Titre : Analyse du comportement des poissons pour améliorer la sélectivité du chalut

 Stage de Master 2
Durée : Stage de 6 mois. Premier semestre 2026
Encadrement :
Marianne Robert et Robin Faillettaz – UMR DECOD (Dynamique et durabilité des
écosystèmes : de la source à l’océan), Ifremer Lorient
Contexte et objectifs
La connaissance du comportement animal est un élément clé pour comprendre les processus
de capture par les engins de pêche. Cette thématique est devenue un axe important de
recherche au sein du Laboratoire de Technologie et Biologie halieutique (Ifremer Lorient). Ces
connaissances permettent de concevoir des dispositifs et engins de pêche plus sélectifs afin
d’éviter les captures non souhaitées et diminuer l’impact de la pêche sur les écosystèmes.
L'utilisation de caméras sous-marines permet d'étudier le comportement des espèces
interagissant avec les engins de pêche dans leur environnement naturel. Ce type de données a
déjà été utilisé pour décrire les comportements natatoires de certaines espèces de poissons
dans les engins de pêche et ouvre la voie à de nouvelles recherches sur les interactions inter-
individus et individus-engin, dans un environnement contraint tel que le chalut.
Par une approche couplant éthologie appliquée et intelligence artificielle, le stage vise à
identifier et si possible quantifier les comportements de nage et d’échappement dans
l’environnement contraint d’un chalut pour plusieurs espèces de poissons (notamment des
gadidés). L’analyse fines des trajectoires individuelles à microéchelle (< 1 m) testera dans
quelles mesures les caractéristiques de nage et d’échappement sont reliés aux capacités des
espèces et des individus, ( i.e traits biologiques tels que la taille, forme, etc.), aux contraintes
physiques de cet environnement (e.g. type et ouverture des mailles) et ou à des effets
d’encombrement (spatial et/ou social). La dynamique temporelle pourra être étudiée à l’aide
des modèles numériques (e.g., estimateur de Kaplan-Meier appliqué aux durées de chaque
comportement), afin d’inférer sur le caractère stationnaire ou avec mémoire (dépendant du
temps) des comportements observés.
Ce stage s’intègre dans le projet ESCAPE. Les résultats de ce stage viseront à appréhender les
lois comportementales sous-jacentes au comportement individuels et réponses collectives
observés dans un chalut. Une fois formalisées, ces différentes hypothèses seront testées, dans
ce stage ou dans la suite du projet ESCAPE, à l’aide d’outils numériques de modélisation couplée
animaux-engins de pêche par une approche individu-centrée.
Pour plus de détails sur le projet ESCAPE : https://www.wikimer.org/projets/escape-
comprehension-et-modelisation-des-comportements-dechappement-des-poissons-dans-les-
engins-de-peche/
Activités principales
- Analyse des trajectoires issues d’annotations manuelles préexistantes, à l’aide
d’éthogrammes et de métriques quantifiant les caractéristiques des déplacements
(trajectoires et positions). Cette approche permettra de caractériser le comportement
des différentes espèces en fonction des conditions expérimentales, notamment le type
de maille, la composition spécifique et la densité d’individus
- Analyse d’images à l’aide du logiciel d’imagerie sous-marine VIAME, pour entrainer,
valider et déployer les algorithmes de détection automatique des espèces de
poissons sur de nouvelles vidéos
- Comparer les résultats obtenus manuellement et automatiquement, afin de déterminer
si les principaux comportements observés peuvent être extraits automatiquement tout
en fournissant des conclusions quantitativement similaires aux analyses manuelles.
- Synthétiser les résultats afin de déterminer quels comportements sont les plus
pertinents à considérer pour améliorer la sélectivité des chaluts.
Compétences recherchées
• Intérêt pour l’analyse et traitement des images et l’analyse de données
• Expérience en écologie, halieutique ou éthologie appréciée
• Qualités personnelles : Rigueur, sens de l’observation, persévérance, curiosité
intellectuelle
Candidature
CV, lettre de motivation et lettre de recommandation (si possible) à envoyer à
marianne.robert@ifremer.fr et robin.fauillettaz@ifremer.fr avant le 22 octobre 2026. Les
candidatures seront examinées au fur et à mesure de leur réception.
Références
Winger et al. 2010. Fish Behavior near Bottom Trawls. Behavior of Marine Fishes. John Wiley &
Sons.
Jones et al. 2008 The influence of towing speed and fish density on the behaviour of
haddock in a trawl cod-end. Fish. Res.
Robert et al. 2020. A methodological framework for characterizing fish swimming and
escapement behaviors in trawls. PLOS ONE.
Vincent et al. 2022. Exploring the mechanics of fish escape attempts through mesh. Fish. Res.
Abangan et al. 2023. Artificial Intelligence for Fish Behavior Recognition May Unlock Fishing
Gear Selectivity. Frontiers in Marine Science. https://doi.org/10.3389/fmars.2023.1010761.