lundi 13 décembre 2021

Offre de stage 1er semestre 2022

 

PROPOSITION DE STAGE

Training proposal

 

 

Lieu de stage

Place of the training

Montpellier (et terrain en Afrique si la situation sanitaire le permet)

Sujet du stage

Title of the training

Analyse de la mobilité et de la sélection de l’habitat d’Hypsignathus monstrosus dans un paysage fragmenté de guinée forestière

 

Problématique

et

contexte du stage

 
Contents of the training

problematic and context

Hypsignathus monstrosus fait partie des espèces de chauves-souris africaines suspectées d’être réservoir du virus Ebola qui a causé 29 épidémies humaines depuis son identification en 1976. La plus importante épidémie de maladie à virus Ebola a débuté en Guinée en décembre 2013 et a conduit à plus de 20.000 cas humains pour plus de 10.000 décès. La circulation des filovirus chez les chauves-souris et leur rôle dans la propagation du virus restent cependant mal compris. Notamment, peu d’informations sont disponibles sur la mobilité de l’espèce et les habitats qu’elle occupe.

L’objectif principal du stage sera d’étudier la mobilité et l’utilisation des habitats d’un groupe de chauves-souris équipées de balises satellitaires. Trente balises GPS seront posées sur des Hypsignathus monstrosus en Guinée forestière sur le site de Palia, suivi par le projet Ebo-Sursy depuis 3 ans.

L’utilisation d’images satellites permettra de collecter des informations sur les habitats utilisés par les chauves-souris et de s’intéresser en particulier aux interfaces entre chauves-souris et humains dans les zones de culture.

Ces résultats permettront de mieux comprendre les interactions directes et indirectes entre humains et chauves-souris dans cette région.

 

Programme proposé

                     et

déroulement du stage

 

Program proposed and training schedule

-  Bibliographie, prise de connaissance des données déjà existantes, prparation des scripts d’analyse de données. Montpellier (2 mois)

- Capture et pose de balises satellites sur chauves-souris en Guinée (1 mois sous réserve de la situation sanitaire)

- Nettoyage des données de télémétrie sous R

- Segmentation du jeu de données en utilisant un modèle de Markov caché sous R

- Analyse de la sélection d’habitat de recheche alimentaire sous R

 

Durée et

date de début

Duration and starting date

 

1er semestre 2022 en fonction des dates de stage du master

 

Cadre institutionnel

          Host  Institution

Structure d'accueil (développer les sigles): CIRAD Montpellier,

Place of the training (write the names in  full):

 

 

Maître(s) de stage (nom et fonction):  Julien Cappelle (UMR ASTRE, CIRAD, Nicolas Courbin (CEFE, CNRS)

Training supervisor(s) (Name and function)  :

 

 

Signataire de la Convention de stage (Nom et fonction): DU ASTRE

Signatory of training Agreement  (Name and fonction):

 

 

Contact et tutorat

Contact person and tutor

Contact sur le terrain (nom et e-mail): Célia Lacomme

On site contact (Name and e-mail address)

 

 

Contact en France (nom et e-mail) :  Julien Cappelle julien.cappelle@cirad.fr, Hélène De Nys <helene.de_nys@cirad.fr>

Contact person in France (name and e-mail address) :

 

 

Tuteur (nom et e-mail) : Hélène De Nys <helene.de_nys@cirad.fr>,

Tutor (Name and e-mail address)

 

 

 

 

 

Remarques et conditions particulières

(diplôme requis, langues pratiquées, aptitudes particulières)

 

Remarks

(degrees required, spoken/written languages, special skills)

 

 

Diplôme en écologie, biologie, ou médecine vétérinaire.

Travail de terrain en zone rurale (camping en forêt / bordure de village, trajets sur pistes)

Intérêt fort pour l’analyse de données sous R

 

Conditions matérielles

       Logistics / costs

Prise en charge billet d'avion        OUI                         NON         

 

Prise en charge logement sur place            OUI                           NON             

 

Prise en charge déplacements pour mission de terrain    OUI           NON            

 

Indemnités de stage    OUI              NON

 

 Bailleur / financement

Donor / financial

Projet ou bailleur finançant les coûts du stage 

Project or donor financing the training expenses:

 

Projet Ebo-Sursy (UE) ou Ebo-Health (MUSE)