Offre de stage de Master 1
2020
TITRE DU SUJET DE STAGE : ETUDE DU METABOLISME EN LIEN AVEC LA STRUCTURE DU GROUPE CHEZ DIFFERENTES ESPECES DE POISSONS SOUS CONTRAINTES ENVIRONNEMENTALES
2020
TITRE DU SUJET DE STAGE : ETUDE DU METABOLISME EN LIEN AVEC LA STRUCTURE DU GROUPE CHEZ DIFFERENTES ESPECES DE POISSONS SOUS CONTRAINTES ENVIRONNEMENTALES
PORTEURS : Tatiana Colchen, Thomas Trancart, Vincent Bels, Eric Feunteun & Alexandre Carpentier
Établissement d’appartenance : Université Rennes 1 – MNHN – BOREA, Equipe BIOPAC
E-mail : tatiana.colchen@univ-rennes1.fr ; alexandre.carpentier@univ-rennes1.fr
DESCRIPTIF DU STAGE :
L’objectif de la première partie du stage est d’étudier la structure du groupe et le métabolisme chez deux espèces de mulets (Chelon ramada et Chelon labrosus). La première partie du stage s’inscrit dans le programme FEREE (comparaison du Fonctionnement Écologique de secteurs intertidaux contrastés pour la compréhension de leurs connectivités et la Restauration des fonctions Ecologiques Estuariennes (2019-2022) financement régional, GIP Seine Aval). L’approche sera expérimentale et devrait permettra de comprendre les facteurs impliqués dans les capacités des mulets à coloniser les habitats estuariens (plateau d’écologie expérimentale du CRESCO à Dinard).
Les mulets sont des téléostéens de l’ordre des Mugiliformes comprenant trois familles dont les Mugilidae qui sont l’une des familles de téléostéens les plus importantes en terme de nombre d’espèces. Elles se répartissent largement sur les espaces côtiers et notamment en estuaire probablement grâce leur régime alimentaire particulier (limnivores) (Lebreton et al., 2011, Carpentier et al., 2013) et de bonnes capacités d’osmorégulation (Daverat et al., 2011).
Depuis quelques années, la régression des stocks de nombreux poissons pourrait amener les mulets à devenir les espèces principales exploitées par la pêche professionnelle fluviale ou estuarienne. Ces espèces semblent sensibles à la destruction des habitats, la contamination par des polluants et à l’exploitation par pêche, conduisant à leur intégration dans les plans d’actions de gestion des poissons migrateurs en raison du manque de connaissances biologiques et écologiques les concernant (DREAL-Bretagne, 2018). De plus, le réchauffement climatique conduit à l’augmentation de la fréquence des épisodes extrêmes comme des crues ou des sécheresses pouvant avoir des effets sur les gradients de salinité dans les estuaires et impacter les capacités de migrations d’une manière différente en fonction des espèces et des stades biologiques. Ce stage vise à enrichir les connaissances sur le comportement social des mulets lors de phases de transition mer-estuaire.
Le but du stage sera d’optimiser le design expérimental afin de pouvoir étudier le comportement des mulets en groupe. Il est donc prévu de maintenir des mulets à des tailles (âges) variées (juvéniles <1 2.7="" 4="" afin="" alors="" an="" animalerie="" ans="" basal="" canal="" ces="" chaque="" cifiques="" comportement="" composition="" consommation="" d="" dans="" de="" des="" diff="" dinard="" du="" e="" en="" entr="" esp="" estuaire="" et="" faisant="" film="" galement="" groupe.="" groupe="" groupes="" hydrodynamique="" il="" individus="" jusque="" l="" la="" large="" le="" les="" long="" m="" mar="" marine="" mesur="" mnhn="" modalit="" mono-="" mouvements="" nage="" nbsp="" ne="" oxyg="" p="" parall="" permettant="" plac="" plurisp="" poissons="" possible="" pour="" proxy="" rentes="" respirom="" s="" sera="" seront="" simulation="" simuler="" socosmes="" station="" structure="" tabolisme="" taille="" tester="" tre="" tudier="" tunnel="" un="" une="" varier="">
CONNAISSANCES OU COMPETENCES ACQUISES A L’ISSUE DU STAGE:
Le stagiaire aura acquis les notions correspondant à la structure du groupe ainsi que les techniques expérimentales et analytiques pour étudier ce comportement. Il saura gérer un système d’élevage ainsi que des structures expérimentales tout en prenant en compte le bienêtre des animaux élevés.
CARACTERISTIQUES DU STAGE :
- Nombre de mois prévus : 2 à 3 mois
- Dates prévues : stage à pourvoir entre avril et juin 2020
- Formation prévue sur les logiciels d’analyse de comportement
- Les candidatures (CV + lettre de motivation) sont à envoyer aux deux adresses mails suivantes avant le 29/02/2020 : tatiana.colchen@univ-rennes1.fr ; alexandre.carpentier@univrennes1.fr
Le stagiaire participera avec les techniciens de la station au maintien des poissons en élevage (nourrissage et entretien), aux tests dans le canal hydrodynamique et les tunnels de nage ainsi qu’éventuellement à l’analyse des vidéos et des données de respirométrie.
Dans une seconde partie, le stagiaire aura accès à des vidéos pour travailler sur l’impact de la variation de température sur la structure du groupe chez des alevins de truite fario (Salmo trutta) lors de la transition vers une alimentation exogène. Chez les poissons, la structure du groupe peut être une variable d’ajustement en réponse à des variations de facteurs de l’environnement. Parmi ces facteurs, la température est connue pour avoir des effets sur la structure du groupe à travers les relations interindividuelles. La truite fario est une espèce faisant partie intégrante de la biodiversité actuelle d’Europe du Nord, touchée par le réchauffement climatique. Il apparait essentiel pour la sauvegarde de cette espèce, de comprendre l’impact que pourrait avoir cette modification du climat sur les comportements des alevins. Les alevins sont plus sténothermes que les stades juvéniles ou adultes (Kamler 2002 ; Ojanguren & Brana 2003). En corrélat à la survie et au maintien de l’espèce dans les habitats qu’elle occupe actuellement, nous posons la question de l’impact de faibles variations de température (dans la gamme des températures prévues par le GIEC, estimant aussi bien des hausses que des baisses de température qui pourraient affecter certaines régions continentales de l’aire de distribution actuelle de l’espèce) sur la structure du groupe, sur la répartition des individus dans le groupe et leurs relations inter-individuelles face à une situation qui ne serait pas optimale pour leur développement. Dans cette optique, la structure du groupe a été testée
à 3 températures d’élevage différentes et à travers trois paramètres classiquement mesurés (logiciel ImageJ) : la dispersion (distance au plus proche voisin), la cohésion (moyenne des distances inter-individuelles) et l’homogénéité (variance des distances inter-individuelles) (Colchen et al., 2017).
Le stagiaire devra assurer l’analyse de ces vidéos (phase analytique) en parallèle des tests dans le canal hydrodynamique et les tunnels de nage (phase technique).
Dans une seconde partie, le stagiaire aura accès à des vidéos pour travailler sur l’impact de la variation de température sur la structure du groupe chez des alevins de truite fario (Salmo trutta) lors de la transition vers une alimentation exogène. Chez les poissons, la structure du groupe peut être une variable d’ajustement en réponse à des variations de facteurs de l’environnement. Parmi ces facteurs, la température est connue pour avoir des effets sur la structure du groupe à travers les relations interindividuelles. La truite fario est une espèce faisant partie intégrante de la biodiversité actuelle d’Europe du Nord, touchée par le réchauffement climatique. Il apparait essentiel pour la sauvegarde de cette espèce, de comprendre l’impact que pourrait avoir cette modification du climat sur les comportements des alevins. Les alevins sont plus sténothermes que les stades juvéniles ou adultes (Kamler 2002 ; Ojanguren & Brana 2003). En corrélat à la survie et au maintien de l’espèce dans les habitats qu’elle occupe actuellement, nous posons la question de l’impact de faibles variations de température (dans la gamme des températures prévues par le GIEC, estimant aussi bien des hausses que des baisses de température qui pourraient affecter certaines régions continentales de l’aire de distribution actuelle de l’espèce) sur la structure du groupe, sur la répartition des individus dans le groupe et leurs relations inter-individuelles face à une situation qui ne serait pas optimale pour leur développement. Dans cette optique, la structure du groupe a été testée
à 3 températures d’élevage différentes et à travers trois paramètres classiquement mesurés (logiciel ImageJ) : la dispersion (distance au plus proche voisin), la cohésion (moyenne des distances inter-individuelles) et l’homogénéité (variance des distances inter-individuelles) (Colchen et al., 2017).
Le stagiaire devra assurer l’analyse de ces vidéos (phase analytique) en parallèle des tests dans le canal hydrodynamique et les tunnels de nage (phase technique).
L’équipe encadrante se réserve le droit de modifier la phase analytique en fonction des premiers résultats obtenus sur les mulets. Les données mulets si elles sont analysables en tant et en heures seront alors privilégiées.
CONNAISSANCES OU COMPETENCES ACQUISES A L’ISSUE DU STAGE:
Le stagiaire aura acquis les notions correspondant à la structure du groupe ainsi que les techniques expérimentales et analytiques pour étudier ce comportement. Il saura gérer un système d’élevage ainsi que des structures expérimentales tout en prenant en compte le bienêtre des animaux élevés.
CARACTERISTIQUES DU STAGE :
- Nombre de mois prévus : 2 à 3 mois
- Dates prévues : stage à pourvoir entre avril et juin 2020
- Formation prévue sur les logiciels d’analyse de comportement
- Les candidatures (CV + lettre de motivation) sont à envoyer aux deux adresses mails suivantes avant le 29/02/2020 : tatiana.colchen@univ-rennes1.fr ; alexandre.carpentier@univrennes1.fr
PUBLICATIONS RECENTES
Carpentier, A., Como, S., Dupuy, C., Lefrançois, C., Feunteun, E. (2013). Feeding ecology of Liza spp. in a tidal flat: Evidence of the importance of primary production (biofilm) and associated meiofauna. Journal of Sea Research, 92, pp.86-91. 10.1016/j.seares.2013.10.007 . hal-00932595.
Colchen, T., Teletchea, F., Fontaine, P., Pasquet, A. (2017). Temperature modifies activity, interindividual relationships and group structure in fish. Current Zoology. 163, 175-183. 10.1093/cz/zow048.
Trancart, T., Feunteun, E., Lefrançois, C., Acou, A., Boinet, C., Carpentier, A. (2016). Difference in responses of two coastal species to fluctuating salinities and temperatures: Potential modification of specific distribution areas in the context of global change. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 173, 9-15. 10.1016/j.ecss.2016.02.012 . hal-01281455.
Trancart, T., Lambert, P., Daverat, F., & Rochard, E. (2014). From selective tidal transport to counter current swimming during watershed colonisation: an impossible step for young-of-the-year catadromous fish? Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 412, 04.
Trancart, T., Lambert, P., Rochard, E., Daverat, F., Roqueplo, C., Coustillas, J. (2011). Swimming activity responses to water current reversal support selective tidal-stream transport hypothesis in juvenile thinlip mullet Liza ramada. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 399, 120-129. 10.1016/j.jembe.2011.02.015.
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