d’analyser les données en vue d’évaluer les qualités des différents indicateurs
- de proposer des ajustements à réaliser en fonction des résultats obtenus.
Une restitution des résultats auprès d’un public plus large composé des partenaires et d’acteurs du
projet sera organisée en fin de stage. Ce travail contribuera à finaliser l’outil et à préparer son
déploiement opérationnel sur le terrain.
Profil :
 Formation : Bac+5 agro/agri ou Master*
*Le stage pourrait être ouvert à un niveau d’études inférieur très motivé (ex BTS Aquacole) ou réduit à
une période plus courte (minimum 4 mois) selon profil. Le cas échéant une délégation d’une partie de
l’analyse de données vers du personnel interne ou externe à l’ITAVI serait envisagée.
 Compétences : Capacités relationnelles et sens de l’observation, rigueur, organisation et
autonomie. Facilité de travail en équipe. Goût pour le milieu piscicole et le bien-être animal –
une expérience ou de bonnes connaissances en pisciculture et en particulier en élevage de
truites est un plus. Goût pour les déplacements fréquents.
 Autre : le stage implique des déplacements nécessitant d’être véhiculé (frais pris en charge)
Conditions proposées :
Stage de 6 mois* sur le premier semestre 2025, co-encadré par le service Bien-être animal et le
service Pisciculture de l’ITAVI
Poste basé préférentiellement dans les locaux de l’ITAVI à Haut-Mauco, sur le site de l’Agrocampus
(40280)
Indemnités prises en charge :
 Gratification : 659,76 €/mois (conforme à la réglementation) + 50€ d’indemnité de double
résidence (si éloignement > 50 km)
 Forfait repas journalier : 5,2 €/repas
 Ordinateur portable fourni
 Frais de transport domicile/travail selon réglementation en vigueur
 Frais de déplacements remboursés selon les barèmes de l’ITAVI
 1 journée de télétravail autorisé par semaine.
Vous souhaitez en savoir plus sur les activités de l’Itavi ? Retrouvez-nous sur www.itavi.asso.fr

Itavi, expert des filières avicole, cunicole et piscicole

offre de stage

 Project title: Grouping together during hot weather? A study of the collective behaviour of aggregation in sheep.
This call is supported by the #DigitAg consortium within the scope of the French National
Research Agency under the Investments for the Future Program, referred to as
ANR-16-CONV-0004.
In grazing livestock farming systems, sheep express a unique collective behaviour of
aggregation linked with environmental heat. During the expression of this behaviour, which
can last several hours in the event of prolonged heat, individuals no longer ingest. The
collective dynamics associated with the expression of this behaviour, their links with
environmental temperature and the individual or collective fitness associated with the
expression of this behaviour are poorly determined. However, this behaviour well known by
shepherds can be a hindrance to the herd's performance and as well as an issue for the
management of animal welfare. The global evolution of climate and the multiplication of heat
waves in the Mediterranean area accentuate the need to study this behaviour in order to
understand it and propose ways of managing the grazing environment.
During this project, using digital tools, we will focus on the characterisation of (i) the
collective dynamics of grouping (using embedded devices, video recordings and direct visual
observations) and (ii) the local climatic conditions (temperature, humidity and solar radiation
sensors). This monitoring will be carried out in different groups of ewes (2 to 10 individuals)
at the Domaine du Merle (Institut Agro Montpellier, Salon-de-Provence). This monitoring
will be completed by behavioural data, in particular the monitoring of the physiological
parameters responsive to heat stress.
Key-words: Collective behaviour, aggregation, heat stress, animal welfare, embedded sensors
Field site: Domaine du Merle, 13300 Salon de Provence, South of France
Period of work : February/March to August/September 2025
Salary: The candidate will receive a grant of around 614 €/month. Travel and stay expenses
in the field will be paid by the project. Candidates will have to assume their living expenses.
We encourage students to find additional support from their university, or from other
institutions.
Qualification and Skills of candidates: A person with background in ethology / animal
behavior (level of master is preferred) wishing to learn about the digital monitoring of animal
behaviour both in terms of tools and methods or, conversely, a person with an
electronics/computer science/data analyst background wishing to apply their skills to the field
of animal behaviour.
The candidate will have to work in a farm station, to follow a formation with sheepherders to
manage sheep in the barn and in the field. The candidate will be also in charge of the care of
sheep involved in the experiments, which requires strong commitment during the whole week
including week-ends and close collaboration with the staff of the field station. The candidate
will thus be involved in physical activities linked to the management of adult sheep, will
work in the field under relatively hot Mediterranean climate and at dawn and possibly sunset.
The work in the field will be done in close collaboration with another student and possibly
professionals during short stay field periods. Thus, the job requires the capacity to work in a
team.
While French speaking is not mandatory, it will be an advantage in the field station.
People interested will have to contact:
Jean-Baptiste MENASSOL
jean-baptiste.menassol@supagro.fr
https://umr-selmet.cirad.fr/en/l-unite/pages-agents/jean-baptiste-menassol
Richard BON
richard.bon@univ-tlse3.fr
https://cbi-toulouse.fr/eng/page-personnelle-30

Stanford University - Job Posting

 

Stanford University is seeking a Veterinarian 1 to administer appropriate veterinary care to all animals in the Stanford research colonies, and make critical health care decisions in a wide variety of situations. This veterinarian will support the research program of a laboratory aimed at the creation and deployment of a highly novel, large-scale neural interface for direct communication with the brain.

The position has three main functions:

• Provide veterinary oversight of the lab’s animals, leading an enrichment and behavioral training program, and research management.
• Provide veterinary guidance and care where/when needed for a range of large and small animal species and work collaboratively with Stanford’s Animal Care Unit.
• Ensure compliance with all federal, state, institutional protocols, and voluntary animal welfare laws and regulations, help to develop standard operating procedures for veterinary care and study implementation, help research staff design and implement in vivo studies, train and oversee lab members on animal training, veterinary care, surgical procedures, lab SOPs, and animal use laws and regulations.

Duties include:

Perform veterinary care physical exams, diagnostic work-ups, medical treatment, surgical and non-surgical research procedures, and/or euthanasia, for all species found in the research colony populations.

Ensure accuracy of research and clinical records in compliance with state and federal regulations.

Provide expert care in the areas of preoperative, intraoperative and postoperative care of research animals.

Develop and manage IACUC protocols with the PI. Assist with preparing and submitting the lab’s animal use procedures for the Administrative Panel on Laboratory Animal Care review and coordinate the monitoring the lab’s approved research projects with the Administrative Panel on Laboratory Animal Care.

Provide assessments of animals prior to intrastate, interstate, and international shipments, including physical examination, review of colony history, and pertinent diagnostic tests.
Supervise other workers, as assigned.
Manage direct reports in the laboratory and oversee all vivarium operations
Serve as a liaison between the lab and the Veterinary Service Center (VSC) to facilitate research activities and ensure animal welfare
Ensure proper anesthesia and pain management for all procedures and postoperative care
Complete pre-op exams, post-op care, and administer controlled substances
Manage surgical sterile preparation, surgical inventory and OR operations
Provide medical and behavioral health monitoring of lab’s animals and oversight of housing
Provide on-call services as assigned
Administer clinical treatments as directed
Ensure compliance with all federal, state, institutional protocols, and voluntary animal welfare laws and regulations
Maintain accurate documentation and medical records in accordance with lab requirements, institutional requirements, and regulatory bodies
Develop and review SOPs to reflect current and best practices and verify training in lab staff.
Develop and manage the lab’s animal training program to achieve voluntary data collection using positive reinforcement

Develop, manage and help implement the lab’s enrichment program

Assist in the design and implementation of in vivo studies
Complete reports as required for research studies

May perform tasks associated with other teams including, but not limited to, animal care or surgery under supervision of someone trained in those areas

* - Other duties may also be assigned

The expected pay range for this position is $160,953 to $197,563 per annum.

Interested applicants please apply directly at: Veterinarian 1 - Stanford University Careers

Stanford University provides pay ranges representing its good faith estimate of what the university reasonably expects to pay for a position. The pay offered to a selected candidate will be determined based on factors such as (but not limited to) the scope and responsibilities of the position, the qualifications of the selected candidate, departmental budget availability, internal equity, geographic location and external market pay for comparable jobs.

At Stanford University, base pay represents only one aspect of the comprehensive rewards package. The Cardinal at Work website (https://cardinalatwork.stanford.edu/benefits-rewards) provides detailed information on Stanford’s extensive range of benefits and rewards offered to employees. Specifics about the rewards package for this position may be discussed during the hiring process.

Consistent with its obligations under the law, the University will provide reasonable accommodations to applicants and employees with disabilities. Applicants requiring a reasonable accommodation for any part of the application or hiring process should contact Stanford University Human Resources at stanfordelr@stanford.edu. For all other inquiries, please submit a contact form.

Stanford is an equal employment opportunity and affirmative action employer. All qualified applicants will receive consideration for employment without regard to race, color, religion, sex, sexual orientation, gender identity, national origin, disability, protected veteran status, or any other characteristic protected by law.

PhD

 

PhD Opportunity, fully funded by the NERC GW4+ Doctoral Training Partnership

From cognition to conservation: using cognitive and behavioural research to enhance red-billed chough reintroductions.

Entry Ref: 5400

September 2025 start

Supervisors

Alex Thornton, University of Exeter, Centre for Ecology and Conservation

Rachel Miller, University of Cambridge, Department of Psychology

Malcolm Nicoll, Institute of Zoology

Elizabeth Corry, Wildwood Trust

Malcolm Burgess, University of Exeter, Centre for Research in Animal Behaviour

We are looking for a highly motivated, talented student with broad interests in animal behaviour, cognition and conservation. The project will be based at the University of Exeter’s Penryn Campus in beautiful Cornwall. 

Full details of the project and how to apply are here: https://www.exeter.ac.uk/study/funding/award/?id=5400

If you have any questions about the project, please write to alex.thornton@exeter.ac.uk

 

Project summary:

As cognition shapes animals’ responses to changing environments, cognitive research is increasingly recognised as a key component of conservation. This PhD project aims to use behavioural and cognitive principles to enhance reintroduction attempts of Britain’s most endangered corvid, the red-billed chough, Pyrrhocorax pyrrhocorax.   

Working with an interdisciplinary supervisory team of cognitive biologists and conservationists (including Paradise Park and CASE partners Wildwood Trust, coordinators of the chough reintroduction scheme in Kent), the project will incorporate controlled experiments, behavioural observations and population monitoring on up to 80 captive and released choughs in Kent and Cornwall.  

Specific research directions are flexible, but broadly, we aim to (1) quantify individual variation in cognitive abilities likely to impact adaptability and survival (e.g. self-control, innovation, social learning, exploration) and (2) relate this to fitness-relevant measures like body condition, stress responses and reproductive success in captivity and the wild. We will then (3) use findings to (a) establish real-world consequences of cognitive performance on behaviour, survival and reproductive success post-release (b) inform release decisions, (c) develop targeted pre-release training and d) expand release protocols. Each objective will be co-developed with the student, with extensive opportunities for you to shape project development according to your interests and the accumulating evidence.

PhD available in the impact of the UK gamebird industry

 

Project Description

Summary

This project will merge social and natural science methods to explore and analyse current antimicrobial use in the UK gamebird industry and its impact on antimicrobial resistance (AMR).

Case award E4 DTP

Pheasant hens sharing feeder with wild birds

Project background

Antimicrobial resistance (AMR) is recognized as a critical threat to One Health. Our understanding of antimicrobial use in UK released gamebird species, and the consequences of this, remains limited. The Game & Wildlife Conservation Trust (GWCT) estimates around 30-35 million pheasants and 10-12 million red-legged partridges are released annually for shooting in the UK. The ecological consequences of this practice are currently being discussed in relation to possible licencing and limits on releasing.   

Preliminary studies indicate that resistance to β-Lactams and multi-drug resistant members of the Campylobacter genus are prevalent among UK gamebirds. Pheasants and partridges are raised in rearing facilities where they are sometimes provided with antimicrobials through their food or water, which could contribute to the development of resistance. As gamebirds are released into the wild, there is a risk of transmitting resistant bacteria into the broader ecosystem. Also, anecdotal evidence indicates that gamebirds are sometimes given food supplemented with anti-microbials on shooting estates. This practice can attract other wild species that may come into contact with contaminated bird faeces.  

This project will lead to an understanding of antimicrobial use and the prevalence of AMR in the gamebird industry. This will allow the development of strategies to mitigate the industry’s impact on AMR in released gamebirds and potentially on the wider ecosystem. Using an interdisciplinary approach, we aim to explore the factors driving antimicrobial use, assess its biological impact on birds, and identify effective methods for communicating these findings to industry stakeholders. This will enable stakeholders to make more informed decisions and reduce the potential for AMR development. 

Research questions

• What is the current rational for antimicrobial use in gamebirds and what factors determine specific drug use?
• To what extent is the gamebird industry aware of antimicrobial resistance resulting from prophylactic antimicrobial use?
• How prevalent is AMR in the microbiota of released UK gamebirds?
• How do different antimicrobial practices affect resistance levels in the gamebird microbiota?
• What is the most effective method for communicating the impact of antimicrobial use to stakeholders in the gamebird industry?

Methodology

This interdisciplinary project will be conducted in collaboration with The GWCT. In the first year of the studentship, a survey will be conducted to characterise the use of antimicrobials in pheasants and partridges in both rearing facilities and shooting estates. This survey will include a knowledge, attitudes and practices (KAP) component which will allow the student to explore the drivers for different forms of antimicrobial usage. The entire survey and specifically the KAP questions will be designed in close collaboration with The GWCT to ensure questions are appropriately worded to generate meaningful data without participants feeling interrogated regarding their practices. This survey will quantify current husbandry techniques, AMR knowledge and prevention practices amongst industry stakeholders, and the motivations behind stakeholder interest in AMR avoidance measures. 

Based on the results from the survey, the student will design an appropriate sampling protocol for partridges and pheasants during both rearing and release on a sub-sample of the shoots that have been surveyed. Prevalence of AMR genes during rearing, in release pens, after release and during shooting will be assessed. Samples will be taken from birds that have either been submitted for veterinary post-mortem examination or from birds shot during the shooting season. Faecal and caecal pellet samples will also be taken from live birds. Microbial DNA will be extracted from gastrointestinal and respiratory samples, and qPCR will be used to determine the abundance of antimicrobial resistance genes. A subset of samples will undergo metagenomic sequencing, and antimicrobial resistance genes and other virulence genes will be identified. The presence and abundance of AMR and antimicrobial residues will be correlated with the previously surveyed antimicrobial usage practises.   

A co-creation workshop with survey respondents will be arranged to firstly share findings of the research and to explore effective methods for communicating such findings to game industry stakeholders more widely i.e., shooting estates, game rearing facility owners, vets, young game keepers etc. The student will analyse qualitative transcripts from this workshop and create a pilot draft of AMR communication materials. These pilot materials will be pre-tested with a sub-set of workshop and survey participants and reviewed by The GWCT stakeholders. Final feedback will allow the student to generate recommendations for future AMR communications in this sector     

Year 1: Literature review and knowledge, attitudes and practices (KAP) survey of antimicrobial usage in the gamebird industry, understanding of issue, what drives usage practices, and of other relevant husbandry practices. Initiation of AMR prevalence survey.   
Year 2: Continuation of prevalence survey. Engagement activity (ie: focus group/workshop) to feedback and discuss KAP survey findings. Characterisation of antimicrobial resistance profiles from gut and respiratory samples (metagenomics and qPCR).  
Year 3: Continue bioinformatic analysis of metagenomic data. Feedback current results in co-creation workshop. Develop and pre-test pilot materials for feeding back scientific findings to game industry stakeholders. Produce final recommendations for communication on AMR within the gamebird sector. 

Training

A comprehensive training programme will be provided comprising both specialist scientific training and generic transferable and professional skills. This is a highly interdisciplinary project, enabling the student to acquire skills in both social and natural sciences. Natural science skills will include qPCR, metagenomics, and bioinformatic analysis. Social science skills will include survey design, workshop/focus group design and facilitation, and the analysis and synthesis of qualitative data. The student will also acquire a variety of transferable skills, including data management; effective communication with experts and non-experts in the field; and scientific writing. 

Requirements

Evidence of critical thinking, the ability to carry out high-quality research, and the ability to understand the wider outcomes of research. The successful candidate will have an interest in AMR and its management. As this is an inter-disciplinary project, we do not expect students to have previous experience of all of the disciplines involved.

References

Aebischer, N.J. "Fifty-year trends in hunting bags of birds and mammals and calibrated estimation of national bag size using GWCT’s National Gamebag Census".  European Journal of Wildlife Research, 65 (2019).

Arnold, K.E. et al. "‘Disperse abroad in the land’: the role of wildlife in the dissemination of antimicrobial resistance." Biology Letters, 12 (2016).

Bain, C. et al. "β‐Lactam resistance genes present in UK pheasants and red‐legged partridges." Veterinary Record 192.5 (2023)

Madden, J.R. "How many gamebirds are released in the UK each year?" European Journal of Wildlife Research, 67, (2021).

Sage R.B. et al. "Summary review and synthesis: effects on habitats and wildlife of the release and management of pheasants and red-legged partridges on UK lowland shoots." Wildlife Biology, 2020 (2020).

Seguino, A. et al. "Campylobacter spp. carriage in wild game pheasants (Phasianus colchicus) in Scotland and its relevance to public health." Game meat hygiene. Wageningen Academic, 2017: 83-99.

CASE partner: Game & Wildlife Conservation Trust - The GWCT

Supervisors

Laura Glendinning	RDSVS - The Roslin Institute	Laura.Glendinning@roslin.ed.ac.uk	www.ed.ac.uk/profile/laura-glendinning
Jess Mitchell	GAAFS	jmitch2@ed.ac.uk
Rufus Sage	Game & Wildlife Conservation Trust	rsage@gwct.org.uk	scholar.google.com/citations?user=VwvTTCMAAAAJ&hl=en

E4 supervisors are happy to hear from candidates who would wish to adapt the project to their own ideas and research background.

CASE studentship

This is a CASE project which benefits from the association of an external non-academic partner to provide additional expertise, access to data, labs and facilities (in some cases), a placement and enhanced research costs. CASE studentships are a great opportunity to apply research in real-world settings (e.g. industry, businesses, charities) and to open up to non-academic careers. See more information on CASE Studentships on our "How to apply" webpages.

To apply: https://e4-dtp.ed.ac.uk/how-to-apply/supervisor-led-projects/project?item=1674