mercredi 11 avril 2018

offre de thèse urbanisation - communication - stress - mésanges

Sujet    de    thèse    :
Effets     de     l’urbanisation     sur     la     communication     acoustique,     le     stress  physiologique     et     le     succès    reproducteur    des    mésanges    bleues    et    charbonnières.    Implications    pour    la    biodiversité    avienne    en    ville.

Laboratoire    :
Institut    d'Ecologie    et    des    Sciences    de    l'environnement    de    Paris   
Equipe    Ecophysiologie    Evolutive
Sorbonne    Université,    Faculté    des    Sciences,
Case    courrier    237,
4    place    Jussieu,   
F-75005    Paris,    France
Encadrantes    :
Clotilde    BIARD    MC    S.U.    (clotilde.biard@sorbonne-universite.fr)    et    Clémentine    VIGNAL,    Prof.    S.U.   
HDR    (clementine.vignal@sorbonne-universite.fr)
Descriptif    du    sujet    :
Les    changements     globaux     actuels     induisent     des     variations     rapides     de     l’environnement   
auxquelles    les    individus    doivent    s’adapter    sur    une    échelle    de    temps    réduite.    En    particulier,    avec   
l’urbanisation    rapide    de    ces    dix    dernières    années,    la    ville    est    devenue    un    environnement    original   
avec     de     nouvelles     pressions     évolutives.     L’objectif     de     ce     projet     est     de     comprendre     les     effets   
directs    et    indirects    de    l’urbanisation    sur    les    individus,    puis    ses    conséquences    sur    les    populations.   
Ce    projet    se    focalise    sur    les    réponses    comportementales    et    physiologiques    à    l’urbanisation,    ainsi   
que    leurs    conséquences    en    terme    de    valeur    sélective    chez    les    oiseaux,    modèle    d’étude    privilégié   
car    différentes    espèces    sauvages    se    sont    installées    en    milieu    urbain.
Ce     projet     reposera     sur     une     approche     allant     de     la     physiologie     au     comportement,     et   
s’appuiera    sur    la     complémentarité     entre     une     approche     d’écologie     urbaine     utilisant     le     gradient   
environnemental    créé    par    l’urbanisation    (e.g.    pollutions,    température,    végétation,    fragmentation   
de     l’habitat)     et     une     approche     comparative     à     l’échelle     régionale     avec     une     population     rurale   
forestière.     Ce     projet     bénéficiera     des     suivis     biodémographiques     de     populations     de     mésanges   
bleue    (Cyanistes    caeruleus)    et    charbonnières    (Parus    major)    établies    depuis    2012    dans    les    parcs   
de    Paris    et    Rueil-Malmaison,    et    depuis    2010    en    forêt    domaniale    de    la    Commanderie    (77).
Les    questions    fondamentales    étudiées    au    cours    du    projet    doctoral    seront    :
1.  Impact     de     l’urbanisation     sur     la     communication     acoustique,     la     synchronisation     des   
activités    au    sein    du    couple    et    le    stress    physiologique
Chez     les     oiseaux     monogames,     mâle     et     femelle     synchronisent     leurs     activités     lors     de     la   
reproduction,    notamment    grâce    à    la    communication    acoustique,    qui    sera    ici    étudiée    grâce    à    des   
enregistreurs     automatiques     placés    dans     les     nichoirs.     Cette     approche     de     suivi     comportemental   
sera    associée    à    un    suivi    physiologique.    Le    milieu    urbain    est    susceptible    de    modifier    le    niveau    de   
stress     physiologique     (mesuré     grâce     à     différents     paramètres    :    stress     oxydatif,     stress     hydrique,   
télomères,    ratio     hétérophiles/lymphocytes),     la     réponse     fonctionnelle     de     l’axe     hypothalamushypophyse-surrénale    (mesurée    par    la    réponse    comportementale    au    stress    de    la    capture),    et    les   
conséquences     du     stress     (mesurées     par     la     capacité     à     développer     des     ornements   
sexuels=coloration     du     plumage).     Nous     explorerons     ainsi     les     corrélations     entre     urbanisation,   
stress    physiologique    et    communication/synchronisation    du    couple.
2.  Influence     de     la     communication     acoustique,     de     la     synchronisation     et     du     stress   
physiologique    sur    le    succès    de    reproduction    et    la    survie
La    qualité    de    l’incubation    et    du    nourrissage    des    poussins    ont    un    impact    essentiel    sur    le    succès    de   
reproduction.     Le     comportement     d’incubation     sera     suivi     grâce     à     des     enregistreurs     de   
température     placés     au     fond     des     nids     et    l’investissement     parental     de     nourrissage    grâce     à    des   
observations     comportementales     au     nichoir.     Les     communications     acoustiques     seront   
enregistrées    à    ces    deux    étapes.    Enfin,    le    succès    de    reproduction    sera    mesuré    avant    l’envol    par    le   
nombre    de    poussins    envolés,    et    leur    condition    physique    et    physiologique.    La    survie    des    adultes   
reproducteurs    ainsi    que    celle    de    leurs    poussins    sera    déterminée    grâce    à    des    modèles    de    Capture-Marquage-Recapture.
Profil    du/de    la    candidat•e    recherché•e    :
Le/la     candidat•e    recherché•e     devra     avoir     de     solides     connaissances     en     écologie     évolutive     et   
comportementales,     écophysiologie,     analyses     statistiques,     et     très     une     bonne     capacité   
rédactionnelle    (anglais    et    français).    Une    forte    motivation    pour    le    travail    de    terrain    et    les    analyses   
biologiques     au     laboratoire,     du     sérieux     et     de     la     rigueur     pour     la     conduite     de     protocoles   
expérimentaux     et     une     capacité     de     travail     autonome     seront     indispensables.     L'étudiant•e     devra   
contribuer     aux     activités     communes     du     laboratoire     et     être     mobile     entre     les    différents     sites     de   
terrain    du    projet    (le    permis    de    conduire    sera    indispensable).
Publications    en    lien    avec    la    thèse    :
Bleu,     J.,     S.     Agostini,     and     C.     Biard.     2017.     Nest     box     temperature     affects     clutch     size,     incubation   
initiation    and    nestling    health    in    great    tits.    Behavioral    Ecology    48:489-501.
Boucaud,          Aguirre     Smith,     Valère,     Vignal,     2016.     Incubating     females     signal     their     needs     during   
intra-pair     vocal     communication     at     the     nest:     a     feeding     experiment     in     great     tits.    Animal   
Behaviour.    122:    77-86.
Boucaud,    Perez,    Ramos,    Griffith,    Vignal,    2017.    Acoustic    communication    in    zebra    finches    signals   
when    mates    will    take    turns    with    parental    duties.    Behavioral    Ecology    28(3)    :    645-656.
Perez,     Mariette,     Cochard,     Soulage,     Griffith,     Vignal,     2016.    Corticosterone     triggers     high-pitched   
nestlings’     begging     calls     and     affects     parental     behavior     in     the     wild     zebra     finch.     Behavioral   
Ecology    27    (6):    1665-1675.
Senar,    J.    C.,    L.    Z.    Garamszegi,    V.    Tilgar,    C.    Biard,    G.    Moreno-Rueda,    P.    Salmón,    J.    M.    Rivas,    P.    Sprau,   
N.    J.    Dingemanse,    A.    Charmantier,    V.    Demeyrier,    H.    Navalpotro,    and    C.    Isaksson.    2017.    Urban   
Great     Tits     (Parus     major)     Show     Higher     Distress     Calling     and     Pecking     Rates     than     Rural     Birds   
across    Europe.    Frontiers    in    Ecology    and    Evolution    5.
Vaugoyeau,     M.,     S.     Meylan,     and     C.     Biard.     2017.     How     does     an     increase     in     minimum     daily   
temperatures     during     incubation     influence     reproduction     in     the     great     tit     (Parus     major)?     .   
Journal    of    Avian    Biology    48:714-725.

Modalités    de    candidature    :
Les    candidat•es    doivent    candidater    sur    la    plateforme    de    l’ED227    avant    le    21    mai    2018    :   
(http://enseignementsuperieur.mnhn.fr/fr/enseignement-superieur/doctorat/concoursed227).
 
Les    pièces    demandées    sont    :
-    CV
-    lettre    de    motivation
-    diplôme    ou    une    attestation    de    diplôme    (Master)
-    relevé    de    notes    avec    classement    pour    les    deux    semestres    de    master    1    et    master    2
 
En    complément    de    leur    dossier    de    candidature    en    ligne,    les    candidat•es    enverront    aux directrices    de    thèse    les    documents    suivants    :
-  Lettres    de    recommandation    ou    contacts    des    précédent•es    encadrant•es,    au    minimum    ceux    du    stage    de    M1    et    M2
-  Lettre    de    motivation    en    anglais
-  Mémoire    de    M2

Les    candidat•es    pré-sélectionné•es    seront    auditionné•es    devant    un    jury    composé    des    deux    directrices    de    thèse    et    de    spécialistes    du    domaine    de    recherche.    Les    auditions    se    dérouleront    la    semaine    du    18    juin    2018    sur    le    campus    Jussieu    ou    par    visioconférence.