jeudi 24 octobre 2013

Analyser des images de cerveau d’oiseau chanteur, Bio-Imaging Lab de l’Université d’Anvers, Belgique, Mars 2014


Short internship offer (March 2014) 

Magnetic Resonance Imaging (MRI) is a powerful technique that can provide detailed anatomical images of the whole brain. Recent developments have allowed small brains to be imaged and have led to the development of 3D atlases of the brain of different animal species. The intern will analyse images of the brain of a songbird. Songbirds are a good model to study brain plasticity, especially in relation to vocal learning. Starlings are highly social songbirds that are widely used in laboratory research. We therefore want to develop an MRI 3D atlas of the starling brain. We already acquired high-resolution images of a starling brain and we are now looking for someone to analyse these images. The objective will be to manually delineate the regions of interest involved in song perception, learning and production, using dedicated 3D analysis software (Amira). 

The intern will sign an agreement with Rennes 1 University (France) and will have to spend up to one month in the pioneering and leading lab in songbird brain imaging, the Bio-Imaging Lab of the University of Antwerp (Belgium), in March 2014. Travel from France to Belgium and accommodation expenses in Belgium will be covered. A good knowledge of neuroanatomy is necessary and knowledge of MRI would be appreciated. A good command of English is required. 

For more information, please contact isabelle.george [ chez ] univ-rennes1.fr and geert.degroof [ chez ] uantwerpen.be. 
To apply, please send a CV and a cover letter. 

Reading suggestions: 
Güntürkün, O., Verhoye, M., De Groof, G., Van der Linden, A., 2013. A 3-dimensional digital atlas of the ascending sensory and the descending motor systems in the pigeon brain. Brain Struct. Funct. 218, 269–281. 
Poirier, C., Vellema, M., Verhoye, M., Van Meir, V., Wild, J.M., Balthazart, J., Van Der Linden, A., 2008. A three-dimensional MRI atlas of the zebra finch brain in stereotaxic coordinates. Neuroimage 41, 1–6. 
 


Offre de stage court (Mars 2014) 

L’Imagerie par Résonance Magnétique (IRM) constitue un outil précieux pour réaliser des images anatomiques détaillées du cerveau entier. Les progrès récents de cette technique permettent d’imager des cerveaux de plus en plus petits. Cela a conduit au développement d’atlas du cerveau de plusieurs espèces animales. Dans ce stage, il s’agira d’analyser des images de cerveau d’oiseau chanteur. Les oiseaux chanteurs constituent un modèle privilégié pour étudier la plasticité cérébrale en lien avec l’apprentissage vocal. L’étourneau en particulier est un oiseau chanteur hautement social largement étudié en laboratoire. Dans ce cadre, nous souhaitons développer un atlas en 3 dimensions du cerveau d’étourneau à l’aide de l’IRM. Des images haute résolution du cerveau d’un étourneau ont déjà été acquises et nous cherchons un stagiaire pour analyser ces images. L’objectif du stage sera de segmenter manuellement les structures d’intérêt impliquées dans la perception, dans l’apprentissage et dans la production du chant à l’aide d’un logiciel d’analyse d’images spécifique (Amira). 

Le stagiaire aura une convention avec l’Université de Rennes 1 (France) et devra passer jusqu’à 1 mois au Bio-Imaging Lab de l’Université d’Anvers (Belgique), laboratoire pionnier et leader de l’imagerie par IRM chez les oiseaux chanteurs, en Mars 2014. Les frais de voyage entre la France et la Belgique et d’hébergement en Belgique seront pris en charge. Une bonne connaissance de la neuroanatomie est nécessaire et une connaissance de l’IRM serait appréciée. La maîtrise de l’anglais est indispensable. 

Pour plus d’information, contacter isabelle.george [ chez ] univ-rennes1.fr. 
Pour candidater, envoyer CV détaillé et lettre de motivation. 

A lire : 
Güntürkün, O., Verhoye, M., De Groof, G., Van der Linden, A., 2013. A 3-dimensional digital atlas of the ascending sensory and the descending motor systems in the pigeon brain. Brain Struct. Funct. 218, 269–281. 
Poirier, C., Vellema, M., Verhoye, M., Van Meir, V., Wild, J.M., Balthazart, J., Van Der Linden, A., 2008. A three-dimensional MRI atlas of the zebra finch brain in stereotaxic coordinates. Neuroimage 41, 1–6.