lundi 8 juin 2015

Offre de thèse financée

Thèse : Evolution des comportements de recherche et du mouvement chez les microhyménoptères parasitoïdes du genre Trichogramma

Durée : 3 ans
Date de début : Novembre 2015
Laboratoire d'accueil : Institut Sophia Agrobiotech, UMR INRA-CNRS-Université de Nice
400 route des Chappes, 06903 Sophia Antipolis

Ecole doctorale : Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (85)
Financement : Projet ANR TriPTIC (100%)
Encadrants : Vincent Calcagno et Ludovic Mailleret
Contact : vincent.calcagno@sophia.inra.fr +33 4 92 38 64 85

Description du sujet :
Les trichogrammes sont des parasitoïdes de très petite taille (<0 .5="" a="" afin="" agents="" agressivit="" aide="" analyse="" artificiels="" au="" aujourd="" autres="" biologique="" bit="" ce="" ces="" cet="" chimiques.="" cision="" comportement="" comportements="" computer-vision="" constitu="" d="" de="" des="" diff="" dispositif="" e.g.="" en="" entre="" es="" esp="" et="" faible="" fera="" g="" h="" haut="" hui="" images="" insectes="" insecticides="" int="" inter-individuelles="" interactions="" interf="" isolement="" l="" la="" laboratoire.="" le="" les="" leur="" leurs="" lever="" lign="" longtemps="" lors="" lutte="" m="" machine-learning="" minipaysages="" mm="" mouvements="" obstacle.="" obstacle="" oeuf="" oeufs="" orientation="" otaxie="" p="" parti="" permettent="" phototaxie="" plusieurs="" pondent="" populations="" pr="" principalement="" prises="" progr="" propose="" qui="" recherche="" rence="" rentes="" rieur="" s="" se="" seront="" si="" sont="" substitution="" sujet="" taille="" te.="" technologiques="" tes="" th="" thodes="" tirer="" titre="" tr="" trichogrammes.="" tuant="" tude="" tudi="" tudier="" un="" utilis="" velopp="" veloppent="" zygotique="">
Cette thèse s'intégre dans le projet ANR TriPTIC (2015-2018), qui vise à caractériser la diversité des trichogrammes européens aux niveaux génomique (phylogénie, variation intra-populationnelle par NGS RAD-seq), phénotypique, et démographique. Dans le cadre de ce projet, un ensemble d'espèces et de populations de Trichogrammes seront échantillonnées dans différentes régions et milieux écologiques. Elles seront caractérisées moléculairement, et maintenues en élevage, au sein du Centre de Ressources Biologiques sur les parasitoïdes oophages de l'UMR ISA de Sophia-Antipolis.
La thèse s'appuiera sur cette ressource biologique, et l'étude des comportements permettra de (i) comprendre leur évolution, par analyse comparative sur la base de la phylogénie moléculaire générée dans le projet TriPTIC, (ii) tester l'existence de patrons de spécialisation écologique, par association avec le type d'habitat (e.g. canopée versus strate herbacée) et/ou l'hôte majoritaire, et (iii) confronter les stratégies comportementales et les syndromes observés aux prédictions théoriques issues de modèles d'optimal-foraging et d'écologie du mouvement. En outre, les traits étudiés étant en lien direct avec l'efficacité du trichogramme lors de leur déploiement en lutte biologique, les données générées pourront servir de base à l'identification de souches/espèces utiles en biocontrôle.

Collaborations envisagées :
– Institut Pasteur, Paris
– Institut d’écologie et des sciences de l’environnement, Paris
– CBGP, Montpellier
– Centre INRIA Sophia Antipolis-Méditerrannée

Compétences requises : expérimentation avec des insectes en laboratoire, écologie évolutive et comportementale, analyse statistique sous R. Des connaissances en outils d'analyse d'image (ImageJ...) et un certain goût pour la programmation seront un plus.

Joindre CV + lettre de motivation pour toute candidature.